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Database: Pfam
Entry: Rhabdo_glycop
LinkDB: Rhabdo_glycop
Original site: Rhabdo_glycop 
#=GF ID   Rhabdo_glycop
#=GF AC   PF00974.18
#=GF DE   Rhabdovirus spike glycoprotein
#=GF PI   Rhabd_glycop;
#=GF AU   Finn RD;0000-0001-8626-2148
#=GF AU   Bateman A;0000-0002-6982-4660
#=GF SE   Pfam-B_167 (release 3.0)
#=GF GA   22.00 22.00;
#=GF TC   22.70 26.10;
#=GF NC   21.10 20.30;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   1660200
#=GF RT   Membrane fusion activity, oligomerization, and assembly of the
#=GF RT   rabies virus glycoprotein. 
#=GF RA   Whitt MA, Buonocore L, Prehaud C, Rose JK; 
#=GF RL   Virology 1991;185:681-688.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   9000093
#=GF RT   Low pH-induced pore formation by spike proteins of enveloped
#=GF RT   viruses. 
#=GF RA   Kasermann F, Kempf C; 
#=GF RL   J Gen Virol 1996;77:3025-3032.
#=GF DR   INTERPRO; IPR001903;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   Frequently abbreviated to G protein.  The glycoprotein spike is
#=GF CC   made up of a trimer of G proteins. Channel formed by
#=GF CC   glycoprotein spike is thought to function in a similar manner to
#=GF CC   Influenza virus M2 protein channel, thus allowing a signal to
#=GF CC   pass across the viral membrane to signal for viral uncoating.
#=GF SQ   125
#=GS A0A0B5KKB0_9RHAB/5-540    AC A0A0B5KKB0.1
#=GS A0A1L3KND6_9VIRU/5-511    AC A0A1L3KND6.1
#=GS A0A024A1N5_9RHAB/6-509    AC A0A024A1N5.1
#=GS A0A023T326_9RHAB/7-173    AC A0A023T326.1
#=GS K7XJ96_PRVF/7-515         AC K7XJ96.1
#=GS A0A0D3R1G5_9RHAB/106-645  AC A0A0D3R1G5.1
#=GS VGLN_BEFVB/228-435        AC P32596.1
#=GS A0A140D8K3_9RHAB/39-543   AC A0A140D8K3.1
#=GS A0A0D3R0Y9_9RHAB/7-540    AC A0A0D3R0Y9.1
#=GS E7D0U5_9RHAB/3-504        AC E7D0U5.1
#=GS A0A0B5KRE4_9RHAB/16-511   AC A0A0B5KRE4.1
#=GS Q88415_SVCVA/7-508        AC Q88415.1
#=GS W8R902_9RHAB/6-498        AC W8R902.1
#=GS A0A0D3R1E7_9RHAB/4-553    AC A0A0D3R1E7.1
#=GS GLYCO_CHAV/6-516          AC P13180.2
#=GS GLYCO_CHAV/6-516          DR PDB; 4D6W B; 1-416;
#=GS GLYCO_CHAV/6-516          DR PDB; 4D6W A; 1-415;
#=GS GLYCO_CHAV/6-516          DR PDB; 5MDM A; 1-410;
#=GS GLYCO_CHAV/6-516          DR PDB; 5MDM C; 1-405;
#=GS GLYCO_CHAV/6-516          DR PDB; 4D6W C; 1-413;
#=GS GLYCO_CHAV/6-516          DR PDB; 5MDM E; 1-410;
#=GS GLYCO_CHAV/6-516          DR PDB; 5MDM F; 1-405;
#=GS A0A0D3R120_9RHAB/6-405    AC A0A0D3R120.1
#=GS A0A140D8P6_9RHAB/21-539   AC A0A140D8P6.1
#=GS G1BWF2_9RHAB/5-198        AC G1BWF2.1
#=GS A0A0D3R131_9RHAB/6-551    AC A0A0D3R131.1
#=GS A0A0D3R1F2_9RHAB/49-375   AC A0A0D3R1F2.1
#=GS A0A0D3R1Y2_9RHAB/4-523    AC A0A0D3R1Y2.1
#=GS D8V085_9RHAB/6-624        AC D8V085.1
#=GS A0A0B5KRS6_9VIRU/5-515    AC A0A0B5KRS6.1
#=GS GLYCO_RABVP/6-503         AC P08667.1
#=GS A0A0B5KKA6_9RHAB/4-489    AC A0A0B5KKA6.1
#=GS A0A140D8K9_9RHAB/2-503    AC A0A140D8K9.1
#=GS A0A1L3KNA5_9VIRU/2-506    AC A0A1L3KNA5.1
#=GS GLYCO_DMSVA/16-540        AC A7WNB3.1
#=GS A0A0D3R1L8_9RHAB/16-402   AC A0A0D3R1L8.1
#=GS GLYCO_EBLV1/7-503         AC A4UHQ1.1
#=GS Q82173_9RHAB/7-495        AC Q82173.1
#=GS A0A0D3R151_9RHAB/5-507    AC A0A0D3R151.1
#=GS A0A0A7RU82_9RHAB/3-502    AC A0A0A7RU82.1
#=GS A0A0D3R1B8_9RHAB/42-455   AC A0A0D3R1B8.1
#=GS A0A0D3R1P1_9RHAB/18-370   AC A0A0D3R1P1.1
#=GS U3LYU2_9RHAB/16-505       AC U3LYU2.1
#=GS A0A0C5C390_9RHAB/26-376   AC A0A0C5C390.1
#=GS A0A140D8Q2_9RHAB/6-423    AC A0A140D8Q2.1
#=GS J9U0Z2_9RHAB/38-352       AC J9U0Z2.1
#=GS A0A0D3R1Z2_9RHAB/100-438  AC A0A0D3R1Z2.1
#=GS A0A1L3KMU4_9VIRU/22-517   AC A0A1L3KMU4.1
#=GS D2E9X6_9RHAB/4-508        AC D2E9X6.1
#=GS A0A0D3R1G0_9RHAB/6-528    AC A0A0D3R1G0.1
#=GS A0A1Z2RTB8_9VIRU/12-491   AC A0A1Z2RTB8.1
#=GS A0A097A5A4_9RHAB/80-440   AC A0A097A5A4.1
#=GS A0A0B5KK73_9RHAB/25-529   AC A0A0B5KK73.1
#=GS A0A068ERZ2_9RHAB/2-509    AC A0A068ERZ2.1
#=GS GLYCO_WCBV/5-502          AC Q5VKN9.1
#=GS A0A1L3KMR9_9VIRU/7-514    AC A0A1L3KMR9.1
#=GS A0A0C4MKA3_9RHAB/42-543   AC A0A0C4MKA3.1
#=GS G1BWF2_9RHAB/300-527      AC G1BWF2.1
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#=GS GLYCO_MOKV/5-500          AC P0C572.1
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#=GS A0A1L3KMX8_9VIRU/1-507    AC A0A1L3KMX8.1
#=GS K4HIF6_ARV/7-365          AC K4HIF6.1
#=GS GLYCO_VSNJO/4-514         AC P04882.1
#=GS A0A0D3R1L7_9RHAB/23-532   AC A0A0D3R1L7.1
#=GS A0A0B5KTK4_9RHAB/5-506    AC A0A0B5KTK4.1
#=GS GLYCO_BEFVB/2-420         AC P32595.1
#=GS E3P8Z0_9RHAB/7-513        AC E3P8Z0.1
#=GS H8XWF3_9RHAB/8-600        AC H8XWF3.1
#=GS A0A0D3R1J5_9RHAB/29-401   AC A0A0D3R1J5.1
#=GS A0A140DDE0_9RHAB/6-404    AC A0A140DDE0.1
#=GS A0A1L3KN00_9VIRU/11-534   AC A0A1L3KN00.1
#=GS Q170M5_AEDAE/438-705      AC Q170M5.1
#=GS GLYCO_TIBVC/8-409         AC D8V075.1
#=GS G0ZMN8_9RHAB/7-503        AC G0ZMN8.1
#=GS A0A0D3R288_9RHAB/7-508    AC A0A0D3R288.1
#=GS I1SV90_9RHAB/5-514        AC I1SV90.1
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#=GS A0A0D3R1W3_9RHAB/4-514    AC A0A0D3R1W3.1
#=GS D3GGL7_9RHAB/99-460       AC D3GGL7.1
#=GS A0A140D8M1_9RHAB/12-520   AC A0A140D8M1.1
#=GS GLYCO_ABLVB/5-503         AC Q9QSP1.1
#=GS X4QM08_9RHAB/4-359        AC X4QM08.1
#=GS A0A140D8Q1_9RHAB/7-373    AC A0A140D8Q1.1
#=GS J9U7A1_9RHAB/7-381        AC J9U7A1.1
#=GS D6C4E8_9RHAB/43-506       AC D6C4E8.1
#=GS A0A059U0H0_9RHAB/115-644  AC A0A059U0H0.1
#=GS A0A096ZGU1_9RHAB/4-569    AC A0A096ZGU1.1
#=GS A0A0D3R0Z1_9RHAB/219-609  AC A0A0D3R0Z1.1
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#=GS A0A0S2RRM1_9VIRU/18-497   AC A0A0S2RRM1.1
#=GS B2X7D8_9RHAB/40-425       AC B2X7D8.1
#=GS C8CJF0_9RHAB/18-529       AC C8CJF0.1
#=GS A0A1L3KMV6_9VIRU/20-400   AC A0A1L3KMV6.1
#=GS GLYCO_EBLV2/6-503         AC A4UHQ6.1
#=GS A0A0A0V7V5_9RHAB/1-146    AC A0A0A0V7V5.1
#=GS A0A0B5KRT4_9RHAB/8-513    AC A0A0B5KRT4.1
#=GS A0A0D3R1Z3_9RHAB/34-439   AC A0A0D3R1Z3.1
#=GS GLYCO_TUPVT/11-530        AC Q4VKV3.1
#=GS A0A1L3KN73_9VIRU/4-526    AC A0A1L3KN73.1
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#=GS A0A0D3R1R4_9RHAB/5-508    AC A0A0D3R1R4.1
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#=GS D3GGL8_9RHAB/4-380        AC D3GGL8.1
#=GS A0A0D3R170_9RHAB/35-415   AC A0A0D3R170.1
#=GS U5NI88_9RHAB/38-543       AC U5NI88.1
#=GS GLYCO_SVCV/7-509          AC Q91DS0.1
#=GS A0A0D3R143_9RHAB/115-644  AC A0A0D3R143.1
#=GS I1SV84_9RHAB/8-517        AC I1SV84.1
#=GS A0A1L3KMW1_9VIRU/10-409   AC A0A1L3KMW1.1
#=GS M4VNB9_9RHAB/7-514        AC M4VNB9.1
#=GS A0A1L3KNB2_9VIRU/5-507    AC A0A1L3KNB2.1
#=GS H8XWF4_9RHAB/20-443       AC H8XWF4.1
#=GS Q170M5_AEDAE/60-349       AC Q170M5.1
#=GS R9ZPI5_9RHAB/27-530       AC R9ZPI5.1
#=GS A0A1A9UR89_GLOAU/20-160   AC A0A1A9UR89.1
#=GS Q8UY99_9RHAB/7-514        AC Q8UY99.1
#=GS F7J0V2_9RHAB/3-401        AC F7J0V2.1
#=GS A0A0D3R1P3_9RHAB/5-533    AC A0A0D3R1P3.1
#=GS GLYCO_SHRV/13-504         AC Q9QJT6.1
#=GS GLYCO_VSIVA/9-503         AC P03522.1
#=GS GLYCO_IHNVW/9-506         AC Q82683.1
#=GS A0A0D3R1C5_9RHAB/41-560   AC A0A0D3R1C5.1
#=GS GLYCO_ISFV/5-513          AC Q5K2K4.1
#=GS B3FRL4_9RHAB/4-506        AC B3FRL4.1
#=GS A0A068J4R3_9RHAB/235-778  AC A0A068J4R3.1
#=GS A0A096ZGU3_9RHAB/217-479  AC A0A096ZGU3.1
#=GS A0A0B5KRE8_9RHAB/35-311   AC A0A0B5KRE8.1
A0A0B5KKB0_9RHAB/5-540               ............liliacangyindndteyvwrarplgsvadkgvlyvpl----------------...............--.-----DHS--KNWR.P.A.KY.QDLKCPK....--PQG..DWQ...LKFiI....H.T.RWV...TWR....PD.D.IS..LDH..I...PGFLCHKAEWITRC.EYTWYLSKTV.SRKLKEETPSESECQDA...V.R.LYEAGk...qeAG...S...FP...-P..E.E.C.Y...W....NS.VND.ESVVKT.I.VVEHSIAYDPYKDCGVDEALV.GGS.CKK............KFCDTK.YSSVKWV..QD...V..D..H....E.sQ...R..C..H-..-....N.II....Q..E..QL.....E...I.LK.R.N........DNKE.Q..-.......-......D....K...S..W....V.....R...S....K..S...FP..I..TE..MDDACK.M.S.FCGLDGIR..LKN.GIW....F.....G..F..............Q.........K.......Sr..........tD......H....S....D...........M.......G.......D.......I.......P......Q......CV.S....G..T.E..I..G...I...PD..K.........N..Y.KEkeF.E..Y..eL...............EDL.-...Q.R.--.....-...E.I...L...CLNVLDKLQLN..Q..VI.SLYDLQYLRQDAPGYGNI..FRV..N.N.G.....T...LEVTTG..KY..IK...V....YH.AKN......D..L.SP.D...C...I.G.T...Y...KD.H.S..G.D.D.....V...CVDWDEwlpie............................................................kdkdqgF.NG..II...-.RIK.N......K......I...I.FP...DD..QL........RASEW....RE..........ELFD.Y.FK.V..DKIHH.P.F.L...N......N...V..T..D..V.IH..DdtD...D..EN.L.I...H.D...KT.....V..nP....GdaIN....NWV.KV..A..E..NK.V.VN.Ffke.....lgiGII...I......I.VWI.I.AGIifLF..I...L.F...K......L..I....R..F.C...I...K-LRYKKVN.TGDKE...I-----emrhy..........................................................................................................................................................................................
A0A1L3KND6_9VIRU/5-511               ........................istvlfllsskfvlggliiplcrsgp----------------...............--.-----------LWH.K.I.NP.TDMICPR....-YESG..PPE...GEM.N....M.T.DIQ..tFDI....PA.-.IS..-GK..Q...LGYLCHGVIYRVIC.IKGVFGGETI.NKVILPTKITPNECEVA...V.K.EYLTTae.dhrSG...Y...FPg.kYC..V.Y.E.I...L....ST.HTEfSDKKFI.L.VSDHTVLYDPYADQWIDTLFL.GGR.CDT............RSCRTI.KDSVVWI..SN...V..-..V....K..P...A..C..P-..-....-.--....-..-..-K.....A...V.SL.L.V........HVAY.E..G.......K......K....P...L..T....I.....H...G....P..T...IP..T..SK..LEGACV.T.K.FCGTKGLR..LSS.GFF....I.....I..P..............P.........A.......-............S......W....I....K...........-.......V.......F.......K.......T......D......CT.D....G..V.S..I..-...-...RG..I.........T..W.ES..V.-..-...V...............QDT.VmynE.I.SV.....I...R.L...H...CLNTIATMSAL..G..RA.SSVQLGIFQPWTPGIHPV..YRV.gV.D.N.....H...LETKMC..GY..IL...G....--.-EG......I..D.MN.E...D...G.A.I...G...KD.H.L..G.HlV.....F...WQDWVS.......................................................................P.RK..LSceaY.GPN.G......I......Y...R.DE...KC..QLhy...pwiELRQD....IMh........rSILV.Q.QT.L..Q--EA.P.H.V...T......E...Q..H..Y..S.QTelE..S...D..FQ.L.F...-.D...KD.....F...T....D..--....--T.KD..I..E..MA.I.FS.W...........TSS...V......R.LGLaI.GGV..VL..V...I.I...V......G..L....V..L.-...-...---------.-----...------lvklgliayiwdkccrrkqhrqesihlepln................................................................................................................................................................
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