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Database: Pfam
Entry: TFIIA
LinkDB: TFIIA
Original site: TFIIA 
#=GF ID   TFIIA
#=GF AC   PF03153.14
#=GF DE   Transcription factor IIA, alpha/beta subunit
#=GF AU   Mifsud W;0000-0002-9805-6461
#=GF SE   Pfam-B_3542 (release 6.5)
#=GF GA   36.20 36.20;
#=GF TC   36.20 36.20;
#=GF NC   36.10 36.10;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11089979
#=GF RT   A transcription reinitiation intermediate that is stabilized by
#=GF RT   activator. 
#=GF RA   Yudkovsky N, Ranish JA, Hahn S; 
#=GF RL   Nature 2000;408:225-229.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   8224848
#=GF RT   A single cDNA, hTFIIA/alpha, encodes both the p35 and p19
#=GF RT   subunits of human TFIIA. 
#=GF RA   DeJong J, Roeder RG; 
#=GF RL   Genes Dev 1993;7:2220-2234.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   8610010
#=GF RT   Crystal structure of a yeast TFIIA/TBP/DNA complex. 
#=GF RA   Tan S, Hunziker Y, Sargent DF, Richmond TJ; 
#=GF RL   Nature 1996;381:127-151.
#=GF DR   INTERPRO; IPR004855;
#=GF DR   SCOP; 1nh2; fa;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   Transcription initiation factor IIA (TFIIA) is a heterotrimer,
#=GF CC   the three subunits being known as alpha, beta, and gamma, in
#=GF CC   order of molecular weight. The N and C-terminal domains of the
#=GF CC   gamma subunit are represented in Pfam:PF02268 and Pfam:PF02751,
#=GF CC   respectively. This family represents the precursor that yields
#=GF CC   both the alpha and beta subunits. The TFIIA heterotrimer is an
#=GF CC   essential general transcription initiation factor for the
#=GF CC   expression of genes transcribed by RNA polymerase II. Together
#=GF CC   with TFIID, TFIIA binds to the promoter region; this is the
#=GF CC   first step in the formation of a pre-initiation complex (PIC).
#=GF CC   Binding of the rest of the transcription machinery follows this
#=GF CC   step [1]. After initiation, the PIC does not completely
#=GF CC   dissociate from the promoter. Some components, including TFIIA,
#=GF CC   remain attached and re-initiate a subsequent round of
#=GF CC   transcription.
#=GF SQ   2557
#=GS A0A061GWZ2_THECC/216-393    AC A0A061GWZ2.1
#=GS A0A067PWW6_9AGAM/156-290    AC A0A067PWW6.1
#=GS G3VCP5_SARHA/13-270         AC G3VCP5.1
#=GS A0A421JW57_9ASCO/9-126      AC A0A421JW57.1
#=GS A0A372R206_9GLOM/9-211      AC A0A372R206.1
#=GS A0A1Y2D870_9PEZI/2-341      AC A0A1Y2D870.1
#=GS B7Q5G2_IXOSC/37-303         AC B7Q5G2.1
#=GS A0A182FPG3_ANOAL/11-500     AC A0A182FPG3.1
#=GS A0A1S2XEG4_CICAR/213-389    AC A0A1S2XEG4.1
#=GS A0A3P8N7K3_ASTCA/11-438     AC A0A3P8N7K3.1
#=GS A0A0J6YK16_COCIT/9-388      AC A0A0J6YK16.1
#=GS A0A3B5XXD2_WHEAT/180-401    AC A0A3B5XXD2.1
#=GS A0A452YAB8_AEGTS/180-426    AC A0A452YAB8.1
#=GS A0A453M1Y5_AEGTS/9-155      AC A0A453M1Y5.1
#=GS A0A3B3QMU1_9TELE/13-45      AC A0A3B3QMU1.1
#=GS A0A0J8RBD3_COCIT/9-388      AC A0A0J8RBD3.1
#=GS A0A210QWM1_MIZYE/10-193     AC A0A210QWM1.1
#=GS A0A384CR46_URSMA/1-231      AC A0A384CR46.1
#=GS A0A287SLG6_HORVV/10-198     AC A0A287SLG6.1
#=GS A0A2B7XBF2_9EURO/9-438      AC A0A2B7XBF2.1
#=GS A0A1X7RCN3_ZYMTR/9-422      AC A0A1X7RCN3.1
#=GS A0A0D0E1K5_9AGAM/178-320    AC A0A0D0E1K5.1
#=GS A0A1R3GVD9_COCAP/9-209      AC A0A1R3GVD9.1
#=GS W6MFN9_9ASCO/112-250        AC W6MFN9.1
#=GS D4B0C8_ARTBC/60-448         AC D4B0C8.1
#=GS A0A0R3SLY9_HYMDI/7-199      AC A0A0R3SLY9.1
#=GS A0A3M0J486_HIRRU/45-470     AC A0A3M0J486.1
#=GS A0A1V6PSG1_9EURO/9-370      AC A0A1V6PSG1.1
#=GS A0A078F602_BRANA/188-375    AC A0A078F602.1
#=GS S7QAX4_GLOTA/185-305        AC S7QAX4.1
#=GS A0A1V8SBV1_9PEZI/9-417      AC A0A1V8SBV1.1
#=GS A0A409XCH3_PSICY/151-291    AC A0A409XCH3.1
#=GS A0A1R0GNE4_9FUNG/188-354    AC A0A1R0GNE4.1
#=GS I3M6W4_ICTTR/254-366        AC I3M6W4.2
#=GS F7H5J8_MACMU/7-263          AC F7H5J8.2
#=GS A0A139IRU7_9PEZI/9-413      AC A0A139IRU7.1
#=GS A0A2N5UXL0_9BASI/9-107      AC A0A2N5UXL0.1
#=GS I3M6W4_ICTTR/3-260          AC I3M6W4.2
#=GS A0A099NTB7_PICKU/9-65       AC A0A099NTB7.1
#=GS A0A1U8PK74_GOSHI/192-391    AC A0A1U8PK74.1
#=GS A0A226DLQ4_FOLCA/499-760    AC A0A226DLQ4.1
#=GS E3RRM2_PYRTT/9-383          AC E3RRM2.1
#=GS A0A0R3TTL4_HYMNN/395-635    AC A0A0R3TTL4.1
#=GS A0A1P6C422_BRUMA/153-333    AC A0A1P6C422.1
#=GS A0A022S0X4_ERYGU/9-240      AC A0A022S0X4.1
#=GS A0A094K497_9PEZI/9-240      AC A0A094K497.1
#=GS A0A0D1E2R0_USTMA/9-99       AC A0A0D1E2R0.1
#=GS A0A0B2UG72_9MICR/63-156     AC A0A0B2UG72.1
#=GS A0A337SK82_FELCA/249-370    AC A0A337SK82.1
#=GS A0A0V0U5N2_9BILA/149-289    AC A0A0V0U5N2.1
#=GS A0A2P6Q9R6_ROSCH/6-126      AC A0A2P6Q9R6.1
#=GS A0A1G4KMD8_9SACH/9-143      AC A0A1G4KMD8.1
#=GS A0A093Y882_9PEZI/363-616    AC A0A093Y882.1
#=GS A0A3P8WS59_CYNSE/14-286     AC A0A3P8WS59.1
#=GS A0A452YAD8_AEGTS/47-185     AC A0A452YAD8.1
#=GS A0A2N1JB27_9BASI/9-79       AC A0A2N1JB27.1
#=GS A0A445HL73_GLYSO/193-389    AC A0A445HL73.1
#=GS A0A2Y9RSR1_TRIMA/254-368    AC A0A2Y9RSR1.1
#=GS X0CY17_FUSOX/9-397          AC X0CY17.1
#=GS A0A0F9ZYI2_TRIHA/9-374      AC A0A0F9ZYI2.1
#=GS Q2UL91_ASPOR/9-411          AC Q2UL91.1
#=GS A0A3Q0D285_MESAU/1-386      AC A0A3Q0D285.1
#=GS A0A2I4C8Q1_9TELE/268-389    AC A0A2I4C8Q1.1
#=GS E2AFV2_CAMFO/11-265         AC E2AFV2.1
#=GS S6F8C6_ZYGB2/9-164          AC S6F8C6.1
#=GS A0A4P1R1Q3_LUPAN/79-284     AC A0A4P1R1Q3.1
#=GS A0A182LG17_9DIPT/11-503     AC A0A182LG17.1
#=GS A0A2G7FIH7_9EURO/9-412      AC A0A2G7FIH7.1
#=GS A0A287F3Z9_HORVV/14-213     AC A0A287F3Z9.1
#=GS A0A060Y4G3_ONCMY/9-461      AC A0A060Y4G3.1
#=GS A0A0D9ZWT1_9ORYZ/110-331    AC A0A0D9ZWT1.1
#=GS A0A340YBT8_LIPVE/13-268     AC A0A340YBT8.1
#=GS R0J2X7_SETT2/9-392          AC R0J2X7.1
#=GS A0A1E3PM45_9ASCO/81-322     AC A0A1E3PM45.1
#=GS A0A026W8S9_OOCBI/1-61       AC A0A026W8S9.1
#=GS D5GD47_TUBMM/9-373          AC D5GD47.1
#=GS C9SQY7_VERA1/9-416          AC C9SQY7.1
#=GS A0A1D6M0J8_MAIZE/322-541    AC A0A1D6M0J8.1
#=GS A0A1S3SB23_SALSA/286-399    AC A0A1S3SB23.1
#=GS A0A371DQT7_9APHY/150-285    AC A0A371DQT7.1
#=GS A0A371I5S4_MUCPR/9-220      AC A0A371I5S4.1
#=GS A0A2I2UZB4_FELCA/13-270     AC A0A2I2UZB4.2
#=GS A0A3B0JF26_DROGU/11-251     AC A0A3B0JF26.1
#=GS A0A1W4WG24_AGRPL/62-199     AC A0A1W4WG24.1
#=GS A0A0D3C8A6_BRAOL/8-218      AC A0A0D3C8A6.1
#=GS A0A0R3WQ71_HYDTA/23-141     AC A0A0R3WQ71.1
#=GS D8TDN9_SELML/8-148          AC D8TDN9.1
#=GS A0A2K5TKH3_MACFA/224-337    AC A0A2K5TKH3.1
#=GS A0A2T4BHQ6_9HYPO/50-351     AC A0A2T4BHQ6.1
#=GS G3AGR6_SPAPN/132-276        AC G3AGR6.1
#=GS A0A178ZYF3_9EURO/9-366      AC A0A178ZYF3.1
#=GS A0A3B6MZC8_WHEAT/9-151      AC A0A3B6MZC8.1
#=GS T1F3V4_HELRO/18-538         AC T1F3V4.1
#=GS A0A2T7EG07_9POAL/217-389    AC A0A2T7EG07.1
#=GS A0A074RKX8_9AGAM/9-177      AC A0A074RKX8.1
#=GS G0VCF8_NAUCC/9-131          AC G0VCF8.1
#=GS A0A1I8ERT6_WUCBA/223-388    AC A0A1I8ERT6.1
#=GS A0A498NHZ2_LABRO/45-94      AC A0A498NHZ2.1
#=GS K5WYP8_AGABU/9-207          AC K5WYP8.1
#=GS A0A1E3QT10_9ASCO/9-125      AC A0A1E3QT10.1
#=GS K1WU29_MARBU/229-487        AC K1WU29.1
#=GS A1IIE6_CHICK/13-271         AC A1IIE6.1
#=GS A0A453M260_AEGTS/6-219      AC A0A453M260.1
#=GS A0A177VD56_9BASI/9-121      AC A0A177VD56.1
#=GS A0A1S3NIK8_SALSA/11-520     AC A0A1S3NIK8.1
#=GS A0A1I7TYQ9_9PELO/1-265      AC A0A1I7TYQ9.1
#=GS A0A3N4JRZ7_9PEZI/9-369      AC A0A3N4JRZ7.1
#=GS D7KH26_ARALL/10-210         AC D7KH26.1
#=GS A0A0A6YYG5_HUMAN/714-788    AC A0A0A6YYG5.1
#=GS A0A2P5D6B4_TREOI/175-383    AC A0A2P5D6B4.1
#=GS A0A3P7I7E8_ANGCS/104-221    AC A0A3P7I7E8.1
#=GS A0A090D3R8_PODAN/522-548    AC A0A090D3R8.1
#=GS A0A1Y2XCK1_9PEZI/9-379      AC A0A1Y2XCK1.1
#=GS A0A0J7KBC0_LASNI/70-343     AC A0A0J7KBC0.1
#=GS A0A1G4MI80_LACFM/9-136      AC A0A1G4MI80.1
#=GS A0A316W027_9BASI/76-220     AC A0A316W027.1
#=GS A0A0C3F7W6_9AGAM/143-298    AC A0A0C3F7W6.1
#=GS A0A3P9PZX5_POERE/13-286     AC A0A3P9PZX5.1
#=GS M0S9A6_MUSAM/29-193         AC M0S9A6.1
#=GS L8G073_PSED2/9-243          AC L8G073.1
#=GS F0XAM5_GROCL/9-429          AC F0XAM5.1
#=GS A0A1V9XVF1_9ACAR/75-293     AC A0A1V9XVF1.1
#=GS A0A1Z5RP71_SORBI/59-259     AC A0A1Z5RP71.1
#=GS A0A158NUK7_ATTCE/11-262     AC A0A158NUK7.1
#=GS A0A1B7NKL6_9EURO/17-287     AC A0A1B7NKL6.1
#=GS A0A0K6GDL4_9AGAM/357-576    AC A0A0K6GDL4.1
#=GS A0A151GAL8_9HYPO/9-359      AC A0A151GAL8.1
#=GS A0A2Y9JKK1_ENHLU/13-270     AC A0A2Y9JKK1.1
#=GS A0A3G2S1M7_9BASI/9-98       AC A0A3G2S1M7.1
#=GS A0A2N1JB27_9BASI/84-185     AC A0A2N1JB27.1
#=GS A0A1D5R6P6_MACMU/714-1182   AC A0A1D5R6P6.1
#=GS A0A2P5SJN4_GOSBA/127-345    AC A0A2P5SJN4.1
#=GS A0A2G8SQG2_9APHY/9-183      AC A0A2G8SQG2.1
#=GS A0A2K6GH14_PROCO/10-477     AC A0A2K6GH14.1
#=GS TF2AA_DROME/244-366         AC P52654.2
#=GS A0A445IDX9_GLYSO/190-390    AC A0A445IDX9.1
#=GS A0A3Q4HQ71_NEOBR/10-243     AC A0A3Q4HQ71.1
#=GS A0A3S0ZQK3_ELYCH/175-250    AC A0A3S0ZQK3.1
#=GS W0TB70_KLUMD/9-98           AC W0TB70.1
#=GS O49349_ARATH/175-375        AC O49349.1
#=GS A0A367Y237_9ASCO/9-138      AC A0A367Y237.1
#=GS A0A0J1B9J2_9TREE/94-197     AC A0A0J1B9J2.1
#=GS A0A401PJN9_SCYTO/3-251      AC A0A401PJN9.1
#=GS A0A0C9ZFU4_9AGAM/202-323    AC A0A0C9ZFU4.1
#=GS A0A445I105_GLYSO/9-230      AC A0A445I105.1
#=GS G2YWZ4_BOTF4/9-233          AC G2YWZ4.1
#=GS A0A0A1TFD7_9HYPO/156-332    AC A0A0A1TFD7.1
#=GS A0A2U9CVP0_SCOMX/282-396    AC A0A2U9CVP0.1
#=GS A0A0P9GG45_RHOGW/75-181     AC A0A0P9GG45.1
#=GS Q149E9_MOUSE/1-232          AC Q149E9.1
#=GS Q173T9_AEDAE/11-253         AC Q173T9.1
#=GS A0A135LNR7_PENPA/9-369      AC A0A135LNR7.1
#=GS H2AZC9_KAZAF/9-143          AC H2AZC9.1
#=GS A0A4X3NXJ3_PRIPA/296-336    AC A0A4X3NXJ3.1
#=GS Q149E9_MOUSE/225-339        AC Q149E9.1
#=GS M7YTB1_TRIUA/165-288        AC M7YTB1.1
#=GS A0A453M232_AEGTS/94-306     AC A0A453M232.1
#=GS L8WC81_THACA/16-50          AC L8WC81.1
#=GS A0A1M2VMF9_TRAPU/187-322    AC A0A1M2VMF9.1
#=GS B9S3E9_RICCO/11-217         AC B9S3E9.1
#=GS A0A151IFV9_9HYME/227-355    AC A0A151IFV9.1
#=GS A0A124SI90_CYNCS/57-513     AC A0A124SI90.1
#=GS A0A445I1I4_GLYSO/9-232      AC A0A445I1I4.1
#=GS A0A091CN07_FUKDA/10-475     AC A0A091CN07.1
#=GS A0A2K6T5M5_SAIBB/250-375    AC A0A2K6T5M5.1
#=GS A0A3Q2CLS0_CYPVA/182-295    AC A0A3Q2CLS0.1
#=GS A0A2K6Q5M0_RHIRO/3-233      AC A0A2K6Q5M0.1
#=GS A0A2H9TPD0_9FUNG/66-249     AC A0A2H9TPD0.1
#=GS A0A368QK57_SETIT/9-141      AC A0A368QK57.1
#=GS TOA1_YEAST/160-285          AC P32773.1
#=GS TOA1_YEAST/160-285          DR PDB; 1NH2 C; 228-285;
#=GS TOA1_YEAST/160-285          DR PDB; 6GYK U; 241-285;
#=GS TOA1_YEAST/160-285          DR PDB; 1YTF C; 241-285;
#=GS TOA1_YEAST/160-285          DR PDB; 5OQM U; 241-285;
#=GS TOA1_YEAST/160-285          DR PDB; 1RM1 C; 228-285;
#=GS TOA1_YEAST/160-285          DR PDB; 6GYM U; 241-285;
#=GS TOA1_YEAST/160-285          DR PDB; 5SVA d; 228-285;
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#=GS TOA1_YEAST/160-285          DR PDB; 5OQJ U; 241-285;
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