GenomeNet

Database: PROSITE
Entry: PS50027
LinkDB: PS50027
Original site: PS50027 
ID   EGF_LAM_2; MATRIX.
AC   PS50027;
DT   01-MAY-2005 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 10-APR-2019 INFO UPDATE.
DE   Laminin-type EGF-like (LE) domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=50;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=50;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.6474471; R2=0.0190416; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=439; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=124; N_SCORE=6.0; MODE=1; TEXT='R?';
MA   /DEFAULT: B1=*; E1=*; MM=*; II=*;
MA   /I: B1=-85; E0=*; BD=-50;
MA   /M: SY='C'; M=-78,59,-79,-83,-83,-68,-75,-93,-84,-88,-87,-81,-73,-83,-78,-83,-81,-89,-71,-83; M0=-79;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='N'; M=-23,-38,17,8,-5,-18,6,-39,-4,-19,-29,20,-8,18,-7,2,-7,-34,-40,-1; M0=-9;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='C'; M=-78,59,-79,-83,-83,-68,-75,-93,-84,-88,-87,-81,-73,-83,-78,-83,-81,-89,-71,-83; M0=-79;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-50; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='N'; M=-34,-48,20,-22,-7,-39,28,-49,-27,-48,-40,29,2,-25,-33,7,-33,-44,-46,-5; M0=-22;
MA   /I: MM=-2; MI=-101; MD=-28; IM=-9; II=-11; DM=-14; DD=-7;
MA   /M: SY='P'; M=-21,-34,-20,-7,-37,5,6,-10,-14,-20,-25,-2,31,0,1,0,-21,3,-36,-30; M0=-10;
MA   /I: MM=-1; MI=-48; MD=-109; IM=-10; II=-10; DM=-19; DD=-5;
MA   /M: SY='H'; M=-22,-34,9,-16,-7,-32,22,2,2,-1,-25,8,-4,11,-9,-3,-5,9,-36,9; M0=-5;
MA   /I: MM=0; MI=-99; MD=-110; IM=-9; II=-11; DM=-1; DD=-34;
MA   /M: SY='G'; M=-53,-56,-61,-64,-76,38,-66,-81,-72,-80,-74,-6,-63,-68,-71,-56,-58,-70,-70,-76; M0=-57;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='S'; M=8,-36,-6,-19,-39,-35,25,-16,-19,-37,-28,4,-36,-18,-23,26,5,-16,-39,-33; M0=-15;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='Y'; M=3,-30,-29,3,3,-36,8,3,-9,8,-22,-25,-8,9,-7,6,-1,3,-34,10; M0=-5;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='S'; M=-10,-38,2,5,-6,5,17,-39,-5,-38,-29,2,-2,-5,-5,23,-9,-34,-40,-33; M0=-10;
MA   /I: MM=-1; MI=-102; MD=-44; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='E'; M=0,-37,5,12,-9,6,-19,-12,5,-7,-28,-1,-6,-1,6,10,-6,-11,-39,-33; M0=-4;
MA   /I: MM=-2; MI=-101; MD=-29; IM=-9; II=-11; DM=-17; DD=-5;
MA   /M: SY='T'; M=-3,-36,2,-3,-39,2,-17,-4,-7,-7,-27,11,-32,5,7,-4,16,5,-37,-1; M0=-5;
MA   /I: MM=-4; MI=-20; MD=-109; IM=-10; II=-10; DM=-1; DD=-36;
MA   /M: SY='C'; M=-78,59,-79,-83,-83,-68,-75,-93,-84,-88,-87,-81,-73,-83,-78,-83,-81,-89,-71,-83; M0=-79;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-53; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='D'; M=-4,-42,27,4,-9,-36,19,-43,-20,-42,-33,26,-37,-19,-25,-12,-27,-11,-44,-37; M0=-18;
MA   /I: MM=-3; MI=-40; MD=-29; IM=-26; II=-3; DM=-13; DD=-7;
MA   /M: SY='P'; M=-21,-36,-20,-3,-39,-31,-3,-36,7,-5,16,-2,22,10,6,-4,4,4,-38,-31; M0=-8;
MA   /I: MM=0; MI=-99; MD=-110; IM=-9; II=-11; DM=-3; DD=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-38,5,15,-41,-10,11,-17,2,-8,-29,11,-34,-1,-6,2,2,6,-40,5; M0=-5;
MA   /I: MM=0; MI=-101; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-4; DD=-20;
MA   /M: SY='T'; M=-26,-26,-46,-40,-26,1,4,-7,-37,-25,-19,-37,-42,-34,-37,18,29,-1,-31,4; M0=-18;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='G'; M=-54,-56,-61,-65,-77,38,-66,-81,-72,-80,-74,-8,-63,-68,-71,-56,-58,-70,-70,-76; M0=-58;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-38,-6,-17,3,-33,11,-38,-4,-6,-29,-5,-34,37,0,-11,-23,-34,-40,-6; M0=-13;
MA   /I: MM=-2; MI=-33; MD=-112; IM=-17; II=-5; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='C'; M=-78,59,-79,-83,-83,-68,-75,-93,-84,-88,-87,-81,-73,-83,-78,-83,-81,-89,-71,-83; M0=-79;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-11,-37,-4,13,-6,-33,1,-11,-8,-8,17,-20,6,17,6,3,-3,2,7,-33; M0=-5;
MA   /I: MM=-3; MI=-25; MD=-112; IM=0; II=-54; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='C'; M=-78,59,-79,-83,-83,-68,-75,-93,-84,-88,-87,-81,-73,-83,-78,-83,-81,-89,-71,-83; M0=-79;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='K'; M=-40,-50,-42,-11,-57,-47,-29,-52,29,-16,-41,-34,-9,18,24,-12,-38,-48,-49,-46; M0=-25;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-38,9,12,-41,-33,20,-39,-5,-38,-29,-1,29,-15,2,-22,-6,-13,-40,-33; M0=-14;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='G'; M=-49,-53,-38,-41,-26,30,23,-57,-47,-18,-51,26,-56,-44,-49,-48,-50,-55,-33,-5; M0=-33;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='V'; M=0,-30,-55,-50,10,-46,-35,-22,-46,-28,-23,-43,-47,-42,-44,-37,20,30,-33,8; M0=-25;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='T'; M=-10,-37,-7,12,-39,4,-20,-12,-4,-19,-1,-20,-34,11,-21,-23,27,-2,-39,-32; M0=-10;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='G'; M=-78,-68,-78,-82,-84,39,-75,-94,-84,-88,-87,-80,-73,-82,-78,-82,-81,-89,-71,-84; M0=-74;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='R'; M=-1,-38,-8,-4,4,-33,-20,-22,0,7,-29,-20,14,15,18,-10,3,-34,-40,-33; M0=-8;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='H'; M=-3,-40,-25,-19,-44,-36,24,-41,12,-40,0,9,-37,23,22,-25,5,-37,-42,-35; M0=-18;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='C'; M=-78,59,-79,-83,-83,-68,-75,-93,-84,-88,-87,-81,-73,-83,-78,-83,-81,-89,-71,-83; M0=-79;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='D'; M=-47,-69,32,21,-69,-44,-39,-69,-43,-68,-62,18,-50,5,-54,-43,-48,-64,-70,-58; M0=-40;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-38,-8,1,-41,-33,-20,-19,5,-2,-29,-20,-34,21,28,-11,5,-23,-40,-33; M0=-12;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='C'; M=-78,59,-79,-83,-83,-68,-75,-93,-84,-88,-87,-81,-73,-83,-78,-83,-81,-89,-71,-83; M0=-79;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='A'; M=17,-38,9,3,-41,-33,-20,-12,14,6,-29,-20,-34,15,-5,-5,-23,-34,-40,-33; M0=-11;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-38,9,1,-41,-33,8,-39,-4,-16,-29,7,31,-15,1,-1,-12,-34,-40,-33; M0=-13;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='G'; M=-36,-41,-32,-11,-3,34,3,-39,-36,-41,-35,-34,-2,-34,-40,-37,-11,-38,-36,5; M0=-24;
MA   /I: MM=-2; MI=-29; MD=-112; IM=-7; II=-15; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-67,-57,-71,-75,36,-70,11,-57,-70,-50,-51,-57,-69,-58,-64,-21,-4,-58,-25,37; M0=-47;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-25,-43,-37,21,-13,17,-20,-34,-24,-17,-35,-41,5,-12,-31,-6,-9,27,35; M0=-17;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='G'; M=-10,-38,-5,-1,-41,28,-2,-39,-16,-8,3,11,-34,7,1,-22,-23,-34,-40,-33; M0=-13;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='F'; M=-26,0,17,-40,20,-41,-30,-8,-37,13,-16,12,-41,-7,-36,-2,-15,-2,-29,11; M0=-13;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='P'; M=6,-38,-4,-5,-41,6,-20,-39,-16,-38,-29,-4,23,7,7,1,8,-15,-40,-3; M0=-9;
MA   /I: MM=-1; MI=-102; MD=-36; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='T'; M=-5,-37,-4,-6,-12,-11,-19,-10,-4,-8,-28,-3,4,11,10,14,14,-33,12,-8; M0=-5;
MA   /I: MM=-1; MI=-100; MD=-44; IM=-9; II=-11; DM=-22; DD=-4;
MA   /M: SY='N'; M=4,-36,-1,1,-40,3,4,3,7,-16,-27,15,-10,-14,7,5,4,-33,-38,-2; M0=-5;
MA   /I: MM=-6; MI=-100; MD=-16; IM=-9; II=-11; DM=-26; DD=-3;
MA   /M: SY='G'; M=3,-23,-24,-19,2,18,4,-4,-17,-11,-15,15,8,3,-2,-20,-18,7,-27,-22; M0=-6;
MA   /I: MM=-2; MI=-94; MD=-28; IM=-9; II=-11; DM=-40; DD=-1;
MA   /M: SY='T'; M=9,-31,-15,-9,-34,16,1,-31,10,-31,-22,-12,10,6,-5,-15,16,-27,-32,-26; M0=-9;
MA   /I: MM=-12; MI=-8; MD=-102; IM=-10; II=-10; DM=-3; DD=-24;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-37,5,-15,-40,26,-19,-37,2,-16,-28,-2,3,-14,-9,-1,-6,-6,-39,-32; M0=-9;
MA   /I: MM=0; MI=-100; MD=-111; IM=-9; II=-11; DM=-2; DD=-28;
MA   /M: SY='C'; M=-78,59,-79,-83,-83,-68,-75,-93,-84,-88,-87,-81,-73,-83,-78,-83,-81,-89,-71,-83; M0=-79;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='Q'; M=-9,-38,-11,0,-6,-33,6,4,11,-10,-29,-20,-34,23,11,-11,13,-13,-40,-5; M0=-8;
MA   /I: MM=0; MI=-102; MD=-112; IM=-9; II=-11; DM=-7; DD=-14;
MA   /M: SY='P'; M=1,-38,-12,-17,-41,-33,-20,-38,13,-18,-29,-9,32,-6,3,-9,-23,1,-40,-33; M0=-13;
MA   /I: B0=*; E1=-10;
NR   /RELEASE=2019_03,559634;
NR   /TOTAL=584(90); /POSITIVE=569(88); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=15(2);
NR   /FALSE_NEG=6; /PARTIAL=1;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=22;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Laminin EGF-like;
CC   /VERSION=3;
DR   P31696    , AGRIN_CHICK, T; Q90404    , AGRIN_DIPOM, T;
DR   O00468    , AGRIN_HUMAN, T; A2ASQ1    , AGRIN_MOUSE, T;
DR   P25304    , AGRIN_RAT  , T; Q5VV63    , ATRN1_HUMAN, T;
DR   Q6A051    , ATRN1_MOUSE, T; O75882    , ATRN_HUMAN , T;
DR   Q9WU60    , ATRN_MOUSE , T; Q99J86    , ATRN_RAT   , T;
DR   Q9NYQ6    , CELR1_HUMAN, T; O35161    , CELR1_MOUSE, T;
DR   Q9HCU4    , CELR2_HUMAN, T; Q9R0M0    , CELR2_MOUSE, T;
DR   Q9QYP2    , CELR2_RAT  , T; Q9NYQ7    , CELR3_HUMAN, T;
DR   Q91ZI0    , CELR3_MOUSE, T; O88278    , CELR3_RAT  , T;
DR   Q21313    , EPI1_CAEEL , T; Q18823    , LAM2_CAEEL , T;
DR   P25391    , LAMA1_HUMAN, T; P19137    , LAMA1_MOUSE, T;
DR   P24043    , LAMA2_HUMAN, T; Q60675    , LAMA2_MOUSE, T;
DR   Q16787    , LAMA3_HUMAN, T; Q61789    , LAMA3_MOUSE, T;
DR   Q16363    , LAMA4_HUMAN, T; P97927    , LAMA4_MOUSE, T;
DR   O15230    , LAMA5_HUMAN, T; Q61001    , LAMA5_MOUSE, T;
DR   Q00174    , LAMA_DROME , T; Q01635    , LAMB1_CHICK, T;
DR   P11046    , LAMB1_DROME, T; P07942    , LAMB1_HUMAN, T;
DR   Q27262    , LAMB1_HYDVU, T; P02469    , LAMB1_MOUSE, T;
DR   P55268    , LAMB2_HUMAN, T; Q61292    , LAMB2_MOUSE, T;
DR   P15800    , LAMB2_RAT  , T; Q13751    , LAMB3_HUMAN, T;
DR   Q61087    , LAMB3_MOUSE, T; Q8JHV6    , LAMB4_DANRE, T;
DR   A4D0S4    , LAMB4_HUMAN, T; Q25092    , LAMB_HIRME , T;
DR   Q1LVF0    , LAMC1_DANRE, T; P15215    , LAMC1_DROME, T;
DR   P11047    , LAMC1_HUMAN, T; P02468    , LAMC1_MOUSE, T;
DR   A0JP86    , LAMC1_XENTR, T; Q8HZI9    , LAMC2_HORSE, T;
DR   Q13753    , LAMC2_HUMAN, T; Q61092    , LAMC2_MOUSE, T;
DR   Q9Y6N6    , LAMC3_HUMAN, T; Q9R0B6    , LAMC3_MOUSE, T;
DR   Q7Z7M0    , MEGF8_HUMAN, T; P60882    , MEGF8_MOUSE, T;
DR   Q9QYP0    , MEGF8_RAT  , T; Q9H1U4    , MEGF9_HUMAN, T;
DR   Q8BH27    , MEGF9_MOUSE, T; Q90922    , NET1_CHICK , T;
DR   O95631    , NET1_HUMAN , T; O09118    , NET1_MOUSE , T;
DR   Q2HXW4    , NET1_PIG   , T; Q924Z9    , NET1_RAT   , T;
DR   Q90923    , NET3_CHICK , T; O00634    , NET3_HUMAN , T;
DR   Q9R1A3    , NET3_MOUSE , T; Q9HB63    , NET4_HUMAN , T;
DR   Q9JI33    , NET4_MOUSE , T; Q5RB89    , NET4_PONAB , T;
DR   Q8WTR8    , NET5_HUMAN , T; Q3UQ22    , NET5_MOUSE , T;
DR   D3ZT86    , NET5_RAT   , T; Q24567    , NETA_DROME , T;
DR   Q24568    , NETB_DROME , T; Q9Y2I2    , NTNG1_HUMAN, T;
DR   Q8R4G0    , NTNG1_MOUSE, T; Q96CW9    , NTNG2_HUMAN, T;
DR   Q8R4F1    , NTNG2_MOUSE, T; P98160    , PGBM_HUMAN , T;
DR   Q05793    , PGBM_MOUSE , T; Q9V5N8    , STAN_DROME , T;
DR   Q19981    , TAG53_CAEEL, T; Q06561    , UNC52_CAEEL, T;
DR   P34710    , UNC6_CAEEL , T; O75445    , USH2A_HUMAN, T;
DR   Q2QI47    , USH2A_MOUSE, T; Q8K3K1    , USH2A_RAT  , T;
DR   Q01636    , LAMBV_CHICK, P;
DR   Q6TMJ6    , SIGK_DICDI , N; Q9NY15    , STAB1_HUMAN, N;
DR   Q8R4Y4    , STAB1_MOUSE, N; Q8WWQ8    , STAB2_HUMAN, N;
DR   Q8R4U0    , STAB2_MOUSE, N; Q8CFM6    , STAB2_RAT  , N;
DR   A6BM72    , MEG11_HUMAN, F; Q80T91    , MEG11_MOUSE, F;
3D   1KLO; 1NPE; 1TLE; 2Y38; 4AQS; 4OVE; 4PLM; 4PLN; 4PLO; 4URT; 4WNX; 5LF2;
3D   6FKQ;
PR   PRU00460;
DO   PDOC00961;
//
DBGET integrated database retrieval system