GenomeNet

Database: PROSITE
Entry: PS50113
LinkDB: PS50113
Original site: PS50113 
ID   PAC; MATRIX.
AC   PS50113;
DT   01-DEC-2001 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 07-NOV-2018 INFO UPDATE.
DE   PAC domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4010999; R2=0.0265788; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1897.3623047; R2=1.3622642; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=230; H_SCORE=2211; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=155; H_SCORE=2109; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-8,-25,-11,-2,-8,-20,2,-15,1,-10,-4,-4,-16,6,8,-6,-4,-15,-15,2,1;
MA   /M: SY='D'; M=-8,8,-24,10,6,-22,-11,-7,-21,-1,-18,-13,5,-7,1,-4,2,2,-18,-28,-14,3;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-17,-21,-20,-15,-1,-17,-14,0,-14,-1,-1,-16,-22,-14,-13,-10,-4,2,-6,1,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-27,17,36,-28,-17,-3,-27,7,-21,-18,3,-2,13,1,2,-5,-25,-31,-18,24;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-21,-21,-24,-20,9,-21,-14,4,-16,1,2,-18,-19,-18,-14,-14,-8,4,-7,8,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-7,-26,-8,1,-21,-14,-5,-19,10,-16,-7,-4,-16,8,21,-4,-5,-14,-18,-11,3;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-24,-21,-28,-21,11,-27,-16,16,-21,20,14,-21,-25,-19,-18,-18,-8,13,-16,4,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-18,-23,-20,-10,-4,-28,-16,9,-10,4,4,-15,-18,-9,-8,-12,-6,7,-19,-1,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-8,3,-23,-1,1,-20,-11,0,-22,6,-19,-11,7,-14,3,13,-1,-3,-19,-26,-12,1;
MA   /I: I=-8; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-5,-25,-5,0,-22,-15,-11,-21,12,-19,-11,-3,-1,1,12,-5,-6,-17,-24,-14,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-13,28,-27,37,11,-32,-5,1,-32,-1,-27,-22,17,-8,1,-7,4,-5,-26,-35,-18,6;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-28,-5,-13,-28,48,-16,-34,-14,-27,-18,3,-18,-14,-14,1,-15,-26,-23,-26,-13;
MA   /M: SY='S'; M=0,-1,-19,-3,4,-22,-8,-10,-21,0,-20,-14,2,-10,3,3,12,10,-14,-29,-16,3;
MA   /M: M=-7,-16,-20,-17,-9,-13,-21,-17,-2,-9,-4,-1,-14,-5,-9,-9,-8,-4,-2,-21,-11,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-22,-23,-26,-19,12,-24,-15,5,-10,5,3,-16,-24,-16,-1,-15,-9,5,-12,6,-18;
MA   /M: SY='W'; M=-13,-25,-33,-25,-18,1,-22,-12,-11,-16,-12,-10,-23,-12,-14,-14,-19,-12,-16,47,14,-15;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-20,-8,-25,-21,0,-20,-21,11,-21,10,6,-17,-25,-20,-20,-12,-6,13,-23,-7,-21;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-7,-26,-5,5,-11,-22,3,-9,-7,0,-2,-8,-17,1,-4,-11,-10,-10,-21,-2,2;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-19,-19,-21,-16,0,-19,-19,6,-18,7,2,-17,-22,-15,-16,-8,-2,8,-17,-5,-16;
MA   /I: I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0;
MA   /M: SY='N'; M=-6,5,-19,3,1,-16,-13,-1,-18,1,-18,-12,7,-14,2,3,6,5,-13,-23,-8,0; D=-3;
MA   /I: DM=-16;
MA   /M: SY='A'; M=8,-16,-18,-20,-16,-11,-4,-20,2,-15,-2,-1,-12,-19,-16,-16,-3,-3,7,-22,-12,-17; D=-3;
MA   /I: DM=-16;
MA   /M: SY='S'; M=0,-9,-12,-12,-6,-16,-13,-10,-11,-6,-13,-7,-5,-16,-3,-5,5,4,-5,-27,-11,-5;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-19,-27,-15,-6,-18,-17,-20,-10,-13,-13,-11,-18,35,-13,-18,-8,-8,-12,-27,-21,-12;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-20,-23,-25,-17,-1,-28,-14,17,-16,9,12,-16,-21,-12,-13,-12,-4,12,-18,2,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-15,-16,-23,-18,-10,1,-23,-2,-10,1,-4,-1,-10,-21,-5,16,-13,-7,-8,-14,5,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-13,27,-27,33,7,-26,-4,1,-30,-4,-26,-22,19,-15,-2,-8,2,-6,-26,-26,-12,2;
MA   /M: SY='E'; M=0,3,-24,6,14,-26,-7,-6,-22,1,-20,-14,1,-7,8,-3,4,-4,-18,-27,-17,10;
MA   /M: SY='D'; M=-4,7,-25,8,5,-26,-4,-5,-25,4,-22,-15,6,-14,4,4,2,-5,-20,-26,-16,4;
MA   /M: SY='G'; M=-6,6,-29,10,-3,-32,35,-8,-37,-10,-28,-20,6,-16,-6,-12,0,-15,-30,-26,-24,-5;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-17,1,10,-20,-13,1,-20,4,-16,-10,2,-12,10,5,0,-4,-18,-23,-11,10; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-20,-15,-21,-17,2,-21,-17,11,-15,8,5,-19,-13,-17,-13,-11,-3,14,-14,-3,-17; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-12,-23,-14,-7,-15,-23,-13,1,-5,-4,0,-9,-14,-1,-2,-6,-3,1,-23,-9,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-10,-27,-11,-7,-11,4,-2,-18,-6,-12,-7,-5,-19,-6,-3,-8,-13,-16,-14,0,-8;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-25,-22,-30,-22,21,-29,-17,13,-21,11,7,-21,-25,-21,-18,-16,-6,10,-4,15,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-22,-16,-26,-19,-2,-28,-19,18,-21,16,11,-19,-23,-14,-17,-13,-4,15,-24,-5,-18;
MA   /M: SY='G'; M=2,-16,-13,-19,-20,-13,19,-21,-15,-20,-9,-8,-11,-23,-20,-19,-5,-11,-7,-23,-18,-20;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-16,-17,-22,-19,2,-21,-19,11,-17,3,6,-12,-21,-16,-16,-4,5,14,-23,-5,-18;
MA   /M: M=-3,-14,-19,-18,-14,-4,-8,-8,-5,-17,-5,-1,-9,-20,-9,-15,-6,-8,-5,-18,-5,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-10,-24,-12,-3,-16,-21,-5,-8,3,-7,-1,-5,-17,5,13,-4,-3,-7,-24,-9,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-18,45,-29,62,18,-37,-10,-1,-37,-1,-29,-28,19,-9,0,-10,1,-9,-28,-39,-20,9;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-27,-24,-34,-27,-1,-30,-27,35,-26,18,16,-21,-23,-21,-25,-17,-6,26,-22,-4,-27;
MA   /M: SY='T'; M=2,1,-12,-6,-7,-14,-13,-16,-13,-9,-15,-12,2,-11,-7,-9,22,37,-4,-32,-13,-7;
MA   /M: SY='E'; M=-5,9,-27,15,27,-30,-12,-3,-26,4,-20,-16,1,-4,11,-3,0,-9,-23,-28,-18,19;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-10,-26,-12,0,-14,-21,2,-15,5,-6,-2,-6,-18,8,19,-9,-7,-13,-21,-5,2;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-4,-28,-4,3,-21,-21,-3,-19,25,-19,-6,-3,-14,6,19,-9,-8,-13,-20,-5,3;
MA   /M: SY='Q'; M=-7,-3,-26,-3,16,-23,-19,-3,-16,7,-11,-3,-3,-12,18,10,-3,-5,-17,-24,-12,16;
MA   /M: SY='A'; M=15,-16,-17,-21,-13,-9,-13,-19,-1,-14,0,-1,-14,-9,-12,-17,-2,0,2,-21,-11,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-8,-2,-28,0,22,-23,-19,-2,-15,3,-10,-5,-4,-11,18,2,-5,-9,-18,-23,-10,19;
MA   /M: SY='E'; M=-4,3,-25,5,12,-24,-15,-2,-17,1,-13,-8,0,-12,12,1,-1,-7,-17,-26,-12,12;
MA   /M: SY='E'; M=1,-1,-24,-2,11,-24,-15,-5,-19,8,-16,-9,0,-10,9,11,-1,-7,-17,-24,-15,9;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-22,-21,-23,-13,4,-26,-17,9,-19,28,11,-22,-25,-13,-12,-20,-8,4,-20,-3,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,-1,-25,-3,7,-24,-17,1,-16,6,-15,-7,2,-13,14,10,-1,-4,-16,-25,-11,9;
MA   /M: SY='E'; M=-5,2,-23,2,13,-23,-15,-4,-22,8,-17,-12,2,-11,9,12,-2,-5,-19,-25,-14,10;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2018_10,558681;
NR   /TOTAL=139(112); /POSITIVE=139(112); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=107; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann;
CC   /TAXO-RANGE=A?EP?; /MAX-REPEAT=4;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=PAC;
CC   /VERSION=5;
DR   P58363    , ARCB_ECO57 , T; P0AEC3    , ARCB_ECOLI , T;
DR   P0AEC4    , ARCB_SHIFL , T; Q06067    , ATOS_ECOLI , T;
DR   Q9HPU8    , BAT_HALSA  , T; Q9I3S1    , BDLA_PSEAE , T;
DR   P26762    , BVGS_BORBR , T; P40330    , BVGS_BORPA , T;
DR   P16575    , BVGS_BORPE , T; P35841    , DCRA_DESVH , T;
DR   P37739    , DCTS_RHOCA , T; P38097    , DGCE_ECOLI , T;
DR   Q8X8Q3    , DGCM_ECO57 , T; P77302    , DGCM_ECOLI , T;
DR   Q54SP4    , DHKD_DICDI , T; Q551X9    , DHKF_DICDI , T;
DR   Q86AT9    , DHKI_DICDI , T; P76129    , DOSP_ECOLI , T;
DR   E5KK10    , FILI_METH6 , T; P26489    , FIXL_AZOC5 , T;
DR   P23222    , FIXL_BRADU , T; P10955    , FIXL_RHIME , T;
DR   Q02280    , KCNAE_DROME, T; O18965    , KCNH1_BOVIN, T;
DR   O95259    , KCNH1_HUMAN, T; Q60603    , KCNH1_MOUSE, T;
DR   Q63472    , KCNH1_RAT  , T; Q9TSZ3    , KCNH2_CANLF, T;
DR   Q12809    , KCNH2_HUMAN, T; O35219    , KCNH2_MOUSE, T;
DR   Q8WNY2    , KCNH2_RABIT, T; O08962    , KCNH2_RAT  , T;
DR   Q9ULD8    , KCNH3_HUMAN, T; Q9WVJ0    , KCNH3_MOUSE, T;
DR   O89047    , KCNH3_RAT  , T; Q9UQ05    , KCNH4_HUMAN, T;
DR   Q9R1T9    , KCNH4_RAT  , T; Q8NCM2    , KCNH5_HUMAN, T;
DR   Q920E3    , KCNH5_MOUSE, T; Q9EPI9    , KCNH5_RAT  , T;
DR   Q96L42    , KCNH8_HUMAN, T; P59111    , KCNH8_MOUSE, T;
DR   Q9QWS8    , KCNH8_RAT  , T; P39764    , KINC_BACSU , T;
DR   B2SB67    , LOVHK_BRUA1, T; Q2YKK7    , LOVHK_BRUA2, T;
DR   Q577Y7    , LOVHK_BRUAB, T; A9MBM8    , LOVHK_BRUC2, T;
DR   Q8YC53    , LOVHK_BRUME, T; A5VUS1    , LOVHK_BRUO2, T;
DR   A9WYQ7    , LOVHK_BRUSI, T; Q8FW73    , LOVHK_BRUSU, T;
DR   A6X554    , LOVHK_OCHA4, T; Q48IV1    , LOVHK_PSE14, T;
DR   Q881J7    , LOVHK_PSESM, T; Q4ZSY3    , LOVHK_PSEU2, T;
DR   Q1M667    , LOVHK_RHIL3, T; Q2NCA3    , LVHK1_ERYLH, T;
DR   Q2NB77    , LVHK2_ERYLH, T; Q2NB98    , LVHTH_ERYLH, T;
DR   Q9P7Q7    , MAK1_SCHPO , T; O74539    , MAK3_SCHPO , T;
DR   Q8THF6    , MSMS_METAC , T; P30663    , NIFL_AZOVI , T;
DR   P56267    , NIFL_KLEOX , T; P06772    , NIFL_KLEPN , T;
DR   P15939    , NODV_BRADU , T; O48963    , PHOT1_ARATH, T;
DR   P93025    , PHOT2_ARATH, T; Q9ST27    , PHOT2_ORYSJ, T;
DR   O34627    , PHOT_BACSU , T; Q92DM1    , PHOT_LISIN , T;
DR   P58724    , PHOT_LISMO , T; Q2QYY8    , PHT1A_ORYSJ, T;
DR   Q2RBR1    , PHT1B_ORYSJ, T; P25848    , PHY1_CERPU , T;
DR   Q01549    , PHY1_SELMA , T; P33530    , PHYA1_TOBAC, T;
DR   P30733    , PHYA_SOLTU , T; P55004    , PHYE_IPONI , T;
DR   P33529    , PHY_MOUSC  , T; Q9P896    , TCSA_EMENI , T;
DR   O87939    , TDIS_THAAR , T; O64511    , TLOV1_ARATH, T;
DR   Q8KIY1    , TMOS_PSEME , T; A5W4E3    , TODS_PSEP1 , T;
DR   E0X9C7    , TODS_PSEPT , T; Q45614    , WALK_BACSU , T;
DR   A7WWQ7    , WALK_STAA1 , T; A6TXG9    , WALK_STAA2 , T;
DR   Q2FKN7    , WALK_STAA3 , T; Q2G2U4    , WALK_STAA8 , T;
DR   A5INR0    , WALK_STAA9 , T; Q2YUQ2    , WALK_STAAB , T;
DR   Q5HJX6    , WALK_STAAC , T; A6QD58    , WALK_STAAE , T;
DR   Q7A305    , WALK_STAAM , T; Q7A8E0    , WALK_STAAN , T;
DR   Q6GKS6    , WALK_STAAR , T; Q6GD71    , WALK_STAAS , T;
DR   A8YYU2    , WALK_STAAT , T; Q9RDT3    , WALK_STAAU , T;
DR   Q7A215    , WALK_STAAW , T; Q5HK19    , WALK_STAEQ , T;
DR   Q8CU87    , WALK_STAES , T; Q4LAJ8    , WALK_STAHJ , T;
DR   Q4A159    , WALK_STAS1 , T; Q52969    , Y1002_RHIME, T;
DR   P9WLZ6    , Y1364_MYCTO, T; P9WLZ7    , Y1364_MYCTU, T;
DR   Q04855    , Y3085_AZOC5, T; P55552    , Y4LL_SINFN , T;
DR   Q94BT6    , ADO1_ARATH , N; Q8W420    , ADO2_ARATH , N;
DR   Q9C9W9    , ADO3_ARATH , N; O02219    , AHA1_CAEEL , N;
DR   Q95LD9    , AHR_DELLE  , N; P35869    , AHR_HUMAN  , N;
DR   P30561    , AHR_MOUSE  , N; Q8R4S7    , AHR_MUSCR  , N;
DR   Q8R4S6    , AHR_MUSMC  , N; Q8R4S5    , AHR_MUSMM  , N;
DR   Q8R4S4    , AHR_MUSSI  , N; Q8R4S2    , AHR_MUSSP  , N;
DR   O02747    , AHR_RABIT  , N; P41738    , AHR_RAT    , N;
DR   Q9DG12    , ARNT2_DANRE, N; Q9HBZ2    , ARNT2_HUMAN, N;
DR   Q61324    , ARNT2_MOUSE, N; Q78E60    , ARNT2_RAT  , N;
DR   Q9BE97    , ARNT_BOVIN , N; O15945    , ARNT_DROME , N;
DR   P27540    , ARNT_HUMAN , N; P53762    , ARNT_MOUSE , N;
DR   P79832    , ARNT_ONCMY , N; O02748    , ARNT_RABIT , N;
DR   P41739    , ARNT_RAT   , N; Q9I8T7    , BMAL1_CHICK, N;
DR   A0MLS5    , BMAL1_HORSE, N; O00327    , BMAL1_HUMAN, N;
DR   O88529    , BMAL1_MESAU, N; Q9WTL8    , BMAL1_MOUSE, N;
DR   Q91YA9    , BMAL1_NANGA, N; Q5R4T2    , BMAL1_PONAB, N;
DR   Q9EPW1    , BMAL1_RAT  , N; Q6YGZ5    , BMAL1_TYTAL, N;
DR   Q8QGQ7    , BMAL2_CHICK, N; Q8WYA1    , BMAL2_HUMAN, N;
DR   Q2VPD4    , BMAL2_MOUSE, N; Q8QGQ6    , CLOCK_CHICK, N;
DR   O15516    , CLOCK_HUMAN, N; O08785    , CLOCK_MOUSE, N;
DR   Q91YB0    , CLOCK_NANGA, N; Q5RAK8    , CLOCK_PONAB, N;
DR   Q9WVS9    , CLOCK_RAT  , N; Q91YB2    , CLOCK_SPACA, N;
DR   Q91YA8    , CLOCK_SPAJD, N; Q6YGZ4    , CLOCK_TYTAL, N;
DR   O61734    , CYCL_DROME , N; Q54U87    , DHKA_DICDI , N;
DR   Q54RP6    , DHKL_DICDI , N; Q99814    , EPAS1_HUMAN, N;
DR   P97481    , EPAS1_MOUSE, N; Q9JHS1    , EPAS1_RAT  , N;
DR   Q0PGG7    , HIF1A_BOSMU, N; Q9XTA5    , HIF1A_BOVIN, N;
DR   Q9YIB9    , HIF1A_CHICK, N; Q309Z6    , HIF1A_EOSFB, N;
DR   Q16665    , HIF1A_HUMAN, N; Q61221    , HIF1A_MOUSE, N;
DR   Q98SW2    , HIF1A_ONCMY, N; O35800    , HIF1A_RAT  , N;
DR   Q9I8A9    , HIF1A_XENLA, N; G5EGD2    , HIF1_CAEEL , N;
DR   Q9PT84    , KCNH6_CHICK, N; Q9H252    , KCNH6_HUMAN, N;
DR   O54853    , KCNH6_RAT  , N; Q9NS40    , KCNH7_HUMAN, N;
DR   Q9ER47    , KCNH7_MOUSE, N; O54852    , KCNH7_RAT  , N;
DR   P16497    , KINA_BACSU , N; O34206    , KINB_PSEAI , N;
DR   Q99742    , NPAS1_HUMAN, N; P97459    , NPAS1_MOUSE, N;
DR   Q5ZQU2    , NPAS2_CHICK, N; Q99743    , NPAS2_HUMAN, N;
DR   P97460    , NPAS2_MOUSE, N; Q8IXF0    , NPAS3_HUMAN, N;
DR   Q9QZQ0    , NPAS3_MOUSE, N; Q8IUM7    , NPAS4_HUMAN, N;
DR   Q8BGD7    , NPAS4_MOUSE, N; Q8CJH6    , NPAS4_RAT  , N;
DR   Q1ECW2    , NPS4A_DANRE, N; O60658    , PDE8A_HUMAN, N;
DR   O88502    , PDE8A_MOUSE, N; O15534    , PER1_HUMAN , N;
DR   O35973    , PER1_MOUSE , N; Q8CHI5    , PER1_RAT   , N;
DR   Q8K3T3    , PER1_SPAJD , N; Q8QGQ8    , PER2_CHICK , N;
DR   O15055    , PER2_HUMAN , N; O54943    , PER2_MOUSE , N;
DR   Q9Z301    , PER2_RAT   , N; Q8K3T2    , PER2_SPAJD , N;
DR   P56645    , PER3_HUMAN , N; O70361    , PER3_MOUSE , N;
DR   Q8CJE2    , PER3_RAT   , N; P14712    , PHYA_ARATH , N;
DR   Q98SJ5    , SIM1A_DANRE, N; P81133    , SIM1_HUMAN , N;
DR   Q61045    , SIM1_MOUSE , N; A1YFY6    , SIM1_PANPA , N;
DR   A2T6X9    , SIM1_PANTR , N; Q14190    , SIM2_HUMAN , N;
DR   Q61079    , SIM2_MOUSE , N; Q24167    , SIMA_DROME , N;
DR   Q24119    , TRH_DROME  , N; A5A2P0    , WALK_STASR , N;
DR   Q01371    , WC1_NEUCR  , N;
3D   1BYW; 1DP6; 1DP8; 1DP9; 1DRM; 1LSV; 1LSW; 1LSX; 1LT0; 1XJ2; 1XJ3; 1Y28;
3D   2CMN; 2GJ3; 2L0W; 2L1M; 2L4R; 2MWG; 2OWH; 2OWJ; 2PR5; 2PR6; 2Z6C; 2Z6D;
3D   3K3C; 3K3D; 3KX0; 3P7N; 3T50; 4EEP; 4EER; 4EES; 4EET; 4EEU; 4GCZ; 4HHD;
3D   4HOI; 4HP9; 4HQA; 4LLO; 4MN5; 4MN6; 4NXB; 4NXE; 4NXF; 4NXG; 4R38; 4R3A;
3D   5HWT; 5HWV; 5HWW; 5J7E; 5K7L; 5VA1; 5VA2; 5VA3;
PR   PRU00141;
DO   PDOC50112;
//
DBGET integrated database retrieval system