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Database: Pfam
Entry: VirC1
LinkDB: VirC1
Original site: VirC1 
#=GF ID   VirC1
#=GF AC   PF07015.11
#=GF DE   VirC1 protein
#=GF AU   Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE   Pfam-B_11309 (release 10.0)
#=GF GA   20.20 20.20;
#=GF TC   20.20 20.20;
#=GF NC   20.10 20.10;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   2592351
#=GF RT   The Agrobacterium tumefaciens virC1 gene product binds to
#=GF RT   overdrive, a T-DNA transfer enhancer. 
#=GF RA   Toro N, Datta A, Carmi OA, Young C, Prusti RK, Nester EW; 
#=GF RL   J Bacteriol 1989;171:6845-6849.
#=GF DR   INTERPRO; IPR009744;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family consists of several bacterial VirC1 proteins. In
#=GF CC   Agrobacterium tumefaciens, a cis-active 24-base-pair sequence
#=GF CC   adjacent to the right border of the T-DNA, called overdrive,
#=GF CC   stimulates tumour formation by increasing the level of T-DNA
#=GF CC   processing. It is thought that the virC operon which enhances
#=GF CC   T-DNA processing probably does so because the VirC1 protein
#=GF CC   interacts with overdrive. It has now been shown that the virC1
#=GF CC   gene product binds to overdrive but not to the right border of
#=GF CC   T-DNA [1]. 
#=GF SQ   513
#=GS X6D751_9RHIZ/12-210       AC X6D751.1
#=GS A0A0Q7XWF0_9RHIZ/1-226    AC A0A0Q7XWF0.1
#=GS A0A1D3RP49_9BACT/1-228    AC A0A1D3RP49.1
#=GS A0A0M6XVN7_9RHOB/1-152    AC A0A0M6XVN7.1
#=GS A0A285U2Z4_9RHIZ/1-219    AC A0A285U2Z4.1
#=GS A0A011V975_9RHIZ/1-205    AC A0A011V975.1
#=GS A0A0M4D5Y7_SPHS1/1-226    AC A0A0M4D5Y7.1
#=GS A0A0Q4Z505_9RHIZ/1-187    AC A0A0Q4Z505.1
#=GS A0A074T9U1_9RHOB/1-238    AC A0A074T9U1.1
#=GS A0A239K2P7_9BACT/1-220    AC A0A239K2P7.1
#=GS A0A1X7F107_9PROT/2-188    AC A0A1X7F107.1
#=GS X7F2E7_9RHOB/6-174        AC X7F2E7.1
#=GS S3HX73_9RHIZ/1-219        AC S3HX73.1
#=GS A0A0W1D1X5_9SPHN/1-227    AC A0A0W1D1X5.1
#=GS A0A1I0WZJ1_9RHIZ/1-224    AC A0A1I0WZJ1.1
#=GS A0A196QUL8_9RHOB/1-205    AC A0A196QUL8.1
#=GS A0A0L1JK85_9RHOB/2-209    AC A0A0L1JK85.1
#=GS K2I339_9RHOB/1-223        AC K2I339.1
#=GS S5YJD1_PARAH/6-239        AC S5YJD1.1
#=GS I4AKY7_BERLS/1-195        AC I4AKY7.1
#=GS A0A1X7EK43_9PROT/2-208    AC A0A1X7EK43.1
#=GS A0A1W9IA66_9PROT/1-193    AC A0A1W9IA66.1
#=GS B1ZM51_METPB/1-221        AC B1ZM51.1
#=GS A0A1T1B8H4_9DEIO/16-195   AC A0A1T1B8H4.1
#=GS Q0FUD0_PELBH/5-239        AC Q0FUD0.1
#=GS A0A1C7NVL7_9RHIZ/1-218    AC A0A1C7NVL7.1
#=GS A0A0D2SQN9_9PROT/2-210    AC A0A0D2SQN9.1
#=GS B9K405_AGRVS/1-231        AC B9K405.1
#=GS A0A0D0KSJ6_RHIRD/1-222    AC A0A0D0KSJ6.1
#=GS A0A256FXP1_9RHIZ/1-236    AC A0A256FXP1.1
#=GS A0A132BUH2_9RHOB/1-260    AC A0A132BUH2.1
#=GS J1T0H2_9RHIZ/1-219        AC J1T0H2.1
#=GS A0A0W1DJ13_9SPHN/1-227    AC A0A0W1DJ13.1
#=GS B0T9B5_CAUSK/1-73         AC B0T9B5.1
#=GS A0A1U7DDT0_9RHOB/1-249    AC A0A1U7DDT0.1
#=GS K0PZH4_9RHIZ/1-215        AC K0PZH4.1
#=GS V4PVX7_9CAUL/1-217        AC V4PVX7.1
#=GS E8RU23_ASTEC/1-218        AC E8RU23.1
#=GS A0A212R3N1_9PROT/1-195    AC A0A212R3N1.1
#=GS A0A1H3F015_9RHOB/1-139    AC A0A1H3F015.1
#=GS A0A1G7ZLN0_9RHOB/1-238    AC A0A1G7ZLN0.1
#=GS J8W2Y2_9SPHN/1-218        AC J8W2Y2.1
#=GS A0A0D6T7K6_9RHOB/6-236    AC A0A0D6T7K6.1
#=GS A0A1D9MHG6_9RHOB/1-227    AC A0A1D9MHG6.1
#=GS A0A0D6TDA0_9RHOB/1-241    AC A0A0D6TDA0.1
#=GS Q1M9R3_RHIL3/1-231        AC Q1M9R3.1
#=GS A0A196MG45_9SPHN/1-189    AC A0A196MG45.1
#=GS A0A243P7P9_9SPHN/1-220    AC A0A243P7P9.1
#=GS A0A086XTP1_9RHOB/6-239    AC A0A086XTP1.1
#=GS A0A0J9B3B7_9BACT/1-173    AC A0A0J9B3B7.1
#=GS A0A256GCW1_9RHIZ/1-218    AC A0A256GCW1.1
#=GS E8X689_GRATM/1-227        AC E8X689.1
#=GS A0A2D0B170_9RHIZ/1-217    AC A0A2D0B170.1
#=GS A0A1H1KNS8_9RHIZ/1-219    AC A0A1H1KNS8.1
#=GS A0A1H4G0M3_9RHOB/1-187    AC A0A1H4G0M3.1
#=GS A0A1Q9AZX0_9RHIZ/1-219    AC A0A1Q9AZX0.1
#=GS A0A1V5EFW2_9BRAD/1-176    AC A0A1V5EFW2.1
#=GS A0A0N0JBR7_9RHIZ/1-219    AC A0A0N0JBR7.1
#=GS A0A2A2K1N1_9BILA/1-223    AC A0A2A2K1N1.1
#=GS M5FJH4_9RHIZ/1-201        AC M5FJH4.1
#=GS A1RD55_PAEAT/1-207        AC A1RD55.1
#=GS A0A0D6PGU2_9PROT/1-204    AC A0A0D6PGU2.1
#=GS A0A1B9SCQ5_9RHIZ/1-216    AC A0A1B9SCQ5.1
#=GS A0A158J1X4_9BURK/1-219    AC A0A158J1X4.1
#=GS B9JUJ7_AGRVS/1-227        AC B9JUJ7.1
#=GS A0A160JEF0_9PROT/1-206    AC A0A160JEF0.1
#=GS A0A0W1DI21_9SPHN/1-220    AC A0A0W1DI21.1
#=GS G7ZIT9_AZOL4/2-188        AC G7ZIT9.1
#=GS A0A1X4NEK7_9RHOB/1-218    AC A0A1X4NEK7.1
#=GS A0A1G9MI61_9RHOB/1-198    AC A0A1G9MI61.1
#=GS A0A0D0JDV2_RHIRD/1-220    AC A0A0D0JDV2.1
#=GS A0A0Q5EUD2_9RHIZ/1-220    AC A0A0Q5EUD2.1
#=GS A0A1G7L691_9RHOB/1-221    AC A0A1G7L691.1
#=GS A0A1L8PYL9_9RHIZ/1-221    AC A0A1L8PYL9.1
#=GS W4LZL6_9BACT/1-215        AC W4LZL6.1
#=GS A0A1H8LRB8_9RHOB/5-235    AC A0A1H8LRB8.1
#=GS A0A1G4UN91_9SPHN/1-222    AC A0A1G4UN91.1
#=GS A0A196NB21_9SPHN/1-215    AC A0A196NB21.1
#=GS V7F770_9RHIZ/1-203        AC V7F770.1
#=GS N1MJJ9_9SPHN/1-224        AC N1MJJ9.1
#=GS K0Q092_9RHIZ/1-229        AC K0Q092.1
#=GS L0NMS4_9RHIZ/2-227        AC L0NMS4.1
#=GS A0A0R3DSV7_9BRAD/1-173    AC A0A0R3DSV7.1
#=GS A0A147I103_9SPHN/1-224    AC A0A147I103.1
#=GS A0A2G1MG36_9RHOB/46-270   AC A0A2G1MG36.1
#=GS A0A1B3NBR7_9BRAD/1-215    AC A0A1B3NBR7.1
#=GS Q3IV25_RHOS4/1-238        AC Q3IV25.1
#=GS Q5HXJ5_GLUOX/1-220        AC Q5HXJ5.1
#=GS A0A0B4EED5_9RHOB/5-239    AC A0A0B4EED5.1
#=GS A0A1U9RR35_9PROT/1-188    AC A0A1U9RR35.1
#=GS A0A0Q8BEW6_9RHIZ/1-220    AC A0A0Q8BEW6.1
#=GS A0A0D6JBU0_9RHIZ/19-236   AC A0A0D6JBU0.1
#=GS W6RNC6_9RHIZ/2-230        AC W6RNC6.1
#=GS A0A0M3BBP2_9RHIZ/1-228    AC A0A0M3BBP2.1
#=GS A0A1E5AA46_9RHOB/6-234    AC A0A1E5AA46.1
#=GS A0A1U9Z919_9RHIZ/5-239    AC A0A1U9Z919.1
#=GS I3XB16_RHIFR/1-216        AC I3XB16.1
#=GS A0A060QD88_9PROT/1-219    AC A0A060QD88.1
#=GS A0A0T1XR46_9RHIZ/1-222    AC A0A0T1XR46.1
#=GS A0A0L0J5Y9_9RHOB/1-215    AC A0A0L0J5Y9.1
#=GS A0A259LVQ9_9RHOB/1-187    AC A0A259LVQ9.1
#=GS F0MCM4_PSEPM/1-208        AC F0MCM4.1
#=GS A0A1B3M9Y2_9RHIZ/19-237   AC A0A1B3M9Y2.1
#=GS A0A0J5QA75_9RHOB/5-239    AC A0A0J5QA75.1
#=GS A0A0W1CE34_9SPHN/1-220    AC A0A0W1CE34.1
#=GS A6X7N4_OCHA4/1-227        AC A6X7N4.1
#=GS A0A0N7Z5X9_9CYAN/1-213    AC A0A0N7Z5X9.1
#=GS A0A2C7A765_9PROT/1-218    AC A0A2C7A765.1
#=GS A0A0B4X5N2_9RHIZ/1-216    AC A0A0B4X5N2.1
#=GS A0A1Q3GRC6_9BACT/2-188    AC A0A1Q3GRC6.1
#=GS A0A1Z5HD37_9GAMM/1-147    AC A0A1Z5HD37.1
#=GS T0HM76_9SPHN/1-217        AC T0HM76.1
#=GS S3HED2_9RHIZ/1-201        AC S3HED2.1
#=GS A0A0Q7DKP1_9CAUL/18-237   AC A0A0Q7DKP1.1
#=GS J1K514_BARTA/1-225        AC J1K514.1
#=GS A0A1B9RWB2_9RHIZ/1-216    AC A0A1B9RWB2.1
#=GS B3DXC5_METI4/14-129       AC B3DXC5.1
#=GS A0A0L1JJ58_9RHOB/1-213    AC A0A0L1JJ58.1
#=GS A0A1C2E316_9RHIZ/3-225    AC A0A1C2E316.1
#=GS A0A0Q6W5J1_9RHIZ/1-214    AC A0A0Q6W5J1.1
#=GS A0A147ECK2_9SPHN/1-224    AC A0A147ECK2.1
#=GS A0A081D2E5_9RHIZ/1-217    AC A0A081D2E5.1
#=GS A0A1Q4D219_9RHOB/5-238    AC A0A1Q4D219.1
#=GS A0A292E295_9RHIZ/1-220    AC A0A292E295.1
#=GS A1ZZU3_9BACT/2-179        AC A1ZZU3.1
#=GS A0A212RLK2_9PROT/1-194    AC A0A212RLK2.1
#=GS A0A1I3UX99_9RHOB/3-148    AC A0A1I3UX99.1
#=GS K2R1B0_9RHIZ/1-220        AC K2R1B0.1
#=GS A0A1G9MQX0_9RHOB/5-237    AC A0A1G9MQX0.1
#=GS E2CSL1_9RHOB/42-272       AC E2CSL1.1
#=GS A0A1G7G5H3_9RHOB/5-235    AC A0A1G7G5H3.1
#=GS A0A1I5P079_PARPN/7-238    AC A0A1I5P079.1
#=GS A0A1Q9ARN2_9RHIZ/3-219    AC A0A1Q9ARN2.1
#=GS A0A1V0GZE3_9RHOB/1-248    AC A0A1V0GZE3.1
#=GS B9K5Y3_AGRVS/1-204        AC B9K5Y3.1
#=GS A0A1C0SKG6_9RHIZ/1-222    AC A0A1C0SKG6.1
#=GS A0A0T5NPB7_9RHOB/5-239    AC A0A0T5NPB7.1
#=GS A0A212S9W1_RHOAC/1-212    AC A0A212S9W1.1
#=GS A0A1Y1SLG0_9RHOB/1-232    AC A0A1Y1SLG0.1
#=GS A0A081CZW1_9RHIZ/1-231    AC A0A081CZW1.1
#=GS A0A1W2FEJ8_9RHIZ/1-217    AC A0A1W2FEJ8.1
#=GS A0A1H3FRS9_9RHOB/1-231    AC A0A1H3FRS9.1
#=GS A0A1Q4CSF1_9RHOB/5-236    AC A0A1Q4CSF1.1
#=GS A0A125Q629_9RHIZ/1-215    AC A0A125Q629.1
#=GS A0A0M2R028_9PROT/1-218    AC A0A0M2R028.1
#=GS D3P8F4_AZOS1/1-199        AC D3P8F4.1
#=GS A0A0Q6ZLU7_9RHIZ/1-224    AC A0A0Q6ZLU7.1
#=GS A0A1L3L8K0_9RHIZ/1-200    AC A0A1L3L8K0.1
#=GS A0A0P1GJ27_9RHOB/5-239    AC A0A0P1GJ27.1
#=GS A0A0Q9DHH3_9RHIZ/1-218    AC A0A0Q9DHH3.1
#=GS A0A1M5Y922_9RHOB/1-228    AC A0A1M5Y922.1
#=GS A0A2A3C400_9RHIZ/1-198    AC A0A2A3C400.1
#=GS V4NV90_9CAUL/1-218        AC V4NV90.1
#=GS A0A0B8Z777_9SPHN/1-224    AC A0A0B8Z777.1
#=GS A0A0Q5EN40_9RHIZ/1-220    AC A0A0Q5EN40.1
#=GS A0A1C9WXX6_9MICC/1-210    AC A0A1C9WXX6.1
#=GS G7Z8I5_AZOL4/1-205        AC G7Z8I5.1
#=GS A0A1I5H561_9SPHN/1-223    AC A0A1I5H561.1
#=GS A0A1M5TER2_9BACT/2-188    AC A0A1M5TER2.1
#=GS A0A255Z8C9_9PROT/1-219    AC A0A255Z8C9.1
#=GS A0A0Q6BXF2_9RHIZ/1-225    AC A0A0Q6BXF2.1
#=GS A0A0Q5CW25_9RHIZ/1-223    AC A0A0Q5CW25.1
#=GS E4TMA7_MARTH/2-205        AC E4TMA7.1
#=GS A0A1A5SDR7_9RHIZ/1-217    AC A0A1A5SDR7.1
#=GS A0A177ILY2_9CORY/1-152    AC A0A177ILY2.1
#=GS A0A0D6T7V9_9RHOB/1-221    AC A0A0D6T7V9.1
#=GS A0A1G8UEE0_9RHOB/1-217    AC A0A1G8UEE0.1
#=GS J2H6I1_9CAUL/1-186        AC J2H6I1.1
#=GS A0A0M3AYR8_9RHIZ/1-220    AC A0A0M3AYR8.1
#=GS A0A1I3XED4_9RHOB/5-239    AC A0A1I3XED4.1
#=GS A0A1Z8KT75_9PROT/1-214    AC A0A1Z8KT75.1
#=GS H4F1D3_9RHIZ/1-229        AC H4F1D3.1
#=GS W6W9U1_9RHIZ/1-223        AC W6W9U1.1
#=GS A0A1H4I6I6_9MICC/1-209    AC A0A1H4I6I6.1
#=GS A0A0S6UYI0_9BRAD/1-176    AC A0A0S6UYI0.1
#=GS A0A0J6TKA0_9RHIZ/2-194    AC A0A0J6TKA0.1
#=GS A0A1V1UI15_9RHOB/1-171    AC A0A1V1UI15.1
#=GS F4QY93_BREDA/1-217        AC F4QY93.1
#=GS L0NFP5_9RHIZ/1-222        AC L0NFP5.1
#=GS A0A1Q9AM72_9RHIZ/1-219    AC A0A1Q9AM72.1
#=GS D0KZA4_HALNC/1-105        AC D0KZA4.1
#=GS Q0G2K5_9RHIZ/1-222        AC Q0G2K5.1
#=GS A0A1G9NH59_9RHOB/2-246    AC A0A1G9NH59.1
#=GS A0A085TUD6_9RHOB/5-239    AC A0A085TUD6.1
#=GS A0A1G5ZUN9_9RHIZ/1-201    AC A0A1G5ZUN9.1
#=GS E8RVW3_ASTEC/1-222        AC E8RVW3.1
#=GS A0A0F5P6X8_9SPHN/1-219    AC A0A0F5P6X8.1
#=GS A0A095XMM7_9RHIZ/1-224    AC A0A095XMM7.1
#=GS Q1M9M0_RHIL3/1-231        AC Q1M9M0.1
#=GS A0A0S3F5Q5_9SPHN/1-219    AC A0A0S3F5Q5.1
#=GS A0A1H7D9H0_9SPHN/1-220    AC A0A1H7D9H0.1
#=GS A0A246U6S7_9RHIZ/1-213    AC A0A246U6S7.1
#=GS J8VS64_9SPHN/1-225        AC J8VS64.1
#=GS A0A0M6XWZ9_9RHOB/23-254   AC A0A0M6XWZ9.1
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