KEGG   Candidatus Portiera aleyrodidarum TV-BCN: PTV_024
Entry
PTV_024           CDS       T03736                                 
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
  KO
K02337  DNA polymerase III subunit alpha [EC:2.7.7.7]
Organism
plb  Candidatus Portiera aleyrodidarum TV-BCN
Pathway
plb03030  DNA replication
plb03430  Mismatch repair
plb03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:plb00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03030 DNA replication
    PTV_024 (dnaE)
   03430 Mismatch repair
    PTV_024 (dnaE)
   03440 Homologous recombination
    PTV_024 (dnaE)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03032 DNA replication proteins [BR:plb03032]
    PTV_024 (dnaE)
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:plb03400]
    PTV_024 (dnaE)
Enzymes [BR:plb01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.7  DNA-directed DNA polymerase
     PTV_024 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:plb03032]
 Prokaryotic type
  DNA Replication Elongation Factors
   Elongation factors (bacterial)
    DNA polymerase III holoenzyme
     PTV_024 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:plb03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    DNA polymerase III holoenzyme
     PTV_024 (dnaE)
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol3_alpha DNA_pol3_finger PHP HHH_6
Other DBs
NCBI-ProteinID: CEI58979
Position
I:24090..26903
AA seq 937 aa
MNNFIHLRIHSEYSLIDSIIKIKSLIYNIKQMNIPAICITDEQNIFSLIKYYKTSIKNGI
KPIIGCDLQINSKNQLYKITLLAMNKIGYYNLIKLITLSCKGILTKNYIFKFSKGLIVLS
GASKGEIGYLLLSKNIKKATLIINQWKKVFHNRFYLELQRIGLKHEEELLSKSIDLAIKT
NIPVVATNAVMFINKEDYYVHQTRVAINEGKLIKNSKKKDFYSKEQYLKTPNDMIKLFKD
IPSAIENSIMIAIRCNVKLTLNKKNVCFPKFHLSQKINIKKYFIYISNKGLNHRLIKNNI
LKTNQIITYKNRLYEEINIITNMGFIEYFLIVMKFIKWAKKTKIPVGPGRGSGAGSLVAY
ALEITDVDPIKYDLLFERFLNPERINMPDFDMDFCMKKRDKVIHYVTKLYGKNLVAHIVT
FSTMTAKSVIRDVTRVQGKPYWLGDKLSKLIPLDLGINLNKAFNKSLELRNLLKKNEEAN
EIWEMSLKLEGIIKGIGKHAGGIIIAPKKLINFSPILCDDQGKNIIQFDKNDIKYLGLIK
FDFLGLRTLTVINYTLKLINTSKKQPIDINNIPLNDLKSFKLLKNADTNSIFQLESQGMK
ELIKKLKPKNINDIISLIALFRPGPLNSGMVDEFIKRKNGKQINYSYFHQLIQPILKSTY
GIILYQEQVMKITNVLTGFSLGQSDVFRRAIETNKNIKNYRIKFITNCINNNIKKYIAIN
FFEFINKFAGYGFNKSHSTAYGLISYKTIWLKSNYPSQYMASVLSTEMYNIDKIIPIISE
CKRMKLKILPPDINLSNYKFCVDKKNNIIYGLGAIKGIGEEFIKEMISNRKNYGKFYDLF
DFCKRIDRKYLNKRNLSALILSGSLDKIGPSREIILYTINTAIKIAYQNKNNIIMGIKDL
FNNLEYKKYEYVKPFKKLERLQGEKNTLGIYISFINS
NT seq 2814 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaataattttattcatttacgtatacatagtgaatattctttaatagatagtattatt
aaaataaaatctttaatttataatataaaacaaatgaatataccagcaatttgtataact
gatgaacaaaatatatttagtttaataaaatattataaaacttctataaaaaatggtatt
aaaccaataattggttgtgatttacaaataaattctaaaaaccaactttataaaataact
ttattagctatgaataagattggatattataatcttataaaattaattactttatcttgt
aaaggaatattaacaaaaaactatatatttaaattttcaaaaggattaattgtcctttca
ggagctagtaaaggtgaaataggttatttgttactttcaaaaaatataaaaaaagccacg
ttaattataaatcaatggaaaaaagtttttcataataggttttatttagaattacaaaga
ataggtttaaaacatgaagaagaattattatctaaatcaatagatttagctattaagaca
aatattccggtagttgcaacaaatgcagtaatgtttataaacaaagaagattattatgta
catcaaacaagagttgctataaatgaaggtaaattaattaaaaattcaaagaaaaaagat
ttttatagtaaagaacaatatttaaaaacacctaatgacatgatcaagttatttaaagat
attccttcagctattgaaaatagtataatgattgcaattcgttgtaatgtaaaattaaca
ttaaataaaaaaaatgtttgttttccaaaatttcatttatctcaaaagataaatataaaa
aaatattttatatatatatcaaataaaggattaaatcatcgtttaataaaaaataatata
ttaaaaactaaccaaattataacatataaaaatagattgtatgaagaaattaatattatt
actaatatgggttttattgaatattttttaatagtaatgaagtttatcaaatgggcaaaa
aaaacaaagatacctgtaggacctggtaggggttcgggagcaggatctttagttgcttat
gccttagaaataacagatgttgatcctataaaatatgatcttttatttgaaagatttctt
aatcctgaaagaattaatatgcctgattttgatatggatttttgtatgaaaaaacgtgat
aaagtaatacactatgtaactaaattatatggtaaaaatttagtagcacatattgttact
tttagtacaatgacagctaaatcggtaataagagatgttactagagtacaagggaaaccg
tattggttaggtgataaattatcaaaattaatacctttggatttaggtataaatttaaat
aaagcttttaataaatcattagaattaagaaatttacttaaaaagaatgaagaagctaat
gaaatttgggaaatgtctttaaaattagaaggtataattaaaggaataggaaaacacgca
ggaggaataataattgctcctaaaaaattaattaatttttctccaatattatgtgatgat
caaggaaaaaatataatacaatttgataaaaatgatataaaatatttaggtttaattaaa
tttgattttttaggtttaagaacattaacagtaattaattatactttaaaattaataaat
acatcaaaaaaacaaccaattgatattaataatattcctttaaatgatttaaaatctttt
aagttattaaaaaacgctgacactaattctatttttcaattagaatcacaaggtatgaaa
gaattaatcaaaaaattaaaaccaaagaatattaatgatataatatctttgatagcttta
tttagacctggtcctttaaattcaggtatggtagatgagtttataaaaagaaaaaatggt
aaacaaataaattattcatattttcatcaattaatccaaccaatattaaaatcaacttat
ggaataattttatatcaagaacaagtaatgaaaattactaatgttttaactggttttagt
cttggacaatcagatgtatttcgtagagctatagaaacaaataaaaatataaaaaattat
cgtataaaatttatcacaaattgtattaataataatataaaaaaatatattgccattaac
ttttttgaatttataaataaatttgctggttatggatttaataaatcacattcaactgct
tatggattaatttcttacaaaacaatatggttgaaaagtaattatcctagtcaatatatg
gcatcggtattatctacagaaatgtataatattgataaaataataccaattatatccgaa
tgtaaaagaatgaaattaaaaattttacctccggatatcaatctcagtaattataaattt
tgtgtggataaaaaaaataatattatttatggattaggtgctattaaaggaataggtgaa
gaatttattaaagaaatgattagtaatagaaaaaactatggtaagttttatgatttattt
gatttttgtaaacgtatagatagaaaatatttaaataaacgtaatttatctgctttaata
ctttctggtagtttagataaaattggtccatctagagaaattattttatatacgattaat
actgcaataaaaattgcttatcaaaacaaaaataatataataatggggatcaaggattta
tttaataatctagaatataaaaaatatgaatatgttaaaccatttaaaaaattagaaaga
ttacaaggagaaaaaaatactttaggaatatatatatcttttatcaattcttaa

  All links  
Ontology (4)   
   KEGG BRITE (4)   
Pathway (3)   
   KEGG PATHWAY (3)   
Chemical reaction (1)   
   KEGG ENZYME (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (3)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein domain (4)   
   Pfam (4)   
All databases (16)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system