KEGG   Prunus mume (Japanese apricot): 103321598
Entry
103321598         CDS       T03196                                 
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At1g26900, mitochondrial
Organism
pmum  Prunus mume (Japanese apricot)
SSDB
Motif
Pfam: PPR_2 PPR PPR_1 PPR_3 PPR_long
Other DBs
NCBI-GeneID: 103321598
NCBI-ProteinID: XP_008221644
Position
LG2:complement(17298018..17300019)
AA seq 589 aa
MTLLAKSSRLGHRLELWPKHHSMFPDDLKVISLLESCKQTSEISQIHGSMVKTGLDCVPF
TLSKLLVSSIHDIQYAASIFNHIQKPNLFMFNTMVRGYSISDDPTHAFRVFNNLRAQNIT
LDXXXXXXXLKACARELAIGTGQGIHGIVVRSGHGMFVNVKNTLLHFYCISRKMEDAHKL
FDEFPQGNDLISWNTLMGGYLHVSQPQVIVDLFKQMCRSGFEASVTTVLNLLSAIGDLGS
YLGGESLHGYCIKIGFCSDLHVLTALIDMHAKNGQIDLGRRIFDGVAVKDVVLWNCLVDK
YAKCGLVQDAVALLRLMRLERMKPNSSTLAGLLSACAASGSVSVGSCIKDYVEEENLVLD
AVLGTALVDMYAKCGFLEKALDIFESMESKDVKSWTAMISGYGVHGQAGNAIRLFHRMEE
EGCQPNEVTFLAVLSACSHGGLVTEGVRCFEIMVCKYGFVPKVEHYGCMVDLLGRSGLLE
EAHTLIESLPIKSDVTAWRALLSACRVYGYVSLGETVKRVLIQLNDDHPTNSMLLSSTYA
IAGRLPDQTRTQEREDEKMVRGEKFRQVRKEENLIKEAGRSTIEMDSQG
NT seq 1770 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgacattgttagccaagtcctcacgtctggggcatagactcgagctttggcccaaacac
cactctatgttccccgacgatctgaaggtaatttctctattagaatcttgcaaacaaacc
tcagaaatctctcaaatccatggctctatggtcaagactggtctcgactgcgttcctttc
acattgagcaagcttcttgtctcttccattcatgacattcaatatgcggcctccattttc
aaccacatacaaaaaccaaatctcttcatgttcaataccatggtcagaggctattccatc
agtgatgacccaacgcatgcttttcgtgttttcaataacttgagggctcaaaatatcacg
ctagacnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgctcaaagcttgcgctcgtgaactggccattggg
accggtcaagggattcatgggattgttgtgaggtctgggcatgggatgtttgtcaatgta
aagaatacccttttgcatttttactgtatttctaggaaaatggaagatgcacataagttg
tttgatgagtttcctcaaggaaatgacttgatttcatggaatactttgatgggtggttat
cttcatgtgtctcagcctcaagtgattgtagatttgttcaagcaaatgtgtaggagcggt
tttgaagctagtgttaccaccgttttgaaccttttgtctgccattggtgatttaggaagt
taccttggaggagagtctcttcatgggtactgcatcaagattggcttttgttcggattta
catgtgcttactgctttgattgatatgcatgcaaagaatgggcaaattgatttaggacgt
cggattttcgatggagttgctgtgaaggatgttgtattatggaattgtttggtggataag
tatgcaaaatgtggcctggtacaagatgcagtagctttgttgcggttgatgaggcttgaa
agaatgaaacccaattcatctacactggcaggactgctttcggcttgtgctgcttctggg
tctgtaagtgtagggagttgcattaaggattatgtggaagaagagaacttggttttggat
gcggttcttggaacagctctggttgatatgtatgctaaatgtgggtttttggagaaggca
cttgacatctttgaaagcatggaaagcaaagatgtgaaatcatggacagccatgatttca
ggttatggtgttcatgggcaggcaggcaatgccataaggctgtttcatagaatggaagag
gaggggtgccaacctaatgaagtcactttcttggcagtgttaagtgcttgcagccatgga
gggctggtgacagagggagttagatgttttgagataatggtttgcaagtatggatttgtg
ccaaaagttgaacactacggttgtatggtagatcttttgggtcgttcaggattgctggag
gaagcacatacactaattgaaagcttgcccatcaagagtgacgttacggcatggcgtgca
ttgctttcagcttgcagggtttatgggtacgtttctcttggggaaactgtaaagagagtg
ttaatacaacttaatgatgatcatcccaccaattcaatgctattatcaagtacttatgcg
attgctggaaggttgccagatcaaacgagaacacaggaaagggaggatgaaaagatggtg
agaggagagaaattcaggcaagttcgaaaagaagaaaacctgataaaagaagctggacgt
agcacaattgagatggatagtcaaggttga

  All links  
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (3)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (5)   
   Pfam (5)   
All databases (11)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system