GenomeNet

Database: Pfam
Entry: RNA_helicase
LinkDB: RNA_helicase
Original site: RNA_helicase 
#=GF ID   RNA_helicase
#=GF AC   PF00910.22
#=GF DE   RNA helicase
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE   Pfam-B_11 (release 3.0)
#=GF GA   21.50 21.50;
#=GF TC   21.50 21.50;
#=GF NC   21.40 21.40;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   2546125
#=GF RT   Two related superfamilies of putative helicases involved in
#=GF RT   replication, recombination, repair and expression of DNA and RNA
#=GF RT   genomes. 
#=GF RA   Gorbalenya AE, Koonin EV, Donchenko AP, Blinov VM; 
#=GF RL   Nucleic Acids Res 1989;17:4713-4730.
#=GF DR   INTERPRO; IPR000605;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   This family includes RNA helicases thought to be involved in
#=GF CC   duplex unwinding during viral RNA replication. Members of this
#=GF CC   family are found in a variety of single stranded RNA viruses.
#=GF SQ   867
#=GS A0A1L3KKH1_9VIRU/1139-1248  AC A0A1L3KKH1.1
#=GS A0A1L3KHF3_9VIRU/369-479    AC A0A1L3KHF3.1
#=GS D9YV24_PASVA/1405-1508      AC D9YV24.1
#=GS A0A1L3KJH8_9VIRU/485-595    AC A0A1L3KJH8.1
#=GS A0A1L3KKR0_9VIRU/463-569    AC A0A1L3KKR0.1
#=GS A0A1L3KM96_9VIRU/497-611    AC A0A1L3KM96.1
#=GS A0A1L3KL07_9VIRU/637-744    AC A0A1L3KL07.1
#=GS A0A1L3KNP6_9VIRU/625-735    AC A0A1L3KNP6.1
#=GS A0A1Y1UZ29_9FUNG/111-215    AC A0A1Y1UZ29.1
#=GS A0A023AX31_GRENI/154-238    AC A0A023AX31.1
#=GS A0A0B6VHZ4_9VIRU/404-515    AC A0A0B6VHZ4.1
#=GS A0A0C5IAV0_9CIRC/161-246    AC A0A0C5IAV0.1
#=GS A0A1L3KKQ5_9VIRU/509-616    AC A0A1L3KKQ5.1
#=GS A0A126G8I2_9VIRU/182-269    AC A0A126G8I2.1
#=GS A0A1L3KKS2_9VIRU/587-699    AC A0A1L3KKS2.1
#=GS E8JIY2_9ACTO/252-352        AC E8JIY2.1
#=GS A0A140AQQ0_9VIRU/162-250    AC A0A140AQQ0.1
#=GS A0A1L3KM49_9VIRU/1061-1166  AC A0A1L3KM49.1
#=GS A0A1L3KKT2_9VIRU/1571-1681  AC A0A1L3KKT2.1
#=GS A0A145PS86_9VIRU/170-264    AC A0A145PS86.1
#=GS A0A1L3KJ18_9VIRU/384-494    AC A0A1L3KJ18.1
#=GS A0A1L3KNP7_9VIRU/516-631    AC A0A1L3KNP7.1
#=GS A0A023B1R5_GRENI/300-384    AC A0A023B1R5.1
#=GS A0A1L3KM42_9VIRU/735-847    AC A0A1L3KM42.1
#=GS A0A1L3KKU5_9VIRU/1504-1612  AC A0A1L3KKU5.1
#=GS A0A1L3KH06_9VIRU/1443-1553  AC A0A1L3KH06.1
#=GS A0A1L3KMC0_9VIRU/1078-1201  AC A0A1L3KMC0.1
#=GS REP_PCV1C/167-254           AC Q805H4.1
#=GS A0A1L3KJF5_9VIRU/1505-1608  AC A0A1L3KJF5.1
#=GS A0A1L3KHJ4_9VIRU/717-829    AC A0A1L3KHJ4.1
#=GS A0A1L3KH56_9VIRU/364-474    AC A0A1L3KH56.1
#=GS A0A1L3KKX0_9VIRU/362-473    AC A0A1L3KKX0.1
#=GS A0A1L3KNR2_9VIRU/363-479    AC A0A1L3KNR2.1
#=GS A0A0N5D6Z0_THECL/92-178     AC A0A0N5D6Z0.1
#=GS A0A1Y1VDV5_9FUNG/126-221    AC A0A1Y1VDV5.1
#=GS W5ZKV0_9CIRC/162-251        AC W5ZKV0.1
#=GS R5WLG4_9FIRM/200-291        AC R5WLG4.1
#=GS A0A1L3KHF4_9VIRU/471-581    AC A0A1L3KHF4.1
#=GS A0A1Y4INC5_9FIRM/184-270    AC A0A1Y4INC5.1
#=GS A0A0C5I2I9_9CIRC/166-236    AC A0A0C5I2I9.1
#=GS A0A085MYE0_9BILA/196-281    AC A0A085MYE0.1
#=GS A0A0B4UFY0_9VIRU/158-242    AC A0A0B4UFY0.1
#=GS A0A0M9WAM5_9EURO/100-199    AC A0A0M9WAM5.1
#=GS A0A126GA43_9VIRU/161-246    AC A0A126GA43.1
#=GS REPP_ONYPE/200-291          AC Q8G8D1.1
#=GS A0A126GA36_9VIRU/163-250    AC A0A126GA36.1
#=GS A0A1L3KMR5_9VIRU/669-781    AC A0A1L3KMR5.1
#=GS A0A1L3KM26_9VIRU/477-598    AC A0A1L3KM26.1
#=GS POLG_HPE2W/1180-1280        AC O73556.1
#=GS A0A0B4UGX8_9VIRU/165-251    AC A0A0B4UGX8.1
#=GS A0A161IBA2_9VIRU/148-233    AC A0A161IBA2.1
#=GS A0A1Y1UHG9_9FUNG/130-234    AC A0A1Y1UHG9.1
#=GS A0A1L3KM05_9VIRU/558-670    AC A0A1L3KM05.1
#=GS A0A044RV77_ONCVO/181-267    AC A0A044RV77.2
#=GS A0A044RKA0_ONCVO/184-270    AC A0A044RKA0.2
#=GS A0A1L3KKM8_9VIRU/746-851    AC A0A1L3KKM8.1
#=GS A0A1L3KMC7_9VIRU/1354-1454  AC A0A1L3KMC7.1
#=GS A0A168MFT2_9VIRU/178-269    AC A0A168MFT2.1
#=GS A0A1L3KJ27_9VIRU/342-454    AC A0A1L3KJ27.1
#=GS A0A1L3KKU1_9VIRU/290-392    AC A0A1L3KKU1.1
#=GS A0A1L3KME4_9VIRU/813-917    AC A0A1L3KME4.1
#=GS W4EN49_9BACL/204-279        AC W4EN49.1
#=GS V9TQB9_9VIRU/169-264        AC V9TQB9.1
#=GS A0A220IGT1_9VIRU/1012-1117  AC A0A220IGT1.1
#=GS A0A2G5SFE7_9PELO/9-127      AC A0A2G5SFE7.1
#=GS A0A1L3KJ47_9VIRU/290-394    AC A0A1L3KJ47.1
#=GS A0A1L3KHH5_9VIRU/347-457    AC A0A1L3KHH5.1
#=GS A0A1L3KMP1_9VIRU/290-400    AC A0A1L3KMP1.1
#=GS A0A1L3KNR3_9VIRU/527-643    AC A0A1L3KNR3.1
#=GS A0A1L3KL23_9VIRU/522-634    AC A0A1L3KL23.1
#=GS A0A2A5RKQ6_9LACT/11-110     AC A0A2A5RKQ6.1
#=GS G7H0A3_9ACTN/249-346        AC G7H0A3.1
#=GS A0A238X5W5_9FLAO/83-178     AC A0A238X5W5.1
#=GS G0P5Q4_CAEBE/9-128          AC G0P5Q4.1
#=GS G0HA06_CORVD/252-352        AC G0HA06.1
#=GS A0A1L3KJM7_9VIRU/623-727    AC A0A1L3KJM7.1
#=GS A0A1L3KH05_9VIRU/534-648    AC A0A1L3KH05.1
#=GS R9M1R5_9FIRM/82-174         AC R9M1R5.1
#=GS A0A1Y3SC49_9FIRM/180-272    AC A0A1Y3SC49.1
#=GS A0A1L3KHG5_9VIRU/400-511    AC A0A1L3KHG5.1
#=GS D4N3Q8_9CIRC/172-259        AC D4N3Q8.1
#=GS A0A075E1E0_9VIRU/352-463    AC A0A075E1E0.1
#=GS A0A147E9Q6_9MICC/252-352    AC A0A147E9Q6.1
#=GS MREP_FBNY2/176-269          AC O39828.1
#=GS S5TNC2_9CIRC/58-142         AC S5TNC2.1
#=GS E9L812_MEGR1/1720-1823      AC E9L812.1
#=GS A0A2D1SX81_9BACL/204-279    AC A0A2D1SX81.1
#=GS A0A0C3A5R9_9HOMO/1-45       AC A0A0C3A5R9.1
#=GS A0A1L3KJE4_9VIRU/348-460    AC A0A1L3KJE4.1
#=GS A0A1L3KJ60_9VIRU/375-485    AC A0A1L3KJ60.1
#=GS A4VUP1_STRSY/229-304        AC A4VUP1.1
#=GS A0A126GA74_9VIRU/188-290    AC A0A126GA74.1
#=GS A0A182EY76_ONCOC/137-223    AC A0A182EY76.1
#=GS A0A1L3KM71_9VIRU/1520-1627  AC A0A1L3KM71.1
#=GS A0A126G9T2_9VIRU/149-234    AC A0A126G9T2.1
#=GS A0A1L3KJF9_9VIRU/1600-1705  AC A0A1L3KJF9.1
#=GS A0A1L3KMB5_9VIRU/351-454    AC A0A1L3KMB5.1
#=GS A0A0C5I2K0_9CIRC/183-267    AC A0A0C5I2K0.1
#=GS X2FKI7_9PICO/1810-1913      AC X2FKI7.1
#=GS Q0ZQM1_DHAV/1296-1395       AC Q0ZQM1.1
#=GS S5TMY4_9CIRC/158-244        AC S5TMY4.1
#=GS A0A1L3KLT9_9VIRU/943-1042   AC A0A1L3KLT9.1
#=GS POLG_FCVUR/480-576          AC Q66914.1
#=GS A0A023AVY8_GRENI/28-112     AC A0A023AVY8.1
#=GS A0A1Y1V4C8_9FUNG/18-128     AC A0A1Y1V4C8.1
#=GS A0A220QTG2_9VIRU/743-847    AC A0A220QTG2.1
#=GS A0A126G9J8_9VIRU/180-266    AC A0A126G9J8.1
#=GS POLG_POL1M/1252-1351        AC P03300.3
#=GS R9N3N9_9FIRM/209-299        AC R9N3N9.1
#=GS A0A1L3KHB2_9VIRU/748-866    AC A0A1L3KHB2.1
#=GS A0A1L3KM94_9VIRU/402-515    AC A0A1L3KM94.1
#=GS A0A0F3GQE1_9BACT/164-284    AC A0A0F3GQE1.1
#=GS A0A1L3KMG1_9VIRU/1083-1184  AC A0A1L3KMG1.1
#=GS C6GII2_9VIRU/156-246        AC C6GII2.1
#=GS S5TMX4_9CIRC/162-248        AC S5TMX4.1
#=GS A0A1L3KHA7_9VIRU/885-986    AC A0A1L3KHA7.1
#=GS A0A220IGC1_9CIRC/176-237    AC A0A220IGC1.1
#=GS A0A0C5IAW1_9CIRC/159-231    AC A0A0C5IAW1.1
#=GS U5XVC1_9VIRU/171-267        AC U5XVC1.1
#=GS A0A1L3KMM7_9VIRU/321-431    AC A0A1L3KMM7.1
#=GS A0A1L3KMD9_9VIRU/813-930    AC A0A1L3KMD9.1
#=GS A0A1L3KHE4_9VIRU/642-750    AC A0A1L3KHE4.1
#=GS A0A1L3KHQ2_9VIRU/586-696    AC A0A1L3KHQ2.1
#=GS A0A1Y1WSA8_9FUNG/173-281    AC A0A1Y1WSA8.1
#=GS D4N3N8_9CIRC/161-250        AC D4N3N8.1
#=GS A0A1L3KJ85_9VIRU/464-574    AC A0A1L3KJ85.1
#=GS A0A1L3KNN9_9VIRU/487-599    AC A0A1L3KNN9.1
#=GS A0A1L3KKT0_9VIRU/899-1003   AC A0A1L3KKT0.1
#=GS A0A1S6QCC4_9CIRC/96-183     AC A0A1S6QCC4.1
#=GS A0A0C5IBL9_9CIRC/165-255    AC A0A0C5IBL9.1
#=GS A0A1L3KHA1_9VIRU/926-1030   AC A0A1L3KHA1.1
#=GS A0A0D3MCT8_9CIRC/168-254    AC A0A0D3MCT8.1
#=GS A0A1P8JPQ1_9VIRU/181-277    AC A0A1P8JPQ1.1
#=GS A0A0F7KIK0_9VIRU/416-518    AC A0A0F7KIK0.1
#=GS A0A0C5IMJ1_9CIRC/159-248    AC A0A0C5IMJ1.1
#=GS A0A1L3KM73_9VIRU/1656-1761  AC A0A1L3KM73.1
#=GS A0A1L3KNV1_9VIRU/1549-1653  AC A0A1L3KNV1.1
#=GS A0A1L3KNI2_9VIRU/367-486    AC A0A1L3KNI2.1
#=GS A0A140DLX1_9VIRU/267-375    AC A0A140DLX1.1
#=GS A0A023AW01_GRENI/51-135     AC A0A023AW01.1
#=GS A0A1L3KJ69_9VIRU/510-619    AC A0A1L3KJ69.1
#=GS A0A1L3KHK8_9VIRU/188-295    AC A0A1L3KHK8.1
#=GS A0A1L3KIY0_9VIRU/371-487    AC A0A1L3KIY0.1
#=GS S5TNA9_9CIRC/178-263        AC S5TNA9.1
#=GS V9TRN4_9VIRU/176-269        AC V9TRN4.1
#=GS A0A1L3KM35_9VIRU/638-744    AC A0A1L3KM35.1
#=GS A0A1L3KMA5_9VIRU/698-805    AC A0A1L3KMA5.1
#=GS A0A1L3KHR0_9VIRU/313-425    AC A0A1L3KHR0.1
#=GS A0A1P8YT73_9VIRU/304-404    AC A0A1P8YT73.1
#=GS A0A1L3KJH2_9VIRU/467-568    AC A0A1L3KJH2.1
#=GS MREP_BBTVA/176-269          AC Q86567.1
#=GS T2BA54_9PICO/1185-1298      AC T2BA54.1
#=GS F7K887_9FIRM/197-291        AC F7K887.1
#=GS B0YPT4_9CIRC/164-249        AC B0YPT4.1
#=GS A0A1L3KH27_9VIRU/445-555    AC A0A1L3KH27.1
#=GS A0A0E3Z3S0_9CIRC/162-246    AC A0A0E3Z3S0.1
#=GS A0A1Y3WZ50_9FIRM/215-308    AC A0A1Y3WZ50.1
#=GS REP6_SCSVF/171-268          AC Q87013.1
#=GS A0A1L3KHK9_9VIRU/527-642    AC A0A1L3KHK9.1
#=GS A0A1H2TWB3_9FLAO/83-189     AC A0A1H2TWB3.1
#=GS A0A2G2YW30_CAPAN/59-102     AC A0A2G2YW30.1
#=GS A0A1L3KNI6_9VIRU/638-755    AC A0A1L3KNI6.1
#=GS W5U7R2_9VIRU/161-257        AC W5U7R2.1
#=GS A0A1L3KJ66_9VIRU/1328-1437  AC A0A1L3KJ66.1
#=GS A0A1L3KH94_9VIRU/395-507    AC A0A1L3KH94.1
#=GS A0A1L3KMA8_9VIRU/390-501    AC A0A1L3KMA8.1
#=GS A0A1L3KMJ8_9VIRU/426-539    AC A0A1L3KMJ8.1
#=GS A0A1L3KNC3_9VIRU/584-696    AC A0A1L3KNC3.1
#=GS C6GIH4_9VIRU/167-256        AC C6GIH4.1
#=GS V9TP85_9VIRU/166-261        AC V9TP85.1
#=GS S5TMX6_9CIRC/167-259        AC S5TMX6.1
#=GS A0A1L3KNQ5_9VIRU/500-612    AC A0A1L3KNQ5.1
#=GS C6GIH9_9VIRU/156-242        AC C6GIH9.1
#=GS A0A1L3KLY8_9VIRU/402-504    AC A0A1L3KLY8.1
#=GS A0A023B1R5_GRENI/172-256    AC A0A023B1R5.1
#=GS POL1_BBWVS/483-586          AC Q76L40.1
#=GS A0A1L3KM36_9VIRU/1135-1246  AC A0A1L3KM36.1
#=GS A0A1L3KM93_9VIRU/1615-1720  AC A0A1L3KM93.1
#=GS A0A1L3KM76_9VIRU/345-456    AC A0A1L3KM76.1
#=GS S5SY31_9CIRC/150-236        AC S5SY31.1
#=GS F7UX42_EEGSY/177-267        AC F7UX42.1
#=GS A0A1L3KNS1_9VIRU/399-511    AC A0A1L3KNS1.1
#=GS U5HH03_USTV1/27-107         AC U5HH03.1
#=GS Q9DLK1_FMDVP/1213-1315      AC Q9DLK1.1
#=GS W7JYR0_PLAFO/18-107         AC W7JYR0.1
#=GS A0A1N7TEH5_9CIRC/105-194    AC A0A1N7TEH5.1
#=GS A0A190WHD0_9CIRC/174-263    AC A0A190WHD0.1
#=GS A0A1I3STQ7_9FLAO/88-195     AC A0A1I3STQ7.1
#=GS POL1_TORVR/792-895          AC P29150.2
#=GS A0A1L3KNL5_9VIRU/1475-1585  AC A0A1L3KNL5.1
#=GS A0A1L3KMA0_9VIRU/582-695    AC A0A1L3KMA0.1
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#=GS A0A1L3KLV8_9VIRU/1552-1657  AC A0A1L3KLV8.1
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#=GS POLG_VESVA/586-682          AC Q9DUN3.1
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#=GS REP7_FBNY2/168-266          AC O91250.1
#=GS POLG_HRV8A/1223-1320        AC P07210.3
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#=GS POL1_CPMVS/490-593          AC P03600.1
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#=GS A0A140AQK0_9VIRU/194-286    AC A0A140AQK0.1
#=GS A0A140AQI4_9VIRU/153-239    AC A0A140AQI4.1
#=GS A0A0B4UH90_9VIRU/219-311    AC A0A0B4UH90.1
#=GS I3VR62_MISV1/1272-1373      AC I3VR62.1
#=GS A0A1L3KHE2_9VIRU/524-650    AC A0A1L3KHE2.1
#=GS A0A1L3KH86_9VIRU/523-638    AC A0A1L3KH86.1
#=GS G0PF15_CAEBE/9-127          AC G0PF15.1
#=GS A0A1L3KH64_9VIRU/458-581    AC A0A1L3KH64.1
#=GS C8PV43_9PROT/36-147         AC C8PV43.1
#=GS A0A1L3KME2_9VIRU/598-714    AC A0A1L3KME2.1
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