KEGG   Pseudoalteromonas issachenkonii: PI2015_3418
Entry
PI2015_3418       CDS       T04164                                 
Name
(GenBank) RND family multidrug efflux protein
  KO
K18138  multidrug efflux pump
Organism
pia  Pseudoalteromonas issachenkonii
Pathway
pia01501  beta-Lactam resistance
pia01503  Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pia00001]
 09160 Human Diseases
  09175 Drug resistance: antimicrobial
   01501 beta-Lactam resistance
    PI2015_3418
   01503 Cationic antimicrobial peptide (CAMP) resistance
    PI2015_3418
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:pia02000]
    PI2015_3418
   01504 Antimicrobial resistance genes [BR:pia01504]
    PI2015_3418
Transporters [BR:pia02000]
 Other transporters
  Electrochemical potential-driven transporters [TC:2]
   PI2015_3418
Antimicrobial resistance genes [BR:pia01504]
 Gene sets
  Multipdrug resistance modules
   Multidrug resistance, efflux pump MexAB-OprM [MD:M00718]
    PI2015_3418
SSDB
Motif
Pfam: ACR_tran
Other DBs
NCBI-ProteinID: ALQ56657
Position
II:455456..458587
AA seq 1043 aa
MSRFFIDRPIFAWVLAIVVMLAGIIAVKSLPVAQYPSIAPPAITITANYPGASARTLEDS
VTQVIEQKMKGLDGLLYMSSTSESSGSATLTLTFDAETNPDIAQVQVQNKLATATPLLPE
EVQRQGVVVAKSSSSFLLVVGFVSQDGSMTNIDIGDYVSSNVQDIVARVDGVGEVQLFGS
QYAMRIWLDPAKLQSYKLTPNDISAAIKAQNAQVSAGQLGGMPSLAGQQLNATVTAQSRL
QTPEQFKDILVKTNSDGSVVRLQDVADVELGGENYGVVARFNGKPASGLGVKLASGANAL
DTAQGVKDALEELKPFFPEGLEAVVPYDTTPFVALSIEKVVHTLIEAVVLVFVVMYLFLQ
NFRATIIPTIAVPVVLLGTFGILFTFGYSINTLTMFAMVLAIGLLVDDAIVVVENVERLM
TEEKLSAVEATRKSMDEIKGALVGIAMVLSAVFIPMAFFSGSTGVIYRQFSITLVSAMGL
SVLVALILTPALCATLLKPSHVHTDGSFIGRFFSGFNRGFDKTNKGAQGFVGRMIKHSKR
YLLSYALIVGGMVAIFSNLPTAFLPDEDQGILFNQVMLPAGSTTEQTLEVVKKVENHYLE
DQSEAVSSIFTVTGFSFAGSGQNSAIGFVSLKHWDERQRDDLSVGAVAGKGMGYFSTIKE
AFVFAFPPPAIVELGTANGFNMFLQDRVGLGHDELLKARNQLLGMASQSPILAGVRPNGQ
EDMPELQLDIDLAKAEALGVSQGDINSTLSTAWGSSYVNDFIDRGRVKKVYLQGQADARM
VPEDLNKWYVRNKNGDMVPFSAFASSYWSYGSPRLERYNGFSAMEIQGSAAPGYSTGQAM
DEMERLVKQLPQGIASEWTGISYQERSSGGQAPLLYGLSLLFVFLCLAALYESWSVPFAV
MMIVPLGIFGAIVAAFMGNLSNDIYLQVGLLTTIGLASKNAILIVEFAIHKMEEGLSLVD
SAIAAVRLRLRPILMTSMAFVCGVLPLAIASSAGSGAQNALGISIIGGTLAASSLVVIFV
PLFFVLVRRLFSGKAKTTSEEEV
NT seq 3132 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcacgattttttatcgacaggcctatttttgcatgggtactggctattgtggtgatg
cttgcaggtattattgcggttaaaagtttacccgttgctcagtatccgtctattgcaccg
cctgctattacgattactgctaactacccaggtgcttctgcgcgtactttagaggactcg
gtaacccaggttattgagcaaaaaatgaaaggtttagatggcttgttgtatatgtcatcg
acctctgaatcaagtggttcagcaacattgactcttacctttgatgcagaaactaaccct
gatattgcacaagtacaagtgcaaaataaactagcaacagctacgccgttattacctgaa
gaagtgcaacgacaaggcgttgtggttgctaagtcatcgtctagttttttactcgttgtt
ggttttgtatcgcaagatggcagtatgaccaacattgacattggtgattacgtatcatca
aacgtgcaagatattgtagcgcgtgttgatggggtgggcgaagtacaattgtttggctct
caatatgcaatgcgtatttggctcgatccggctaagttacaaagttataaactaacgcca
aacgatatctctgcggcaataaaagcacaaaatgcgcaagtgtcggcaggtcagctcggt
ggtatgccttcattggcaggtcaacagcttaatgcaacggtgacggctcaaagccgatta
caaacacctgagcagtttaaagatattttagttaaaaccaacagcgatggctcggtagtg
cgtttacaagatgttgctgatgtggaactcggtggtgaaaactacggtgttgtagcgcgc
tttaatggtaaaccggcatcgggtttaggggttaaattagccagtggcgcaaacgcctta
gatacagcacaaggtgtaaaagatgcacttgaagaacttaaacctttttttccagaaggt
ttagaggcggttgtgccttatgacaccactccttttgttgcattatcaatcgaaaaagta
gtacataccctaatcgaagcggtcgttttggtatttgttgtaatgtacttatttttacaa
aacttcagagcaactattattccaaccattgcggtgcctgtcgtattgctaggtacgttt
ggtattctatttacctttgggtattccattaataccctcacgatgtttgcgatggtactg
gccattggtttactcgtagatgatgcgattgttgttgtcgaaaacgttgagcgtttaatg
accgaagaaaagctctctgcggttgaagcaacgcgaaaatcgatggatgaaattaaaggg
gcactggtaggtattgcgatggtgctgtcggctgtatttattccgatggcattctttagt
ggctctactggggttatttatcgtcagttctctattaccttagtgtcggcgatgggactg
tcggtactggttgcgcttattttaactcccgcgctgtgtgctacgttattaaagcctagc
catgttcacaccgatggtagttttattggtcgttttttctcaggctttaaccgtggtttt
gataaaaccaataaaggtgcgcaaggttttgttggccgcatgatcaaacattctaagcgc
tacctgcttagctatgcattaattgtaggcggcatggtggctattttttcaaacttacca
acggcatttctacccgatgaagaccaaggtattttgtttaaccaagtaatgcttcctgca
ggctctactacagaacaaacgcttgaagtggttaaaaaagttgaaaaccactatttagaa
gatcaatctgaagccgttagttcaatttttacggtaacaggttttagttttgcaggctct
ggacaaaactcagcaattggctttgttagtttaaagcactgggatgagcgtcaacgtgac
gacctatcagtgggcgccgttgcaggaaaaggcatggggtatttttcaacgattaaagag
gcatttgtatttgcatttccacctccggcgattgttgaacttggaaccgcaaatggcttt
aatatgtttctacaagaccgtgtcggtttaggtcatgatgagctattaaaagcgcgtaat
cagttattaggtatggcgagtcaaagtccaatattggcaggtgttcgccctaatgggcaa
gaagatatgcctgagttacagctggatattgatcttgcaaaagcagaagcgcttggtgtg
tcgcaaggtgatattaatagtacgctttcgacggcgtggggtagtagttatgtaaatgac
tttatcgaccgtggtcgcgtgaaaaaagtatacctgcaaggtcaagccgatgcgagaatg
gtgcctgaggacttaaacaaatggtatgtgcgtaataaaaacggcgatatggtgccattt
tcagcatttgctagttcttattggtcttatggttcgcctcgcttggaaaggtataacggc
ttttcagcaatggaaatccaaggcagtgcagcgccaggctacagtacaggtcaagccatg
gatgaaatggagcgtttagttaagcagttaccacaaggtattgcttctgaatggactggt
atttcatatcaagagcgatcaagtggcggtcaagcgccgttgttatatggattatcactg
ttatttgtatttttatgtttagctgcgctttatgaaagttggtcagtaccatttgcagta
atgatgattgtgccactgggtatttttggtgcgattgtagccgcctttatgggtaactta
tcaaacgatatttacttacaagtgggtttattaaccaccataggtttagcctctaaaaat
gccattttaatcgttgagtttgcgattcataaaatggaagaaggcttaagcttagttgac
tcggcgattgccgctgtacgacttcgcttacgtcctattttaatgacctcaatggccttt
gtgtgtggtgtgcttccattagctattgcctcaagtgctggttcaggtgcacaaaatgca
ttaggtatttcaattattggtggaacacttgccgcctcgtcattggttgttatttttgta
ccgttgttttttgttttagtacgtagactgttttcaggaaaagctaaaaccacctccgag
gaggaagtataa

  All links  
Ontology (3)   
   KEGG BRITE (3)   
Pathway (3)   
   KEGG PATHWAY (2)   
   KEGG MODULE (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (3)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein domain (1)   
   Pfam (1)   
All databases (11)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system