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Database: Pfam
Entry: WaaY
LinkDB: WaaY
Original site: WaaY 
#=GF ID   WaaY
#=GF AC   PF06176.11
#=GF DE   Lipopolysaccharide core biosynthesis protein (WaaY)
#=GF AU   Moxon SJ;0000-0003-4644-1816
#=GF SE   Pfam-B_10767 (release 9.0)
#=GF GA   20.30 20.30;
#=GF TC   20.30 20.30;
#=GF NC   20.20 20.20;
#=GF BM   hmmbuild HMM.ann SEED.ann
#=GF SM   hmmsearch -Z 45638612 -E 1000 --cpu 4 HMM pfamseq
#=GF TP   Family
#=GF RN   [1]
#=GF RM   9756860
#=GF RT   Involvement of waaY, waaQ, and waaP in the modification of
#=GF RT   Escherichia coli lipopolysaccharide and their role in the
#=GF RT   formation of a stable outer membrane. 
#=GF RA   Yethon JA, Heinrichs DE, Monteiro MA, Perry MB, Whitfield C; 
#=GF RL   J Biol Chem 1998;273:26310-26316.
#=GF DR   INTERPRO; IPR009330;
#=GF DR   SO; 0100021; polypeptide_conserved_region;
#=GF CC   This family consists of several bacterial lipopolysaccharide
#=GF CC   core biosynthesis proteins (WaaY or RfaY). The waaY, waaQ, and
#=GF CC   waaP genes are located in the central operon of the waa
#=GF CC   (formerly rfa) locus on the chromosome of Escherichia coli. This
#=GF CC   locus contains genes whose products are involved in the assembly
#=GF CC   of the core region of the lipopolysaccharide molecule. WaaY is
#=GF CC   the enzyme that phosphorylates HepII in this system [1].
#=GF SQ   177
#=GS R0FC66_9BRAS/279-364        AC R0FC66.1
#=GS A0A071LSI6_9ENTR/1-204      AC A0A071LSI6.1
#=GS A0A0N0IBX1_9GAMM/2-229      AC A0A0N0IBX1.1
#=GS D7M390_ARALL/280-368        AC D7M390.1
#=GS Q7P5P1_FUSNV/17-244         AC Q7P5P1.1
#=GS A0A089QX07_PLUGE/1-229      AC A0A089QX07.1
#=GS A0A287XGX6_HORVV/47-142     AC A0A287XGX6.1
#=GS R7T1X5_DICSQ/344-415        AC R7T1X5.1
#=GS H1D4F2_9FUSO/6-122          AC H1D4F2.1
#=GS A0A287XH57_HORVV/231-323    AC A0A287XH57.1
#=GS A0A2B7YA70_9EURO/21-142     AC A0A2B7YA70.1
#=GS F4A1D2_MAHA5/210-346        AC F4A1D2.1
#=GS A8ARK5_CITK8/1-228          AC A8ARK5.1
#=GS U7VD43_9FUSO/1-235          AC U7VD43.1
#=GS A0A1X7MZP9_9LACT/209-300    AC A0A1X7MZP9.1
#=GS A0A1R3J8F2_9ROSI/238-342    AC A0A1R3J8F2.1
#=GS A0A080KKR1_9GAMM/6-232      AC A0A080KKR1.1
#=GS K9SGY9_9CYAN/173-330        AC K9SGY9.1
#=GS A0A0C9ZI65_9HOMO/147-250    AC A0A0C9ZI65.1
#=GS D2TIX8_CITRI/1-229          AC D2TIX8.1
#=GS A0A0V0Q7T9_PSEPJ/134-294    AC A0A0V0Q7T9.1
#=GS V4KXB1_EUTSA/256-355        AC V4KXB1.1
#=GS A0A166J846_DAUCA/232-309    AC A0A166J846.1
#=GS A0A0A2LPS1_PENIT/107-207    AC A0A0A2LPS1.1
#=GS M4DVC8_BRARP/283-359        AC M4DVC8.1
#=GS C3WA16_FUSMR/3-239          AC C3WA16.1
#=GS A0A059CXB6_EUCGR/233-310    AC A0A059CXB6.1
#=GS A0A1I6K274_9ALTE/10-201     AC A0A1I6K274.1
#=GS A0A1H5J7U7_9FLAO/169-308    AC A0A1H5J7U7.1
#=GS E2SMW4_9FIRM/189-309        AC E2SMW4.1
#=GS A0A100ZMM5_9MYCO/222-324    AC A0A100ZMM5.1
#=GS M4CZZ7_BRARP/299-390        AC M4CZZ7.1
#=GS A0A242P967_9GAMM/6-232      AC A0A242P967.1
#=GS A0A0B0NSF9_GOSAR/340-431    AC A0A0B0NSF9.1
#=GS A0A1S3UE72_VIGRR/252-345    AC A0A1S3UE72.1
#=GS A0A1M6MYR5_9CLOT/231-340    AC A0A1M6MYR5.1
#=GS M0T3X4_MUSAM/207-309        AC M0T3X4.1
#=GS A0A081BR72_9BACT/58-214     AC A0A081BR72.1
#=GS A0A059EQM8_9MICR/87-216     AC A0A059EQM8.1
#=GS A0A1M7XVD4_9VIRU/137-191    AC A0A1M7XVD4.1
#=GS A0A0N0D4H1_9DELT/44-165     AC A0A0N0D4H1.1
#=GS A0A2H3JD65_WOLCO/329-416    AC A0A2H3JD65.1
#=GS K7MMH8_SOYBN/226-327        AC K7MMH8.1
#=GS U5FH76_POPTR/232-322        AC U5FH76.1
#=GS I2BEH4_SHIBC/1-230          AC I2BEH4.1
#=GS W9HZF0_FUSOX/189-263        AC W9HZF0.1
#=GS C6JNQ6_FUSVA/1-238          AC C6JNQ6.1
#=GS A0A1B7JUT1_9GAMM/3-230      AC A0A1B7JUT1.1
#=GS A0A1U8JGE3_GOSHI/272-367    AC A0A1U8JGE3.1
#=GS A0A2I4GNX7_9ROSI/234-329    AC A0A2I4GNX7.1
#=GS A0A1C3ZC53_9GAMM/13-239     AC A0A1C3ZC53.1
#=GS A0A0D3DD02_BRAOL/268-354    AC A0A0D3DD02.1
#=GS X0CE74_FUSOX/189-263        AC X0CE74.1
#=GS A1ZSN0_9BACT/203-317        AC A1ZSN0.1
#=GS A0A0A7RZR0_9GAMM/1-227      AC A0A0A7RZR0.1
#=GS G6C0M3_9FUSO/3-229          AC G6C0M3.1
#=GS A0A1T4PMY6_9FUSO/4-220      AC A0A1T4PMY6.1
#=GS E1VG24_9GAMM/230-327        AC E1VG24.1
#=GS A0A1Q3B6T1_CEPFO/230-323    AC A0A1Q3B6T1.1
#=GS A0A1D2R2R0_9EURY/1-226      AC A0A1D2R2R0.1
#=GS Q8XDC1_ECO57/1-229          AC Q8XDC1.1
#=GS A0A1D9P6Y2_9FLAO/164-302    AC A0A1D9P6Y2.1
#=GS A0A059CWQ5_EUCGR/50-127     AC A0A059CWQ5.1
#=GS Q83PN8_SHIFL/1-229          AC Q83PN8.1
#=GS U5GCC8_POPTR/229-319        AC U5GCC8.1
#=GS X2GVF4_9GAMM/6-232          AC X2GVF4.1
#=GS A0A1Q9D018_SYMMI/545-666    AC A0A1Q9D018.1
#=GS A0A1R3GV27_COCAP/289-389    AC A0A1R3GV27.1
#=GS L8JV08_9BACT/7-233          AC L8JV08.1
#=GS E5BHN7_9FUSO/3-153          AC E5BHN7.1
#=GS A0A1J7HL09_LUPAN/221-322    AC A0A1J7HL09.1
#=GS A0A218WXK2_PUNGR/233-310    AC A0A218WXK2.1
#=GS A0A2K2A9B9_POPTR/229-319    AC A0A2K2A9B9.1
#=GS A0A0D2TF17_GOSRA/272-367    AC A0A0D2TF17.1
#=GS A0A0B4HGD8_9HYPO/262-329    AC A0A0B4HGD8.1
#=GS A0A0V9JK82_9ENTR/1-229      AC A0A0V9JK82.1
#=GS A0A1S3UE86_VIGRR/230-323    AC A0A1S3UE86.1
#=GS C6JLQ5_FUSVA/1-180          AC C6JLQ5.1
#=GS A9MKQ0_SALAR/1-229          AC A9MKQ0.1
#=GS A0A0L6U1E9_9FIRM/186-301    AC A0A0L6U1E9.1
#=GS A0A095T5P5_9GAMM/2-228      AC A0A095T5P5.1
#=GS T1IP58_STRMM/64-149         AC T1IP58.1
#=GS E3HD25_ILYPC/3-229          AC E3HD25.1
#=GS A0A087GD01_ARAAL/221-301    AC A0A087GD01.1
#=GS C6JNR9_FUSVA/3-232          AC C6JNR9.1
#=GS F9G1P2_FUSOF/189-263        AC F9G1P2.1
#=GS A0A1R3GV27_COCAP/1239-1341  AC A0A1R3GV27.1
#=GS U7VA86_9FUSO/5-212          AC U7VA86.1
#=GS A0A0C9XME6_9HOMO/89-186     AC A0A0C9XME6.1
#=GS A0A066WQG7_9FLAO/167-302    AC A0A066WQG7.1
#=GS A0A1Y1WHD0_9FUNG/122-236    AC A0A1Y1WHD0.1
#=GS A0A2H3B5H6_9AGAR/480-561    AC A0A2H3B5H6.1
#=GS S8DKX1_FOMPI/365-525        AC S8DKX1.1
#=GS A0A061GPZ0_THECC/161-256    AC A0A061GPZ0.1
#=GS A0A017H279_9FUSO/2-176      AC A0A017H279.1
#=GS A0A1H6WWT9_9FIRM/217-345    AC A0A1H6WWT9.1
#=GS A0A1Z5STD9_HORWE/111-180    AC A0A1Z5STD9.1
#=GS S8ECN5_FOMPI/392-528        AC S8ECN5.1
#=GS T1II48_STRMM/466-563        AC T1II48.1
#=GS Q93YN5_ARATH/272-373        AC Q93YN5.1
#=GS A0A287QDR9_HORVV/33-141     AC A0A287QDR9.1
#=GS A0A0B2QEM2_GLYSO/226-327    AC A0A0B2QEM2.1
#=GS A0A0D2ANM4_9EURO/194-259    AC A0A0D2ANM4.1
#=GS F4KIJ2_ARATH/303-404        AC F4KIJ2.1
#=GS A0A0C9MD41_9FUNG/243-337    AC A0A0C9MD41.1
#=GS A0A0S6W9H5_9BACT/340-513    AC A0A0S6W9H5.1
#=GS RFAY_SALTY/1-229            AC P26472.2
#=GS A0A1M5D2J2_9FLAO/181-309    AC A0A1M5D2J2.1
#=GS A0A0L0ATV3_9ENTR/2-228      AC A0A0L0ATV3.1
#=GS D6LGE9_9FUSO/1-227          AC D6LGE9.1
#=GS A0A0C2HBL1_9STAP/183-330    AC A0A0C2HBL1.1
#=GS A0A0M3F0L8_ENTCL/1-229      AC A0A0M3F0L8.1
#=GS A0A1S6IS13_9LACT/170-312    AC A0A1S6IS13.1
#=GS A0A151R1D3_CAJCA/224-327    AC A0A151R1D3.1
#=GS K8WQI2_PRORD/3-230          AC K8WQI2.1
#=GS A0A0A7S5Z9_9GAMM/1-229      AC A0A0A7S5Z9.1
#=GS A0A090VW67_ESCVU/2-230      AC A0A090VW67.1
#=GS A0A165PLH9_9APHY/494-605    AC A0A165PLH9.1
#=GS A0A0D2UHJ7_GOSRA/119-214    AC A0A0D2UHJ7.1
#=GS R6EI96_9FIRM/177-308        AC R6EI96.1
#=GS L0LX07_ENTBF/1-229          AC L0LX07.1
#=GS A0A059ESP2_9MICR/87-214     AC A0A059ESP2.1
#=GS U5FJT0_POPTR/232-322        AC U5FJT0.1
#=GS RFAY_ECOLI/1-229            AC P27240.2
#=GS A0A287XGX7_HORVV/231-323    AC A0A287XGX7.1
#=GS A0A0D0CBP8_9AGAR/33-129     AC A0A0D0CBP8.1
#=GS V7CTQ1_PHAVU/224-327        AC V7CTQ1.1
#=GS A0A2K2A9A5_POPTR/199-289    AC A0A2K2A9A5.1
#=GS A0A0D3AXT5_BRAOL/283-359    AC A0A0D3AXT5.1
#=GS S8E9H5_FOMPI/89-218         AC S8E9H5.1
#=GS A0A0C9W5V0_9HOMO/333-417    AC A0A0C9W5V0.1
#=GS A0A0J8YAK8_9BACT/1-232      AC A0A0J8YAK8.1
#=GS A0A1B7MF33_9HOMO/183-253    AC A0A1B7MF33.1
#=GS B9SPR5_RICCO/230-327        AC B9SPR5.1
#=GS A0A080KBZ5_9GAMM/6-232      AC A0A080KBZ5.1
#=GS A0A0A1P4H6_9FUNG/244-334    AC A0A0A1P4H6.1
#=GS G7LQ33_9GAMM/4-231          AC G7LQ33.1
#=GS Q329N0_SHIDS/1-229          AC Q329N0.1
#=GS A0A174V7H2_9CLOT/202-328    AC A0A174V7H2.1
#=GS A6DSQ9_9BACT/87-179         AC A6DSQ9.1
#=GS A0A0H2LLI7_PRORE/3-230      AC A0A0H2LLI7.1
#=GS A0A0F7ZGG9_9HYPO/199-270    AC A0A0F7ZGG9.1
#=GS A0A017H6R8_9FUSO/6-231      AC A0A017H6R8.1
#=GS A0A0D9NHS9_METAN/201-269    AC A0A0D9NHS9.1
#=GS G7I544_MEDTR/224-321        AC G7I544.2
#=GS A0A1V6RCW0_9EURO/118-188    AC A0A1V6RCW0.1
#=GS A0A1I5V0D2_9LACT/197-314    AC A0A1I5V0D2.1
#=GS Q8RE78_FUSNN/3-229          AC Q8RE78.1
#=GS C3WFQ6_FUSMR/1-227          AC C3WFQ6.1
#=GS A0A085I1K0_9ENTR/2-228      AC A0A085I1K0.1
#=GS A0A0F4Z3K9_TALEM/151-247    AC A0A0F4Z3K9.1
#=GS G6C2F2_9FUSO/4-194          AC G6C2F2.1
#=GS E3H740_ILYPC/1-181          AC E3H740.1
#=GS A0A097R7N1_HAFAL/1-229      AC A0A097R7N1.1
#=GS A0A1H9LW46_9FLAO/167-304    AC A0A1H9LW46.1
#=GS A0A0A1NCC8_9FUNG/245-334    AC A0A0A1NCC8.1
#=GS A0A0C3ELJ1_9HOMO/377-464    AC A0A0C3ELJ1.1
#=GS N4TSJ9_FUSC1/189-263        AC N4TSJ9.1
#=GS A0A163JDC4_ABSGL/238-324    AC A0A163JDC4.1
#=GS R6KW09_9FIRM/196-299        AC R6KW09.1
#=GS A0A2G2XML9_CAPBA/232-309    AC A0A2G2XML9.1
#=GS K8W2X2_9GAMM/3-230          AC K8W2X2.1
#=GS A0A1L3JK16_9FLAO/159-308    AC A0A1L3JK16.1
#=GS A0A090QPR6_9FLAO/21-185     AC A0A090QPR6.1
#=GS A0A0A1NZA3_9FUNG/244-334    AC A0A0A1NZA3.1
#=GS A0A0D2KKB5_9AGAR/388-467    AC A0A0D2KKB5.1
#=GS A0A2K2A9A1_POPTR/232-322    AC A0A2K2A9A1.1
#=GS A0A099VV76_9HELI/1-178      AC A0A099VV76.1
#=GS A0A085HR66_9GAMM/1-229      AC A0A085HR66.1
#=GS A0A1S2Y2Z6_CICAR/226-322    AC A0A1S2Y2Z6.1
#=GS A0A061GIE8_THECC/227-328    AC A0A061GIE8.1
#=GS E5BE37_9FUSO/7-204          AC E5BE37.1
#=GS U5FFA9_POPTR/232-322        AC U5FFA9.1
#=GS A0A1T4LRB0_9FUSO/1-231      AC A0A1T4LRB0.1
#=GS H1D4F3_9FUSO/1-108          AC H1D4F3.1
#=GS A0A1M4XJ25_9LACT/209-323    AC A0A1M4XJ25.1
#=GS A0A1M7XVH9_9VIRU/122-188    AC A0A1M7XVH9.1
R0FC66_9BRAS/279-364                   ........................................................................................pdiiqsse------------.--.--.-------------.-...--..--..---.---.---.-----..-..----.--..----------.....----.---..--.-.....-....-.-.-.-...-..---.....---..---...-....-...--.....-..-....--...-..-.-.-.-.-....-...-..-....-........-.-........-..-....-..-....-.-.-..SVLILE.....YMDG....I......R....L.N.....D.......V.......E.......S.......L.......D.......Af.....gV.......D.......K......Q........K........I......V......E.....E.....I.....T.......R.....AYA...HqiyvdGFF.NGDPHPGN.F.LV...S.K..E......-....-.-......-..-..-..-......-..-.-..-..-..-..-...-...-..-......--..-....-----..-.-..-...-.---.-.....-.-.-.-...----..-----...---..-..-..-------pphrpilldfgltkkis.................................................
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