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Database: Pfam
Entry: Strumpellin
LinkDB: Strumpellin
Original site: Strumpellin 
#=GF ID   Strumpellin
#=GF AC   PF10266.10
#=GF DE   Hereditary spastic paraplegia protein strumpellin
#=GF AU   KOGs;
#=GF AU   Finn RD;0000-0001-8626-2148
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF SE   KOGs (KOG3666)
#=GF GA   25.00 25.00;
#=GF TC   26.00 25.60;
#=GF NC   22.70 24.60;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   17160902
#=GF RT   Mutations in the KIAA0196 gene at the SPG8 locus cause
#=GF RT   hereditary spastic paraplegia. 
#=GF RA   Valdmanis PN, Meijer IA, Reynolds A, Lei A, MacLeod P,
#=GF RA   Schlesinger D, Zatz M, Reid E, Dion PA, Drapeau P, Rouleau GA; 
#=GF RL   Am J Hum Genet. 2007;80:152-161.
#=GF DR   INTERPRO; IPR019393;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This is a family of proteins conserved from plants to humans, in
#=GF CC   which two closely situated point mutations in the human protein
#=GF CC   lead to the condition of hereditary spastic paraplegia.
#=GF CC   Strumpellin contains one known domain called a spectrin repeat
#=GF CC   that consists of three alpha-helices of a characteristic length
#=GF CC   wrapped in a left-handed coiled coil. The spectrin proteins have
#=GF CC   multiple copies of this repeat, which can then form multimers in
#=GF CC   the cell. Spectrin associates with the cell membrane via
#=GF CC   spectrin repeats in the ankyrin protein. The spectrin repeat is
#=GF CC   a structural platform for cytoskeletal protein assemblies.
#=GF SQ   698
#=GS A0A3P8VPU0_CYNSE/23-734     AC A0A3P8VPU0.1
#=GS T1L5K5_TETUR/116-299        AC T1L5K5.1
#=GS A0A091HQ18_CALAN/28-1108    AC A0A091HQ18.1
#=GS U3DDN4_CALJA/23-1103        AC U3DDN4.1
#=GS A0A182LZN1_9DIPT/31-1133    AC A0A182LZN1.1
#=GS A0A0N5CWK6_THECL/21-1133    AC A0A0N5CWK6.1
#=GS J3LXE8_ORYBR/1-1011         AC J3LXE8.1
#=GS F6RQ92_HORSE/23-1103        AC F6RQ92.2
#=GS A0A2U4B3B9_TURTR/111-1041   AC A0A2U4B3B9.1
#=GS A0A158Q9T7_ENTVE/22-1011    AC A0A158Q9T7.1
#=GS A0A1S3FW18_DIPOR/274-1050   AC A0A1S3FW18.1
#=GS V4BY78_LOTGI/91-151         AC V4BY78.1
#=GS W2GN20_PHYPR/22-1099        AC W2GN20.1
#=GS A0A482WZU3_LAOST/25-872     AC A0A482WZU3.1
#=GS A0A3B3U3F6_9TELE/23-735     AC A0A3B3U3F6.1
#=GS A0A2K1K1H1_PHYPA/44-1151    AC A0A2K1K1H1.1
#=GS A0A0L7LAH5_9NEOP/1-62       AC A0A0L7LAH5.1
#=GS A0A2G5VK86_9PELO/1-414      AC A0A2G5VK86.1
#=GS A0A0D8XG88_DICVI/15-185     AC A0A0D8XG88.1
#=GS A0A261C7C5_9PELO/722-937    AC A0A261C7C5.1
#=GS A0A2U3V759_TURTR/23-1103    AC A0A2U3V759.1
#=GS A0A0D3FVC7_9ORYZ/723-927    AC A0A0D3FVC7.1
#=GS U3J3F9_ANAPP/23-1103        AC U3J3F9.2
#=GS A0A1S3S021_SALSA/23-252     AC A0A1S3S021.1
#=GS A0A200QH14_9MAGN/10-160     AC A0A200QH14.1
#=GS A0A091VMU8_NIPNI/28-1108    AC A0A091VMU8.1
#=GS A0A498P347_LABRO/23-105     AC A0A498P347.1
#=GS M9PCR4_DROME/73-1108        AC M9PCR4.1
#=GS R0LPC4_ANAPL/28-1113        AC R0LPC4.1
#=GS A0A0R3PMZ4_ANGCS/24-111     AC A0A0R3PMZ4.2
#=GS A0A0D2UH13_CAPO3/22-1101    AC A0A0D2UH13.1
#=GS K7GSG6_PIG/236-1052         AC K7GSG6.2
#=GS H2WRC3_CAEJA/714-901        AC H2WRC3.2
#=GS A0A1J1IQY8_9DIPT/12-1127    AC A0A1J1IQY8.1
#=GS G5AY99_HETGA/264-678        AC G5AY99.1
#=GS A0A1S3QWT1_SALSA/1-46       AC A0A1S3QWT1.1
#=GS A0A2U3Y7E6_LEPWE/1-955      AC A0A2U3Y7E6.1
#=GS W5MV85_LEPOC/25-1105        AC W5MV85.1
#=GS A0A443S1H4_9ACAR/23-340     AC A0A443S1H4.1
#=GS G3NSC2_GASAC/23-1108        AC G3NSC2.1
#=GS A0A158Q3Q5_DRAME/15-830     AC A0A158Q3Q5.1
#=GS F7BWM4_XENTR/27-1107        AC F7BWM4.1
#=GS A0A199V5T8_ANACO/4-731      AC A0A199V5T8.1
#=GS A0A226N3R7_CALSU/45-81      AC A0A226N3R7.1
#=GS H9JQ70_BOMMO/9-313          AC H9JQ70.1
#=GS A0A0R3R6M9_9BILA/173-244    AC A0A0R3R6M9.1
#=GS A0A2G8KRG8_STIJA/23-124     AC A0A2G8KRG8.1
#=GS A0A091CNB3_FUKDA/23-239     AC A0A091CNB3.1
#=GS A0A0N5AQG4_9BILA/26-1045    AC A0A0N5AQG4.1
#=GS A0A195BY80_9HYME/439-960    AC A0A195BY80.1
#=GS U4UAB3_DENPD/23-1093        AC U4UAB3.1
#=GS A0A337S1U3_FELCA/23-1102    AC A0A337S1U3.1
#=GS A0A0E0P8J6_ORYRU/31-708     AC A0A0E0P8J6.1
#=GS A0A1W4XPX2_AGRPL/23-877     AC A0A1W4XPX2.1
#=GS W2Q2S6_PHYPN/1-1013         AC W2Q2S6.1
#=GS B4IZY4_DROGR/23-1127        AC B4IZY4.1
#=GS A0A195F8X7_9HYME/23-1092    AC A0A195F8X7.1
#=GS A0A0D3FVC8_9ORYZ/28-806     AC A0A0D3FVC8.1
#=GS A0A484AYJ0_DRONA/23-1126    AC A0A484AYJ0.1
#=GS A0A3Q1CRV9_AMPOC/23-239     AC A0A3Q1CRV9.1
#=GS I3JJN7_ORENI/23-1103        AC I3JJN7.1
#=GS A0A1I8MJM4_MUSDO/973-2062   AC A0A1I8MJM4.1
#=GS A0A3B5K3X2_TAKRU/23-239     AC A0A3B5K3X2.1
#=GS A0A067QIX2_ZOONE/23-1106    AC A0A067QIX2.1
#=GS L9KZ71_TUPCH/54-195         AC L9KZ71.1
#=GS A0A3Q2L0Y5_HORSE/23-1069    AC A0A3Q2L0Y5.1
#=GS A0A3B4E2H1_PYGNA/23-1103    AC A0A3B4E2H1.1
#=GS A0A2U4B3B9_TURTR/23-115     AC A0A2U4B3B9.1
#=GS A0A1U8Q104_NELNU/31-973     AC A0A1U8Q104.1
#=GS A0A2T7NPK6_POMCA/672-985    AC A0A2T7NPK6.1
#=GS A0A084W9X9_ANOSI/24-1121    AC A0A084W9X9.1
#=GS O01858_CAEEL/17-714         AC O01858.1
#=GS A0A267DD98_9PLAT/14-1101    AC A0A267DD98.1
#=GS M3ZAQ8_NOMLE/23-151         AC M3ZAQ8.2
#=GS A0A2Y9LRV3_DELLE/23-986     AC A0A2Y9LRV3.1
#=GS A0A158P8E8_ANGCA/293-487    AC A0A158P8E8.1
#=GS M4BXN5_HYAAE/22-1068        AC M4BXN5.1
#=GS G5AY99_HETGA/61-267         AC G5AY99.1
#=GS F4WWX9_ACREC/23-1088        AC F4WWX9.1
#=GS A0A498SQ68_ACAVI/21-179     AC A0A498SQ68.1
#=GS A0A3Q0SXS0_AMPCI/23-1103    AC A0A3Q0SXS0.1
#=GS A0A0E0KQ11_ORYPU/709-807    AC A0A0E0KQ11.1
#=GS A0A3P9BCW3_9CICH/23-673     AC A0A3P9BCW3.1
#=GS A0A2K5QCT9_CEBCA/1-348      AC A0A2K5QCT9.1
#=GS A0A3B4FY96_9CICH/23-1103    AC A0A3B4FY96.1
#=GS C4LTG1_ENTHI/22-1062        AC C4LTG1.1
#=GS A0A2K5ZUV7_MANLE/770-1051   AC A0A2K5ZUV7.1
#=GS A0A3B4XRI2_SERLL/23-733     AC A0A3B4XRI2.1
#=GS A0A1B0G333_GLOMM/23-1022    AC A0A1B0G333.1
#=GS B3S1C5_TRIAD/23-1106        AC B3S1C5.1
#=GS A0A0E0KQ09_ORYPU/731-829    AC A0A0E0KQ09.1
#=GS A0A0J7K2J9_LASNI/1-396      AC A0A0J7K2J9.1
#=GS L9KZ71_TUPCH/433-587        AC L9KZ71.1
#=GS A0A3B5B7X9_9TELE/236-1052   AC A0A3B5B7X9.1
#=GS A0A0L7LA04_9NEOP/560-818    AC A0A0L7LA04.1
#=GS A0A0E0P8J5_ORYRU/784-989    AC A0A0E0P8J5.1
#=GS E5RFU6_HUMAN/1-163          AC E5RFU6.8
#=GS A0A2C9K087_BIOGL/23-844     AC A0A2C9K087.1
#=GS A0A3B3XEB2_9TELE/23-1103    AC A0A3B3XEB2.1
#=GS B7P2V8_IXOSC/22-435         AC B7P2V8.1
#=GS T1KG62_TETUR/495-643        AC T1KG62.2
#=GS A0A2R9BF54_PANPA/23-1103    AC A0A2R9BF54.1
#=GS A0A3B5B7V5_9TELE/23-1103    AC A0A3B5B7V5.1
#=GS A0A2I4ATK6_9TELE/1-955      AC A0A2I4ATK6.1
#=GS S4RWC9_PETMA/2-880          AC S4RWC9.1
#=GS A0A2K5ZUW9_MANLE/612-677    AC A0A2K5ZUW9.1
#=GS A0A0N4XFH2_NIPBR/307-435    AC A0A0N4XFH2.1
#=GS A0A3B4UG12_SERDU/23-673     AC A0A3B4UG12.1
#=GS A0A0D9W4E9_9ORYZ/385-923    AC A0A0D9W4E9.1
#=GS A0A182PF45_9DIPT/24-807     AC A0A182PF45.1
#=GS A0A0D3FVC5_9ORYZ/28-784     AC A0A0D3FVC5.1
#=GS A0A452HUZ8_9SAUR/24-673     AC A0A452HUZ8.1
#=GS A0A0D9ZK77_9ORYZ/820-1026   AC A0A0D9ZK77.1
#=GS A0A2I3HC31_NOMLE/1-339      AC A0A2I3HC31.1
#=GS H0ZQI1_TAEGU/28-1108        AC H0ZQI1.1
#=GS A0A1I8MJM4_MUSDO/1-975      AC A0A1I8MJM4.1
#=GS M7BUI4_CHEMY/357-499        AC M7BUI4.1
#=GS A0A2K6B5H5_MACNE/1-339      AC A0A2K6B5H5.1
#=GS A0A1U8Q2S9_NELNU/11-1031    AC A0A1U8Q2S9.1
#=GS A0A0N4YK01_NIPBR/393-879    AC A0A0N4YK01.1
#=GS A0A287A0F4_PIG/23-673       AC A0A287A0F4.1
#=GS A0A087YKJ6_POEFO/25-1110    AC A0A087YKJ6.1
#=GS M3ZAQ8_NOMLE/149-767        AC M3ZAQ8.2
#=GS A0A3B4BDN2_9GOBI/1-352      AC A0A3B4BDN2.1
#=GS A0A226PTC4_COLVI/129-971    AC A0A226PTC4.1
#=GS A0A2G8KRG2_STIJA/1-80       AC A0A2G8KRG2.1
#=GS A0A3B4E2F6_PYGNA/671-1076   AC A0A3B4E2F6.1
#=GS A0A2G5VK63_9PELO/8-286      AC A0A2G5VK63.1
#=GS A0A0E0H046_ORYNI/716-921    AC A0A0E0H046.1
#=GS A0A1D1UIN6_RAMVA/22-1108    AC A0A1D1UIN6.1
#=GS A0A0N4YK01_NIPBR/261-407    AC A0A0N4YK01.1
#=GS A0A196SMC8_BLAHN/178-533    AC A0A196SMC8.1
#=GS F0ZIN4_DICPU/24-1095        AC F0ZIN4.1
#=GS A0A0L0D764_THETB/21-1088    AC A0A0L0D764.1
#=GS A7T1T2_NEMVE/1-625          AC A7T1T2.1
#=GS A0A0K0JJG9_BRUMA/21-1035    AC A0A0K0JJG9.1
#=GS A0A226N3R7_CALSU/170-888    AC A0A226N3R7.1
#=GS A0A0D3FVC7_9ORYZ/552-703    AC A0A0D3FVC7.1
#=GS H2YIV1_CIOSA/25-1112        AC H2YIV1.1
#=GS A0A287A0F4_PIG/670-1076     AC A0A287A0F4.1
#=GS A0A368GFD1_ANCCA/24-981     AC A0A368GFD1.1
#=GS A0A1D5PNG4_CHICK/23-673     AC A0A1D5PNG4.2
#=GS I0YQ91_COCSC/65-1060        AC I0YQ91.1
#=GS A0A0N4YK01_NIPBR/189-269    AC A0A0N4YK01.1
#=GS A0A151WRY3_9HYME/427-628    AC A0A151WRY3.1
#=GS A0A183HGQ4_9BILA/7-236      AC A0A183HGQ4.1
#=GS G0NK44_CAEBE/17-304         AC G0NK44.1
#=GS A0A3R7J625_9STRA/22-1099    AC A0A3R7J625.1
#=GS A0A0L0C4G2_LUCCU/23-1128    AC A0A0L0C4G2.1
#=GS D2VWL5_NAEGR/1162-1353      AC D2VWL5.1
#=GS A0A3Q7VGG4_URSAR/23-1103    AC A0A3Q7VGG4.1
#=GS T1KG62_TETUR/270-507        AC T1KG62.2
#=GS L8GQI3_ACACA/25-1136        AC L8GQI3.1
#=GS A0A0L8HQ99_OCTBM/1-952      AC A0A0L8HQ99.1
#=GS A0A2K5CQK0_AOTNA/23-1101    AC A0A2K5CQK0.1
#=GS T1L5K1_TETUR/40-81          AC T1L5K1.2
#=GS F7IB47_CALJA/23-673         AC F7IB47.2
#=GS A0A158Q3Q5_DRAME/847-979    AC A0A158Q3Q5.1
#=GS W5PEX1_SHEEP/23-1104        AC W5PEX1.1
#=GS A0A2K5ZUW9_MANLE/382-614    AC A0A2K5ZUW9.1
#=GS A0A2K5ZUW9_MANLE/23-385     AC A0A2K5ZUW9.1
#=GS A0A0W8BZ22_PHYNI/22-381     AC A0A0W8BZ22.1
#=GS E3LV35_CAERE/17-249         AC E3LV35.1
#=GS A0A498SS37_ACAVI/1-754      AC A0A498SS37.1
#=GS A0A044RZK3_ONCVO/21-1042    AC A0A044RZK3.1
#=GS L9KZ71_TUPCH/190-339        AC L9KZ71.1
#=GS W2N4F3_PHYPR/1-959          AC W2N4F3.1
#=GS A0A0E0H046_ORYNI/31-212     AC A0A0E0H046.1
#=GS E0VYU5_PEDHC/23-1108        AC E0VYU5.1
#=GS A0A3Q3NNN0_9TELE/730-1043   AC A0A3Q3NNN0.1
#=GS A0A158P8E8_ANGCA/159-299    AC A0A158P8E8.1
#=GS WASC5_DICDI/24-1104         AC Q54IR8.1
#=GS A0A182L3D8_9DIPT/24-1131    AC A0A182L3D8.1
#=GS A0A3B4UG12_SERDU/671-1076   AC A0A3B4UG12.1
#=GS W5JH38_ANODA/24-1126        AC W5JH38.1
#=GS A0A3L8T176_CHLGU/23-297     AC A0A3L8T176.1
#=GS A0A0R3PMZ4_ANGCS/121-257    AC A0A0R3PMZ4.2
#=GS A0A0P7TTE9_SCLFO/25-1109    AC A0A0P7TTE9.1
#=GS A0A151WRY3_9HYME/23-430     AC A0A151WRY3.1
#=GS A0A498P347_LABRO/102-296    AC A0A498P347.1
#=GS WASC5_HUMAN/23-1103         AC Q12768.1
#=GS A0A1U8Q0I9_NELNU/31-489     AC A0A1U8Q0I9.1
#=GS A0A226N3R7_CALSU/78-133     AC A0A226N3R7.1
#=GS T1G485_HELRO/23-1102        AC T1G485.1
#=GS A0A2P8Z0I9_BLAGE/1-964      AC A0A2P8Z0I9.1
#=GS E7EQI7_HUMAN/1-955          AC E7EQI7.1
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B4H297_DROPE/23-1135                   ..................................................NSIIAEILRLKDYVPLIYr.....leTKADREKYGEII.L.DF..........SYFKVAEEHER......KIEQS.P......EL....SEL.DDDIR-SHLP....LIRRFYLAFQSIHHY...AKD.LQQ.YIE.E.LNS...G..YYIQQTLE...TVLQDEEGKQLL.......C.....ESLYLYGVILLLLDYHISGDVRERLLISYYRYSGGDATps.........................gdESNIHDVCL.LLR...STGYVHPSe...........taK---Llslggkq..........................................aaagaanLVVPKYP........EAYFSRF.RFDASFIDLVIARLRCDD..IY.....NQ.L.A.IYPHP...S..HRST.ALS.SQAAMLYVCLYFC.P.QVLHGQG....SQMREIVDKFYCDNWI................ISVYMG.ITVNLIDAWLDFQAARSAIANIVNPA.AVQTLCQ.QQ....SE...Q.LAKS.LQKTQEI................V.REGVLDDGFVLQHA..NKLIVLMRQCNVVLRWYCLHTSR..E.VFII.SC.............iAVEPSHVHQLVLK...ELKF...NRNTLYHLLLNCSQME.LTVRELLGEVQQSREERWSKSREGAMQRLQELSESFSGT.RP.L...A.K..IES.......NAHLQQWFGEVAKR.........LQKLEIGRP...QKS......GRLI.IQVMQALDEVQEYHNLHA..N.MLVKQQLQETRDLLNRMAQL.INLKEDIE..IQIQMITDF..SYAWH...LLQrD...........FRPLMQEHIKR....Q.PHAVRGIRS......VF.LKLASTLEVPLMRINQ.AKS........ED......LV.SVSNYYSTELANFLRRVLQIVPETMFSILA.RII..........HLLTNVI....KEF.PTRLDKDKLKEYAQFEERAK.VAQLTN.SIAVFTKGILMMKTTLVGVIE.LDPKQLLEDGIRKELVNHLANAYNL......GLIFTP.eK..............................GKSQ...vQLMQQKLQTLAKTIEGYRRSFEYIE..........DYLRVQGLGILL............EESQRIISYNVEKEC..N..AFLRNK.......................VQE...W......QSS.........H.......Q...SQIIPIPN.FP.PL..Qg..........dpSNSNNFIGR..LAHELLRCTEP.....KG....T.I.YLDLKRTWYE.KRA.pHPEVLSASgFFGILR.EALDPAGM.VGLERLYAHMLADELKRHL.ERLQK.N.L.T..SD.R.MWRDALESVTKELEsr.........................dfPG.P...EVAKQP....LKYYLDYTQRWMK...VWP.................................................RLLDWVLS..VG.QKQVLRQQIAT.EL....SFSSKCEAKLL.QNTAD.TLNR.AFLLE.......L..SRS.K---.......--DLCD..........EQGVGMLTDLEDILLCTGNFEPLEQV.FFP.TK..........................................N...TH..NVSL..FLFLFTIA.HV..DRLQHSA..N....T...........D...........C..........LLPKA.........A.......KD....VIDCVPLVVGLLTILQQFHRNV.KMLYISYMSQYV......................................................
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