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Database: Pfam
Entry: TFIIA
LinkDB: TFIIA
Original site: TFIIA 
#=GF ID   TFIIA
#=GF AC   PF03153.13
#=GF DE   Transcription factor IIA, alpha/beta subunit
#=GF AU   Mifsud W;0000-0002-9805-6461
#=GF SE   Pfam-B_3542 (release 6.5)
#=GF GA   35.40 35.40;
#=GF TC   35.40 35.40;
#=GF NC   35.30 35.30;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11089979
#=GF RT   A transcription reinitiation intermediate that is stabilized by
#=GF RT   activator. 
#=GF RA   Yudkovsky N, Ranish JA, Hahn S; 
#=GF RL   Nature 2000;408:225-229.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   8224848
#=GF RT   A single cDNA, hTFIIA/alpha, encodes both the p35 and p19
#=GF RT   subunits of human TFIIA. 
#=GF RA   DeJong J, Roeder RG; 
#=GF RL   Genes Dev 1993;7:2220-2234.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   8610010
#=GF RT   Crystal structure of a yeast TFIIA/TBP/DNA complex. 
#=GF RA   Tan S, Hunziker Y, Sargent DF, Richmond TJ; 
#=GF RL   Nature 1996;381:127-151.
#=GF DR   INTERPRO; IPR004855;
#=GF DR   SCOP; 1nh2; fa;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   Transcription initiation factor IIA (TFIIA) is a heterotrimer,
#=GF CC   the three subunits being known as alpha, beta, and gamma, in
#=GF CC   order of molecular weight. The N and C-terminal domains of the
#=GF CC   gamma subunit are represented in Pfam:PF02268 and Pfam:PF02751,
#=GF CC   respectively. This family represents the precursor that yields
#=GF CC   both the alpha and beta subunits. The TFIIA heterotrimer is an
#=GF CC   essential general transcription initiation factor for the
#=GF CC   expression of genes transcribed by RNA polymerase II. Together
#=GF CC   with TFIID, TFIIA binds to the promoter region; this is the
#=GF CC   first step in the formation of a pre-initiation complex (PIC).
#=GF CC   Binding of the rest of the transcription machinery follows this
#=GF CC   step [1]. After initiation, the PIC does not completely
#=GF CC   dissociate from the promoter. Some components, including TFIIA,
#=GF CC   remain attached and re-initiate a subsequent round of
#=GF CC   transcription.
#=GF SQ   1989
#=GS A0A1S3MBR6_SALSA/13-282     AC A0A1S3MBR6.1
#=GS A0A094EGY1_9PEZI/9-44       AC A0A094EGY1.1
#=GS A0A0N1HVJ8_9EURO/9-355      AC A0A0N1HVJ8.1
#=GS A0A0G4J000_PLABS/185-271    AC A0A0G4J000.1
#=GS T1M095_TRIUA/163-322        AC T1M095.1
#=GS A0A1Y2D870_9PEZI/2-341      AC A0A1Y2D870.1
#=GS G1SMS4_RABIT/3-261          AC G1SMS4.1
#=GS A0A0R3VVR5_TAEAS/7-651      AC A0A0R3VVR5.1
#=GS B7Q5G2_IXOSC/37-303         AC B7Q5G2.1
#=GS A0A1B0D773_PHLPP/246-369    AC A0A1B0D773.1
#=GS A0A182FPG3_ANOAL/11-500     AC A0A182FPG3.1
#=GS G3AGR6_SPAPN/146-276        AC G3AGR6.1
#=GS A0A091PYJ8_LEPDC/2-453      AC A0A091PYJ8.1
#=GS A0A1U8PK74_GOSHI/9-202      AC A0A1U8PK74.1
#=GS A0A0F8BXR4_LARCR/1357-1807  AC A0A0F8BXR4.1
#=GS A0A1D6S4W9_WHEAT/169-292    AC A0A1D6S4W9.1
#=GS A0A1S2XEG4_CICAR/213-389    AC A0A1S2XEG4.1
#=GS A0A0G2ER98_9PEZI/9-386      AC A0A0G2ER98.1
#=GS A0A1U8AAK9_NELNU/178-382    AC A0A1U8AAK9.1
#=GS A0A0V1NTC7_9BILA/141-296    AC A0A0V1NTC7.1
#=GS A0A059AFM7_EUCGR/181-393    AC A0A059AFM7.1
#=GS A0A0J6YK16_COCIT/9-388      AC A0A0J6YK16.1
#=GS A0A1U7TQN5_TARSY/64-185     AC A0A1U7TQN5.1
#=GS S8FU20_FOMPI/23-209         AC S8FU20.1
#=GS A0A078H6G4_BRANA/81-184     AC A0A078H6G4.1
#=GS A0A095CFS3_CRYGR/118-210    AC A0A095CFS3.1
#=GS A0A2I4C8Q1_9TELE/13-283     AC A0A2I4C8Q1.1
#=GS A0A195BFB8_9HYME/253-371    AC A0A195BFB8.1
#=GS A0A226DLQ4_FOLCA/1194-1457  AC A0A226DLQ4.1
#=GS A0A0J8RBD3_COCIT/9-388      AC A0A0J8RBD3.1
#=GS A0A093QYT9_PYGAD/256-368    AC A0A093QYT9.1
#=GS A0A2B7XBF2_9EURO/9-438      AC A0A2B7XBF2.1
#=GS A0A1X7RCN3_ZYMTR/9-422      AC A0A1X7RCN3.1
#=GS E2LFL6_MONPE/12-156         AC E2LFL6.1
#=GS A0A078FR71_BRANA/10-223     AC A0A078FR71.1
#=GS A0A0R3TTL4_HYMNN/7-329      AC A0A0R3TTL4.1
#=GS I2FRU4_USTH4/63-214         AC I2FRU4.1
#=GS A0A0F2MA49_SPOSC/9-48       AC A0A0F2MA49.1
#=GS A0A0D0E1K5_9HOMO/178-320    AC A0A0D0E1K5.1
#=GS C5M2I7_CANTT/146-268        AC C5M2I7.1
#=GS A0A2K5JDR9_COLAP/10-478     AC A0A2K5JDR9.1
#=GS G0RNN2_HYPJQ/9-68           AC G0RNN2.1
#=GS L2GMY5_VITCO/20-116         AC L2GMY5.1
#=GS D4B0C8_ARTBC/60-448         AC D4B0C8.1
#=GS G8ZMN6_TORDC/9-134          AC G8ZMN6.1
#=GS W1PLJ1_AMBTC/9-219          AC W1PLJ1.1
#=GS X0KU18_FUSOX/1-301          AC X0KU18.1
#=GS A0A0A1NY51_9FUNG/9-106      AC A0A0A1NY51.1
#=GS A0A0C3L981_9HOMO/203-345    AC A0A0C3L981.1
#=GS A0A1I7RTN2_BURXY/14-102     AC A0A1I7RTN2.1
#=GS E0VTQ3_PEDHC/11-216         AC E0VTQ3.1
#=GS A0A0P9GG45_RHOGW/78-181     AC A0A0P9GG45.1
#=GS A0A1J5WQN4_9MICR/10-82      AC A0A1J5WQN4.1
#=GS A0A2G9GJ21_9LAMI/9-252      AC A0A2G9GJ21.1
#=GS A0A1Y2FBN0_9ASCO/123-264    AC A0A1Y2FBN0.1
#=GS A0A1V6PSG1_9EURO/9-370      AC A0A1V6PSG1.1
#=GS H2QHW4_PANTR/714-1182       AC H2QHW4.2
#=GS G1NJW3_MELGA/255-367        AC G1NJW3.2
#=GS A0A2D0Q0E6_ICTPU/1-248      AC A0A2D0Q0E6.1
#=GS M7NPV8_PNEMU/106-263        AC M7NPV8.1
#=GS A0A091PXU4_LEPDC/255-368    AC A0A091PXU4.1
#=GS U3KDF4_FICAL/226-337        AC U3KDF4.1
#=GS A0A182IRM3_9DIPT/324-512    AC A0A182IRM3.1
#=GS A0A1V8SBV1_9PEZI/9-417      AC A0A1V8SBV1.1
#=GS A0A1R0GNE4_9FUNG/188-354    AC A0A1R0GNE4.1
#=GS A0A091LUI6_CARIC/108-218    AC A0A091LUI6.1
#=GS A0A1S3DLP2_DIACI/219-380    AC A0A1S3DLP2.1
#=GS A0A139IRU7_9PEZI/9-413      AC A0A139IRU7.1
#=GS G3VCP6_SARHA/1-254          AC G3VCP6.1
#=GS A0A1Y2AS59_9FUNG/9-125      AC A0A1Y2AS59.1
#=GS A0A200R503_9MAGN/194-380    AC A0A200R503.1
#=GS A0A2K5P1M3_CERAT/13-271     AC A0A2K5P1M3.1
#=GS I3M6W4_ICTTR/3-260          AC I3M6W4.2
#=GS Q5BF64_EMENI/13-419         AC Q5BF64.1
#=GS A0A0A2L4V1_PENIT/9-372      AC A0A0A2L4V1.1
#=GS A0A099NTB7_PICKU/9-65       AC A0A099NTB7.1
#=GS A0A1B0BCP3_9MUSC/191-313    AC A0A1B0BCP3.1
#=GS E2B5F4_HARSA/69-367         AC E2B5F4.1
#=GS A0A1D5S662_WHEAT/176-399    AC A0A1D5S662.1
#=GS E3RRM2_PYRTT/9-383          AC E3RRM2.1
#=GS A0A2H2IG05_CAEJA/26-282     AC A0A2H2IG05.1
#=GS A0A2H3YNZ1_PHODC/170-374    AC A0A2H3YNZ1.1
#=GS A0A086T290_ACRC1/9-375      AC A0A086T290.1
#=GS A0A1E3IT61_9TREE/158-250    AC A0A1E3IT61.1
#=GS A0A1E4TKY4_9ASCO/76-274     AC A0A1E4TKY4.1
#=GS A0A0V0S505_9BILA/13-173     AC A0A0V0S505.1
#=GS H2VA00_TAKRU/13-270         AC H2VA00.1
#=GS A0A1E4RPN6_9ASCO/9-71       AC A0A1E4RPN6.1
#=GS A0A0A0A237_CHAVO/265-377    AC A0A0A0A237.1
#=GS X0CY17_FUSOX/9-397          AC X0CY17.1
#=GS A0A0F9ZYI2_TRIHA/9-374      AC A0A0F9ZYI2.1
#=GS Q2UL91_ASPOR/9-411          AC Q2UL91.1
#=GS A0A284QL47_9AGAR/21-122     AC A0A284QL47.1
#=GS U3K936_FICAL/1-367          AC U3K936.1
#=GS A0A0V0XW04_TRIPS/148-265    AC A0A0V0XW04.1
#=GS A0A0R4IDL3_DANRE/256-336    AC A0A0R4IDL3.1
#=GS E2AFV2_CAMFO/11-265         AC E2AFV2.1
#=GS D3B937_POLPP/6-217          AC D3B937.1
#=GS S6F8C6_ZYGB2/9-164          AC S6F8C6.1
#=GS A0A182LG17_9DIPT/11-503     AC A0A182LG17.1
#=GS L8GWV4_ACACA/134-255        AC L8GWV4.1
#=GS S9VSQ7_SCHCR/9-187          AC S9VSQ7.1
#=GS A0A093EM50_TYTAL/2-454      AC A0A093EM50.1
#=GS A0A075AP92_9FUNG/104-232    AC A0A075AP92.1
#=GS A0A238F8H0_9BASI/9-131      AC A0A238F8H0.1
#=GS L0PCC2_PNEJ8/9-234          AC L0PCC2.1
#=GS A0A2I2YC53_GORGO/1-219      AC A0A2I2YC53.1
#=GS A0A183E089_9BILA/1-250      AC A0A183E089.1
#=GS A0A161HKR6_9ASCO/9-126      AC A0A161HKR6.1
#=GS D2VU95_NAEGR/14-154         AC D2VU95.1
#=GS TF2AA_DICDI/238-309         AC Q54G80.1
#=GS T1EXP9_HELRO/16-454         AC T1EXP9.1
#=GS A0A093ZGC6_9PEZI/52-293     AC A0A093ZGC6.1
#=GS A0A0J1B9J2_9TREE/9-122      AC A0A0J1B9J2.1
#=GS A0A1D5WL24_WHEAT/6-176      AC A0A1D5WL24.1
#=GS A0A2K5IZL9_COLAP/257-370    AC A0A2K5IZL9.1
#=GS A0A183IWI0_9BILA/46-104     AC A0A183IWI0.1
#=GS A0A0V0VIE7_9BILA/141-296    AC A0A0V0VIE7.1
#=GS A0A158P674_ANGCA/19-377     AC A0A158P674.1
#=GS A0A0D1E2R0_USTMA/9-102      AC A0A0D1E2R0.1
#=GS Q4WRX7_ASPFU/9-392          AC Q4WRX7.1
#=GS A0A182M240_9DIPT/11-251     AC A0A182M240.1
#=GS A0A1Q8RJ05_9PEZI/9-381      AC A0A1Q8RJ05.1
#=GS A0A137QUI9_9AGAR/1-112      AC A0A137QUI9.1
#=GS A0A094K497_9PEZI/9-453      AC A0A094K497.1
#=GS A0A0L8HG75_OCTBM/176-307    AC A0A0L8HG75.1
#=GS M5WIA7_PRUPE/172-386        AC M5WIA7.1
#=GS R0J2X7_SETT2/9-392          AC R0J2X7.1
#=GS A0A0A6YYG5_HUMAN/714-787    AC A0A0A6YYG5.1
#=GS A0A1E3IT61_9TREE/20-151     AC A0A1E3IT61.1
#=GS A0A287R0Z6_HORVV/10-153     AC A0A287R0Z6.1
#=GS A0A0V0U5N2_9BILA/13-174     AC A0A0V0U5N2.1
#=GS D5GD47_TUBMM/9-373          AC D5GD47.1
#=GS V5EZW9_KALBG/9-89           AC V5EZW9.1
#=GS H0Y076_OTOGA/13-271         AC H0Y076.1
#=GS C9SQY7_VERA1/9-416          AC C9SQY7.1
#=GS A0A1V2L6L3_CYBFA/9-92       AC A0A1V2L6L3.1
#=GS A0A179UYK6_BLAGS/9-258      AC A0A179UYK6.1
#=GS A0A183GZU6_9BILA/12-218     AC A0A183GZU6.1
#=GS A0A2H3YT49_PHODC/8-213      AC A0A2H3YT49.1
#=GS G4UB39_NEUT9/9-422          AC G4UB39.1
#=GS A0A2D0QDS4_ICTPU/717-1155   AC A0A2D0QDS4.1
#=GS Q7SG05_NEUCR/9-421          AC Q7SG05.1
#=GS A0A0C3PME0_PISTI/13-258     AC A0A0C3PME0.1
#=GS W7LVH6_GIBM7/1-301          AC W7LVH6.1
#=GS A0A094GFM9_9PEZI/115-326    AC A0A094GFM9.1
#=GS A0A1D5QTP5_MACMU/222-337    AC A0A1D5QTP5.1
#=GS U1GFG5_ENDPU/40-418         AC U1GFG5.1
#=GS M0S9A6_MUSAM/164-413        AC M0S9A6.1
#=GS W9IDD7_FUSOX/9-397          AC W9IDD7.1
#=GS A0A1R3GVD9_COCAP/194-392    AC A0A1R3GVD9.1
#=GS A0A093YV96_9PEZI/79-285     AC A0A093YV96.1
#=GS A0A178ZYF3_9EURO/9-366      AC A0A178ZYF3.1
#=GS J9EMT5_WUCBA/14-98          AC J9EMT5.1
#=GS A0A199W9R8_ANACO/165-381    AC A0A199W9R8.1
#=GS T1F3V4_HELRO/18-538         AC T1F3V4.1
#=GS A0A1S3EY79_DIPOR/1-226      AC A0A1S3EY79.1
#=GS E7NN50_YEASO/159-285        AC E7NN50.1
#=GS F6SFM4_CALJA/780-1135       AC F6SFM4.1
#=GS A0A1Y2CA76_9FUNG/79-363     AC A0A1Y2CA76.1
#=GS A0A139GVE4_9PEZI/9-416      AC A0A139GVE4.1
#=GS A0A158NUK7_ATTCE/253-371    AC A0A158NUK7.1
#=GS A0A2D0Q1N8_ICTPU/13-247     AC A0A2D0Q1N8.1
#=GS A0A075AP92_9FUNG/10-113     AC A0A075AP92.1
#=GS A0A0V0U6E0_9BILA/13-173     AC A0A0V0U6E0.1
#=GS A0A1U8H312_CAPAN/195-400    AC A0A1U8H312.1
#=GS A1IIE6_CHICK/13-271         AC A1IIE6.1
#=GS A0A1S3NIK8_SALSA/11-520     AC A0A1S3NIK8.1
#=GS A0A1I7TYQ9_9PELO/1-265      AC A0A1I7TYQ9.1
#=GS A0A132B8L8_9HELO/9-411      AC A0A132B8L8.1
#=GS A0A015JS43_9GLOM/200-293    AC A0A015JS43.1
#=GS A0A087ZQ42_APIME/11-273     AC A0A087ZQ42.1
#=GS A0A0Q9WGL3_DROVI/262-382    AC A0A0Q9WGL3.1
#=GS I1PU43_ORYGL/9-116          AC I1PU43.1
#=GS M0S9A6_MUSAM/29-148         AC M0S9A6.1
#=GS M5G609_DACPD/119-234        AC M5G609.1
#=GS G3B5H4_CANTC/66-269         AC G3B5H4.1
#=GS A0A0C9ZFU4_9HOMO/208-323    AC A0A0C9ZFU4.1
#=GS A0A068Y7P5_ECHMU/1-487      AC A0A068Y7P5.1
#=GS U6M2V3_EIMMA/13-332         AC U6M2V3.1
#=GS J9VWI6_CRYNH/9-145          AC J9VWI6.2
#=GS H8ZBK7_NEMS1/60-175         AC H8ZBK7.1
#=GS A0A090D3R8_PODAN/522-548    AC A0A090D3R8.1
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