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Database: Pfam
Entry: Sina
LinkDB: Sina
Original site: Sina 
#=GF ID   Sina
#=GF AC   PF03145.17
#=GF DE   Seven in absentia protein family
#=GF AU   Mifsud W;0000-0002-9805-6461
#=GF SE   Pfam-B_1854 (release 6.5)
#=GF GA   31.50 31.50;
#=GF TC   31.50 31.50;
#=GF NC   31.40 31.40;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   9403064
#=GF RT   Characterization of human homologs of the Drosophila seven in
#=GF RT   absentia (sina) gene. 
#=GF RA   Hu G, Chung YL, Glover T, Valentine V, Look AT, Fearon ER; 
#=GF RL   Genomics 1997;46:103-111.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   9267026
#=GF RT   PHYL acts to down-regulate TTK88, a transcriptional repressor of
#=GF RT   neuronal cell fates, by a SINA-dependent mechanism. 
#=GF RA   Tang AH, Neufeld TP, Kwan E, Rubin GM; 
#=GF RL   Cell 1997;90:459-467.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   11389839
#=GF RT   Siah-1, SIP, and Ebi collaborate in a novel pathway for
#=GF RT   beta-catenin degradation linked to p53 responses. 
#=GF RA   Matsuzawa SI, Reed JC; 
#=GF RL   Mol Cell 2001;7:915-926.
#=GF DR   INTERPRO; IPR018121;
#=GF DR   SCOP; 1k2f; fa;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   The seven in absentia (sina) gene was first identified in
#=GF CC   Drosophila. The Drosophila Sina protein is essential for the
#=GF CC   determination of the R7 pathway in photoreceptor cell
#=GF CC   development: the loss of functional Sina results in the
#=GF CC   transformation of the R7 precursor cell to a non- neuronal cell
#=GF CC   type. The Sina protein contains an N-terminal RING finger domain
#=GF CC   Pfam:PF00097. Through this domain, Sina binds E2
#=GF CC   ubiquitin-conjugating enzymes (UbcD1) Sina also interacts with
#=GF CC   Tramtrack (TTK88) via PHYL. Tramtrack is a transcriptional
#=GF CC   repressor that blocks photoreceptor determination, while PHYL
#=GF CC   down-regulates the activity of TTK88. In turn, the activity of
#=GF CC   PHYL requires the activation of the Sevenless receptor tyrosine
#=GF CC   kinase, a process essential for R7 determination. It is thought
#=GF CC   that thus Sina targets TTK88 for degradation, therefore
#=GF CC   promoting the R7 pathway. Murine and human homologues of Sina
#=GF CC   have also been identified. The human homologue Siah-1 [1] also
#=GF CC   binds E2 enzymes (UbcH5) and through a series of physical
#=GF CC   interactions, targets beta-catenin for ubiquitin degradation.
#=GF CC   Siah-1 expression is enhanced by p53, itself promoted by DNA
#=GF CC   damage. Thus this pathway links DNA damage to beta-catenin
#=GF CC   degradation [2,3]. Sina proteins, therefore, physically interact
#=GF CC   with a variety of proteins. The N-terminal RING finger domain
#=GF CC   that binds ubiquitin conjugating enzymes is described in
#=GF CC   Pfam:PF00097, and does not form part of the alignment for this
#=GF CC   family. The remainder C-terminal part is involved in
#=GF CC   interactions with other proteins, and is included in this
#=GF CC   alignment. In addition to the Drosophila protein and mammalian
#=GF CC   homologues, whose similarity was noted previously, this family
#=GF CC   also includes putative homologues from Caenorhabditis elegans,
#=GF CC   Arabidopsis thaliana.
#=GF SQ   3040
#=GS SIL11_ARATH/87-266         AC Q9FM14.2
#=GS A0A2G9HJ68_9LAMI/102-301   AC A0A2G9HJ68.1
#=GS U3KP05_RABIT/113-309       AC U3KP05.1
#=GS A0A022RND4_ERYGU/419-569   AC A0A022RND4.1
#=GS A0A0B2S4N3_GLYSO/135-304   AC A0A0B2S4N3.1
#=GS A0A287KNN2_HORVV/45-244    AC A0A287KNN2.1
#=GS SINL6_ARATH/87-264         AC Q9FKD9.1
#=GS A0A2J6M6D9_LACSA/104-303   AC A0A2J6M6D9.1
#=GS A0A2J7QTL9_9NEOP/61-256    AC A0A2J7QTL9.1
#=GS A0A022RLP6_ERYGU/61-229    AC A0A022RLP6.1
#=GS J9NYA3_CANLF/72-255        AC J9NYA3.1
#=GS A0A103YMV1_CYNCS/51-142    AC A0A103YMV1.1
#=GS A0A2U1QF76_ARTAN/117-291   AC A0A2U1QF76.1
#=GS A0A3B4WQM9_SERLL/86-282    AC A0A3B4WQM9.1
#=GS A0A1J1IGL0_9DIPT/390-586   AC A0A1J1IGL0.1
#=GS A0A2I0KYQ0_PUNGR/102-260   AC A0A2I0KYQ0.1
#=GS H0XXJ8_OTOGA/82-280        AC H0XXJ8.1
#=GS D7MIK1_ARALL/94-279        AC D7MIK1.1
#=GS M4DK70_BRARP/99-298        AC M4DK70.1
#=GS G1LQ56_AILME/129-325       AC G1LQ56.1
#=GS A0A2P8YDM6_BLAGE/187-342   AC A0A2P8YDM6.1
#=GS G3QHJ8_GORGO/67-256        AC G3QHJ8.1
#=GS M1D5F7_SOLTU/1-126         AC M1D5F7.1
#=GS A0A3L6SM13_PANMI/114-192   AC A0A3L6SM13.1
#=GS A0A2Y9R874_TRIMA/276-472   AC A0A2Y9R874.1
#=GS A0A0D2QUV9_GOSRA/144-303   AC A0A0D2QUV9.1
#=GS H2MEL0_ORYLA/86-282        AC H2MEL0.2
#=GS A0A1B6Q274_SORBI/97-271    AC A0A1B6Q274.1
#=GS V4LJH0_EUTSA/102-301       AC V4LJH0.1
#=GS A0A0P0UXQ7_ORYSJ/10-90     AC A0A0P0UXQ7.1
#=GS A0A3B6FJD9_WHEAT/104-207   AC A0A3B6FJD9.1
#=GS A0A0R3T347_HYMNN/190-383   AC A0A0R3T347.1
#=GS SIA1B_MOUSE/82-278         AC Q06985.2
#=GS A0A2P5RE63_GOSBA/95-294    AC A0A2P5RE63.1
#=GS A0A154PK96_DUFNO/79-275    AC A0A154PK96.1
#=GS A0A3L6TK99_PANMI/249-339   AC A0A3L6TK99.1
#=GS A0A2K6EUC9_PROCO/122-318   AC A0A2K6EUC9.1
#=GS A0A3B6IQ46_WHEAT/78-163    AC A0A3B6IQ46.1
#=GS A0A2K5I7G1_COLAP/113-309   AC A0A2K5I7G1.1
#=GS A0A2G9G3Y6_9LAMI/102-301   AC A0A2G9G3Y6.1
#=GS A0A3B4CFI2_PYGNA/144-340   AC A0A3B4CFI2.1
#=GS A0A3B6RA34_WHEAT/99-189    AC A0A3B6RA34.1
#=GS B0X888_CULQU/115-318       AC B0X888.1
#=GS I1PBE1_ORYGL/95-294        AC I1PBE1.1
#=GS A0A103Y6P8_CYNCS/96-295    AC A0A103Y6P8.1
#=GS A0A2G5DCG5_AQUCA/61-122    AC A0A2G5DCG5.1
#=GS A0A498IGI7_MALDO/81-280    AC A0A498IGI7.1
#=GS A0A2G3DEB1_CAPCH/101-300   AC A0A2G3DEB1.1
#=GS A0A0E0BWA1_9ORYZ/113-193   AC A0A0E0BWA1.1
#=GS A0A482WB72_9CUCU/113-298   AC A0A482WB72.1
#=GS A0A2T7DQG5_9POAL/63-236    AC A0A2T7DQG5.1
#=GS A0A2P8YDC2_BLAGE/7-125     AC A0A2P8YDC2.1
#=GS A0A226DN41_FOLCA/651-853   AC A0A226DN41.1
#=GS A0A0V1NTG3_9BILA/95-294    AC A0A0V1NTG3.1
#=GS A0A3B6EEQ0_WHEAT/93-292    AC A0A3B6EEQ0.1
#=GS A0A1J7IVI5_LUPAN/90-289    AC A0A1J7IVI5.1
#=GS A0A3Q7Y2P8_CICAR/109-308   AC A0A3Q7Y2P8.1
#=GS A0A2K5HYA2_COLAP/72-256    AC A0A2K5HYA2.1
#=GS A0A368R2X0_SETIT/112-188   AC A0A368R2X0.1
#=GS A0A3B6JHX7_WHEAT/95-294    AC A0A3B6JHX7.1
#=GS A0A1D2N7C1_ORCCI/98-293    AC A0A1D2N7C1.1
#=GS A0A3L6R9H1_PANMI/134-291   AC A0A3L6R9H1.1
#=GS A0A2P8XKI3_BLAGE/59-247    AC A0A2P8XKI3.1
#=GS A0A0A0KWV9_CUCSA/120-319   AC A0A0A0KWV9.1
#=GS I1K2W5_SOYBN/135-302       AC I1K2W5.1
#=GS Q7PZE6_ANOGA/31-226        AC Q7PZE6.4
#=GS A0A443Q076_9MAGN/99-298    AC A0A443Q076.1
#=GS A0A1A6GZK6_NEOLE/149-344   AC A0A1A6GZK6.1
#=GS A0A2P8YDE4_BLAGE/104-240   AC A0A2P8YDE4.1
#=GS A0A3Q0D5T2_MESAU/98-294    AC A0A3Q0D5T2.1
#=GS A0A2A4K3N6_HELVI/69-262    AC A0A2A4K3N6.1
#=GS A0A2P8XBY7_BLAGE/55-249    AC A0A2P8XBY7.1
#=GS F1PEG8_CANLF/108-304       AC F1PEG8.2
#=GS A0A226EZU3_FOLCA/52-249    AC A0A226EZU3.1
#=GS A5CAJ5_VITVI/99-298        AC A5CAJ5.1
#=GS A0A3Q7UIN5_VULVU/71-254    AC A0A3Q7UIN5.1
#=GS A0A287JZW5_HORVV/79-156    AC A0A287JZW5.1
#=GS A0A067FAG8_CITSI/30-202    AC A0A067FAG8.1
#=GS G3HYR1_CRIGR/82-278        AC G3HYR1.1
#=GS I1NCM1_SOYBN/94-216        AC I1NCM1.1
#=GS A0A437AS75_CHISP/3-103     AC A0A437AS75.1
#=GS A0A1U8H864_CAPAN/99-298    AC A0A1U8H864.1
#=GS A0A3Q3MSE2_9LABR/86-282    AC A0A3Q3MSE2.1
#=GS A0A3P8PYP0_ASTCA/82-278    AC A0A3P8PYP0.1
#=GS A2Y0H7_ORYSI/173-290       AC A2Y0H7.1
#=GS A0A2A4K3L4_HELVI/70-263    AC A0A2A4K3L4.1
#=GS W5M1E6_LEPOC/109-272       AC W5M1E6.1
#=GS A0A2P5SKP9_GOSBA/102-301   AC A0A2P5SKP9.1
#=GS A0A0N4UKP6_DRAME/132-329   AC A0A0N4UKP6.1
#=GS A0A0L0BM07_LUCCU/99-295    AC A0A0L0BM07.1
#=GS A0A0D3EJ23_9ORYZ/97-188    AC A0A0D3EJ23.1
#=GS A0A453QUU7_AEGTS/1-87      AC A0A453QUU7.1
#=GS A0A4P1QX77_LUPAN/117-265   AC A0A4P1QX77.1
#=GS U3KN60_RABIT/83-253        AC U3KN60.1
#=GS A0A484BVW0_DRONA/121-316   AC A0A484BVW0.1
#=GS A0A2I4DSR8_JUGRE/371-522   AC A0A2I4DSR8.1
#=GS A0A067D462_CITSI/101-272   AC A0A067D462.1
#=GS A0A0E0MTL9_ORYRU/54-253    AC A0A0E0MTL9.1
#=GS A0A0D2Q762_GOSRA/117-169   AC A0A0D2Q762.1
#=GS A0A182R0S6_9DIPT/107-311   AC A0A182R0S6.1
#=GS A0A2A2K0F3_9BILA/149-347   AC A0A2A2K0F3.1
#=GS A0A2T7E8D2_9POAL/110-191   AC A0A2T7E8D2.1
#=GS W5J851_ANODA/84-280        AC W5J851.1
#=GS A0A2P8XG93_BLAGE/191-367   AC A0A2P8XG93.1
#=GS A0A368QBB5_SETIT/89-206    AC A0A368QBB5.1
#=GS A0A3Q3MC28_9TELE/86-282    AC A0A3Q3MC28.1
#=GS I1JS02_SOYBN/91-283        AC I1JS02.1
#=GS A0A0D9Y2L7_9ORYZ/116-314   AC A0A0D9Y2L7.1
#=GS A0A078HAA9_BRANA/101-300   AC A0A078HAA9.1
#=GS A0A093HKA1_STRCA/82-278    AC A0A093HKA1.1
#=GS A0A2K2DVQ9_BRADI/137-294   AC A0A2K2DVQ9.1
#=GS Q7XAM5_ORYSJ/96-295        AC Q7XAM5.1
#=GS W7X4R0_TETTS/61-157        AC W7X4R0.1
#=GS A0A1U7Z1X2_NICSY/605-775   AC A0A1U7Z1X2.1
#=GS A0A2H3XPR8_PHODC/90-290    AC A0A2H3XPR8.1
#=GS A0A2Y9NZQ9_DELLE/121-317   AC A0A2Y9NZQ9.1
#=GS A0A1W0VWE7_SORBI/90-236    AC A0A1W0VWE7.1
#=GS D6WLK5_TRICA/43-215        AC D6WLK5.1
#=GS A0A3B6FFP8_WHEAT/116-206   AC A0A3B6FFP8.1
#=GS A0A3P8X5X9_CYNSE/86-282    AC A0A3P8X5X9.1
#=GS A0A2U3WK82_ODORO/82-278    AC A0A2U3WK82.1
#=GS A0A1U7W384_NICSY/101-300   AC A0A1U7W384.1
#=GS A0A4D8ZQ51_SALSN/63-145    AC A0A4D8ZQ51.1
#=GS A0A022PZJ2_ERYGU/101-300   AC A0A022PZJ2.1
#=GS A0A1Y2HJU6_9FUNG/95-171    AC A0A1Y2HJU6.1
#=GS A0A498JB15_MALDO/244-383   AC A0A498JB15.1
#=GS A2WK57_ORYSI/84-171        AC A2WK57.1
#=GS A0A314ZQD3_PRUYE/113-312   AC A0A314ZQD3.1
#=GS A0A1J6J8A0_NICAT/110-309   AC A0A1J6J8A0.1
#=GS A0A0E0JDG9_ORYPU/149-241   AC A0A0E0JDG9.1
#=GS A0A1W4UG31_DROFC/149-344   AC A0A1W4UG31.1
#=GS A0A3Q4HL54_NEOBR/132-328   AC A0A3Q4HL54.1
#=GS A0A3B6E9D1_WHEAT/101-209   AC A0A3B6E9D1.1
#=GS A0A0D3BWE0_BRAOL/102-301   AC A0A0D3BWE0.1
#=GS A0A0L0SCS7_ALLM3/146-250   AC A0A0L0SCS7.1
#=GS A0A1W4XCS1_AGRPL/323-512   AC A0A1W4XCS1.1
#=GS A0A384D2B8_URSMA/113-309   AC A0A384D2B8.1
#=GS A0A1U8HCL3_CAPAN/111-310   AC A0A1U8HCL3.1
#=GS A0A1S3MNR6_SALSA/86-282    AC A0A1S3MNR6.1
#=GS A0A0D9Y5R1_9ORYZ/1-160     AC A0A0D9Y5R1.1
#=GS A0A1U7U0C7_TARSY/82-278    AC A0A1U7U0C7.1
#=GS A0A453J8J5_AEGTS/80-240    AC A0A453J8J5.1
#=GS A0A182Y9D8_ANOST/52-263    AC A0A182Y9D8.1
#=GS M7YF51_TRIUA/97-188        AC M7YF51.1
#=GS A0A3B6GK60_WHEAT/75-217    AC A0A3B6GK60.1
#=GS A0A287X319_HORVV/1-126     AC A0A287X319.1
#=GS F6SK11_CALJA/113-309       AC F6SK11.1
#=GS A0A314KW14_NICAT/101-300   AC A0A314KW14.1
#=GS A0A2P8Y2Z5_BLAGE/55-242    AC A0A2P8Y2Z5.1
#=GS A0A340WUF4_LIPVE/82-278    AC A0A340WUF4.1
#=GS A0A3Q0FI19_ALLSI/93-289    AC A0A3Q0FI19.1
#=GS A0A453DQA1_AEGTS/38-134    AC A0A453DQA1.1
#=GS A0A2P8YDN6_BLAGE/96-287    AC A0A2P8YDN6.1
#=GS A0A452QHP4_URSAM/82-278    AC A0A452QHP4.1
#=GS A0A2K6TPM0_SAIBB/83-256    AC A0A2K6TPM0.1
#=GS A0A0K9PS33_ZOSMR/121-210   AC A0A0K9PS33.1
#=GS M0W8Q4_HORVV/179-335       AC M0W8Q4.1
#=GS M7ZRI3_TRIUA/111-232       AC M7ZRI3.1
#=GS A0A1U7Z9K8_NELNU/108-258   AC A0A1U7Z9K8.1
#=GS A0A2K5S850_CEBCA/83-256    AC A0A2K5S850.1
#=GS M4CJL7_BRARP/77-216        AC M4CJL7.1
#=GS A0A0V0VIU1_9BILA/95-294    AC A0A0V0VIU1.1
#=GS A0A3Q0HFU1_ALLSI/43-229    AC A0A3Q0HFU1.1
#=GS A0A0N5DW90_TRIMR/127-323   AC A0A0N5DW90.1
#=GS A0A453DS68_AEGTS/78-184    AC A0A453DS68.1
#=GS A0A0A0KF08_CUCSA/95-294    AC A0A0A0KF08.1
#=GS M0UGH5_HORVV/81-242        AC M0UGH5.1
#=GS A0A232EPE6_9HYME/78-274    AC A0A232EPE6.1
#=GS A0A194YIF2_SORBI/3-93      AC A0A194YIF2.1
#=GS M0SF52_MUSAM/94-293        AC M0SF52.1
#=GS A0A1V9XUP1_9ACAR/1-192     AC A0A1V9XUP1.1
#=GS A0A0D9UW99_9ORYZ/72-156    AC A0A0D9UW99.1
#=GS A0A3Q0IP09_DIACI/454-551   AC A0A3Q0IP09.1
#=GS R0HKJ3_9BRAS/78-187        AC R0HKJ3.1
#=GS A0A286ZUL1_PIG/113-309     AC A0A286ZUL1.1
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#=GS D7MK79_ARALL/1-162         AC D7MK79.1
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#=GS SINL2_ARATH/86-204         AC Q9C6H3.1
#=GS A0A1U8K792_GOSHI/144-303   AC A0A1U8K792.1
#=GS A0A2P5CBV4_TREOI/171-341   AC A0A2P5CBV4.1
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#=GS H3ADB1_LATCH/114-310       AC H3ADB1.2
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