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Database: Pfam
Entry: Vps39_2
LinkDB: Vps39_2
Original site: Vps39_2 
#=GF ID   Vps39_2
#=GF AC   PF10367.9
#=GF DE   Vacuolar sorting protein 39 domain 2
#=GF AU   Mistry J;0000-0003-2479-5322
#=GF AU   Wood V;0000-0001-6330-7526
#=GF SE   Manual
#=GF GA   24.30 24.30;
#=GF TC   24.30 24.30;
#=GF NC   24.20 24.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Domain
#=GF RN   [1]
#=GF RM   11062257
#=GF RT   New component of the vacuolar class C-Vps complex couples
#=GF RT   nucleotide exchange on the Ypt7 GTPase to SNARE-dependent
#=GF RT   docking and fusion. 
#=GF RA   Wurmser AE, Sato TK, Emr SD; 
#=GF RL   J Cell Biol. 2000;151:551-562.
#=GF RN   [2]
#=GF RM   9111041
#=GF RT   Vam2/Vps41p and Vam6/Vps39p are components of a protein complex
#=GF RT   on the vacuolar membranes and involved in the vacuolar assembly
#=GF RT   in the yeast Saccharomyces cerevisiae. 
#=GF RA   Nakamura N, Hirata A, Ohsumi Y, Wada Y; 
#=GF RL   J Biol Chem. 1997;272:11344-11349.
#=GF RN   [3]
#=GF RM   1493335
#=GF RT   Morphological classification of the yeast vacuolar protein
#=GF RT   sorting mutants: evidence for a prevacuolar compartment in class
#=GF RT   E vps mutants. 
#=GF RA   Raymond CK, Howald-Stevenson I, Vater CA, Stevens TH; 
#=GF RL   Mol Biol Cell. 1992;3:1389-1402.
#=GF DR   INTERPRO; IPR019453;
#=GF DR   SO; 0000417; polypeptide_domain;
#=GF CC   This domain is found on the vacuolar sorting protein Vps39 which
#=GF CC   is a component of the C-Vps complex [2].  Vps39 is thought to be
#=GF CC   required for the fusion of endosomes and other types of
#=GF CC   transport intermediates with the vacuole [3].  In Saccharomyces
#=GF CC   cerevisiae, Vps39 has been shown to stimulate nucleotide
#=GF CC   exchange [1].  This domain is involved in localisation and in
#=GF CC   mediating the interactions of Vps39 with Vps11 [1].
#=GF SQ   1915
#=GS G8ZUP5_TORDC/888-1002       AC G8ZUP5.1
#=GS A0A2G3A9Z3_CAPAN/818-926    AC A0A2G3A9Z3.1
#=GS A0A1J4JXV2_9EUKA/655-763    AC A0A1J4JXV2.1
#=GS B9HEW9_POPTR/828-937        AC B9HEW9.2
#=GS A0A2H3BUQ9_9AGAR/912-1018   AC A0A2H3BUQ9.1
#=GS A0A2H3ECV4_ARMGA/912-1018   AC A0A2H3ECV4.1
#=GS J4H528_9APHY/567-652        AC J4H528.1
#=GS Q4QGF6_LEIMA/841-949        AC Q4QGF6.1
#=GS G9NU45_HYPAI/913-1036       AC G9NU45.1
#=GS A0A182UQ85_ANOME/793-902    AC A0A182UQ85.1
#=GS A0A067P3E6_PLEOS/804-910    AC A0A067P3E6.1
#=GS S6F8Q4_ZYGB2/892-1006       AC S6F8Q4.1
#=GS A1DCR9_NEOFI/933-1038       AC A1DCR9.1
#=GS K7KPC4_SOYBN/312-436        AC K7KPC4.1
#=GS A0A177V534_9BASI/660-739    AC A0A177V534.1
#=GS F4RLX3_MELLP/473-580        AC F4RLX3.1
#=GS H0ET76_GLAL7/678-795        AC H0ET76.1
#=GS A7S1S5_NEMVE/746-854        AC A7S1S5.1
#=GS A0A109FML1_9BASI/865-972    AC A0A109FML1.1
#=GS A0A0D2GJX2_9EURO/892-1007   AC A0A0D2GJX2.1
#=GS A0A151VZI4_HYPMA/575-655    AC A0A151VZI4.1
#=GS A0A067PPC8_9HOMO/574-654    AC A0A067PPC8.1
#=GS J3NSU0_GAGT3/949-1072       AC J3NSU0.1
#=GS A0A1R2CHD3_9CILI/804-919    AC A0A1R2CHD3.1
#=GS V4B225_LOTGI/765-873        AC V4B225.1
#=GS A0A0F2M2M4_SPOSC/1098-1223  AC A0A0F2M2M4.1
#=GS A0A0G2KA50_RAT/772-880      AC A0A0G2KA50.1
#=GS A0A2K5LQK9_CERAT/739-847    AC A0A2K5LQK9.1
#=GS A0A091GIJ7_9AVES/738-846    AC A0A091GIJ7.1
#=GS A0A0B4I059_9HYPO/927-1050   AC A0A0B4I059.1
#=GS D8Q3Y8_SCHCM/957-1063       AC D8Q3Y8.1
#=GS H2Q990_PANTR/772-880        AC H2Q990.1
#=GS A0A1S4AEV0_TOBAC/667-775    AC A0A1S4AEV0.1
#=GS Q4WS24_ASPFU/1111-1187      AC Q4WS24.1
#=GS A1CP36_ASPCL/1111-1189      AC A1CP36.1
#=GS A0A1B9GEA6_9TREE/941-1050   AC A0A1B9GEA6.1
#=GS A0A0C3BQD5_9HOMO/913-1019   AC A0A0C3BQD5.1
#=GS A0A0E0P0G5_ORYRU/803-912    AC A0A0E0P0G5.1
#=GS F1A193_DICPU/914-1022       AC F1A193.1
#=GS A0A1B7N3R6_9HOMO/909-1015   AC A0A1B7N3R6.1
#=GS A0A059J8K2_9EURO/928-1044   AC A0A059J8K2.1
#=GS A0A0G4EGS0_VITBC/1013-1124  AC A0A0G4EGS0.1
#=GS V5EQJ6_KALBG/1224-1333      AC V5EQJ6.1
#=GS A0A1I8D420_9BILA/487-595    AC A0A1I8D420.1
#=GS A0A1J8R2Z5_9HOMO/825-931    AC A0A1J8R2Z5.1
#=GS U5D3M7_AMBTC/851-959        AC U5D3M7.1
#=GS A0A1S2YSL9_CICAR/867-1011   AC A0A1S2YSL9.1
#=GS H1VJ67_COLHI/28-99          AC H1VJ67.1
#=GS M0ZVG4_SOLTU/376-485        AC M0ZVG4.1
#=GS A0A0D3CCJ2_BRAOL/853-961    AC A0A0D3CCJ2.1
#=GS L5M4Y8_MYODS/729-830        AC L5M4Y8.1
#=GS L8HA69_ACACA/807-921        AC L8HA69.1
#=GS A0A261C8D1_9PELO/283-391    AC A0A261C8D1.1
#=GS A0A093P378_PYGAD/738-846    AC A0A093P378.1
#=GS A0A0L0DPG5_THETB/839-947    AC A0A0L0DPG5.1
#=GS A0A072P1X6_9EURO/1087-1158  AC A0A072P1X6.1
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#=GS A0A059C5K0_EUCGR/882-937    AC A0A059C5K0.1
#=GS N1JKK6_BLUG1/1091-1165      AC N1JKK6.1
#=GS A0A1E3NSE0_9ASCO/803-911    AC A0A1E3NSE0.1
#=GS E9AGJ5_LEIIN/841-949        AC E9AGJ5.1
#=GS A0A0D0AWU9_9HOMO/590-676    AC A0A0D0AWU9.1
#=GS A0A1Y1ILN8_KLENI/1145-1253  AC A0A1Y1ILN8.1
#=GS A0A0D0CID3_9AGAR/930-1036   AC A0A0D0CID3.1
#=GS K5V660_PHACS/932-1040       AC K5V660.1
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#=GS A0A1I8ITW3_9PLAT/111-212    AC A0A1I8ITW3.1
#=GS A0A183H4W5_9BILA/250-358    AC A0A183H4W5.1
#=GS A0A0D2F4P4_9EURO/1100-1174  AC A0A0D2F4P4.1
#=GS A0A178DMC0_9PLEO/1101-1172  AC A0A178DMC0.1
#=GS A0A0V0S6R3_9BILA/800-908    AC A0A0V0S6R3.1
#=GS F7GE10_MACMU/772-880        AC F7GE10.2
#=GS A0A024W016_PLAFA/578-688    AC A0A024W016.1
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#=GS U5GMM6_POPTR/835-883        AC U5GMM6.1
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#=GS E9EZ91_METRA/927-1050       AC E9EZ91.1
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#=GS A0A1V4KET2_PATFA/761-869    AC A0A1V4KET2.1
#=GS A0A0C9N5Q4_9FUNG/819-927    AC A0A0C9N5Q4.1
#=GS S8G638_FOMPI/922-1029       AC S8G638.1
#=GS A0A1J1HD43_PLARL/1133-1243  AC A0A1J1HD43.1
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#=GS I2G2G9_USTH4/1041-1117      AC I2G2G9.1
#=GS M5E8Y1_MALS4/292-361        AC M5E8Y1.1
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#=GS A0A196S9N6_BLAHN/773-882    AC A0A196S9N6.1
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#=GS W9CN02_9HELO/918-1035       AC W9CN02.1
#=GS A0A251S3C6_HELAN/877-986    AC A0A251S3C6.1
#=GS A0A074WA15_9PEZI/900-1017   AC A0A074WA15.1
#=GS A0A0E0KI90_ORYPU/803-912    AC A0A0E0KI90.1
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#=GS E1BM41_BOVIN/761-869        AC E1BM41.1
#=GS A0A0B7NSB6_9FUNG/969-1080   AC A0A0B7NSB6.1
#=GS E9DW57_METAQ/927-1050       AC E9DW57.1
#=GS C5GDS5_AJEDR/941-1059       AC C5GDS5.1
#=GS A0A0D1YZC2_9EURO/893-1008   AC A0A0D1YZC2.1
#=GS A0A0G4MNJ1_9PEZI/1813-1870  AC A0A0G4MNJ1.1
#=GS A0A0N1IH25_LEPSE/1363-1472  AC A0A0N1IH25.1
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#=GS A0A161TPI2_9PEZI/1138-1215  AC A0A161TPI2.1
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#=GS A0A161Y5J3_9PEZI/1114-1185  AC A0A161Y5J3.1
#=GS D3BN92_POLPP/698-807        AC D3BN92.1
#=GS A0A1S2YYR3_CICAR/855-964    AC A0A1S2YYR3.1
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#=GS VPS39_CAEEL/811-919         AC Q1ZXS5.1
#=GS V2XQ47_MONRO/964-1070       AC V2XQ47.1
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#=GS J9EGS1_9SPIT/837-958        AC J9EGS1.1
#=GS A0A060S967_PYCCI/755-831    AC A0A060S967.1
#=GS A0A0L1HUN1_9PLEO/929-1012   AC A0A0L1HUN1.1
#=GS A0A1C1X1F2_9PEZI/1131-1202  AC A0A1C1X1F2.1
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#=GS A0A1V6PUM6_9EURO/844-951    AC A0A1V6PUM6.1
#=GS A0A0E0GSW0_ORYNI/787-896    AC A0A0E0GSW0.1
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#=GS G4UCY0_NEUT9/1140-1210      AC G4UCY0.1
#=GS A0A0G4IHV5_PLABS/730-835    AC A0A0G4IHV5.1
#=GS A0A016TYY3_9BILA/768-877    AC A0A016TYY3.1
#=GS A0A0U1M1X2_TALIS/930-1040   AC A0A0U1M1X2.1
#=GS W2SCV3_9EURO/1094-1173      AC W2SCV3.1
#=GS F1NID0_CHICK/761-869        AC F1NID0.2
#=GS A0A1J4L5T1_9EUKA/800-908    AC A0A1J4L5T1.1
#=GS A0A0K8LDX2_9EURO/933-1049   AC A0A0K8LDX2.1
#=GS A0A2K1ZN84_POPTR/876-985    AC A0A2K1ZN84.1
#=GS A0A1E4SJS8_9ASCO/944-1052   AC A0A1E4SJS8.1
#=GS A0A1J4KVI6_9EUKA/747-858    AC A0A1J4KVI6.1
#=GS M7U7P2_BOTF1/1104-1181      AC M7U7P2.1
#=GS A0A1A6HW33_NEOLE/726-834    AC A0A1A6HW33.1
#=GS A0A1B8EXU3_9PEZI/915-1046   AC A0A1B8EXU3.1
#=GS A0A0V0S6Y7_9BILA/807-915    AC A0A0V0S6Y7.1
#=GS G3X1U5_SARHA/741-849        AC G3X1U5.1
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A0A0B2PTN2_GLYSO/825-933               .............................VRLLHNH..G..E..S..L.DP.........L.Q.VL........EKLSP...DM.PL.QL....................................ASDT.LL.R.M.........FRARV..H.H.HR..Q..GQI.VHNLS....RA..VD..I..D....A.R.L.SR.L....................................E..E..RS..R....N..V.QI.N.D.E..S.L..CD..SCD......A......R....L......G...........T......K.....L....F.A.M...Y....P......D.....D...T.........VV.CYKCYR-r..................................
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