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Database: Pfam
Entry: Sigma70_ECF
LinkDB: Sigma70_ECF
Original site: Sigma70_ECF 
#=GF ID   Sigma70_ECF
#=GF AC   PF07638.13
#=GF DE   ECF sigma factor
#=GF AU   Studholme DJ;0000-0002-3010-6637
#=GF SE   Blast clustering of Pirellula proteome
#=GF GA   21.10 21.10;
#=GF TC   21.10 21.10;
#=GF NC   21.00 21.00;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 57096847 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF CL   CL0123
#=GF RN   [1]
#=GF RM   12073657
#=GF RT   The extracytoplasmic function (ECF) sigma factors. 
#=GF RA   Helmann JD; 
#=GF RL   Adv Microb Physiol 2002;46:47-110.
#=GF DR   INTERPRO; IPR011517;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   These proteins are probably RNA polymerase sigma factors
#=GF CC   belonging to the extra-cytoplasmic function (ECF) subfamily [1]
#=GF CC   and show sequence similarity to Pfam:PF04542 and Pfam:PF04545.
#=GF SQ   1892
#=GS A0A2P6C459_9BACT/9-188      AC A0A2P6C459.1
#=GS A0A514BSX1_9GAMM/4-186      AC A0A514BSX1.1
#=GS A0A099LPE7_9VIBR/5-190      AC A0A099LPE7.1
#=GS A0A518BGY6_9BACT/1-185      AC A0A518BGY6.1
#=GS A0A5B9PR51_9BACT/6-197      AC A0A5B9PR51.1
#=GS A0A4R6XML7_9GAMM/8-182      AC A0A4R6XML7.1
#=GS A0A368VGV0_9ACTN/7-89       AC A0A368VGV0.1
#=GS W0RFR6_9BACT/2-185          AC W0RFR6.1
#=GS A0A5C6ATV4_9BACT/2-186      AC A0A5C6ATV4.1
#=GS A0A0F3GJC6_9BACT/7-90       AC A0A0F3GJC6.1
#=GS A0A5C6A5U5_9BACT/104-293    AC A0A5C6A5U5.1
#=GS A0A1U7CZH1_9BACT/1-183      AC A0A1U7CZH1.1
#=GS A0A0U2UHF7_9BACL/97-194     AC A0A0U2UHF7.1
#=GS A0A259TU24_9BACT/15-190     AC A0A259TU24.1
#=GS A0A2A2WJI4_9BACT/1-184      AC A0A2A2WJI4.1
#=GS A0A255QPL4_9BACT/4-197      AC A0A255QPL4.1
#=GS L0D7L1_SINAD/4-189          AC L0D7L1.1
#=GS A0A518BRR0_9BACT/1-182      AC A0A518BRR0.1
#=GS A0A1P8WM88_9PLAN/9-177      AC A0A1P8WM88.1
#=GS A0A518HEV3_9BACT/3-113      AC A0A518HEV3.1
#=GS A0A4Q6CCZ2_9GAMM/4-187      AC A0A4Q6CCZ2.1
#=GS A0A5C6DZP9_9BACT/1-183      AC A0A5C6DZP9.1
#=GS A0A0L6T427_9BURK/1-174      AC A0A0L6T427.1
#=GS A0A4V1SAA6_9BACT/8-186      AC A0A4V1SAA6.1
#=GS A0A5C6DI74_9BACT/1-184      AC A0A5C6DI74.1
#=GS A0A257LG42_9BURK/6-127      AC A0A257LG42.1
#=GS A0A5C6CTP8_9BACT/108-291    AC A0A5C6CTP8.1
#=GS M5TZ10_9BACT/1-183          AC M5TZ10.1
#=GS A0A5B9E496_9BACT/5-187      AC A0A5B9E496.1
#=GS Q5LKI9_RUEPO/47-182         AC Q5LKI9.1
#=GS K6Y5T0_9ALTE/7-182          AC K6Y5T0.1
#=GS A0A518G3K6_9BACT/8-179      AC A0A518G3K6.1
#=GS A0A514BUX2_9GAMM/5-180      AC A0A514BUX2.1
#=GS A0A2A2W8Y4_9BACT/1-190      AC A0A2A2W8Y4.1
#=GS A0A411HLG2_9GAMM/9-180      AC A0A411HLG2.1
#=GS A0A2T6DEL0_9BACT/48-241     AC A0A2T6DEL0.1
#=GS A0A5C6E6K4_9BACT/56-238     AC A0A5C6E6K4.1
#=GS A0A143PI93_9BACT/9-189      AC A0A143PI93.1
#=GS A0A2K8KTN2_9GAMM/9-184      AC A0A2K8KTN2.1
#=GS A0A1Y2PGX9_9FLAO/2-166      AC A0A1Y2PGX9.1
#=GS A0A517XW59_9BACT/1-183      AC A0A517XW59.1
#=GS A0A1V0DFT5_9BACT/6-189      AC A0A1V0DFT5.1
#=GS A0A5C5YM43_9BACT/4-186      AC A0A5C5YM43.1
#=GS A0A4R6YYM6_9GAMM/1-186      AC A0A4R6YYM6.1
#=GS R6SQ96_9FIRM/3-75           AC R6SQ96.1
#=GS A0A6C2UKR6_9BACT/15-197     AC A0A6C2UKR6.1
#=GS A0A1P8WLU8_9PLAN/4-191      AC A0A1P8WLU8.1
#=GS A0A2A8CX38_9BACT/62-244     AC A0A2A8CX38.1
#=GS A0A2P1PVZ9_9GAMM/1-184      AC A0A2P1PVZ9.1
#=GS A0A271JCY2_9BACT/32-212     AC A0A271JCY2.1
#=GS J9R0K2_RIEAN/2-189          AC J9R0K2.1
#=GS A0A4R3LFE1_9GAMM/4-185      AC A0A4R3LFE1.1
#=GS A0A4R6YW68_9GAMM/6-194      AC A0A4R6YW68.1
#=GS A0A517ZYD5_9BACT/35-219     AC A0A517ZYD5.1
#=GS A0A2P1PV22_9GAMM/33-212     AC A0A2P1PV22.1
#=GS A0A1G6Y2Y8_9GAMM/16-196     AC A0A1G6Y2Y8.1
#=GS A0A5C6CY40_9BACT/20-210     AC A0A5C6CY40.1
#=GS H8L295_FRAAD/6-183          AC H8L295.1
#=GS A0A437JYG2_9BURK/1-181      AC A0A437JYG2.1
#=GS A0A396KNV2_9FIRM/4-190      AC A0A396KNV2.1
#=GS A0A5C6CZ66_9BACT/1-184      AC A0A5C6CZ66.1
#=GS A0A177RAA4_9BACT/2-180      AC A0A177RAA4.1
#=GS A0A5M8SE61_9BACT/6-188      AC A0A5M8SE61.1
#=GS A0A0Q4RX35_9BURK/13-204     AC A0A0Q4RX35.1
#=GS A0A4R0YY50_9GAMM/5-170      AC A0A4R0YY50.1
#=GS A0A143PFQ8_9BACT/1-181      AC A0A143PFQ8.1
#=GS A0A177QW39_9PLAN/9-198      AC A0A177QW39.1
#=GS A0A2U9T751_9GAMM/6-188      AC A0A2U9T751.1
#=GS A3ZZC0_9BACT/1-185          AC A3ZZC0.1
#=GS A0A1U7CPJ6_9BACT/6-201      AC A0A1U7CPJ6.1
#=GS A0A5B9P4C3_9BACT/2-178      AC A0A5B9P4C3.1
#=GS A0A5B9WD37_9BACT/12-192     AC A0A5B9WD37.1
#=GS A0A062U5W7_9RHOB/6-185      AC A0A062U5W7.1
#=GS A0A5C6CLQ3_9BACT/3-187      AC A0A5C6CLQ3.1
#=GS A0A2N0VE24_9BACT/9-191      AC A0A2N0VE24.1
#=GS U5F516_9FIRM/27-160         AC U5F516.1
#=GS A0A177Q1P8_9PLAN/8-195      AC A0A177Q1P8.1
#=GS A0A142Y9P6_9PLAN/5-208      AC A0A142Y9P6.1
#=GS A0A167G7V7_9GAMM/10-190     AC A0A167G7V7.1
#=GS A0A518N4I8_9GAMM/5-187      AC A0A518N4I8.1
#=GS A0A5C6F2F0_9BACT/1-53       AC A0A5C6F2F0.1
#=GS A0A4U5JV14_9GAMM/3-188      AC A0A4U5JV14.1
#=GS A0A518DC95_9BACT/1-184      AC A0A518DC95.1
#=GS L0DL66_SINAD/1-184          AC L0DL66.1
#=GS A0A518HAE3_9BACT/1-181      AC A0A518HAE3.1
#=GS A0A371QNX7_9BACT/23-212     AC A0A371QNX7.1
#=GS A0A3D8V871_9GAMM/4-186      AC A0A3D8V871.1
#=GS A0A517XZC7_9BACT/4-195      AC A0A517XZC7.1
#=GS A0A5C6DRL5_9BACT/1-184      AC A0A5C6DRL5.1
#=GS A0A5M6D8F6_9BACT/1-183      AC A0A5M6D8F6.1
#=GS A0A517TTF9_9BACT/15-199     AC A0A517TTF9.1
#=GS A0A518CU65_9BACT/6-188      AC A0A518CU65.1
#=GS YAGL_ECOLI/160-228          AC P77607.1
#=GS A0A4V3DMD2_9GAMM/14-180     AC A0A4V3DMD2.1
#=GS Q5E1V3_ALIF1/4-188          AC Q5E1V3.1
#=GS A0A1U7CTQ6_9BACT/6-197      AC A0A1U7CTQ6.1
#=GS A0A5C1AMZ9_9BACT/19-189     AC A0A5C1AMZ9.1
#=GS A0A517SLL9_9BACT/1-180      AC A0A517SLL9.1
#=GS A0A2A2GFV5_9BACT/17-200     AC A0A2A2GFV5.1
#=GS A6BZ67_9PLAN/25-215         AC A6BZ67.1
#=GS A0A5C6EI93_9BACT/1-183      AC A0A5C6EI93.1
#=GS A0A0K0XYC8_9GAMM/4-178      AC A0A0K0XYC8.1
#=GS D5ENY3_CORAD/56-172         AC D5ENY3.1
#=GS A0A518EV43_9BACT/6-175      AC A0A518EV43.1
#=GS A0A5R8KLM1_9BACT/16-192     AC A0A5R8KLM1.1
#=GS A0A432MN54_9BACT/21-211     AC A0A432MN54.1
#=GS A0A0K0XU72_9GAMM/3-185      AC A0A0K0XU72.1
#=GS A0A177PU10_9PLAN/4-195      AC A0A177PU10.1
#=GS A0A368KVC9_9BACT/9-192      AC A0A368KVC9.1
#=GS A0A271JCP4_9BACT/4-186      AC A0A271JCP4.1
#=GS A0A5C1AS46_9BACT/4-185      AC A0A5C1AS46.1
#=GS A0A5C6EJG9_9BACT/7-198      AC A0A5C6EJG9.1
#=GS A0A090KMB4_9BACT/9-189      AC A0A090KMB4.1
#=GS A0A142YBR3_9PLAN/6-200      AC A0A142YBR3.1
#=GS Q021X5_SOLUE/4-187          AC Q021X5.1
#=GS A0A5C6M6J0_9PLAN/15-198     AC A0A5C6M6J0.1
#=GS A0A4R6YUY7_9GAMM/18-199     AC A0A4R6YUY7.1
#=GS A0A5C5ZHN8_9BACT/6-192      AC A0A5C5ZHN8.1
#=GS A0A4R5H812_9ALTE/967-1102   AC A0A4R5H812.1
#=GS R6WYT2_9CLOT/42-124         AC R6WYT2.1
#=GS A0A517MD46_9BACT/7-200      AC A0A517MD46.1
#=GS A6C669_9PLAN/2-172          AC A6C669.1
#=GS A0A142YDD8_9PLAN/11-200     AC A0A142YDD8.1
#=GS A0A5Q3L3E6_9BACT/1-185      AC A0A5Q3L3E6.1
#=GS A0A5C5YQF2_9BACT/47-208     AC A0A5C5YQF2.1
#=GS A0A4Z0M036_9GAMM/110-286    AC A0A4Z0M036.1
#=GS A0A517Y1S0_9BACT/1167-1316  AC A0A517Y1S0.1
#=GS A0A0K8P1H6_IDESA/5-177      AC A0A0K8P1H6.1
#=GS A0A5B9W660_9BACT/6-208      AC A0A5B9W660.1
#=GS A0A517MF14_9BACT/11-210     AC A0A517MF14.1
#=GS A0A518DIU4_9BACT/11-118     AC A0A518DIU4.1
#=GS A0A518B7Q0_9BACT/5-205      AC A0A518B7Q0.1
#=GS A0A517P6C1_9PLAN/1-74       AC A0A517P6C1.1
#=GS A0A411HI80_9GAMM/53-223     AC A0A411HI80.1
#=GS A0A0U3EQS2_9BURK/1-178      AC A0A0U3EQS2.1
#=GS H8MGU7_CORCM/18-179         AC H8MGU7.1
#=GS A0A4R6XJ32_9GAMM/3-185      AC A0A4R6XJ32.1
#=GS A0A517ZLC4_9BACT/34-224     AC A0A517ZLC4.1
#=GS A0A517NA32_9BACT/18-202     AC A0A517NA32.1
#=GS A0A517QGM7_9BACT/19-202     AC A0A517QGM7.1
#=GS A0A517YDJ5_9BACT/9-195      AC A0A517YDJ5.1
#=GS A0A143PTQ8_9BACT/4-186      AC A0A143PTQ8.1
#=GS A0A518IVC0_9BACT/19-218     AC A0A518IVC0.1
#=GS A0A368KUN7_9BACT/26-203     AC A0A368KUN7.1
#=GS A0A517ZED6_9BACT/4-198      AC A0A517ZED6.1
#=GS I4AJ64_BERLS/4-191          AC I4AJ64.1
#=GS A0A6I5CEZ6_9ACTN/32-204     AC A0A6I5CEZ6.1
#=GS Q028D8_SOLUE/24-191         AC Q028D8.1
#=GS A0A0A0M9U7_9GAMM/4-186      AC A0A0A0M9U7.1
#=GS L0DID4_SINAD/4-194          AC L0DID4.1
#=GS A0A2A2G9W4_9BACT/4-186      AC A0A2A2G9W4.1
#=GS A0A2T6CNS3_9BACT/24-229     AC A0A2T6CNS3.1
#=GS L7U026_MYXSD/3-186          AC L7U026.1
#=GS A0A2A2WGV6_9BACT/2-196      AC A0A2A2WGV6.1
#=GS A0A161HIP7_9GAMM/2-183      AC A0A161HIP7.1
#=GS A0A653JXH7_9BURK/7-174      AC A0A653JXH7.1
#=GS A0A518EUH3_9BACT/9-194      AC A0A518EUH3.1
#=GS A0A142WQ55_9PLAN/6-199      AC A0A142WQ55.1
#=GS K9XZJ4_STAC7/125-202        AC K9XZJ4.1
#=GS A0A518DDF9_9BACT/8-202      AC A0A518DDF9.1
#=GS A0A5B9P9M9_9BACT/4-198      AC A0A5B9P9M9.1
#=GS A0A143PLV0_9BACT/10-192     AC A0A143PLV0.1
#=GS A0A432MDY0_9BACT/15-186     AC A0A432MDY0.1
#=GS A0A257JUN2_9BURK/1-47       AC A0A257JUN2.1
#=GS A0A142X011_9PLAN/1-186      AC A0A142X011.1
#=GS A0A518EKD2_9BACT/3-186      AC A0A518EKD2.1
#=GS A0A254NF45_9BURK/1-184      AC A0A254NF45.1
#=GS A0A4R6ZAT1_9GAMM/5-188      AC A0A4R6ZAT1.1
#=GS A0A142WQP6_9PLAN/44-229     AC A0A142WQP6.1
#=GS A0A518HBW5_9BACT/39-237     AC A0A518HBW5.1
#=GS D3FEJ5_CONWI/5-176          AC D3FEJ5.1
#=GS A0A142XS32_9BACT/4-198      AC A0A142XS32.1
#=GS A0A2P1PS03_9GAMM/47-217     AC A0A2P1PS03.1
#=GS A0A0R2HW34_CARDV/8-196      AC A0A0R2HW34.1
#=GS M5T5F6_9BACT/1-167          AC M5T5F6.1
#=GS A0A3A8YVY4_9BACT/58-188     AC A0A3A8YVY4.1
#=GS A0A1B1G295_9BACT/3-183      AC A0A1B1G295.1
#=GS A0A2T6CM83_9BACT/4-186      AC A0A2T6CM83.1
#=GS A0A3A9BBM7_9BACT/57-140     AC A0A3A9BBM7.1
#=GS A0A518BP46_9BACT/16-199     AC A0A518BP46.1
#=GS A0A372IKJ8_9BACT/127-288    AC A0A372IKJ8.1
#=GS L0DFV0_SINAD/1-184          AC L0DFV0.1
#=GS A0A090KMS8_9BACT/11-200     AC A0A090KMS8.1
#=GS A0A3P0X4G0_9BACT/5-186      AC A0A3P0X4G0.1
#=GS A0A3N7HQS5_9BURK/8-194      AC A0A3N7HQS5.1
#=GS A0A142Y3C3_9BACT/13-210     AC A0A142Y3C3.1
#=GS A0A5C6B6B8_9BACT/31-217     AC A0A5C6B6B8.1
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