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Database: Pfam
Entry: RNA_helicase
LinkDB: RNA_helicase
Original site: RNA_helicase 
#=GF ID   RNA_helicase
#=GF AC   PF00910.24
#=GF DE   RNA helicase
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE   Pfam-B_11 (release 3.0)
#=GF GA   21.50 21.50;
#=GF TC   21.50 21.50;
#=GF NC   21.40 21.40;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF CL   CL0023
#=GF RN   [1]
#=GF RM   2546125
#=GF RT   Two related superfamilies of putative helicases involved in
#=GF RT   replication, recombination, repair and expression of DNA and RNA
#=GF RT   genomes. 
#=GF RA   Gorbalenya AE, Koonin EV, Donchenko AP, Blinov VM; 
#=GF RL   Nucleic Acids Res 1989;17:4713-4730.
#=GF DR   INTERPRO; IPR000605;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   This family includes RNA helicases thought to be involved in
#=GF CC   duplex unwinding during viral RNA replication. Members of this
#=GF CC   family are found in a variety of single stranded RNA viruses.
#=GF SQ   1015
#=GS A0A1L3KKH1_9VIRU/1139-1248  AC A0A1L3KKH1.1
#=GS A0A1L3KHF3_9VIRU/369-479    AC A0A1L3KHF3.1
#=GS D9YV24_PASVA/1405-1508      AC D9YV24.1
#=GS A0A1L3KJH8_9VIRU/485-595    AC A0A1L3KJH8.1
#=GS A0A0B4UFT9_9VIRU/165-251    AC A0A0B4UFT9.1
#=GS A0A1L3KKR0_9VIRU/463-569    AC A0A1L3KKR0.1
#=GS A0A1L3KM96_9VIRU/497-611    AC A0A1L3KM96.1
#=GS A0A1L3KL07_9VIRU/637-744    AC A0A1L3KL07.1
#=GS A0A1L3KNP6_9VIRU/625-735    AC A0A1L3KNP6.1
#=GS A0A1Y1UZ29_9FUNG/111-215    AC A0A1Y1UZ29.1
#=GS A0A023AX31_GRENI/154-238    AC A0A023AX31.1
#=GS A0A2H4MWW2_9CIRC/172-256    AC A0A2H4MWW2.1
#=GS A0A0B6VHZ4_9VIRU/404-515    AC A0A0B6VHZ4.1
#=GS A0A140CTU2_9VIRU/132-232    AC A0A140CTU2.1
#=GS A0A0C5IAV0_9CIRC/161-246    AC A0A0C5IAV0.1
#=GS A0A1L3KKQ5_9VIRU/509-616    AC A0A1L3KKQ5.1
#=GS A0A126G8I2_9VIRU/182-269    AC A0A126G8I2.1
#=GS A0A5C5T9M9_9STRE/240-343    AC A0A5C5T9M9.1
#=GS A0A1L3KIW6_9VIRU/370-473    AC A0A1L3KIW6.1
#=GS A0A1L3KKS2_9VIRU/587-699    AC A0A1L3KKS2.1
#=GS A0A140AQQ0_9VIRU/162-250    AC A0A140AQQ0.1
#=GS A0A1L3KM49_9VIRU/1061-1166  AC A0A1L3KM49.1
#=GS A0A125RL97_9CIRC/177-261    AC A0A125RL97.1
#=GS A0A2I2MP63_9CIRC/206-294    AC A0A2I2MP63.1
#=GS A0A1L3KKT2_9VIRU/1571-1681  AC A0A1L3KKT2.1
#=GS A0A1L3KJ18_9VIRU/384-494    AC A0A1L3KJ18.1
#=GS A0A1L3KNP7_9VIRU/516-631    AC A0A1L3KNP7.1
#=GS A0A023B1R5_GRENI/300-384    AC A0A023B1R5.1
#=GS A0A1L3KM42_9VIRU/735-847    AC A0A1L3KM42.1
#=GS A0A1L3KKU5_9VIRU/1504-1612  AC A0A1L3KKU5.1
#=GS A0A1L3KH06_9VIRU/1443-1553  AC A0A1L3KH06.1
#=GS A0A2I8B2M4_9VIRU/165-254    AC A0A2I8B2M4.1
#=GS A0A1L3KMC0_9VIRU/1078-1201  AC A0A1L3KMC0.1
#=GS A0A0B4UFV0_9VIRU/163-250    AC A0A0B4UFV0.1
#=GS REP_PCV1/167-254            AC Q805H4.1
#=GS A0A397U449_9GLOM/302-392    AC A0A397U449.1
#=GS A0A1L3KJF5_9VIRU/1505-1608  AC A0A1L3KJF5.1
#=GS A0A1L3KHJ4_9VIRU/717-829    AC A0A1L3KHJ4.1
#=GS A0A2I2MP66_9CIRC/157-249    AC A0A2I2MP66.1
#=GS A0A1L3KMD0_9VIRU/397-507    AC A0A1L3KMD0.1
#=GS A0A1L3KH56_9VIRU/364-474    AC A0A1L3KH56.1
#=GS A0A1L3KKX0_9VIRU/362-473    AC A0A1L3KKX0.1
#=GS A0A1L3KNR2_9VIRU/363-479    AC A0A1L3KNR2.1
#=GS A0A346BPA4_9VIRU/150-236    AC A0A346BPA4.1
#=GS A0A0N5D6Z0_THECL/92-178     AC A0A0N5D6Z0.1
#=GS A0A1Y1VDV5_9FUNG/126-221    AC A0A1Y1VDV5.1
#=GS R5WLG4_9FIRM/200-291        AC R5WLG4.1
#=GS A0A1L3KHF4_9VIRU/471-581    AC A0A1L3KHF4.1
#=GS A0A1Y4INC5_9FIRM/184-270    AC A0A1Y4INC5.1
#=GS A0A0C5I2I9_9CIRC/166-236    AC A0A0C5I2I9.1
#=GS G1C9H6_9VIRU/174-260        AC G1C9H6.1
#=GS A0A0B4UFY0_9VIRU/158-242    AC A0A0B4UFY0.1
#=GS A0A0M9WAM5_9EURO/100-199    AC A0A0M9WAM5.1
#=GS A0A126GA43_9VIRU/161-246    AC A0A126GA43.1
#=GS REPP_ONYPE/200-291          AC Q8G8D1.1
#=GS A0A126GA36_9VIRU/163-250    AC A0A126GA36.1
#=GS A0A1L3KMR5_9VIRU/669-781    AC A0A1L3KMR5.1
#=GS A0A1L3KM26_9VIRU/477-598    AC A0A1L3KM26.1
#=GS POLG_HPE2W/1180-1280        AC O73556.1
#=GS A0A0B4UGX8_9VIRU/165-251    AC A0A0B4UGX8.1
#=GS A0A161IBA2_9VIRU/148-233    AC A0A161IBA2.1
#=GS A0A140CTU9_9VIRU/148-232    AC A0A140CTU9.1
#=GS A0A1Y1UHG9_9FUNG/130-234    AC A0A1Y1UHG9.1
#=GS A0A1L3KM05_9VIRU/558-670    AC A0A1L3KM05.1
#=GS A0A044RV77_ONCVO/181-267    AC A0A044RV77.2
#=GS A0A385E3D0_9VIRU/164-248    AC A0A385E3D0.1
#=GS A0A044RKA0_ONCVO/184-270    AC A0A044RKA0.2
#=GS A0A1L3KKM8_9VIRU/746-851    AC A0A1L3KKM8.1
#=GS A0A1L3KMC7_9VIRU/1354-1454  AC A0A1L3KMC7.1
#=GS A0A168MFT2_9VIRU/178-269    AC A0A168MFT2.1
#=GS A0A1L3KJ27_9VIRU/342-454    AC A0A1L3KJ27.1
#=GS A0A1L3KKU1_9VIRU/290-392    AC A0A1L3KKU1.1
#=GS A0A1L3KME4_9VIRU/813-917    AC A0A1L3KME4.1
#=GS A0A2L0HH22_9VIRU/171-260    AC A0A2L0HH22.1
#=GS W4EN49_9BACL/204-279        AC W4EN49.1
#=GS V9TQB9_9VIRU/169-264        AC V9TQB9.1
#=GS A0A1L3KHW5_9VIRU/102-210    AC A0A1L3KHW5.1
#=GS A0A220IGT1_9VIRU/1012-1117  AC A0A220IGT1.1
#=GS A0A2G5SFE7_9PELO/9-127      AC A0A2G5SFE7.1
#=GS A0A1L3KJ47_9VIRU/290-394    AC A0A1L3KJ47.1
#=GS A0A0B1PE00_9BILA/36-121     AC A0A0B1PE00.1
#=GS A0A1L3KHH5_9VIRU/347-457    AC A0A1L3KHH5.1
#=GS A0A1L3KMP1_9VIRU/290-400    AC A0A1L3KMP1.1
#=GS A0A1L3KNR3_9VIRU/527-643    AC A0A1L3KNR3.1
#=GS A0A1L3KL23_9VIRU/522-634    AC A0A1L3KL23.1
#=GS A0A2A5RKQ6_9LACT/11-110     AC A0A2A5RKQ6.1
#=GS G7H0A3_9ACTN/249-346        AC G7H0A3.1
#=GS A0A238X5W5_9FLAO/83-178     AC A0A238X5W5.1
#=GS G0P5Q4_CAEBE/9-128          AC G0P5Q4.1
#=GS A0A1L3KJM7_9VIRU/623-727    AC A0A1L3KJM7.1
#=GS A0A1L3KH05_9VIRU/534-648    AC A0A1L3KH05.1
#=GS R9M1R5_9FIRM/82-174         AC R9M1R5.1
#=GS A0A1L3KHG5_9VIRU/400-511    AC A0A1L3KHG5.1
#=GS A0A288Q8B2_9LACT/211-300    AC A0A288Q8B2.1
#=GS A0A168MGI1_9VIRU/164-250    AC A0A168MGI1.1
#=GS A0A075E1E0_9VIRU/352-463    AC A0A075E1E0.1
#=GS A0A147E9Q6_9MICC/252-352    AC A0A147E9Q6.1
#=GS MREP_FBNY2/176-269          AC O39828.1
#=GS S5TNC2_9CIRC/58-142         AC S5TNC2.1
#=GS E9L812_MEGR1/1720-1823      AC E9L812.1
#=GS A0A2D1SX81_9BACL/204-279    AC A0A2D1SX81.1
#=GS A0A0D3MDR3_9CIRC/293-382    AC A0A0D3MDR3.1
#=GS A0A0C3A5R9_9AGAM/1-45       AC A0A0C3A5R9.1
#=GS A0A1L3KJE4_9VIRU/348-460    AC A0A1L3KJE4.1
#=GS A0A190WHJ9_9CIRC/162-248    AC A0A190WHJ9.1
#=GS A0A1L3KJ60_9VIRU/375-485    AC A0A1L3KJ60.1
#=GS A4VUP1_STRSY/229-304        AC A4VUP1.1
#=GS A0A126GA74_9VIRU/188-290    AC A0A126GA74.1
#=GS A0A182EY76_ONCOC/137-223    AC A0A182EY76.1
#=GS A0A1L3KM71_9VIRU/1520-1627  AC A0A1L3KM71.1
#=GS A0A126G9T2_9VIRU/149-234    AC A0A126G9T2.1
#=GS A0A1L3KJF9_9VIRU/1600-1705  AC A0A1L3KJF9.1
#=GS A0A1L3KMB5_9VIRU/351-454    AC A0A1L3KMB5.1
#=GS A0A0C5I2K0_9CIRC/183-267    AC A0A0C5I2K0.1
#=GS X2FKI7_SIVA1/1810-1913      AC X2FKI7.1
#=GS Q0ZQM1_DHAV/1296-1395       AC Q0ZQM1.1
#=GS S5TMY4_9CIRC/158-244        AC S5TMY4.1
#=GS A0A1L3KLT9_9VIRU/943-1042   AC A0A1L3KLT9.1
#=GS POLG_FCVUR/480-576          AC Q66914.1
#=GS A0A023AVY8_GRENI/28-112     AC A0A023AVY8.1
#=GS A0A1Y1V4C8_9FUNG/18-128     AC A0A1Y1V4C8.1
#=GS A0A0B4UI27_9VIRU/174-264    AC A0A0B4UI27.1
#=GS A0A397VXI5_9GLOM/246-338    AC A0A397VXI5.1
#=GS A0A126G9J8_9VIRU/180-266    AC A0A126G9J8.1
#=GS POLG_POL1M/1252-1351        AC P03300.3
#=GS POLG_POL1M/1252-1351        DR PDB; 5Z3Q D; 125-224;
#=GS POLG_POL1M/1252-1351        DR PDB; 5Z3Q A; 125-223;
#=GS POLG_POL1M/1252-1351        DR PDB; 5Z3Q H; 125-220;
#=GS POLG_POL1M/1252-1351        DR PDB; 5Z3Q C; 125-223;
#=GS POLG_POL1M/1252-1351        DR PDB; 5Z3Q B; 125-224;
#=GS POLG_POL1M/1252-1351        DR PDB; 5Z3Q E; 125-224;
#=GS R9N3N9_9FIRM/209-299        AC R9N3N9.1
#=GS A0A1L3KHB2_9VIRU/748-866    AC A0A1L3KHB2.1
#=GS A0A1L3KM94_9VIRU/402-515    AC A0A1L3KM94.1
#=GS A0A0B4UI40_9VIRU/150-236    AC A0A0B4UI40.1
#=GS A0A0F3GQE1_9BACT/164-284    AC A0A0F3GQE1.1
#=GS A0A346BPD8_9VIRU/211-261    AC A0A346BPD8.1
#=GS A0A1L3KMG1_9VIRU/1083-1184  AC A0A1L3KMG1.1
#=GS C6GII2_9VIRU/156-246        AC C6GII2.1
#=GS A0A410PUF5_9FIRM/4-99       AC A0A410PUF5.1
#=GS S5TMX4_9CIRC/162-248        AC S5TMX4.1
#=GS A0A1L3KHA7_9VIRU/885-986    AC A0A1L3KHA7.1
#=GS A0A2S6CQF6_9CYAN/250-348    AC A0A2S6CQF6.1
#=GS A0A220IGC1_9CIRC/176-237    AC A0A220IGC1.1
#=GS A0A0C5IAW1_9CIRC/159-231    AC A0A0C5IAW1.1
#=GS A0A1L3KMM7_9VIRU/321-431    AC A0A1L3KMM7.1
#=GS A0A1L3KMD9_9VIRU/813-930    AC A0A1L3KMD9.1
#=GS A0A1L3KHE4_9VIRU/642-750    AC A0A1L3KHE4.1
#=GS A0A1L3KHQ2_9VIRU/586-696    AC A0A1L3KHQ2.1
#=GS A0A498NTT0_LABRO/155-236    AC A0A498NTT0.1
#=GS A0A1Y1WSA8_9FUNG/173-281    AC A0A1Y1WSA8.1
#=GS A0A1L3KJ85_9VIRU/464-574    AC A0A1L3KJ85.1
#=GS A0A1L3KNN9_9VIRU/487-599    AC A0A1L3KNN9.1
#=GS A0A1S6QCC4_9CIRC/96-183     AC A0A1S6QCC4.1
#=GS A0A0C5IBL9_9CIRC/165-255    AC A0A0C5IBL9.1
#=GS A0A1L3KHA1_9VIRU/926-1030   AC A0A1L3KHA1.1
#=GS A0A397VTU7_9GLOM/240-335    AC A0A397VTU7.1
#=GS A0A0F7KIK0_9VIRU/416-518    AC A0A0F7KIK0.1
#=GS A0A0C5IMJ1_9CIRC/159-248    AC A0A0C5IMJ1.1
#=GS A0A1L3KM73_9VIRU/1656-1761  AC A0A1L3KM73.1
#=GS A0A1L3KNV1_9VIRU/1549-1653  AC A0A1L3KNV1.1
#=GS A5H1G3_9VIRU/181-277        AC A5H1G3.1
#=GS A0A1L3KNI2_9VIRU/367-486    AC A0A1L3KNI2.1
#=GS A0A140DLX1_9VIRU/267-375    AC A0A140DLX1.1
#=GS REP7_FBNY1/168-266          AC Q9WIK0.1
#=GS A0A023AW01_GRENI/51-135     AC A0A023AW01.1
#=GS A0A1L3KJ69_9VIRU/510-619    AC A0A1L3KJ69.1
#=GS A0A1L3KHK8_9VIRU/188-295    AC A0A1L3KHK8.1
#=GS A0A1L3KIY0_9VIRU/371-487    AC A0A1L3KIY0.1
#=GS S5TNA9_9CIRC/178-263        AC S5TNA9.1
#=GS A0A346BPA0_9VIRU/150-236    AC A0A346BPA0.1
#=GS V9TRN4_9VIRU/176-269        AC V9TRN4.1
#=GS A0A1L3KM35_9VIRU/638-744    AC A0A1L3KM35.1
#=GS A0A1L3KMA5_9VIRU/698-805    AC A0A1L3KMA5.1
#=GS A0A1L3KHR0_9VIRU/313-425    AC A0A1L3KHR0.1
#=GS A0A1P8YT73_9VIRU/304-404    AC A0A1P8YT73.1
#=GS A0A1L3KJH2_9VIRU/467-568    AC A0A1L3KJH2.1
#=GS MREP_BBTVA/176-269          AC Q86567.1
#=GS T2BA54_9PICO/1185-1298      AC T2BA54.1
#=GS A0A4Q1INF6_9FLAO/83-175     AC A0A4Q1INF6.1
#=GS F7K887_9FIRM/197-291        AC F7K887.1
#=GS POLG_AIVA8/1444-1547        AC O91464.2
#=GS A0A1L3KH27_9VIRU/445-555    AC A0A1L3KH27.1
#=GS A0A1Y3WZ50_9FIRM/215-308    AC A0A1Y3WZ50.1
#=GS A0A220IGS6_9VIRU/939-1044   AC A0A220IGS6.1
#=GS REP6_SCSVF/171-268          AC Q87013.1
#=GS A0A1L3KHK9_9VIRU/527-642    AC A0A1L3KHK9.1
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#=GS A0A2G2YW30_CAPAN/59-102     AC A0A2G2YW30.1
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#=GS W5ZLF9_9CIRC/162-251        AC W5ZLF9.1
#=GS A0A1L3KNK6_9VIRU/439-551    AC A0A1L3KNK6.1
#=GS A0A1L3KHQ8_9VIRU/593-707    AC A0A1L3KHQ8.1
#=GS A0A1L3KM33_9VIRU/408-514    AC A0A1L3KM33.1
#=GS D4N3P0_9CIRC/163-252        AC D4N3P0.1
#=GS A0A387BIT1_9LACT/250-353    AC A0A387BIT1.1
#=GS A0A1L3KH82_9VIRU/510-626    AC A0A1L3KH82.1
#=GS A0A1L3KNQ7_9VIRU/291-393    AC A0A1L3KNQ7.1
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#=GS REP7_FBNY2/168-266          AC O91250.1
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#=GS A0A1L3KM88_9VIRU/355-468    AC A0A1L3KM88.1
#=GS A0A075IZM2_9VIRU/177-269    AC A0A075IZM2.1
#=GS D8M4F4_BLAHO/364-454        AC D8M4F4.1
#=GS A0A1L3KNW8_9VIRU/524-643    AC A0A1L3KNW8.1
#=GS A0A140AQK0_9VIRU/194-286    AC A0A140AQK0.1
#=GS E6Z7X4_9VIRU/174-271        AC E6Z7X4.1
#=GS A0A140CTT8_9VIRU/167-257    AC A0A140CTT8.1
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#=GS POLG_NVN68/556-658          AC Q83883.1
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#=GS A0A1L3KHB9_9VIRU/1588-1699  AC A0A1L3KHB9.1
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#=GS A0A1L3KNG0_9VIRU/376-486    AC A0A1L3KNG0.1
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#=GS A0A397JRU4_9GLOM/88-169     AC A0A397JRU4.1
#=GS A0A140AQN3_9VIRU/162-219    AC A0A140AQN3.1
#=GS C6GIH7_9VIRU/204-299        AC C6GIH7.1
#=GS A0A1L3KMG9_9VIRU/339-449    AC A0A1L3KMG9.1
#=GS A0A220IGS0_9CIRC/175-261    AC A0A220IGS0.1
#=GS A0A182ETG9_ONCOC/187-273    AC A0A182ETG9.1
#=GS E3NK77_CAERE/10-128         AC E3NK77.1
#=GS REP9_FBNY1/168-264          AC P0CK60.1
#=GS A0A2G5SAG9_9PELO/1-119      AC A0A2G5SAG9.1
#=GS A0A1L3KKN0_9VIRU/1507-1614  AC A0A1L3KKN0.1
#=GS R7MMS0_9FIRM/179-268        AC R7MMS0.1
#=GS A0A1L3KKP4_9VIRU/1713-1820  AC A0A1L3KKP4.1
#=GS A8D7N3_AQUAV/1041-1140      AC A8D7N3.1
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#=GS A0A140DLX0_9VIRU/110-220    AC A0A140DLX0.1
#=GS A0A1L3KNN3_9VIRU/957-1066   AC A0A1L3KNN3.1
#=GS A0A1L3KKY8_9VIRU/1420-1528  AC A0A1L3KKY8.1
#=GS POLG_RTSVA/1773-1879        AC Q83034.1
#=GS A0A0A0YPN0_9CIRC/151-237    AC A0A0A0YPN0.1
#=GS A0A1L3KME0_9VIRU/582-697    AC A0A1L3KME0.1
#=GS A0A1L3KNL7_9VIRU/497-610    AC A0A1L3KNL7.1
#=GS A0A1L3KH17_9VIRU/1067-1170  AC A0A1L3KH17.1
#=GS POLG_EMCVR/1309-1410        AC Q66765.1
#=GS REP2_SCSVF/168-263          AC Q87009.1
#=GS A0A1L3KM99_9VIRU/313-429    AC A0A1L3KM99.1
#=GS A0A1S6KEN3_9VIRU/170-264    AC A0A1S6KEN3.1
#=GS D9YV26_OSCV1/1269-1372      AC D9YV26.1
#=GS POL_SINV3/392-498           AC C1JCT1.1
#=GS A0A3G2CHS8_9CIRC/171-257    AC A0A3G2CHS8.1
#=GS A0A238BZJ3_9BILA/252-334    AC A0A238BZJ3.1
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