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Database: Pfam
Entry: TPP_enzyme_M_2
LinkDB: TPP_enzyme_M_2
Original site: TPP_enzyme_M_2 
#=GF ID   TPP_enzyme_M_2
#=GF AC   PF16582.5
#=GF DE   Middle domain of thiamine pyrophosphate
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF SE   pdb_2jla
#=GF GA   30.10 30.10;
#=GF TC   30.10 30.10;
#=GF NC   30.00 30.00;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   18983854
#=GF RT   Specificity and reactivity in menaquinone biosynthesis: the
#=GF RT   structure of Escherichia coli MenD
#=GF RT   (2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexadiene-1-carboxyla
#=GF RT   te synthase).
#=GF RA   Dawson A, Fyfe PK, Hunter WN;
#=GF RL   J Mol Biol. 2008;384:1353-1368.
#=GF DR   INTERPRO; IPR032264;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   TPP_enzyme_M_2 is the middle domain of thiamine pyrophosphate in
#=GF CC   sequences not captured by Pfam:PF00205. This enzyme is necessary
#=GF CC   for the first step of the biosynthesis of menaquinone, or
#=GF CC   vitamin K2, an important cofactor in electron transport in
#=GF CC   bacteria [1].
#=GF SQ   1364
#=GS A0A1X7DTH5_9PROT/237-442   AC A0A1X7DTH5.1
#=GS W2F0V7_9ACTN/195-379       AC W2F0V7.1
#=GS R5NVZ3_9BACT/197-383       AC R5NVZ3.1
#=GS MEND_GEOTN/202-401         AC A4IS14.1
#=GS A0A176JAH2_9BACI/198-404   AC A0A176JAH2.1
#=GS MEND_ROSS1/208-406         AC A5UPB5.1
#=GS U4JZQ3_9VIBR/187-399       AC U4JZQ3.1
#=GS A0A1I2PJ07_9BACT/204-402   AC A0A1I2PJ07.1
#=GS A0A287U485_HORVV/300-535   AC A0A287U485.1
#=GS U3BHY1_VIBPR/188-402       AC U3BHY1.1
#=GS A0A2A8D3U6_9BACT/192-418   AC A0A2A8D3U6.1
#=GS Q4C7L2_CROWT/206-413       AC Q4C7L2.1
#=GS A0A1R4I4D2_9GAMM/197-415   AC A0A1R4I4D2.1
#=GS R7ZCC8_LYSSH/189-398       AC R7ZCC8.1
#=GS A0A024P8T8_9BACI/181-401   AC A0A024P8T8.1
#=GS I8XQ17_9BACE/224-407       AC I8XQ17.1
#=GS F9RFK9_VIBSN/192-411       AC F9RFK9.1
#=GS A0A1J1ADK6_9EURY/204-409   AC A0A1J1ADK6.1
#=GS D4E3R7_SEROD/183-389       AC D4E3R7.1
#=GS S3ISH4_9ENTR/183-389       AC S3ISH4.1
#=GS F9VCP7_LACGL/191-381       AC F9VCP7.1
#=GS H2BSD9_9FLAO/206-408       AC H2BSD9.1
#=GS MEND_VIBPA/188-403         AC Q87R69.1
#=GS A0A1M5VT04_9BACI/204-405   AC A0A1M5VT04.1
#=GS B6EJ56_ALISL/190-407       AC B6EJ56.1
#=GS A0A0D9VHK9_9ORYZ/533-744   AC A0A0D9VHK9.1
#=GS MEND_MICAN/193-405         AC B0JII8.1
#=GS D8J2U7_HALJB/224-407       AC D8J2U7.1
#=GS W0Q772_9PAST/190-397       AC W0Q772.1
#=GS A0A1H9T828_9BACI/195-393   AC A0A1H9T828.1
#=GS D4GYA1_HALVD/199-409       AC D4GYA1.1
#=GS A0A171DKI6_9ACTN/192-379   AC A0A171DKI6.1
#=GS A0A1D7XUD0_9FLAO/200-390   AC A0A1D7XUD0.1
#=GS A0A0U1KQA9_9BACI/185-401   AC A0A0U1KQA9.1
#=GS A0A098C1A7_9PORP/185-379   AC A0A098C1A7.1
#=GS A0A1J0PEE4_9SYNE/212-395   AC A0A1J0PEE4.1
#=GS D3RPJ5_ALLVD/215-414       AC D3RPJ5.1
#=GS A0A1I0WSL9_9BACI/189-404   AC A0A1I0WSL9.1
#=GS A0A287U4I2_HORVV/47-282    AC A0A287U4I2.1
#=GS A0A0P4V0M3_9CYAN/203-402   AC A0A0P4V0M3.1
#=GS A0A200QPY3_9MAGN/490-725   AC A0A200QPY3.1
#=GS G9ZAC7_9ENTR/183-388       AC G9ZAC7.1
#=GS A0A078I6U1_BRANA/541-775   AC A0A078I6U1.1
#=GS A0A059BFD8_EUCGR/199-429   AC A0A059BFD8.1
#=GS A0A1B7JJW8_9GAMM/182-388   AC A0A1B7JJW8.1
#=GS A0A249LK68_9ACTN/169-359   AC A0A249LK68.1
#=GS H8XVH5_FLAIG/172-374       AC H8XVH5.1
#=GS A0A0E0CMH9_9ORYZ/548-778   AC A0A0E0CMH9.1
#=GS E9CKG4_9GAMM/174-368       AC E9CKG4.1
#=GS C0AV92_9GAMM/183-388       AC C0AV92.1
#=GS A0A1D6HBM9_MAIZE/538-773   AC A0A1D6HBM9.1
#=GS H8YWV1_9GAMM/224-421       AC H8YWV1.1
#=GS A0A0D9VHL4_9ORYZ/533-763   AC A0A0D9VHL4.1
#=GS A0A1U8HM44_GOSHI/294-531   AC A0A1U8HM44.1
#=GS A0A1V1YY85_9ACTN/188-387   AC A0A1V1YY85.1
#=GS MEND_BACSU/198-402         AC P23970.3
#=GS MEND_BACSU/198-402         DR PDB; 2X7J B; 198-402;
#=GS MEND_BACSU/198-402         DR PDB; 2X7J C; 198-402;
#=GS MEND_BACSU/198-402         DR PDB; 2X7J D; 198-402;
#=GS MEND_BACSU/198-402         DR PDB; 2X7J A; 198-402;
#=GS E1GVP1_9BACT/193-377       AC E1GVP1.1
#=GS W9QNV1_9ROSA/483-719       AC W9QNV1.1
#=GS V4YCM8_9ARCH/219-423       AC V4YCM8.1
#=GS A0A0B0HI56_9BACI/189-361   AC A0A0B0HI56.1
#=GS A0A1N6X6M0_9EURY/205-410   AC A0A1N6X6M0.1
#=GS L8M6A8_9CYAN/199-408       AC L8M6A8.1
#=GS A0A1J8QDB3_9GAMM/196-408   AC A0A1J8QDB3.1
#=GS MEND_CROS8/183-388         AC A7MHU4.1
#=GS D1BL01_VEIPT/302-444       AC D1BL01.1
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#=GS A0A1R4B3E4_9VIBR/188-404   AC A0A1R4B3E4.1
#=GS A0A239K4Y0_9ACTN/184-379   AC A0A239K4Y0.1
#=GS A0A1I3QZ68_HALDA/186-401   AC A0A1I3QZ68.1
#=GS MEND_SALTY/183-388         AC Q8ZNE8.1
#=GS A0A0Q9Z850_9FLAO/204-405   AC A0A0Q9Z850.1
#=GS A0A142HA88_9BACT/243-419   AC A0A142HA88.1
#=GS A0A193KAG1_9VIBR/194-401   AC A0A193KAG1.1
#=GS F4XL62_9CYAN/211-377       AC F4XL62.1
#=GS A0A1B9XZD3_9FLAO/186-385   AC A0A1B9XZD3.1
#=GS A0A1V3TGN6_9PAST/190-397   AC A0A1V3TGN6.1
#=GS A0A1I6GTK6_9FLAO/237-397   AC A0A1I6GTK6.1
#=GS A0A0D2RFH6_GOSRA/516-753   AC A0A0D2RFH6.1
#=GS U1PGF5_9EURY/203-393       AC U1PGF5.1
#=GS I4Z9E4_9BACT/183-387       AC I4Z9E4.1
#=GS A0A1H6RXQ7_9FLAO/188-387   AC A0A1H6RXQ7.1
#=GS A0A285CVY4_9BACI/200-400   AC A0A285CVY4.1
#=GS J1ABC1_9FLAO/192-386       AC J1ABC1.1
#=GS C6CBR5_DICP7/184-391       AC C6CBR5.1
#=GS U9VHH1_9CYAN/197-409       AC U9VHH1.1
#=GS K1LV64_9FLAO/172-364       AC K1LV64.1
#=GS C0BKA3_FLABM/222-422       AC C0BKA3.1
#=GS S0KAZ9_9ENTE/194-412       AC S0KAZ9.1
#=GS A0A2G2JEZ0_9FLAO/202-388   AC A0A2G2JEZ0.1
#=GS A0A170PE11_9CHLR/212-414   AC A0A170PE11.2
#=GS A0A0J1GWW7_9GAMM/194-407   AC A0A0J1GWW7.1
#=GS A0A0B8P1P0_9VIBR/190-398   AC A0A0B8P1P0.1
#=GS S2DJP4_9BACT/203-389       AC S2DJP4.1
#=GS A0A231MU69_9GAMM/189-396   AC A0A231MU69.1
#=GS A0A1S2R533_9BACI/197-403   AC A0A1S2R533.1
#=GS MEND_CYAA5/204-413         AC B1WZR3.1
#=GS F0LQT7_VIBFN/188-402       AC F0LQT7.1
#=GS A0A073K6X2_9BACI/189-404   AC A0A073K6X2.1
#=GS A0A0D9YU55_9ORYZ/550-780   AC A0A0D9YU55.1
#=GS A0A1S3BG05_CUCME/543-778   AC A0A1S3BG05.1
#=GS A0A251S3B0_HELAN/523-756   AC A0A251S3B0.1
#=GS C7M9J7_CAPOD/182-387       AC C7M9J7.1
#=GS A0A1G6D7L1_9FLAO/223-405   AC A0A1G6D7L1.1
#=GS A0A090UXU0_ESCVU/183-388   AC A0A090UXU0.1
#=GS A0A0U1P2P9_9BACI/200-403   AC A0A0U1P2P9.1
#=GS A0A090SP77_9VIBR/40-252    AC A0A090SP77.1
#=GS M4R8E4_BIBTR/191-398       AC M4R8E4.1
#=GS E4RS09_LEAB4/179-376       AC E4RS09.1
#=GS I0JPY6_HALH3/194-401       AC I0JPY6.1
#=GS A0A0M2PV41_PROHO/234-429   AC A0A0M2PV41.1
#=GS M1WRN2_9NOST/217-424       AC M1WRN2.1
#=GS W1FR51_ECOLX/183-368       AC W1FR51.1
#=GS A0A1V0L0G8_9BACL/187-394   AC A0A1V0L0G8.1
#=GS I6YVS6_MELRP/208-386       AC I6YVS6.1
#=GS L0H328_9GAMM/210-402       AC L0H328.1
#=GS A0A170YUY0_9BACT/183-391   AC A0A170YUY0.1
#=GS A0A139SS79_9BACT/210-424   AC A0A139SS79.1
#=GS A0A1A9LEE8_9FLAO/169-387   AC A0A1A9LEE8.1
#=GS A0A0T9KMX9_9GAMM/183-389   AC A0A0T9KMX9.1
#=GS A0A261QEJ1_9BACI/190-404   AC A0A261QEJ1.1
#=GS A0A1Q3STD2_9CHLR/205-425   AC A0A1Q3STD2.1
#=GS G2DZU2_9GAMM/202-402       AC G2DZU2.1
#=GS A0A061EAU2_THECC/606-843   AC A0A061EAU2.1
#=GS A0A099W0P7_9LIST/193-404   AC A0A099W0P7.1
#=GS F8IC82_SULAT/174-392       AC F8IC82.1
#=GS F6HGG1_VITVI/165-372       AC F6HGG1.1
#=GS A0A1M5JIN9_9FLAO/208-399   AC A0A1M5JIN9.1
#=GS A0A198GFC3_9GAMM/183-388   AC A0A198GFC3.1
#=GS A0A0K9F6D7_9BACI/190-398   AC A0A0K9F6D7.1
#=GS M0HCQ1_9EURY/198-408       AC M0HCQ1.1
#=GS MEND_CYAP8/209-411         AC B7K0T5.1
#=GS A0A1I2JDQ8_9BACT/188-406   AC A0A1I2JDQ8.1
#=GS A0A023X5L2_9ACTN/194-415   AC A0A023X5L2.1
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#=GS A0A1G1TEF5_9BACT/231-400   AC A0A1G1TEF5.1
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#=GS A0A1H8A0G0_9DELT/190-408   AC A0A1H8A0G0.1
#=GS V5CSX6_ENTCL/183-388       AC V5CSX6.1
#=GS A0A1Z4JBT0_LEPBY/212-398   AC A0A1Z4JBT0.1
#=GS R8NRI3_BACCE/186-404       AC R8NRI3.1
#=GS A0A075LQI8_9BACI/188-401   AC A0A075LQI8.1
#=GS D8MUS6_ERWBE/182-385       AC D8MUS6.1
#=GS K0TT94_9STAP/186-390       AC K0TT94.1
#=GS Q05TR6_9SYNE/156-377       AC Q05TR6.1
#=GS A0A227NG08_9FLAO/209-386   AC A0A227NG08.1
#=GS A0A1M6FNR6_9FLAO/189-387   AC A0A1M6FNR6.1
#=GS K9Z369_CYAAP/198-414       AC K9Z369.1
#=GS A0A150MRJ1_9BACI/202-395   AC A0A150MRJ1.1
#=GS A0A0H4WSM5_9DELT/214-410   AC A0A0H4WSM5.1
#=GS A0A2G2ZHN3_CAPAN/41-275    AC A0A2G2ZHN3.1
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#=GS A0A1B1V8C6_9VIBR/189-404   AC A0A1B1V8C6.1
#=GS MEND_CHLL2/186-404         AC B3EG68.1
#=GS K9P3A4_CYAGP/249-444       AC K9P3A4.1
#=GS A0A1Y0M4I4_9FLAO/185-385   AC A0A1Y0M4I4.1
#=GS A0A0F7PDS3_9EURY/213-408   AC A0A0F7PDS3.1
#=GS B8F691_HAEPS/191-398       AC B8F691.1
#=GS A0A1S2U020_9GAMM/189-403   AC A0A1S2U020.1
#=GS A0A1H5LIG4_9FLAO/205-403   AC A0A1H5LIG4.1
#=GS A0A1H1SJX2_9FLAO/220-418   AC A0A1H1SJX2.1
#=GS A0A0D9VHL7_9ORYZ/542-772   AC A0A0D9VHL7.1
#=GS MEND_CHLL7/186-403         AC Q3B612.1
#=GS A0A0G4GZP4_VITBC/874-1077  AC A0A0G4GZP4.1
#=GS A0A1B9ADI8_9BACI/182-406   AC A0A1B9ADI8.1
#=GS M7MH53_9FLAO/216-419       AC M7MH53.1
#=GS A0A0J8YNM4_9BACT/191-396   AC A0A0J8YNM4.1
#=GS A0A072TSM7_MEDTR/539-775   AC A0A072TSM7.1
#=GS A0A0M0XCI7_9BACI/195-404   AC A0A0M0XCI7.1
#=GS A0A0R2HVS5_CARDV/191-403   AC A0A0R2HVS5.1
#=GS A0A1J1LS94_9CYAN/204-415   AC A0A1J1LS94.1
#=GS A0A0M4FY06_9BACI/194-401   AC A0A0M4FY06.1
#=GS A0A0U3IVK8_9FLAO/189-404   AC A0A0U3IVK8.1
#=GS A0A109MZ10_9BACI/199-403   AC A0A109MZ10.1
#=GS A0A1N6MVQ1_9GAMM/187-396   AC A0A1N6MVQ1.1
#=GS B9HWS3_POPTR/521-757       AC B9HWS3.2
#=GS A0A0D9YU57_9ORYZ/550-780   AC A0A0D9YU57.1
#=GS A0A1G9RPI4_9BACT/196-401   AC A0A1G9RPI4.1
#=GS A0A1U7VAD3_NICSY/329-563   AC A0A1U7VAD3.1
#=GS K8GNC4_9CYAN/223-409       AC K8GNC4.1
#=GS A0A087SN26_AUXPR/718-959   AC A0A087SN26.1
#=GS K9YLX0_CYASC/215-416       AC K9YLX0.1
#=GS A0A0C5WDM5_9FLAO/214-419   AC A0A0C5WDM5.1
#=GS E1Z4H3_CHLVA/916-1114      AC E1Z4H3.1
#=GS A0A1C4A1N9_WEIHE/188-390   AC A0A1C4A1N9.1
#=GS A0A167HPW8_9FLAO/185-387   AC A0A167HPW8.1
#=GS A0A0R2GWA6_9LACO/191-384   AC A0A0R2GWA6.1
#=GS H1X853_WEICO/185-388       AC H1X853.1
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#=GS A0A287U4I0_HORVV/300-535   AC A0A287U4I0.1
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#=GS A0A2C1L015_9BACI/183-405   AC A0A2C1L015.1
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