GenomeNet

Database: Pfam
Entry: RVP_2
LinkDB: RVP_2
Original site: RVP_2 
#=GF ID   RVP_2
#=GF AC   PF08284.11
#=GF DE   Retroviral aspartyl protease
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE   Pfam-B_
#=GF GA   20.30 20.30;
#=GF TC   20.30 20.30;
#=GF NC   20.20 20.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   Single domain aspartyl proteases from retroviruses,
#=GF CC   retrotransposons, and badnaviruses (plant dsDNA viruses). These
#=GF CC   proteases are generally part of a larger polyprotein; usually
#=GF CC   pol, more rarely gag. Retroviral proteases appear to be
#=GF CC   homologous to a single domain of the two-domain eukaryotic
#=GF CC   aspartyl proteases.
#=GF SQ   3777
#=GS A0A1S2XEU5_CICAR/377-489    AC A0A1S2XEU5.1
#=GS A0A2I4HKJ3_9ROSI/179-259    AC A0A2I4HKJ3.1
#=GS A0A151QYY3_CAJCA/1-52       AC A0A151QYY3.1
#=GS A0A0K0G3I8_9BILA/95-229     AC A0A0K0G3I8.1
#=GS M5C3X7_THACB/432-566        AC M5C3X7.1
#=GS A0A284QXX3_9AGAR/244-377    AC A0A284QXX3.1
#=GS A0A1U7X1W1_NICSY/104-203    AC A0A1U7X1W1.1
#=GS A0A1J6HYJ3_NICAT/219-336    AC A0A1J6HYJ3.1
#=GS A0A0C9VBT2_9HOMO/175-288    AC A0A0C9VBT2.1
#=GS A0A284R7Z9_9AGAR/492-611    AC A0A284R7Z9.1
#=GS A0A1Q3AT45_CEPFO/111-232    AC A0A1Q3AT45.1
#=GS A0A2G2XMX6_CAPBA/810-910    AC A0A2G2XMX6.1
#=GS A0A1S2Y593_CICAR/456-572    AC A0A1S2Y593.1
#=GS E2M055_MONPE/1-105          AC E2M055.1
#=GS G4ZJN9_PHYSP/100-170        AC G4ZJN9.1
#=GS A0A1U8NPW6_GOSHI/66-200     AC A0A1U8NPW6.1
#=GS A0A1S4BXE0_TOBAC/346-450    AC A0A1S4BXE0.1
#=GS A0A251S8Y3_HELAN/1-114      AC A0A251S8Y3.1
#=GS K5WRN7_AGABU/1-85           AC K5WRN7.1
#=GS F8PXG2_SERL3/81-192         AC F8PXG2.1
#=GS H3H3U6_PHYRM/309-389        AC H3H3U6.1
#=GS A0A1U8KNH0_GOSHI/182-273    AC A0A1U8KNH0.1
#=GS A0A1U8PXS9_GOSHI/269-340    AC A0A1U8PXS9.1
#=GS A0A067PGJ8_9HOMO/359-473    AC A0A067PGJ8.1
#=GS G4THH4_SERID/1108-1233      AC G4THH4.1
#=GS F8Q2V8_SERL3/12-125         AC F8Q2V8.1
#=GS A0A1Q3AP78_CEPFO/57-167     AC A0A1Q3AP78.1
#=GS A0A1S2Z847_CICAR/43-136     AC A0A1S2Z847.1
#=GS V2WM62_MONRO/401-514        AC V2WM62.1
#=GS A0A151SF10_CAJCA/241-355    AC A0A151SF10.1
#=GS A0A0L0UQ51_9BASI/21-130     AC A0A0L0UQ51.1
#=GS A0A1R3I9T4_COCAP/314-400    AC A0A1R3I9T4.1
#=GS A0A0D0B2N1_9HOMO/46-164     AC A0A0D0B2N1.1
#=GS A0A284RZ66_9AGAR/1294-1410  AC A0A284RZ66.1
#=GS A0A284REQ0_9AGAR/156-273    AC A0A284REQ0.1
#=GS L8GAB7_PSED2/353-489        AC L8GAB7.1
#=GS A0A151QP33_CAJCA/241-376    AC A0A151QP33.1
#=GS A0A284S5T4_9AGAR/971-1106   AC A0A284S5T4.1
#=GS A0A1U8MVE8_GOSHI/19-95      AC A0A1U8MVE8.1
#=GS A0A0W0GE73_9AGAR/13-125     AC A0A0W0GE73.1
#=GS A0A0B7N9T5_9FUNG/466-574    AC A0A0B7N9T5.1
#=GS A0A1Q3CII7_CEPFO/3-112      AC A0A1Q3CII7.1
#=GS V2WJS4_MONRO/1-104          AC V2WJS4.1
#=GS M5C4K0_THACB/6-116          AC M5C4K0.1
#=GS A0A0B4H1L7_9HYPO/3-119      AC A0A0B4H1L7.1
#=GS A0A151RTS6_CAJCA/177-287    AC A0A151RTS6.1
#=GS A0A151RG49_CAJCA/1-43       AC A0A151RG49.1
#=GS A0A225V4N0_9STRA/11-113     AC A0A225V4N0.1
#=GS A0A0D3A4Q3_BRAOL/139-254    AC A0A0D3A4Q3.1
#=GS A0A151UDB9_CAJCA/94-219     AC A0A151UDB9.1
#=GS A0A1C7N3F9_9FUNG/294-411    AC A0A1C7N3F9.1
#=GS M5CCK0_THACB/7-116          AC M5CCK0.1
#=GS A0A0W0FI80_9AGAR/31-140     AC A0A0W0FI80.1
#=GS A0A0W0FLQ0_9AGAR/27-140     AC A0A0W0FLQ0.1
#=GS A0A1Q3C1P5_CEPFO/1-99       AC A0A1Q3C1P5.1
#=GS A0A1S4CL10_TOBAC/293-428    AC A0A1S4CL10.1
#=GS H3GUE6_PHYRM/155-234        AC H3GUE6.1
#=GS A0A1U7WH14_NICSY/117-229    AC A0A1U7WH14.1
#=GS J3MDG5_ORYBR/335-443        AC J3MDG5.1
#=GS A0A251UAW3_HELAN/37-167     AC A0A251UAW3.1
#=GS M5BRS7_THACB/6-114          AC M5BRS7.1
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#=GS M5BZF3_THACB/381-506        AC M5BZF3.1
#=GS A0A251T4H4_HELAN/348-483    AC A0A251T4H4.1
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#=GS A0A1U8N4J5_GOSHI/235-366    AC A0A1U8N4J5.1
#=GS A0A087GAS3_ARAAL/377-498    AC A0A087GAS3.1
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#=GS A0A1W5CX52_9LECA/30-156     AC A0A1W5CX52.1
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#=GS V2WPT4_MONRO/17-125         AC V2WPT4.1
#=GS A0A087GGU6_ARAAL/105-227    AC A0A087GGU6.1
#=GS A0A1U7Y113_NICSY/410-544    AC A0A1U7Y113.1
#=GS A0A1U8HVV2_GOSHI/1-37       AC A0A1U8HVV2.1
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#=GS A0A1U7VVA5_NICSY/170-304    AC A0A1U7VVA5.1
#=GS A0A2I4FH83_9ROSI/239-350    AC A0A2I4FH83.1
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#=GS A0A1Q3D7R8_CEPFO/1-100      AC A0A1Q3D7R8.1
#=GS M1DF09_SOLTU/153-233        AC M1DF09.1
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#=GS A0A284S3F4_9AGAR/140-250    AC A0A284S3F4.1
#=GS A0A2H3X7W6_PHODC/244-298    AC A0A2H3X7W6.1
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#=GS A0A151R0X9_CAJCA/150-260    AC A0A151R0X9.1
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#=GS A0A1S4ADR7_TOBAC/184-289    AC A0A1S4ADR7.1
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#=GS A0A0C9V8H1_9HOMO/3-128      AC A0A0C9V8H1.1
#=GS A0A087HSH3_ARAAL/356-485    AC A0A087HSH3.1
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#=GS A0A0C3DRD9_9HOMO/46-177     AC A0A0C3DRD9.1
#=GS A0A1S3VTD0_VIGRR/319-396    AC A0A1S3VTD0.1
#=GS A0A093YUP7_9PEZI/1-104      AC A0A093YUP7.1
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#=GS V2W4Y4_MONRO/303-424        AC V2W4Y4.1
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#=GS A0A0W0GCE2_9AGAR/8-120      AC A0A0W0GCE2.1
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#=GS A0A061EE95_THECC/42-130     AC A0A061EE95.1
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#=GS A0A151QWW2_CAJCA/1-127      AC A0A151QWW2.1
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#=GS A0A1Y2C6I1_9FUNG/7-59       AC A0A1Y2C6I1.1
#=GS A0A1U7YL46_NICSY/177-253    AC A0A1U7YL46.1
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#=GS A0A1U8PMA2_GOSHI/98-158     AC A0A1U8PMA2.1
#=GS A0A2I4FL26_9ROSI/1-105      AC A0A2I4FL26.1
#=GS H9H5N7_MACMU/427-536        AC H9H5N7.2
#=GS V2XUL3_MONRO/9-120          AC V2XUL3.1
#=GS A0A151RF96_CAJCA/237-347    AC A0A151RF96.1
#=GS A0A151R0F7_CAJCA/1-112      AC A0A151R0F7.1
#=GS A0A1R1PP93_ZANCU/297-418    AC A0A1R1PP93.1
#=GS A0A151U998_CAJCA/146-281    AC A0A151U998.1
#=GS A0A1R3K9E3_9ROSI/67-168     AC A0A1R3K9E3.1
#=GS A0A2I4DQ39_9ROSI/372-483    AC A0A2I4DQ39.1
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#=GS W9R3H7_9ROSA/109-178        AC W9R3H7.1
#=GS A0A2I4ETF0_9ROSI/8-117      AC A0A2I4ETF0.1
#=GS A0A0C9T2D5_9HOMO/471-599    AC A0A0C9T2D5.1
#=GS A0A1S3XLI6_TOBAC/348-481    AC A0A1S3XLI6.1
#=GS A0A151V8B4_HYPMA/498-618    AC A0A151V8B4.1
#=GS A0A1S3TEX8_VIGRR/23-148     AC A0A1S3TEX8.1
#=GS W4JV27_9HOMO/1-103          AC W4JV27.1
#=GS A0A0D3BD31_BRAOL/407-480    AC A0A0D3BD31.1
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#=GS A0A0C3PG16_PISTI/8-124      AC A0A0C3PG16.1
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#=GS M5CHD6_THACB/390-489        AC M5CHD6.1
#=GS A0A0L9V4B0_PHAAN/411-539    AC A0A0L9V4B0.1
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#=GS A0A1Q3DF11_CEPFO/1-99       AC A0A1Q3DF11.1
#=GS A0A1S4BN64_TOBAC/288-366    AC A0A1S4BN64.1
#=GS F9GA28_FUSOF/1-103          AC F9GA28.1
#=GS A0A1R1XID0_9FUNG/1-81       AC A0A1R1XID0.1
#=GS A0A087HDE5_ARAAL/452-536    AC A0A087HDE5.1
#=GS A0A251SJJ2_HELAN/346-481    AC A0A251SJJ2.1
#=GS V2WPA8_MONRO/21-134         AC V2WPA8.1
#=GS A0A151RJS4_CAJCA/224-343    AC A0A151RJS4.1
#=GS A0A0C3E0E1_9HOMO/592-711    AC A0A0C3E0E1.1
#=GS A0A2I4GM39_9ROSI/403-518    AC A0A2I4GM39.1
#=GS A0A1S4CDP0_TOBAC/216-324    AC A0A1S4CDP0.1
#=GS A0A1U8N4T4_GOSHI/1-37       AC A0A1U8N4T4.1
#=GS A0A1Y3NF83_PIRSE/46-138     AC A0A1Y3NF83.1
#=GS A0A251UAL7_HELAN/1-127      AC A0A251UAL7.1
#=GS B9RY72_RICCO/37-165         AC B9RY72.1
#=GS A0A0C2SSY5_AMAMU/11-132     AC A0A0C2SSY5.1
#=GS A0A1U8L1S7_GOSHI/5-52       AC A0A1U8L1S7.1
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#=GS A0A015JY07_9GLOM/51-184     AC A0A015JY07.1
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#=GS K2SC82_MACPH/1-106          AC K2SC82.1
#=GS A0A1U7XWD8_NICSY/345-438    AC A0A1U7XWD8.1
#=GS A0A0W0GF26_9AGAR/8-120      AC A0A0W0GF26.1
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#=GS A0A087H8D5_ARAAL/359-480    AC A0A087H8D5.1
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#=GS A0A1S2XNN1_CICAR/9-118      AC A0A1S2XNN1.1
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#=GS A0A0C9YAB6_9AGAR/218-347    AC A0A0C9YAB6.1
#=GS A0A0W0F5P4_9AGAR/9-120      AC A0A0W0F5P4.1
#=GS K5WGC8_AGABU/1-88           AC K5WGC8.1
#=GS A0A284RD95_9AGAR/663-785    AC A0A284RD95.1
#=GS S9WA92_CAMFR/16-124         AC S9WA92.1
#=GS A0A0C2YKF2_9HOMO/19-128     AC A0A0C2YKF2.1
#=GS W4KJK6_9HOMO/6-125          AC W4KJK6.1
#=GS A0A1U8P8W6_GOSHI/158-254    AC A0A1U8P8W6.1
#=GS E2M036_MONPE/336-463        AC E2M036.1
#=GS A0A1Q3C6V7_CEPFO/2-105      AC A0A1Q3C6V7.1
#=GS J9L0Z4_ACYPI/369-488        AC J9L0Z4.2
#=GS A0A165P5E9_9HOMO/4-79       AC A0A165P5E9.1
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#=GS I2FX21_USTH4/323-437        AC I2FX21.1
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#=GS W2R9B2_PHYPN/2-109          AC W2R9B2.1
#=GS A0A151QVC3_CAJCA/1-132      AC A0A151QVC3.1
#=GS B8BKF4_ORYSI/88-220         AC B8BKF4.1
#=GS S9X4M8_CAMFR/1-103          AC S9X4M8.1
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#=GS A0A2C5WVS8_9PEZI/511-643    AC A0A2C5WVS8.1
#=GS A0A0P0W7K0_ORYSJ/397-529    AC A0A0P0W7K0.1
#=GS A0A1U7LJF1_9ASCO/171-287    AC A0A1U7LJF1.1
#=GS H3H215_PHYRM/331-411        AC H3H215.1
#=GS A0A2I4HPV7_9ROSI/366-484    AC A0A2I4HPV7.1
#=GS A0A1U7VPE8_NICSY/50-165     AC A0A1U7VPE8.1
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#=GS A0A284S8P0_9AGAR/335-447    AC A0A284S8P0.1
#=GS A0A0C3IJ34_PISTI/185-319    AC A0A0C3IJ34.1
#=GS A0A1S4CHB8_TOBAC/50-147     AC A0A1S4CHB8.1
#=GS A0A0D3ATN5_BRAOL/6-68       AC A0A0D3ATN5.1
#=GS V2WRL6_MONRO/13-125         AC V2WRL6.1
#=GS A0A0W0G2P0_9AGAR/9-120      AC A0A0W0G2P0.1
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#=GS U6LNX6_9EIME/107-216        AC U6LNX6.1
#=GS A0A251VCL3_HELAN/345-480    AC A0A251VCL3.1
#=GS A0A0C3NBJ1_PISTI/9-124      AC A0A0C3NBJ1.1
#=GS A0A1S3XZU0_TOBAC/334-469    AC A0A1S3XZU0.1
#=GS A0A1Q3C6B8_CEPFO/2-112      AC A0A1Q3C6B8.1
#=GS A0A0H2QYP6_9HOMO/13-81      AC A0A0H2QYP6.1
#=GS A0A1U7X115_NICSY/51-165     AC A0A1U7X115.1
#=GS A0A251UI76_HELAN/313-419    AC A0A251UI76.1
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#=GS A0A0N7KTK3_ORYSJ/32-162     AC A0A0N7KTK3.1
#=GS A0A1S2Z3R5_CICAR/28-161     AC A0A1S2Z3R5.1
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#=GS A0A1D5V8I3_WHEAT/229-343    AC A0A1D5V8I3.1
#=GS A0A284SBD4_9AGAR/6-120      AC A0A284SBD4.1
#=GS F4J487_ARATH/125-239        AC F4J487.1
#=GS A0A1S3DZG8_CICAR/85-219     AC A0A1S3DZG8.1
#=GS A0A1Q3AMF4_CEPFO/48-183     AC A0A1Q3AMF4.1
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#=GS A0A151UGT0_CAJCA/20-154     AC A0A151UGT0.1
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#=GS A0A0E0EV96_9ORYZ/344-435    AC A0A0E0EV96.1
#=GS U6N8N2_9EIME/322-430        AC U6N8N2.1
#=GS A0A0C9W454_9HOMO/399-486    AC A0A0C9W454.1
#=GS A0A1D6AI12_WHEAT/132-260    AC A0A1D6AI12.1
#=GS A0A2I4GHT2_9ROSI/295-387    AC A0A2I4GHT2.1
#=GS A0A2H3ZBC5_PHODC/115-229    AC A0A2H3ZBC5.1
#=GS A0A232EDI5_9HYME/12-135     AC A0A232EDI5.1
#=GS A0A0W0GBC2_9AGAR/238-350    AC A0A0W0GBC2.1
#=GS A0A1S3TBV0_VIGRR/339-461    AC A0A1S3TBV0.1
#=GS A0A1Q3D7R3_CEPFO/43-178     AC A0A1Q3D7R3.1
#=GS A0A1W5DBD2_9LECA/10-130     AC A0A1W5DBD2.1
#=GS A0A151QX87_CAJCA/235-275    AC A0A151QX87.1
#=GS V2WTG1_MONRO/14-125         AC V2WTG1.1
#=GS A0A1Q3BBS0_CEPFO/1-99       AC A0A1Q3BBS0.1
#=GS A0A067DB76_CITSI/334-442    AC A0A067DB76.1
#=GS A0A1Q3BHE7_CEPFO/44-179     AC A0A1Q3BHE7.1
#=GS V2WK55_MONRO/332-444        AC V2WK55.1
#=GS A0A1U8MR24_GOSHI/1-72       AC A0A1U8MR24.1
#=GS A0A1Q3AS80_CEPFO/58-193     AC A0A1Q3AS80.1
#=GS M1D9T4_SOLTU/185-283        AC M1D9T4.1
#=GS A0A151RWX2_CAJCA/301-403    AC A0A151RWX2.1
#=GS A0A284RXR4_9AGAR/14-120     AC A0A284RXR4.1
#=GS A0A0W0GD70_9AGAR/28-141     AC A0A0W0GD70.1
#=GS A0A151RH09_CAJCA/51-125     AC A0A151RH09.1
#=GS A0A286ULD4_9HOMO/23-138     AC A0A286ULD4.1
#=GS B7EMV3_ORYSJ/388-514        AC B7EMV3.1
#=GS A0A284RVK0_9AGAR/323-432    AC A0A284RVK0.1
#=GS A0A074S5L0_9HOMO/113-225    AC A0A074S5L0.1
#=GS M1DZR4_SOLTU/114-213        AC M1DZR4.1
#=GS A0A165PLW9_9HOMO/85-187     AC A0A165PLW9.1
#=GS A0A1R3KGV0_9ROSI/28-152     AC A0A1R3KGV0.1
#=GS H3H5W9_PHYRM/325-457        AC H3H5W9.1
#=GS A0A284RBW6_9AGAR/1309-1427  AC A0A284RBW6.1
#=GS M5CGK5_THACB/384-495        AC M5CGK5.1
#=GS A0A1S2Z444_CICAR/66-197     AC A0A1S2Z444.1
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#=GS A0A251S994_HELAN/1-127      AC A0A251S994.1
#=GS F8Q0V1_SERL3/122-231        AC F8Q0V1.1
#=GS A0A1S4A4G6_TOBAC/131-241    AC A0A1S4A4G6.1
#=GS A0A0C9SN50_PAXIN/6-109      AC A0A0C9SN50.1
#=GS M5CFA8_THACB/293-405        AC M5CFA8.1
#=GS A0A1U8PVC7_GOSHI/225-316    AC A0A1U8PVC7.1
#=GS U6MJI5_9EIME/110-220        AC U6MJI5.1
#=GS A0A0E0CZI5_9ORYZ/328-393    AC A0A0E0CZI5.1
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#=GS A0A1Q3C367_CEPFO/1-100      AC A0A1Q3C367.1
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#=GS A0A1U7YJV1_NICSY/112-241    AC A0A1U7YJV1.1
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