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Database: Pfam
Entry: SID-1_RNA_chan
LinkDB: SID-1_RNA_chan
Original site: SID-1_RNA_chan 
#=GF ID   SID-1_RNA_chan
#=GF AC   PF13965.7
#=GF DE   dsRNA-gated channel SID-1
#=GF AU   Eberhardt R;0000-0001-6152-1369
#=GF SE   Jackhmmer:Q9GZC8
#=GF GA   28.70 28.70;
#=GF TC   28.90 29.90;
#=GF NC   28.40 28.60;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   12970568
#=GF RT   Transport of dsRNA into cells by the transmembrane protein
#=GF RT   SID-1.
#=GF RA   Feinberg EH, Hunter CP;
#=GF RL   Science. 2003;301:1545-1547.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   11834782
#=GF RT   Systemic RNAi in C. elegans requires the putative transmembrane
#=GF RT   protein SID-1.
#=GF RA   Winston WM, Molodowitch C, Hunter CP;
#=GF RL   Science. 2002;295:2456-2459.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   16202143
#=GF RT   Nymphal RNAi: systemic RNAi mediated gene knockdown in juvenile
#=GF RT   grasshopper.
#=GF RA   Dong Y, Friedrich M;
#=GF RL   BMC Biotechnol. 2005;5:25.
#=GF RN   [4]
#=GF RM   21733186
#=GF RT   CREST--a large and diverse superfamily of putative transmembrane
#=GF RT   hydrolases.
#=GF RA   Pei J, Millay DP, Olson EN, Grishin NV;
#=GF RL   Biol Direct. 2011;6:37.
#=GF DR   INTERPRO; IPR025958;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This is a family of proteins that are transmembrane dsRNA-gated
#=GF CC   channels. They passively transport dsRNA into cells and do not
#=GF CC   act as ATP-dependent pumps [1]. They are required for systemic
#=GF CC   RNA interference [2,3]. This family of proteins belong to the
#=GF CC   CREST superfamily [4], which are distantly related to GPCRs.
#=GF SQ   992
#=GS A0A3Q0H839_ALLSI/167-856    AC A0A3Q0H839.1
#=GS A0A2K5MUT8_CERAT/737-795    AC A0A2K5MUT8.1
#=GS E3MB37_CAERE/802-924        AC E3MB37.1
#=GS A0A1S3NQQ3_SALSA/183-831    AC A0A1S3NQQ3.1
#=GS A0A2K6GT43_PROCO/393-756    AC A0A2K6GT43.1
#=GS A0A1S3NQQ4_SALSA/183-866    AC A0A1S3NQQ4.1
#=GS A0A3P8PH83_ASTCA/190-816    AC A0A3P8PH83.1
#=GS A0A3B3R3C7_9TELE/177-838    AC A0A3B3R3C7.1
#=GS A0A3P6SGK5_LITSI/164-328    AC A0A3P6SGK5.1
#=GS A0A1L8FLK7_XENLA/169-836    AC A0A1L8FLK7.1
#=GS A0A3M6UJ57_9CNID/600-663    AC A0A3M6UJ57.1
#=GS A0A287DCR9_ICTTR/169-853    AC A0A287DCR9.1
#=GS H2NFE3_PONAB/234-776        AC H2NFE3.1
#=GS M3WJ35_FELCA/169-832        AC M3WJ35.3
#=GS A0A2K6C251_MACNE/169-836    AC A0A2K6C251.1
#=GS A0A194PYX2_PAPXU/174-791    AC A0A194PYX2.1
#=GS A0A3Q1MF94_BOVIN/166-434    AC A0A3Q1MF94.1
#=GS A0A261CNB4_9PELO/308-679    AC A0A261CNB4.1
#=GS A0A091D975_FUKDA/396-673    AC A0A091D975.1
#=GS A0A2I2UZE2_FELCA/169-836    AC A0A2I2UZE2.1
#=GS A0A2A2K2W7_9BILA/152-769    AC A0A2A2K2W7.1
#=GS A0A452IJX9_9SAUR/176-855    AC A0A452IJX9.1
#=GS A0A2G5SLC5_9PELO/17-544     AC A0A2G5SLC5.1
#=GS E9GL72_DAPPU/1-430          AC E9GL72.1
#=GS A0A337SST3_FELCA/180-804    AC A0A337SST3.1
#=GS SIDT1_RAT/184-831           AC Q6Q3F5.2
#=GS A0A2Y9FA82_PHYMC/169-835    AC A0A2Y9FA82.1
#=GS H2SZ64_TAKRU/171-369        AC H2SZ64.2
#=GS A0A164NKG6_9CRUS/208-282    AC A0A164NKG6.1
#=GS A0A1D2MUE9_ORCCI/273-411    AC A0A1D2MUE9.1
#=GS A0A226NMF5_CALSU/170-792    AC A0A226NMF5.1
#=GS A0A2Y9LFA2_DELLE/177-848    AC A0A2Y9LFA2.1
#=GS A0A1I7U026_9PELO/161-534    AC A0A1I7U026.1
#=GS M7B6M7_CHEMY/111-782        AC M7B6M7.1
#=GS H3E6H0_PRIPA/383-1016       AC H3E6H0.2
#=GS A0A2Y9M1A8_DELLE/169-839    AC A0A2Y9M1A8.1
#=GS A0A2K6GT43_PROCO/184-399    AC A0A2K6GT43.1
#=GS F6Z9S7_XENTR/167-833        AC F6Z9S7.1
#=GS A0A493SYS2_ANAPP/174-833    AC A0A493SYS2.1
#=GS A0A482W6M3_9CUCU/394-508    AC A0A482W6M3.1
#=GS A0A3Q3BRB9_KRYMA/192-855    AC A0A3Q3BRB9.1
#=GS A0A2K5MUT8_CERAT/184-739    AC A0A2K5MUT8.1
#=GS A0A194RII4_PAPMA/174-783    AC A0A194RII4.1
#=GS A0A1S2ZAG7_ERIEU/180-823    AC A0A1S2ZAG7.1
#=GS A0A2R9A7R5_PANPA/169-820    AC A0A2R9A7R5.1
#=GS A0A261CMU3_9PELO/78-261     AC A0A261CMU3.1
#=GS A0A2K6TFJ7_SAIBB/179-806    AC A0A2K6TFJ7.1
#=GS A0A2G5SLW7_9PELO/75-170     AC A0A2G5SLW7.1
#=GS A0A093HIN6_STRCA/1-128      AC A0A093HIN6.1
#=GS E9FVT5_DAPPU/1-421          AC E9FVT5.1
#=GS A8XNC4_CAEBR/161-298        AC A8XNC4.1
#=GS A0A2G5SLM2_9PELO/305-697    AC A0A2G5SLM2.1
#=GS A0A3B3H9U7_ORYLA/188-553    AC A0A3B3H9U7.1
#=GS A0A0V1B608_TRISP/168-774    AC A0A0V1B608.1
#=GS SID1_CAEEL/197-776          AC Q9GZC8.2
#=GS B3S1A4_TRIAD/4-400          AC B3S1A4.1
#=GS A0A3Q3KTP7_9TELE/168-787    AC A0A3Q3KTP7.1
#=GS A0A226ERR1_FOLCA/634-914    AC A0A226ERR1.1
#=GS H9JNZ7_BOMMO/678-817        AC H9JNZ7.1
#=GS A0A369SBA6_9METZ/1232-1491  AC A0A369SBA6.1
#=GS A0A2G5SLI9_9PELO/162-324    AC A0A2G5SLI9.1
#=GS A0A044UI49_ONCVO/183-753    AC A0A044UI49.1
#=GS A0A1D1VLE8_RAMVA/225-392    AC A0A1D1VLE8.1
#=GS A0A3B3X3Z6_9TELE/191-875    AC A0A3B3X3Z6.1
#=GS A8XM97_CAEBR/151-760        AC A8XM97.2
#=GS A0A0Q3LWE8_AMAAE/1-180      AC A0A0Q3LWE8.1
#=GS A0A0P7ULT8_SCLFO/185-826    AC A0A0P7ULT8.1
#=GS E9FVT6_DAPPU/166-333        AC E9FVT6.1
#=GS A0A183H5X1_9BILA/185-458    AC A0A183H5X1.1
#=GS A0A3B1JSV6_ASTMX/197-877    AC A0A3B1JSV6.1
#=GS A0A2K5Y5D2_MANLE/169-817    AC A0A2K5Y5D2.1
#=GS A0A1S3SYP6_SALSA/183-862    AC A0A1S3SYP6.1
#=GS A0A226DUP2_FOLCA/70-247     AC A0A226DUP2.1
#=GS A8XNC3_CAEBR/360-562        AC A8XNC3.2
#=GS G3U6K3_LOXAF/1-363          AC G3U6K3.1
#=GS A0A0N5E097_TRIMR/526-756    AC A0A0N5E097.1
#=GS A0A1D5QYH6_MACMU/1-76       AC A0A1D5QYH6.1
#=GS A0A3P9BDF5_9CICH/190-845    AC A0A3P9BDF5.1
#=GS H2NFE3_PONAB/169-238        AC H2NFE3.1
#=GS A0A1D1UGX0_RAMVA/192-839    AC A0A1D1UGX0.1
#=GS A0A3Q3FAD5_9LABR/190-874    AC A0A3Q3FAD5.1
#=GS A0A2B4SUM8_STYPI/164-480    AC A0A2B4SUM8.1
#=GS A0A2Y9JI45_ENHLU/180-218    AC A0A2Y9JI45.1
#=GS A0A2A3EM94_APICC/432-745    AC A0A2A3EM94.1
#=GS A0A0R3X3R6_HYDTA/35-155     AC A0A0R3X3R6.1
#=GS H9JNQ6_BOMMO/1-310          AC H9JNQ6.1
#=GS A0A0R3QV82_9BILA/20-605     AC A0A0R3QV82.1
#=GS H3DA30_TETNG/144-805        AC H3DA30.1
#=GS A0A1A6H2J3_NEOLE/83-153     AC A0A1A6H2J3.1
#=GS A0A1D5P9R1_CHICK/173-357    AC A0A1D5P9R1.2
#=GS A0A267E765_9PLAT/216-940    AC A0A267E765.1
#=GS A0A1S3SYP7_SALSA/183-852    AC A0A1S3SYP7.1
#=GS A0A3M6UEU6_9CNID/371-608    AC A0A3M6UEU6.1
#=GS A0A1W4XF31_AGRPL/1-341      AC A0A1W4XF31.1
#=GS A0A452EW95_CAPHI/180-823    AC A0A452EW95.1
#=GS A0A287D3V4_ICTTR/188-836    AC A0A287D3V4.1
#=GS A0A1V4J7Q8_PATFA/183-856    AC A0A1V4J7Q8.1
#=GS A0A267GWI1_9PLAT/181-743    AC A0A267GWI1.1
#=GS A0A1X7VVV3_AMPQE/177-809    AC A0A1X7VVV3.1
#=GS G1P210_MYOLU/112-795        AC G1P210.1
#=GS A0A183VJ56_TRIRE/147-258    AC A0A183VJ56.1
#=GS W4Z695_STRPU/8-153          AC W4Z695.1
#=GS A0A218UPZ7_9PASE/176-846    AC A0A218UPZ7.1
#=GS A0A2B4SVF4_STYPI/260-379    AC A0A2B4SVF4.1
#=GS A0A3Q1JPZ3_ANATE/189-792    AC A0A3Q1JPZ3.1
#=GS A0A2K5QVJ7_CEBCA/169-813    AC A0A2K5QVJ7.1
#=GS E2B9B2_HARSA/111-720        AC E2B9B2.1
#=GS E9HYQ2_DAPPU/1-68           AC E9HYQ2.1
#=GS A0A2I0ML62_COLLI/171-817    AC A0A2I0ML62.1
#=GS A0A267GCR4_9PLAT/172-559    AC A0A267GCR4.1
#=GS A0A2K6MNP6_RHIBE/169-829    AC A0A2K6MNP6.1
#=GS A0A1U7QLM2_MESAU/184-827    AC A0A1U7QLM2.1
#=GS A0A286ZN25_PIG/169-856      AC A0A286ZN25.1
#=GS A0A1V4J7S2_PATFA/183-852    AC A0A1V4J7S2.1
#=GS A0A3P8UPI2_CYNSE/191-860    AC A0A3P8UPI2.1
#=GS B3S1A3_TRIAD/1-380          AC B3S1A3.1
#=GS A0A0K0J3V5_BRUMA/144-729    AC A0A0K0J3V5.3
#=GS A0A194RN59_PAPMA/643-838    AC A0A194RN59.1
#=GS A0A1S3SYQ1_SALSA/183-866    AC A0A1S3SYQ1.1
#=GS A0A3S2LF11_CHISP/169-801    AC A0A3S2LF11.1
#=GS A0A286XM03_CAVPO/169-832    AC A0A286XM03.1
#=GS A0A2B4SZM3_STYPI/171-830    AC A0A2B4SZM3.1
#=GS A0A0M8ZS38_9HYME/174-773    AC A0A0M8ZS38.1
#=GS A0A1S3SYP3_SALSA/183-845    AC A0A1S3SYP3.1
#=GS A0A2U3Z933_LEPWE/329-567    AC A0A2U3Z933.1
#=GS A0A3Q3L5H9_9TELE/203-867    AC A0A3Q3L5H9.1
#=GS A0A2A4JCH4_HELVI/227-396    AC A0A2A4JCH4.1
#=GS SIDT2_RAT/169-832           AC D3ZEH5.2
#=GS A0A151LZP7_ALLMI/167-835    AC A0A151LZP7.1
#=GS A0A2K6GT45_PROCO/184-401    AC A0A2K6GT45.1
#=GS A0A3Q3BHA5_KRYMA/192-846    AC A0A3Q3BHA5.1
#=GS A0A2T7P1K7_POMCA/61-174     AC A0A2T7P1K7.1
#=GS A0A0V0ZEK1_9BILA/994-1610   AC A0A0V0ZEK1.1
#=GS A0A2B4SVF4_STYPI/396-705    AC A0A2B4SVF4.1
#=GS D4A117_RAT/33-681           AC D4A117.3
#=GS A0A016VHH0_9BILA/51-673     AC A0A016VHH0.1
#=GS A0A2K6R0R9_RHIRO/169-836    AC A0A2K6R0R9.1
#=GS A0A1D2N8N3_ORCCI/126-305    AC A0A1D2N8N3.1
#=GS I3L776_PIG/180-828          AC I3L776.2
#=GS E9GL71_DAPPU/160-305        AC E9GL71.1
#=GS A0A2J7RDJ2_9NEOP/183-804    AC A0A2J7RDJ2.1
#=GS D2HC74_AILME/169-837        AC D2HC74.1
#=GS A0A2B4S4B3_STYPI/339-784    AC A0A2B4S4B3.1
#=GS F6WXE2_MACMU/130-798        AC F6WXE2.2
#=GS A0A2C9JQS9_BIOGL/33-669     AC A0A2C9JQS9.1
#=GS A0A4D9DZT8_9SAUR/171-841    AC A0A4D9DZT8.1
#=GS A0A3B3X3P1_9TELE/191-866    AC A0A3B3X3P1.1
#=GS A0A1U8BMI5_MESAU/169-857    AC A0A1U8BMI5.1
#=GS A0A060VV49_ONCMY/439-846    AC A0A060VV49.1
#=GS M3ZL05_XIPMA/191-846        AC M3ZL05.2
#=GS A0A3P8UEJ8_AMPPE/191-854    AC A0A3P8UEJ8.1
#=GS A0A091EUX9_CORBR/525-683    AC A0A091EUX9.1
#=GS F7AAY2_XENTR/109-790        AC F7AAY2.1
#=GS E9PPN9_HUMAN/19-170         AC E9PPN9.2
#=GS A0A2G5SM09_9PELO/149-290    AC A0A2G5SM09.1
#=GS A0A2R9ACY0_PANPA/15-185     AC A0A2R9ACY0.1
#=GS A0A2I3SXW2_PANTR/169-818    AC A0A2I3SXW2.1
#=GS A0A226CXG3_FOLCA/421-747    AC A0A226CXG3.1
#=GS A0A0V0TUC5_9BILA/276-892    AC A0A0V0TUC5.1
#=GS G1LF37_AILME/180-830        AC G1LF37.1
#=GS A0A0L7L423_9NEOP/107-177    AC A0A0L7L423.1
#=GS A0A068YIP1_ECHMU/35-334     AC A0A068YIP1.1
#=GS F7B6N2_MOUSE/1-221          AC F7B6N2.1
#=GS A0A2A4K1B3_HELVI/464-877    AC A0A2A4K1B3.1
#=GS E1BB88_BOVIN/169-831        AC E1BB88.2
#=GS A0A2Y9JI61_ENHLU/180-823    AC A0A2Y9JI61.1
#=GS A0A3P8ZS10_ESOLU/188-826    AC A0A3P8ZS10.1
#=GS A0A2A2LAK2_9BILA/183-316    AC A0A2A2LAK2.1
#=GS A0A2I0LQE1_COLLI/133-482    AC A0A2I0LQE1.1
#=GS A0A087T5Q6_9ARAC/202-510    AC A0A087T5Q6.1
#=GS H0X497_OTOGA/110-758        AC H0X497.1
#=GS A0A2I3H1J8_NOMLE/15-185     AC A0A2I3H1J8.1
#=GS A0A401P7T2_SCYTO/182-848    AC A0A401P7T2.1
#=GS A0A1D2M6D7_ORCCI/211-386    AC A0A1D2M6D7.1
#=GS G3NRW7_GASAC/168-832        AC G3NRW7.1
#=GS M3W303_FELCA/180-823        AC M3W303.2
#=GS W4Z9Z6_STRPU/142-187        AC W4Z9Z6.1
#=GS A0A2K5JXG8_COLAP/184-827    AC A0A2K5JXG8.1
#=GS A0A077ZFN8_TRITR/146-746    AC A0A077ZFN8.1
#=GS A9UPD0_MONBE/1-334          AC A9UPD0.1
#=GS A0A2A4K1B3_HELVI/170-428    AC A0A2A4K1B3.1
#=GS A0A267GJC6_9PLAT/176-405    AC A0A267GJC6.1
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#=GS H3B1E4_LATCH/113-763        AC H3B1E4.1
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