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Database: Pfam
Entry: TraI_2
LinkDB: TraI_2
Original site: TraI_2 
#=GF ID   TraI_2
#=GF AC   PF07514.11
#=GF DE   Putative helicase
#=GF AU   Studholme DJ;0000-0002-3010-6637
#=GF SE   Manual
#=GF GA   23.90 23.90;
#=GF TC   23.90 23.90;
#=GF NC   23.80 23.80;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   8645296
#=GF RT   A new plasmid-encoded proteic killer gene system: cloning,
#=GF RT   sequencing, and analyzing hig locus of plasmid Rts1. 
#=GF RA   Tian QB, Ohnishi M, Tabuchi A, Terawaki Y; 
#=GF RL   Biochem Biophys Res Commun 1996;220:280-284.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   8078071
#=GF RT   Molecular cloning and expression of a novel
#=GF RT   hydroxymethylcytosine-specific restriction enzyme (PvuRts1I)
#=GF RT   modulated by glucosylation of DNA. 
#=GF RA   Janosi L, Yonemitsu H, Hong H, Kaji A; 
#=GF RL   J Mol Biol 1994;242:45-61.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   12426355
#=GF RT   Gene islands integrated into tRNA(Gly) genes confer genome
#=GF RT   diversity on a Pseudomonas aeruginosa clone. 
#=GF RA   Larbig KD, Christmann A, Johann A, Klockgether J, Hartsch T,
#=GF RA   Merkl R, Wiehlmann L, Fritz HJ, Tummler B; 
#=GF RL   J Bacteriol 2002;184:6665-6680.
#=GF RN   [4]
#=GF RM   12107144
#=GF RT   Genomic and functional analyses of SXT, an integrating
#=GF RT   antibiotic resistance gene transfer element derived from Vibrio
#=GF RT   cholerae. 
#=GF RA   Beaber JW, Hochhut B, Waldor MK; 
#=GF RL   J Bacteriol 2002;184:4259-4269.
#=GF RN   [5]
#=GF RM   14506243
#=GF RT   Extent of Single-stranded DNA Required for Efficient TraI
#=GF RT   Helicase Activity in Vitro. 
#=GF RA   Csitkovits VC, Zechner EL; 
#=GF RL   J Biol Chem 2003;278:48696-48703.
#=GF RN   [6]
#=GF RM   12637015
#=GF RT   Subdomain organization and catalytic residues of the F factor
#=GF RT   TraI relaxase domain. 
#=GF RA   Street LM, Harley MJ, Stern JC, Larkin C, Williams SL, Miller
#=GF RA   DL, Dohm JA, Rodgers ME, Schildbach JF; 
#=GF RL   Biochim Biophys Acta 2003;1646:86-99.
#=GF DR   INTERPRO; IPR011119;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   Some members of this family have been annotated as helicases.
#=GF SQ   489
#=GS M7CX73_9ALTE/111-212      AC M7CX73.1
#=GS A0A0M2KEM5_9GAMM/29-251   AC A0A0M2KEM5.1
#=GS A0A1I3B166_9GAMM/18-330   AC A0A1I3B166.1
#=GS A0A259EY55_9PROT/57-381   AC A0A259EY55.1
#=GS A0A1D9H819_9BURK/27-340   AC A0A1D9H819.1
#=GS I3TV48_TISMK/51-364       AC I3TV48.1
#=GS W1JA93_9GAMM/32-263       AC W1JA93.1
#=GS A0A2D0KLQ8_9GAMM/32-243   AC A0A2D0KLQ8.1
#=GS L8MJA5_PSEPS/27-340       AC L8MJA5.1
#=GS A0A0K8P6N8_IDESA/1-312    AC A0A0K8P6N8.1
#=GS Q5ZRF5_LEGPH/23-260       AC Q5ZRF5.1
#=GS A0A285UVX9_9RHIZ/1-312    AC A0A285UVX9.1
#=GS A0A1W9J471_9PROT/44-361   AC A0A1W9J471.1
#=GS A0A0W0R0Y8_9GAMM/16-253   AC A0A0W0R0Y8.1
#=GS A0A1E4HFH3_9GAMM/28-340   AC A0A1E4HFH3.1
#=GS S9ZNY5_9RHOO/27-340       AC S9ZNY5.1
#=GS A0A1S2DFJ4_9GAMM/20-332   AC A0A1S2DFJ4.1
#=GS F2B8L6_9NEIS/44-375       AC F2B8L6.1
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#=GS A0A0A1VMZ2_9BURK/1-312    AC A0A0A1VMZ2.1
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#=GS A0A068R5N0_9GAMM/32-263   AC A0A068R5N0.1
#=GS H8GP24_METAL/44-364       AC H8GP24.1
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#=GS B8GNQ4_THISH/26-339       AC B8GNQ4.1
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#=GS Q5P582_AROAE/26-339       AC Q5P582.1
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#=GS U2HE63_9BURK/55-376       AC U2HE63.1
#=GS A0A158ATS9_9BURK/4-248    AC A0A158ATS9.1
#=GS A0A1E4L849_9PROT/27-340   AC A0A1E4L849.1
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#=GS C4LA75_TOLAT/27-340       AC C4LA75.1
#=GS A0A1I2DX51_9BURK/44-365   AC A0A1I2DX51.1
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#=GS Q21QJ1_RHOFT/57-380       AC Q21QJ1.1
#=GS A0A0U1PXK8_9BURK/27-340   AC A0A0U1PXK8.1
#=GS K5X8W5_9PSED/1-312        AC K5X8W5.1
#=GS A0A069NS50_9BURK/5-249    AC A0A069NS50.1
#=GS G4F8Z0_9GAMM/111-209      AC G4F8Z0.1
#=GS A0A1W9J7N2_9PROT/44-363   AC A0A1W9J7N2.1
#=GS F4G795_ALIDK/29-342       AC F4G795.1
#=GS A0A1Q8ITR6_9BURK/7-233    AC A0A1Q8ITR6.1
#=GS A0A193KJ41_9VIBR/31-367   AC A0A193KJ41.1
#=GS A0A257LUJ2_9BURK/61-384   AC A0A257LUJ2.1
#=GS A0A0A8UTZ8_LEGHA/19-253   AC A0A0A8UTZ8.1
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#=GS A0A0A1BC68_9GAMM/99-399   AC A0A0A1BC68.1
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#=GS A0A1D9HCI4_9BURK/3-246    AC A0A1D9HCI4.1
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#=GS A0A0M2K5T6_9GAMM/27-242   AC A0A0M2K5T6.1
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#=GS J4P7B6_9BURK/1-313        AC J4P7B6.1
#=GS G7UNV6_PSEUP/27-340       AC G7UNV6.1
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#=GS D3S9E5_THISK/142-213      AC D3S9E5.1
#=GS A0A176VAD1_9PSED/23-335   AC A0A176VAD1.1
#=GS A0A0C4YJW1_9BURK/53-377   AC A0A0C4YJW1.1
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#=GS A0A1G6L5H4_9BURK/29-342   AC A0A1G6L5H4.1
#=GS A0A1I1N0W3_9GAMM/44-369   AC A0A1I1N0W3.1
#=GS G7LRS7_9GAMM/31-263       AC G7LRS7.1
#=GS A0A1G3CZ62_9GAMM/54-375   AC A0A1G3CZ62.1
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#=GS A0A098GK06_TATMI/20-249   AC A0A098GK06.1
#=GS A0A0C4WS82_9GAMM/54-375   AC A0A0C4WS82.1
#=GS F3GPG1_PSESJ/1-67         AC F3GPG1.1
#=GS M9WY45_MANHA/34-347       AC M9WY45.1
#=GS Q4K7F0_PSEF5/22-336       AC Q4K7F0.1
#=GS A0A011QKY0_9PROT/45-364   AC A0A011QKY0.1
#=GS A0A0W0WR16_9GAMM/20-254   AC A0A0W0WR16.1
#=GS A0A1Z9XAW1_9ALTE/70-387   AC A0A1Z9XAW1.1
#=GS A4JUP7_BURVG/6-239        AC A4JUP7.1
#=GS A0A0W0XMY9_9GAMM/19-256   AC A0A0W0XMY9.1
#=GS A0A1W6ZFP6_9BORD/26-339   AC A0A1W6ZFP6.1
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