KEGG   Polaribacter sp. MED152: MED152_08630
Entry
MED152_08630      CDS       T02533                                 
Symbol
alyP
Name
(GenBank) alginate lyase precursor
  KO
K01729  poly(beta-D-mannuronate) lyase [EC:4.2.2.3]
Organism
pom  Polaribacter sp. MED152
Pathway
pom00051  Fructose and mannose metabolism
pom01100  Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pom00001]
 09100 Metabolism
  09101 Carbohydrate metabolism
   00051 Fructose and mannose metabolism
    MED152_08630 (alyP)
Enzymes [BR:pom01000]
 4. Lyases
  4.2  Carbon-oxygen lyases
   4.2.2  Acting on polysaccharides
    4.2.2.3  mannuronate-specific alginate lyase
     MED152_08630 (alyP)
SSDB
Motif
Pfam: Chondroitinas_B F5_F8_type_C Por_Secre_tail BACON BACON_2
Other DBs
NCBI-ProteinID: EAQ42774
UniProt: A2TYE9
Position
complement(1954431..1956839)
AA seq 802 aa
MYMISNKKFFPIIFLSLFWSISINAQLVSTNAELETAISNANAGSEIILKDGSYNNVFVN
INKNGTNSSPIVVKAQNPGSVFLTGNSRVYMRGTYITVSGLIFQNPSNLIENGNTIEPVF
ELNQCDNCTVTNNKIDAYNGTDAQKTLKFKWVYIIDGQYNEISHNSFIGKYGVGSIINDN
RSNSNEDYLKIHHNYFADRVPVDNDINGLNDQDAIRIGTSTTSLSDSYSEVYDNYFYNWS
GEVEIISNKSGKNKYYNNTFRDYQGTLTLRHGNGCEVFNNYFFANNNSFTGGIRIIGEDH
KVYNNYIEGINSFKPTGSSSNVTGGINVMNGVTNSALNQYYQVKNAQVVNNTFVNCDYAI
RIGTSLGGTEEPVNLTVANNIMYNTSINAYQINTTPSGNFVSEGNLTNLSNSDMVDDGNF
HRIKAGSAPIDASIGAYSFVTEDVLGGTRDAIVDAGAEEFGANGSKLPYIADDVGVKIGF
LSSPSPFLNTSTNELNFSISGGNLNFDVSANVNWTISENADWLSLNVSDGVNSQTVAATT
TNNTTGSIRSAIITISEVGGTLNQTINVSQSDGTFSANDAVVLTGITVTGVGTQEGGINI
PENTLDGDDSTRWSANSSNGSAYLTYNLYCKKTVTSVKIYFHKGDSRTSSFKIATSVDGT
NFTDVTGILTSSGTTVGFEDFDFSPFQEVQFIRIFGYGNSEGSGWNSYEEVQIFGNDSCA
SLSLEDINLVDNQVQYYPNPTSNLLQITANKEIGTIEVFDIKGKRILSKKITSNQGTLNV
TPLAKGIYFIKRNSISTKFIKE
NT seq 2409 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtatatgatatcaaataaaaagttttttcctataatttttctttctctattttggtca
atttcaataaatgcgcaattggtttctacaaatgctgagttggaaactgcaatttctaat
gccaatgcaggttcagaaattattttaaaagatggtagttacaacaatgtatttgtaaat
attaataaaaacggaaccaactcttcacctattgttgttaaagctcagaatccaggttct
gtttttttaacaggtaattctcgtgtttacatgagaggaacttacattacagtttctggt
ttaatcttccaaaatccatcaaatttaatagaaaatggaaatacaattgaacccgttttt
gaattaaatcaatgtgacaattgtacagtaacaaacaataagattgatgcttataatggc
acagatgctcaaaaaacattaaagtttaaatgggtttacatcattgatggtcagtacaac
gaaatttcgcacaattcttttattggtaaatatggtgttggcagtattataaatgacaat
agaagtaattcaaatgaagattatttaaaaattcatcataattattttgcagatagagta
cctgtagataatgatattaacgggttaaatgatcaagatgctattcgaattggaactagt
accacttctttatcagattcctattcagaagtttatgataattatttctacaattggtct
ggagaggtagaaattatatctaacaagagcggaaaaaacaaatattacaacaatactttt
agagattatcaaggaacgttaaccttaaggcatggaaatggctgtgaagtttttaacaat
tatttctttgcaaataataactcatttacaggaggtataagaattattggagaagatcat
aaggtatataacaattacatagaaggtattaactcttttaaaccaactggctcatcttct
aatgtaacaggtggtataaatgtaatgaatggtgttacaaactcagcattaaaccagtat
tatcaggtaaaaaatgctcaagttgtaaataacacctttgtaaactgtgattatgctata
agaattggaacctctttaggaggtacagaagaaccagttaatttaacggttgccaataat
attatgtacaatacaagtataaatgcatatcaaattaatacaactccatcagggaatttt
gtttctgaaggcaacttaaccaatttgtctaattcagatatggttgatgatggtaatttt
cataggataaaagctggtagtgctcctattgatgcaagtattggcgcttattcatttgta
actgaagacgttttgggtggtacaagagacgccattgttgatgctggtgcagaagagttt
ggtgctaatggatctaaattaccatatatagcagatgatgttggtgtaaaaattggcttt
ttatcttctccttcaccatttttaaatacttctacaaatgaattgaatttttcaatttct
ggaggaaatctaaattttgacgtaagtgcgaatgtaaattggaccatttcagaaaatgca
gattggttatctttaaacgttagtgatggtgtcaattcacaaacggttgcagctaccaca
acaaataatacaactggttcaataagatctgcaattatcaccatttctgaagttggtggt
actttaaatcaaacaattaatgtctcacaatctgatggtacttttagtgcaaatgatgct
gttgtacttacagggattacagttacaggtgttggtacacaagaaggtggaattaatatt
ccagaaaacactttagatggagatgattctacaagatggtctgcaaattcatctaatggt
tctgcatatttgacctataatttatattgtaaaaaaacagtaactagtgtaaaaatttac
tttcataaaggcgattcaagaacatcttcttttaaaattgcaacttctgttgatggtaca
aattttacagatgttacagggatacttacaagttcaggaaccacagtaggttttgaagat
ttcgatttttcaccttttcaagaagtacaatttattcgaatttttggttatggcaactca
gaaggtagtggttggaatagttatgaagaggttcaaatttttggtaatgattcttgtgct
tcactttcattggaagacattaatttggtcgataatcaggttcaatattatccaaaccca
acctcgaatttgttacaaattacggcgaataaagaaatcggaacaatagaggtttttgat
ataaagggtaaaagaattctaagtaaaaaaattacttcaaatcaaggaactttaaatgta
acaccattagccaaaggcatatattttatcaaacgaaattcaatttctaccaaatttatc
aaagaataa

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Pathway (2)   
   KEGG PATHWAY (2)   
Chemical substance (2)   
   KEGG COMPOUND (2)   
Chemical reaction (2)   
   KEGG ENZYME (1)   
   KEGG REACTION (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (50)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (47)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   UniProt (1)   
Protein domain (5)   
   Pfam (5)   
All databases (65)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system