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Database: Pfam
Entry: Sterol-sensing
LinkDB: Sterol-sensing
Original site: Sterol-sensing 
#=GF ID   Sterol-sensing
#=GF AC   PF12349.9
#=GF DE   Sterol-sensing domain of SREBP cleavage-activation
#=GF PI   SREBP-CAP_SSD;
#=GF AU   Wood V;0000-0001-6330-7526
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF SE   Wood V
#=GF GA   22.30 22.30;
#=GF TC   22.30 22.30;
#=GF NC   22.20 22.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   9488713
#=GF RT   Cleavage of sterol regulatory element-binding proteins (SREBPs)
#=GF RT   at site-1 requires interaction with SREBP cleavage-activating
#=GF RT   protein.  Evidence from in vivo competition studies.
#=GF RA   Sakai J, Nohturfft A, Goldstein JL, Brown MS;
#=GF RL   J Biol Chem. 1998;273:5785-5793.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   17604677
#=GF RT   Endoplasmic reticulum stress causes the activation of sterol
#=GF RT   regulatory element binding protein-2.
#=GF RA   Colgan SM, Tang D, Werstuck GH, Austin RC;
#=GF RL   Int J Biochem Cell Biol. 2007;39:1843-1851.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   9242699
#=GF RT   Identification of complexes between the COOH-terminal domains of
#=GF RT   sterol regulatory element-binding proteins (SREBPs) and SREBP
#=GF RT   cleavage-activating protein.
#=GF RA   Sakai J, Nohturfft A, Cheng D, Ho YK, Brown MS, Goldstein JL;
#=GF RL   J Biol Chem. 1997;272:20213-20221.
#=GF RN   [4]
#=GF RM   12482938
#=GF RT   Three mutations in sterol-sensing domain of SCAP block
#=GF RT   interaction with insig and render SREBP cleavage insensitive to
#=GF RT   sterols.
#=GF RA   Yabe D, Xia ZP, Adams CM, Rawson RB;
#=GF RL   Proc Natl Acad Sci U S A. 2002;99:16672-16677.
#=GF DR   INTERPRO; IPR000731;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   Sterol regulatory element-binding proteins (SREBPs) are
#=GF CC   membrane-bound transcription factors that promote lipid
#=GF CC   synthesis in animal cells. They are embedded in the membranes of
#=GF CC   the endoplasmic reticulum (ER) in a helical hairpin orientation
#=GF CC   and are released from the ER by a two-step proteolytic process.
#=GF CC   Proteolysis begins when the SREBPs are cleaved at Site-1, which
#=GF CC   is located at a leucine residue in the middle of the hydrophobic
#=GF CC   loop in the lumen of the ER [1]. Upon proteolytic processing
#=GF CC   SREBP can activate the expression of genes involved in
#=GF CC   cholesterol biosynthesis and uptake. SCAP stimulates cleavage of
#=GF CC   SREBPs via fusion of the their two C-termini [2]. This domain is
#=GF CC   the transmembrane region that traverses the membrane eight times
#=GF CC   and is the sterol-sensing domain of the cleavage protein [4].
#=GF CC   WD40 domains are found towards the C-terminus.
#=GF SQ   3616
#=GS A0A287BH10_PIG/308-457      AC A0A287BH10.1
#=GS A0A371DQH6_9APHY/250-412    AC A0A371DQH6.1
#=GS A0A0L0GFT6_9EUKA/316-468    AC A0A0L0GFT6.1
#=GS A0A168LNG4_ABSGL/273-427    AC A0A168LNG4.1
#=GS G3S497_GORGO/661-815        AC G3S497.2
#=GS A0A1U7QGI0_MESAU/448-602    AC A0A1U7QGI0.1
#=GS A0A074Z635_AURSE/285-433    AC A0A074Z635.1
#=GS A0A2K6AAT5_MANLE/649-803    AC A0A2K6AAT5.1
#=GS A0A2J7R3R4_9NEOP/89-229     AC A0A2J7R3R4.1
#=GS A0A3P9Q6K1_POERE/304-453    AC A0A3P9Q6K1.1
#=GS A0A2K6TVW9_SAIBB/452-606    AC A0A2K6TVW9.1
#=GS A0A0C3G4Y6_9AGAM/264-432    AC A0A0C3G4Y6.1
#=GS A0A2H5P1B2_CITUN/1381-1533  AC A0A2H5P1B2.1
#=GS U3KNR7_RABIT/658-812        AC U3KNR7.1
#=GS A0A3Q3H0U9_9LABR/53-205     AC A0A3Q3H0U9.1
#=GS A0A368GRS4_ANCCA/1-95       AC A0A368GRS4.1
#=GS A0A2Y9IXW6_ENHLU/308-457    AC A0A2Y9IXW6.1
#=GS L1JX55_GUITC/94-245         AC L1JX55.1
#=GS A0A452R598_URSAM/641-795    AC A0A452R598.1
#=GS A0A3B4GMP7_9CICH/678-832    AC A0A3B4GMP7.1
#=GS A0A384D421_URSMA/564-710    AC A0A384D421.1
#=GS K7ICZ3_CAEJA/1-95           AC K7ICZ3.1
#=GS U3JLH0_FICAL/416-570        AC U3JLH0.1
#=GS E4ZJ18_LEPMJ/638-802        AC E4ZJ18.1
#=GS A0A3B3UZY5_9TELE/476-627    AC A0A3B3UZY5.1
#=GS A0A3P8RG15_ASTCA/417-569    AC A0A3P8RG15.1
#=GS A0A091FX76_9AVES/85-235     AC A0A091FX76.1
#=GS A0A2U4BQ38_TURTR/112-266    AC A0A2U4BQ38.1
#=GS A0A2S7QTS4_9HELO/277-452    AC A0A2S7QTS4.1
#=GS C3ZSN0_BRAFL/718-872        AC C3ZSN0.1
#=GS M2NK65_BAUPA/269-436        AC M2NK65.1
#=GS A0A317W223_ASPEC/266-437    AC A0A317W223.1
#=GS A0A3P9BWM4_9CICH/390-539    AC A0A3P9BWM4.1
#=GS A0A0B7N1N1_9FUNG/620-768    AC A0A0B7N1N1.1
#=GS A0A2Y9PZQ3_DELLE/661-815    AC A0A2Y9PZQ3.1
#=GS A0A1D5Q618_MACMU/649-803    AC A0A1D5Q618.1
#=GS A0A2I4CXI3_9TELE/650-804    AC A0A2I4CXI3.1
#=GS A0A1V8TLK7_9PEZI/289-441    AC A0A1V8TLK7.1
#=GS A0A182MRB0_9DIPT/461-614    AC A0A182MRB0.1
#=GS A0A2K5KTK0_CERAT/85-235     AC A0A2K5KTK0.1
#=GS A0A2H5P1K4_CITUN/1381-1533  AC A0A2H5P1K4.1
#=GS A0A136JGG9_9PEZI/267-438    AC A0A136JGG9.1
#=GS F1R837_DANRE/445-597        AC F1R837.1
#=GS A0A165R1X1_9APHY/317-466    AC A0A165R1X1.1
#=GS A0A370JHS7_VENIN/1-138      AC A0A370JHS7.1
#=GS A0A2C9LQU5_BIOGL/445-581    AC A0A2C9LQU5.1
#=GS A0A3B4VJC9_SERDU/613-767    AC A0A3B4VJC9.1
#=GS A0A016SH32_9BILA/27-178     AC A0A016SH32.1
#=GS H3CF93_TETNG/85-236         AC H3CF93.1
#=GS A0A2T3AR69_AMORE/276-450    AC A0A2T3AR69.1
#=GS A0A3B3WT59_9TELE/84-234     AC A0A3B3WT59.1
#=GS I3MQN9_ICTTR/308-457        AC I3MQN9.2
#=GS A0A3Q1AUX4_AMPOC/84-234     AC A0A3Q1AUX4.1
#=GS K9FMK0_PEND2/267-437        AC K9FMK0.1
#=GS G3PZ00_GASAC/643-797        AC G3PZ00.1
#=GS Q6FKH6_CANGA/214-372        AC Q6FKH6.1
#=GS A0A2R9A944_PANPA/661-815    AC A0A2R9A944.1
#=GS A0A080WLA7_TRIRC/2-136      AC A0A080WLA7.1
#=GS A0A1Y2J961_PYCCO/285-447    AC A0A1Y2J961.1
#=GS A0A1Y2WXS4_9PEZI/621-776    AC A0A1Y2WXS4.1
#=GS A0A3B3HKK1_ORYLA/390-539    AC A0A3B3HKK1.1
#=GS A0A3Q1I1K2_ANATE/84-234     AC A0A3Q1I1K2.1
#=GS A8XFS7_CAEBR/369-509        AC A8XFS7.2
#=GS SCAP_PIG/308-457            AC Q5MNU5.2
#=GS F7HJ02_MACMU/85-235         AC F7HJ02.2
#=GS A0A3Q1AWX9_AMPOC/84-234     AC A0A3Q1AWX9.1
#=GS A0A2I2UV66_FELCA/85-235     AC A0A2I2UV66.1
#=GS E9QEH6_DANRE/301-450        AC E9QEH6.1
#=GS A0A0N5D778_THECL/295-442    AC A0A0N5D778.1
#=GS R1EL95_BOTPV/261-314        AC R1EL95.1
#=GS A0A1W4W9C1_AGRPL/423-561    AC A0A1W4W9C1.1
#=GS G7E403_MIXOS/1056-1138      AC G7E403.1
#=GS A0A2Y9KXT1_ENHLU/662-816    AC A0A2Y9KXT1.1
#=GS A0A319A2X7_ASPLB/266-437    AC A0A319A2X7.1
#=GS A0A1A6HV76_NEOLE/644-792    AC A0A1A6HV76.1
#=GS A0A3Q1G6Z1_9TELE/452-606    AC A0A3Q1G6Z1.1
#=GS A0A2I3SU78_PANTR/652-806    AC A0A2I3SU78.1
#=GS A0A1L9VQN3_ASPGL/632-787    AC A0A1L9VQN3.1
#=GS A0A094DCI6_9PEZI/343-436    AC A0A094DCI6.1
#=GS N1RED0_FUSC4/311-463        AC N1RED0.1
#=GS A0A093Y8A7_9PEZI/343-436    AC A0A093Y8A7.1
#=GS G4MWF9_MAGO7/267-444        AC G4MWF9.1
#=GS L5KL12_PTEAL/78-228         AC L5KL12.1
#=GS F6WAG3_XENTR/85-235         AC F6WAG3.1
#=GS A0A1Y1VKF6_9FUNG/423-576    AC A0A1Y1VKF6.1
#=GS A0A0P7AUU8_9HYPO/261-414    AC A0A0P7AUU8.1
#=GS A0A0R3S7Z0_HYMDI/495-651    AC A0A0R3S7Z0.1
#=GS A0A3P8ZP16_ESOLU/85-235     AC A0A3P8ZP16.1
#=GS A0A401P326_SCYTO/654-808    AC A0A401P326.1
#=GS A0A437AC31_9PEZI/641-796    AC A0A437AC31.1
#=GS A0A0C2X4A3_AMAMU/264-436    AC A0A0C2X4A3.1
#=GS K7J0E0_NASVI/95-244         AC K7J0E0.1
#=GS A0A074SJ49_9AGAM/243-340    AC A0A074SJ49.1
#=GS A0A3Q1IU64_ANATE/453-607    AC A0A3Q1IU64.1
#=GS Z4YJC9_MOUSE/661-815        AC Z4YJC9.1
#=GS A0A0V1LQB9_9BILA/316-466    AC A0A0V1LQB9.1
#=GS X2J9B0_DROME/647-801        AC X2J9B0.1
#=GS A0A2K6AMQ2_MACNE/649-803    AC A0A2K6AMQ2.1
#=GS A0A3P8ZVR1_ESOLU/305-454    AC A0A3P8ZVR1.1
#=GS A0A2G8LCG5_STIJA/595-748    AC A0A2G8LCG5.1
#=GS A0A2Y9J6C5_ENHLU/308-457    AC A0A2Y9J6C5.1
#=GS A0A452EN38_CAPHI/663-817    AC A0A452EN38.1
#=GS A0A1V9XBX1_9ACAR/619-773    AC A0A1V9XBX1.1
#=GS A0A158QTJ5_9CEST/281-450    AC A0A158QTJ5.1
#=GS A0A0V1B9G4_TRISP/1308-1455  AC A0A0V1B9G4.1
#=GS A0A1L0BYS7_9ASCO/635-790    AC A0A1L0BYS7.1
#=GS A0A226PQL2_COLVI/754-881    AC A0A226PQL2.1
#=GS A0A2K5XEF9_MANLE/418-570    AC A0A2K5XEF9.1
#=GS E7A0E6_SPORE/425-578        AC E7A0E6.1
#=GS A0A1X2GXL3_9FUNG/260-412    AC A0A1X2GXL3.1
#=GS A0A2A9P7S7_9HYPO/265-417    AC A0A2A9P7S7.1
#=GS A0A2U4AYN3_TURTR/649-803    AC A0A2U4AYN3.1
#=GS A0A1B9GE12_9TREE/445-601    AC A0A1B9GE12.1
#=GS A0A1B8AHB4_FUSPO/623-778    AC A0A1B8AHB4.1
#=GS W5LWR5_LEPOC/2-127          AC W5LWR5.1
#=GS A0A183HQ34_9BILA/18-68      AC A0A183HQ34.1
#=GS A0A1B8DZX7_9PEZI/310-462    AC A0A1B8DZX7.1
#=GS M5GAU0_DACPD/313-461        AC M5GAU0.1
#=GS A0A195BTZ6_9HYME/398-553    AC A0A195BTZ6.1
#=GS A0A1S3WDI6_ERIEU/663-817    AC A0A1S3WDI6.1
#=GS G3WNV7_SARHA/448-602        AC G3WNV7.1
#=GS B4KT98_DROMO/384-537        AC B4KT98.1
#=GS A0A0C4EG79_MAGP6/636-791    AC A0A0C4EG79.1
#=GS N4VBA3_COLOR/266-441        AC N4VBA3.1
#=GS A0A1I7TA84_9PELO/286-439    AC A0A1I7TA84.1
#=GS A0A423VES8_9PEZI/216-369    AC A0A423VES8.1
#=GS A0A3P8VH69_CYNSE/495-649    AC A0A3P8VH69.1
#=GS A0A287DDH1_ICTTR/662-816    AC A0A287DDH1.1
#=GS A0A3Q1JMS3_ANATE/626-780    AC A0A3Q1JMS3.1
#=GS A0A0D0AR60_9AGAM/265-431    AC A0A0D0AR60.1
#=GS A0A1F5LK55_9EURO/593-748    AC A0A1F5LK55.1
#=GS A0A2J7R5B1_9NEOP/59-209     AC A0A2J7R5B1.1
#=GS R0K1D0_SETT2/668-821        AC R0K1D0.1
#=GS A0A2P8AIL2_9PEZI/267-436    AC A0A2P8AIL2.1
#=GS H3CES5_TETNG/296-448        AC H3CES5.1
#=GS V2XB01_MONRO/270-436        AC V2XB01.1
#=GS A0A319FM69_ASPSB/228-391    AC A0A319FM69.1
#=GS A0A1D2MTG1_ORCCI/439-581    AC A0A1D2MTG1.1
#=GS A0A229Z413_9EURO/266-434    AC A0A229Z413.1
#=GS A0A1U8CMG6_MESAU/85-235     AC A0A1U8CMG6.1
#=GS A0A0M9VUT4_9HYPO/261-438    AC A0A0M9VUT4.1
#=GS M7UC50_BOTF1/277-446        AC M7UC50.1
#=GS H2VCT8_TAKRU/84-233         AC H2VCT8.2
#=GS G3UNS0_LOXAF/85-235         AC G3UNS0.1
#=GS A0A1L9X3M3_ASPAC/266-429    AC A0A1L9X3M3.1
#=GS A0A287CS69_ICTTR/308-457    AC A0A287CS69.1
#=GS Q6C3B9_YARLI/284-439        AC Q6C3B9.2
#=GS A0A3P9Q0Q9_POERE/84-234     AC A0A3P9Q0Q9.1
#=GS G3GYR3_CRIGR/418-570        AC G3GYR3.1
#=GS F1SBB5_PIG/648-802          AC F1SBB5.3
#=GS A0A067P0V7_PLEOS/328-477    AC A0A067P0V7.1
#=GS A0A383Z1E4_BALAS/308-457    AC A0A383Z1E4.1
#=GS A0A2V5GRD2_9EURO/266-429    AC A0A2V5GRD2.1
#=GS A0A3Q1EA39_9TELE/84-234     AC A0A3Q1EA39.1
#=GS H9JHQ1_BOMMO/598-752        AC H9JHQ1.1
#=GS A0A150GTL6_GONPE/1-102      AC A0A150GTL6.1
#=GS G3VY29_SARHA/308-457        AC G3VY29.1
#=GS A0A2B7Z979_9EURO/267-437    AC A0A2B7Z979.1
#=GS A0A183WFV6_TRIRE/53-160     AC A0A183WFV6.1
#=GS G1SQB2_RABIT/454-598        AC G1SQB2.1
#=GS M7NPQ9_PNEMU/228-384        AC M7NPQ9.1
#=GS A0A1V6QZC5_9EURO/265-437    AC A0A1V6QZC5.1
#=GS E2AX94_CAMFO/91-264         AC E2AX94.1
#=GS A0A094KAC1_9PEZI/310-462    AC A0A094KAC1.1
#=GS A0A195BRT8_9HYME/634-788    AC A0A195BRT8.1
#=GS F6RHK7_XENTR/420-569        AC F6RHK7.1
#=GS A0A3B3WZC6_9TELE/478-629    AC A0A3B3WZC6.1
#=GS A0A3Q0EKB4_TARSY/85-235     AC A0A3Q0EKB4.1
#=GS A0A3B3R063_9TELE/85-235     AC A0A3B3R063.1
#=GS A0A1D1W925_RAMVA/358-511    AC A0A1D1W925.1
#=GS A0A2K6R0X3_RHIRO/661-723    AC A0A2K6R0X3.1
#=GS A0A1S3WPT1_ERIEU/78-227     AC A0A1S3WPT1.1
#=GS A0A367JBF7_9FUNG/268-418    AC A0A367JBF7.1
#=GS A0A2K1QJI8_9PEZI/630-785    AC A0A2K1QJI8.1
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#=GS SCAP_MOUSE/308-457          AC Q6GQT6.1
#=GS E0VRD4_PEDHC/317-468        AC E0VRD4.1
#=GS A0A452R574_URSAM/648-802    AC A0A452R574.1
#=GS W3WM89_PESFW/240-410        AC W3WM89.1
#=GS A0A1V1TL12_9FUNG/264-428    AC A0A1V1TL12.1
#=GS J4GUK2_9APHY/406-556        AC J4GUK2.1
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#=GS C5MCB4_CANTT/610-765        AC C5MCB4.1
#=GS A0A1Y2XDY6_9PEZI/477-651    AC A0A1Y2XDY6.1
#=GS A0A2X0MLB0_9BASI/290-356    AC A0A2X0MLB0.1
#=GS M4AFX3_XIPMA/527-677        AC M4AFX3.2
#=GS A0A0D1XVH4_9PEZI/311-462    AC A0A0D1XVH4.1
#=GS A0A0E9NLD0_SAICN/218-373    AC A0A0E9NLD0.1
#=GS A0A0V0Y1D0_TRIPS/252-402    AC A0A0V0Y1D0.1
#=GS A0A448YGY0_BRENA/270-422    AC A0A448YGY0.1
#=GS L8FPT7_PSED2/310-462        AC L8FPT7.1
#=GS A0A395SVG7_FUSSP/267-441    AC A0A395SVG7.1
#=GS S4RDZ4_PETMA/644-798        AC S4RDZ4.1
#=GS A0A3Q0IIG0_DIACI/427-577    AC A0A3Q0IIG0.1
#=GS A0A3Q1HF16_ANATE/625-778    AC A0A3Q1HF16.1
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#=GS A0A100I9Q7_ASPNG/257-412    AC A0A100I9Q7.1
#=GS E9PY17_MOUSE/85-210         AC E9PY17.1
#=GS A0A0R3TU16_HYMNN/495-651    AC A0A0R3TU16.2
#=GS PTC2_HUMAN/418-570          AC Q9Y6C5.2
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#=GS V2WQX4_MONRO/284-432        AC V2WQX4.1
#=GS F0X9U6_GROCL/646-801        AC F0X9U6.1
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