KEGG   Prochlorococcus marinus MIT 9301: P9301_12101
Entry
P9301_12101       CDS       T00488                                 
Symbol
recB
Name
(GenBank) possible UvrD/REP helicase subunit B
  KO
K03582  exodeoxyribonuclease V beta subunit [EC:3.1.11.5]
Organism
pmg  Prochlorococcus marinus MIT 9301
Pathway
pmg03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pmg00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03440 Homologous recombination
    P9301_12101 (recB)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:pmg03400]
    P9301_12101 (recB)
Enzymes [BR:pmg01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.11  Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.11.5  exodeoxyribonuclease V
     P9301_12101 (recB)
DNA repair and recombination proteins [BR:pmg03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    RecBC pathway proteins
     P9301_12101 (recB)
SSDB
Motif
Pfam: UvrD-helicase UvrD_C AAA_19 AAA_30 UvrD_C_2 AAA_12 Viral_helicase1 ResIII
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABO17833
UniProt: A3PDK8
Position
complement(1025111..1028737)
AA seq 1208 aa
MDINQIKLDNKFKLVEASAGTGKSFTLAHIVLRNVLEKKVKPDEILLLSFTKNTCSELRD
KILLRFHTLKVYLQSHNEVKIDNTLKDWYLNFKDKDESKENIISEIDNFINQFYKLKVIT
FHAFCNDIIDEYSIEIGVTQDPYIENNIDNFYKDVIDNLWIDDFLNLNHELISAVNKKKI
SSRFGSRINKSFFVEILKNIDQENICKFQINNKYKNIDFNNYFNQFFYLNWNDFCFEWNK
KGKELFLQLIELGKLIKESGGKSQIYAAKPRNDKFNQINCWIEEINKRLNSKNIIDLIYD
ISKDDLLSKYFYIENISKEINKHNLKLDFTKFNSLQDKIYKIKEGFFTEFVRIFTQLAYI
KLIELKKSFSILNFNDLIKTVENTFLDSEICNSNTLSKIQKRFKCVLVDEFQDTDITQWN
LIKKFFNTKNHFLLCVGDPKQAIYKFRGGDIETYLDARSNAIEVFNLTDNYRSSKKLIDV
LNKLYKNGLKQSKLKYSKLTSTINEDINYEFKFKDVFEIVEFSKKETDIEDLVTHYIVNF
ILNNKEIDINKIAILTLNNSQCLDFKKKLNQFNLPCKIQNKQNIFDTEASSLLFLFIECL
LNPRSLKNITLLATSKFIEIKLEDLLDHGISNNLEILINKCITWSHELREKGFLNIVNEL
LINYKSSSIIQDSDLNLNLFQLSEIVEIELINNDFDINIVFNWYKNQLDHILRISTGEDF
LTKDYNLQNGINLSTIHSSKGLEFEIVLCPYLSIISNKSNKIKGPLWKSNIDRNIYVNIS
NNYSKVEKFKLIEEEDLFKESERLIYVALTRSKYKLIVFNDLEDTNNILNNDLLNNLENI
NIYKSNFQVRIEKEKIKEIFSKFRTKRLNNNLWKIDNFNKKISNVFNSDQFISYSSYSSW
IRKDKNIDAVINQYKDYEDNISIIKDSNFKNSKNNPNYFSYPNPLSEFPKGNIAGTCLHK
ILERFEFRNDNNQELIDLIIEELNFHQIDTSLAFKVKDAILRIINISLGRELQNKKLVDI
PNDYLIKELKYDLTLSYEGRNINSNDISNCFFLDQEYEFGEEYANKINDLQIMNKGFHSG
CIDCVFPVGNKLEDSKWWVIDWKSNLISGSDNSDCLPRNYNYENMRNEMIKHHYPLQSHL
YLLALHRLLKWRLKNYQPHKHLGGYIYLFLKGLPDSELFEKSKSEDISPGIFISKAPLKR
INYLDNLF
NT seq 3627 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggatattaatcaaattaaattagataataagtttaaattagtagaagcaagtgcggga
acgggtaagagttttactttggctcacatagttttaagaaatgttttggagaaaaaagtt
aaaccagatgagatactcttgctgagttttacgaaaaatacttgttcagaattaagagat
aaaatactcttgagatttcatactttaaaagtatatttgcaaagtcataatgaagttaag
atagataatactcttaaggattggtatttaaattttaaggataaagatgaatctaaggaa
aatataatttccgaaattgataattttataaatcaattctacaagttaaaagtaattaca
ttccatgctttttgtaatgatattattgatgaatatagtattgaaataggtgtaactcaa
gatccatatattgagaataatattgataatttttataaagatgtaatagataatttgtgg
attgatgattttctgaatcttaatcatgagcttatttcagcggtcaacaaaaaaaaaata
agttctagatttggaagtaggatcaataagtcattttttgtagaaattttaaaaaatata
gatcaagaaaatatctgtaaatttcaaataaataataaatataagaatattgattttaat
aattattttaatcaatttttttatttaaattggaacgatttttgttttgaatggaataag
aaaggtaaggaattatttttacaactcatagagttgggaaaattaattaaggagagtggt
ggaaaaagtcaaatatatgctgcaaaaccaagaaatgataagtttaatcaaataaattgt
tggattgaagagattaacaaaagacttaattctaaaaatattattgatttaatatatgat
atttctaaggatgatcttttatctaaatatttttatattgaaaatatatctaaagaaatt
aataaacataatctaaaattagattttactaaatttaattcattacaagataaaatttat
aaaataaaagaaggtttctttactgaatttgtaagaatatttacccaattagcttatata
aaattaattgaattaaagaaaagtttttctattttaaacttcaatgatcttatcaagact
gtagaaaatacatttctagattcggaaatttgtaatagtaatactctatctaaaattcaa
aaaagatttaaatgtgtcttagttgatgagttccaagatacagatattactcagtggaat
ttaataaaaaagttctttaatacaaaaaatcattttttactttgcgtaggtgatccaaaa
caagcgatttacaaatttagaggtggagatattgaaacttacttagatgcaagatctaat
gcaatcgaagtctttaatcttacagataactatagatcctcaaaaaagttaatcgatgtt
cttaataaactttataagaatggacttaaacaatcaaaactaaaatatagtaaattaacc
tcaacaattaatgaagatattaattatgaatttaaatttaaggatgtatttgaaattgta
gagttttcaaaaaaagagactgatatagaggatcttgtaactcactatatagttaacttt
attttaaataataaagaaattgatattaataaaattgcgattcttacattaaataattcg
caatgcttagattttaaaaaaaaattaaatcagtttaacctcccatgcaaaattcaaaat
aagcaaaatatttttgatacagaagcaagttctttactatttttattcatcgaatgttta
ttaaatccgaggtctttaaaaaatataactttgctagctacttcaaagtttatagaaata
aaattagaagatttacttgatcatggaattagtaataatttagaaattttaattaataaa
tgcattacttggtcccacgaactaagagaaaaaggttttttaaacattgttaatgaacta
cttataaattacaagtcatcctcgattattcaagattcagatttaaatttaaatttattt
caactttcagaaattgttgaaatagagttaataaataatgattttgatatcaatatagtc
ttcaactggtataaaaatcagttagatcatattttaagaatttctactggcgaagatttt
ttgacgaaagattataatcttcaaaatggaataaatctttctaccattcatagtagtaag
ggcctcgaatttgaaatagtcctatgtccatatctctcaattatttcaaataagtcaaat
aaaattaaaggacctctttggaaatcgaatattgatagaaatatatatgttaatatttct
aataattactctaaagttgaaaaatttaaattaatagaagaagaagatttatttaaagaa
agtgagaggttaatttatgtagcacttaccaggagcaaatataaacttattgtttttaat
gatttagaggatacaaataatattttaaataatgatttacttaataatttggaaaatatc
aatatttacaagtctaattttcaagtcaggatagaaaaagagaaaataaaagaaattttt
tcgaagttccgaaccaagcgattgaataataatctttggaaaatcgataactttaataag
aaaatatctaatgtatttaattctgatcaatttatttcttattcaagttattcttcttgg
atacgtaaagataaaaatattgatgcagttattaatcaatataaggattatgaagataat
atatcaattatcaaagattctaattttaagaattcaaagaataatcctaattatttttct
tatccaaatcccttaagtgaatttcccaaaggaaatattgctgggacttgcctgcacaaa
atattagaaagatttgaatttagaaacgataataatcaagaattaattgatttaattatt
gaggaattgaattttcatcaaatagatacttctttagcttttaaagtaaaagatgcgatt
ttaagaatcataaatatatctttaggaagagaattacaaaataagaaactagttgatatt
ccaaatgattacttaattaaggaactcaaatatgatttaaccctatcttatgaaggtaga
aatattaattctaatgatatatcaaattgcttttttttagatcaagaatatgaatttggt
gaagaatatgcaaataaaataaatgatcttcaaattatgaataaaggctttcattcagga
tgtattgattgtgttttccctgtaggaaataaattagaagatagtaaatggtgggtaatt
gactggaaaagtaatttgatttctggtagtgataatagtgattgtttaccgagaaactat
aactatgaaaatatgagaaatgaaatgattaaacatcattatccattgcaatctcatctt
tatttattagcattgcatagattattgaagtggcgacttaaaaattatcaaccacataaa
catctaggaggatatatttatttgtttttaaagggattgccagattctgaattatttgaa
aagtctaagtctgaagatatatctccaggtatttttattagcaaagcacctttaaaaaga
attaattatttagataaccttttttaa

  All links  
Ontology (3)   
   KEGG BRITE (3)   
Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Chemical reaction (1)   
   KEGG ENZYME (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (3)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   UniProt (1)   
Protein domain (8)   
   Pfam (8)   
All databases (18)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system