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Database: Pfam
Entry: TrwB_AAD_bind
LinkDB: TrwB_AAD_bind
Original site: TrwB_AAD_bind 
#=GF ID   TrwB_AAD_bind
#=GF AC   PF10412.10
#=GF DE   Type IV secretion-system coupling protein DNA-binding domain
#=GF AU   Finn RD;0000-0001-8626-2148
#=GF AU   Coggill P;0000-0001-5731-1588
#=GF SE   Gene3D, pdb_1e9r
#=GF GA   20.50 20.50;
#=GF TC   20.50 20.50;
#=GF NC   20.40 20.40;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 47079205 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11214325
#=GF RT   The bacterial conjugation protein TrwB resembles ring helicases
#=GF RT   and F1-ATPase. 
#=GF RA   Gomis-Ruth FX, Moncalian G, Perez-Luque R, Gonzalez A, Cabezon
#=GF RA   E, de la Cruz F, Coll M; 
#=GF RL   Nature. 2001;409:637-641.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   11748238
#=GF RT   Conjugative plasmid protein TrwB, an integral membrane type IV
#=GF RT   secretion system coupling protein. Detailed structural features
#=GF RT   and mapping of the active site cleft. 
#=GF RA   Gomis-Ruth FX, Moncalian G, de la Cruz F, Coll M; 
#=GF RL   J Biol Chem. 2002;277:7556-7566.
#=GF DR   INTERPRO; IPR019476;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   The plasmid conjugative coupling protein TrwB forms hexamers
#=GF CC   from six structurally very similar protomers [1]. This hexamer
#=GF CC   contains a central channel running from the cytosolic pole (made
#=GF CC   up by the AADs) to the membrane pole ending at the transmembrane
#=GF CC   pore shaped by 12 transmembrane helices, rendering an overall
#=GF CC   mushroom-like structure. The TrwB_AAD (all-alpha domain) domain
#=GF CC   appears to be the DNA-binding domain of the structure. TrwB, a
#=GF CC   basic integral inner-membrane nucleoside-triphosphate-binding
#=GF CC   protein, is the structural prototype for the type IV secretion
#=GF CC   system coupling proteins, a family of proteins essential for
#=GF CC   macromolecular transport between cells and export [2].
#=GF SQ   1276
#=GS A0A1Z4JS75_LEPBY/155-542    AC A0A1Z4JS75.1
#=GS G8NT31_GRAMM/223-591        AC G8NT31.1
#=GS A0A327LN80_9RHOB/436-521    AC A0A327LN80.1
#=GS A0A2G1VLS7_9FLAO/96-463     AC A0A2G1VLS7.1
#=GS A0A2Z5FTP8_9BACT/221-593    AC A0A2Z5FTP8.1
#=GS A0A2A2HGD8_9GAMM/80-245     AC A0A2A2HGD8.1
#=GS A0A2W7F7W7_9BURK/36-426     AC A0A2W7F7W7.1
#=GS A4XE63_NOVAD/225-611        AC A4XE63.1
#=GS A0A3A9BPS8_9BACT/120-515    AC A0A3A9BPS8.1
#=GS A0A0C1MVL0_9RICK/127-213    AC A0A0C1MVL0.1
#=GS R6XPG3_9FIRM/66-133         AC R6XPG3.1
#=GS M0C5E9_9EURY/86-432         AC M0C5E9.1
#=GS A0A127CRI2_9RHIZ/123-517    AC A0A127CRI2.1
#=GS A0A437J312_9SPHN/224-610    AC A0A437J312.1
#=GS B4WW43_SYNS7/1-244          AC B4WW43.1
#=GS A0A239MPR9_9BACT/204-577    AC A0A239MPR9.1
#=GS A0A225N3D8_9BURK/117-518    AC A0A225N3D8.1
#=GS A0A1H7D836_9SPHN/224-614    AC A0A1H7D836.1
#=GS A0A126R800_9SPHN/172-554    AC A0A126R800.1
#=GS A0A1G9XAU1_9EURY/62-416     AC A0A1G9XAU1.1
#=GS A0A2A4G5A5_9FLAO/59-433     AC A0A2A4G5A5.1
#=GS A0A1H6EZW4_9ACTN/429-506    AC A0A1H6EZW4.1
#=GS A0A031J2U6_9SPHN/167-561    AC A0A031J2U6.1
#=GS W1S0I1_9SPHN/224-610        AC W1S0I1.1
#=GS A3VKX4_9RHOB/440-525        AC A3VKX4.1
#=GS A0A0C4WLM4_9GAMM/151-199    AC A0A0C4WLM4.1
#=GS A0A149VX41_9PROT/128-191    AC A0A149VX41.1
#=GS A0A1R4HH93_9GAMM/178-239    AC A0A1R4HH93.1
#=GS A0A1L4D4S7_9PROT/201-591    AC A0A1L4D4S7.1
#=GS A0A378K9U5_9GAMM/168-556    AC A0A378K9U5.1
#=GS A0A239XWS7_9FLAO/199-592    AC A0A239XWS7.1
#=GS A0A1N7FDN1_9EURY/97-449     AC A0A1N7FDN1.1
#=GS W8L8H3_9GAMM/177-237        AC W8L8H3.1
#=GS A0A1I6B1B5_9PSEU/4-79       AC A0A1I6B1B5.1
#=GS A0A0P1EPF7_9RHOB/436-521    AC A0A0P1EPF7.1
#=GS A0A2S7WFW5_9FLAO/1-317      AC A0A2S7WFW5.1
#=GS C1F5K1_ACIC5/216-586        AC C1F5K1.1
#=GS A9MS47_SALAR/134-190        AC A9MS47.1
#=GS A0A244CN34_9GAMM/146-345    AC A0A244CN34.1
#=GS A0A365T6K7_9EURY/432-776    AC A0A365T6K7.1
#=GS A0A0W0ZAE4_9GAMM/116-285    AC A0A0W0ZAE4.1
#=GS A5CC23_ORITB/180-562        AC A5CC23.1
#=GS A0A2K8T6W1_9NOSO/109-505    AC A0A2K8T6W1.1
#=GS A0A2Z4LSH6_9FLAO/115-485    AC A0A2Z4LSH6.1
#=GS L0JTW1_NATP1/101-447        AC L0JTW1.1
#=GS A0A1A6C6T0_9GAMM/16-395     AC A0A1A6C6T0.1
#=GS A0A1R4H470_9GAMM/175-238    AC A0A1R4H470.1
#=GS I3Y948_THIV6/139-332        AC I3Y948.1
#=GS A0A0F0LXH1_9MICO/295-636    AC A0A0F0LXH1.1
#=GS A0A1H6CF11_9BACT/215-585    AC A0A1H6CF11.1
#=GS U9VXF5_9CYAN/159-527        AC U9VXF5.1
#=GS A0A0S4LCE4_9BACT/164-546    AC A0A0S4LCE4.1
#=GS A0A0F5PBL1_9SPHN/224-610    AC A0A0F5PBL1.1
#=GS A0A1T4NHH0_9BACT/377-719    AC A0A1T4NHH0.1
#=GS A0A367S3D9_9NOSO/138-512    AC A0A367S3D9.1
#=GS A0A0D1P8T2_BRAEL/154-513    AC A0A0D1P8T2.1
#=GS A0A367RWB1_9NOSO/113-507    AC A0A367RWB1.1
#=GS A0A285TDQ6_9RHOB/433-515    AC A0A285TDQ6.1
#=GS A0A2R3Z8J8_9FLAO/90-462     AC A0A2R3Z8J8.1
#=GS A0A2R4MIV4_9RHIZ/183-568    AC A0A2R4MIV4.1
#=GS A0A447G750_9ARCH/624-751    AC A0A447G750.1
#=GS A0A437N4B1_9SPHN/225-615    AC A0A437N4B1.1
#=GS A0A410GDQ8_9BURK/117-518    AC A0A410GDQ8.1
#=GS A0A0C1YCN8_9CYAN/95-481     AC A0A0C1YCN8.1
#=GS A0A3S0J9V5_9BACT/123-512    AC A0A3S0J9V5.1
#=GS I0ILY2_LEPFC/14-411         AC I0ILY2.1
#=GS A0A076I376_9BACT/126-512    AC A0A076I376.1
#=GS A0A432MLJ0_9BACT/264-678    AC A0A432MLJ0.1
#=GS A0A0W0WRR6_9GAMM/168-535    AC A0A0W0WRR6.1
#=GS A0A098GBG9_9GAMM/176-569    AC A0A098GBG9.1
#=GS E0ULT5_CYAP2/264-513        AC E0ULT5.1
#=GS A0A3D9ET11_9FLAO/194-483    AC A0A3D9ET11.1
#=GS A0A238DSB5_9BURK/88-476     AC A0A238DSB5.1
#=GS I1AYY7_9RHOB/436-521        AC I1AYY7.1
#=GS A0A1Y0GD07_9PROT/71-462     AC A0A1Y0GD07.1
#=GS A0A270BGY2_9SPHN/172-554    AC A0A270BGY2.1
#=GS D8JCS4_HALJB/31-378         AC D8JCS4.1
#=GS A0A418NTL9_9SPHN/170-562    AC A0A418NTL9.1
#=GS A0A327JK47_9RHIZ/25-353     AC A0A327JK47.1
#=GS F9UAG9_9GAMM/140-308        AC F9UAG9.1
#=GS A4V7C3_PSEFS/22-100         AC A4V7C3.1
#=GS A0A1B1ZJ25_9PSEU/385-472    AC A0A1B1ZJ25.1
#=GS A0A369W097_9RHIZ/146-259    AC A0A369W097.1
#=GS A0A2W2H8X4_9ACTN/391-469    AC A0A2W2H8X4.1
#=GS A0A1E1EYS9_9SPHN/172-554    AC A0A1E1EYS9.1
#=GS D8J9Y4_HALJB/67-147         AC D8J9Y4.1
#=GS A0A3N4NSZ7_9FLAO/176-464    AC A0A3N4NSZ7.1
#=GS A0A2A8IE96_9BACI/191-266    AC A0A2A8IE96.1
#=GS A0A212PF98_9DELT/25-396     AC A0A212PF98.1
#=GS Q5V7P5_HALMA/133-500        AC Q5V7P5.1
#=GS Q30Q33_SULDN/95-423         AC Q30Q33.1
#=GS Q11ZH3_POLSJ/474-623        AC Q11ZH3.1
#=GS A0A0W0VIT3_9GAMM/173-319    AC A0A0W0VIT3.1
#=GS A0A218QUV6_9CYAN/124-520    AC A0A218QUV6.1
#=GS U2ZXJ1_9SPHN/172-554        AC U2ZXJ1.1
#=GS A0A345QFK8_9RHOB/22-208     AC A0A345QFK8.1
#=GS F8L2X3_SIMNZ/192-577        AC F8L2X3.1
#=GS R5XWY7_9FIRM/43-443         AC R5XWY7.1
#=GS A0A347ZVI2_9CHLR/20-91      AC A0A347ZVI2.1
#=GS L1NSJ8_9FLAO/276-593        AC L1NSJ8.1
#=GS A0A1M5HPE9_9BACT/20-320     AC A0A1M5HPE9.1
#=GS A0A2G5KJH8_9FLAO/134-416    AC A0A2G5KJH8.1
#=GS A0A1Z4RSG7_9CHRO/117-494    AC A0A1Z4RSG7.1
#=GS R7F8G4_9CLOT/317-511        AC R7F8G4.1
#=GS A0A166R0A7_9RHOB/436-521    AC A0A166R0A7.1
#=GS A0A1G8F049_9VIBR/151-529    AC A0A1G8F049.1
#=GS A0A1H1NTT8_9BACT/116-271    AC A0A1H1NTT8.1
#=GS A0A086XUT5_9RHOB/436-521    AC A0A086XUT5.1
#=GS Q1GN15_RUEST/436-521        AC Q1GN15.1
#=GS L8M5I9_9CYAN/173-579        AC L8M5I9.1
#=GS A5V2N2_SPHWW/189-575        AC A5V2N2.1
#=GS D3VAD3_XENNA/174-228        AC D3VAD3.1
#=GS U9VN73_9CYAN/31-277         AC U9VN73.1
#=GS D4H0C4_HALVD/423-495        AC D4H0C4.1
#=GS A0A0H4L529_9RHOB/436-521    AC A0A0H4L529.1
#=GS F2LRX9_BURGS/170-557        AC F2LRX9.1
#=GS A0A161XHQ4_9EURY/96-448     AC A0A161XHQ4.1
#=GS A0A1Z4KDW6_9CYAN/137-511    AC A0A1Z4KDW6.1
#=GS Q8YKT5_NOSS1/717-829        AC Q8YKT5.1
#=GS B4VV16_9CYAN/137-541        AC B4VV16.1
#=GS A0A0W0XSR1_9GAMM/172-565    AC A0A0W0XSR1.1
#=GS A0A238VQ19_9FLAO/29-360     AC A0A238VQ19.1
#=GS A0A0B1ZGZ7_9SPHN/172-554    AC A0A0B1ZGZ7.1
#=GS B2JBL5_NOSP7/229-495        AC B2JBL5.1
#=GS A0A147EFJ9_9SPHN/171-563    AC A0A147EFJ9.1
#=GS Q8YK80_NOSS1/318-515        AC Q8YK80.1
#=GS A0A0M3T9P1_9SPHN/139-525    AC A0A0M3T9P1.1
#=GS A0A1G4U2R4_9SPHN/224-610    AC A0A1G4U2R4.1
#=GS I6Y203_PSEPQ/275-612        AC I6Y203.1
#=GS J2H0K7_9SPHN/169-570        AC J2H0K7.1
#=GS F4GW04_PUSST/113-496        AC F4GW04.1
#=GS L0JTE5_NATP1/123-197        AC L0JTE5.1
#=GS A0A1W6BYI0_9PROT/640-788    AC A0A1W6BYI0.1
#=GS A0A2A2TCK5_9CYAN/227-322    AC A0A2A2TCK5.1
#=GS L0JRD6_NATP1/75-419         AC L0JRD6.1
#=GS A0A062XQV1_9BACT/534-655    AC A0A062XQV1.1
#=GS A0A1N7GFA3_9ACTN/470-685    AC A0A1N7GFA3.1
#=GS A0A0M9E7E4_9DELT/12-398     AC A0A0M9E7E4.1
#=GS H9ZZE1_FERFK/276-610        AC H9ZZE1.1
#=GS A0A372G8X2_9ACTN/446-591    AC A0A372G8X2.1
#=GS Q2NDJ4_ERYLH/197-583        AC Q2NDJ4.1
#=GS A0A081PDN5_9SPHI/192-586    AC A0A081PDN5.1
#=GS R7FHX9_9FIRM/44-411         AC R7FHX9.1
#=GS A0A3N1LAA7_9ACTN/424-568    AC A0A3N1LAA7.1
#=GS Q3HKI7_RHOS4/184-568        AC Q3HKI7.1
#=GS A0A223V8B8_9FLAO/140-418    AC A0A223V8B8.1
#=GS A0A494W4R8_9SPHN/172-554    AC A0A494W4R8.1
#=GS R4K232_CLOPA/173-568        AC R4K232.1
#=GS A0A495BQJ0_9BACT/214-585    AC A0A495BQJ0.1
#=GS A0A1M7PZW3_9BACT/201-592    AC A0A1M7PZW3.1
#=GS A0A1H9CJQ8_9EURY/119-463    AC A0A1H9CJQ8.1
#=GS A0A078KYH4_9GAMM/168-557    AC A0A078KYH4.1
#=GS A0A1C5IJ61_9ACTN/408-502    AC A0A1C5IJ61.1
#=GS N2IVD9_9PSED/152-322        AC N2IVD9.1
#=GS A0A132BUJ7_9RHOB/439-522    AC A0A132BUJ7.1
#=GS A0A139WQK3_9CYAN/109-504    AC A0A139WQK3.1
#=GS A0A2Z3H079_9BACT/8-401      AC A0A2Z3H079.1
#=GS F4GMN4_PUSST/117-518        AC F4GMN4.1
#=GS Q326X8_SHIDS/56-446         AC Q326X8.1
#=GS Q971N4_SULTO/231-557        AC Q971N4.1
#=GS A0A1Q4RBS3_9CYAN/129-530    AC A0A1Q4RBS3.1
#=GS C7QG99_CATAD/428-558        AC C7QG99.1
#=GS A0A418YKE4_9GAMM/146-355    AC A0A418YKE4.1
#=GS A0A0B8ZH00_9SPHN/225-611    AC A0A0B8ZH00.1
#=GS A0A3S0QZR8_9SPHN/224-610    AC A0A3S0QZR8.1
#=GS A0A0P1GT61_9RHOB/432-519    AC A0A0P1GT61.1
#=GS A0A140NDH2_PROSM/163-341    AC A0A140NDH2.1
#=GS A0A3L7DZ79_9GAMM/172-234    AC A0A3L7DZ79.1
#=GS W0LE18_9GAMM/175-237        AC W0LE18.1
#=GS A0A1W6BBF6_9GAMM/179-571    AC A0A1W6BBF6.1
#=GS A0A2P8QYC0_9PROT/645-792    AC A0A2P8QYC0.1
#=GS A0A432VBH6_9RHIZ/239-617    AC A0A432VBH6.1
#=GS A0A1H4FUY5_9RHOB/175-383    AC A0A1H4FUY5.1
#=GS A0A1N6W091_9BRAD/166-539    AC A0A1N6W091.1
#=GS A0A2T0MID9_9FLAO/49-419     AC A0A2T0MID9.1
#=GS A0A139NB09_9STRE/292-631    AC A0A139NB09.1
#=GS E4NHN8_KITSK/272-355        AC E4NHN8.1
#=GS N1ML58_9SPHN/172-554        AC N1ML58.1
#=GS N6WEM9_9ACTO/295-631        AC N6WEM9.1
#=GS A0A1A8T720_9GAMM/146-343    AC A0A1A8T720.1
#=GS A5CEG6_ORITB/63-358         AC A5CEG6.1
#=GS A9EBX2_9RHOB/436-521        AC A9EBX2.1
#=GS I2JFJ2_9GAMM/112-489        AC I2JFJ2.1
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