GenomeNet

Database: PROSITE
Entry: PS50135
LinkDB: PS50135
Original site: PS50135 
ID   ZF_ZZ_2; MATRIX.
AC   PS50135;
DT   01-DEC-2001 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 13-NOV-2019 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger ZZ-type profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=48;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=44;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.4852999; R2=0.0112511; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1673.0373535; R2=5.6606874; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=624; H_SCORE=5205; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=446; H_SCORE=4198; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-14,-21,-16,-15,-1,-16,-19,0,-11,-4,1,-13,-12,-17,-14,-8,-4,5,-21,-7,-16;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-7,-25,-8,-5,-11,-11,25,-22,0,-19,-7,1,-18,-2,4,-3,-9,-16,-24,1,-5;
MA   /M: SY='H'; M=-16,-1,-30,-2,-1,-12,-18,29,-22,-2,-17,-4,2,-12,1,1,-11,-14,-23,-13,4,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-6,4,-25,4,5,-26,-3,0,-22,-1,-23,-13,6,-4,4,-5,3,-6,-20,-29,-17,4;
MA   /M: SY='V'; M=1,-20,-19,-26,-23,6,-25,-16,16,-18,4,4,-15,-24,-20,-19,-10,-5,17,-14,8,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-5,-14,-6,4,-21,-18,-4,-18,2,-18,-11,-3,-5,2,0,3,3,-14,-29,-13,2;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='B'; M=-3,33,-21,31,6,-27,-4,0,-26,-2,-27,-22,30,-14,-1,-8,9,-2,-24,-37,-20,2;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-3,-26,-4,-7,-18,8,-12,-16,-8,-17,-11,0,-17,-10,-12,-2,-9,-12,-21,-10,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=0,-4,-15,-4,-2,-16,10,-6,-18,4,-15,-8,0,-9,1,4,1,-5,-13,-13,-11,-1; D=-5;
MA   /I: DM=-25;
MA   /M: M=-2,-8,-5,-11,-4,-9,-9,-11,-8,-11,-4,-2,-6,-17,-5,-11,-3,-5,-6,-22,-11,-4; D=-5;
MA   /I: DM=-25;
MA   /M: M=-5,-5,-5,-5,-2,-17,-10,-14,-18,-2,-9,-9,-6,-17,-7,-3,-5,-2,-12,-25,-14,-5; D=-5;
MA   /I: DM=-25;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-13,-14,-11,-8,-18,-19,-9,-9,-10,-16,-9,-11,15,-10,-11,-4,-5,-7,-29,-16,-12; D=-5;
MA   /I: DM=-25;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-22,-22,-29,-22,11,-29,-13,19,-23,11,13,-15,-22,-18,-20,-12,-4,13,-18,4,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-16,-20,-21,-16,-8,-23,-18,14,-16,3,8,-12,-13,-11,-16,-5,0,13,-27,-10,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-9,-31,-8,-11,-29,50,-17,-37,-13,-29,-19,-2,-10,-14,-12,-2,-18,-29,-22,-28,-13;
MA   /M: SY='F'; M=-3,-15,-17,-20,-16,13,-19,-13,-3,-18,-3,-5,-9,-13,-19,-15,0,4,1,-19,-1,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-12,-28,-13,-4,-17,-21,-2,-21,23,-14,-3,-4,-21,6,56,-11,-9,-12,-21,-9,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-26,-29,-29,-25,38,-28,-2,-1,-17,0,-2,-24,-30,-21,-15,-22,-12,-6,39,53,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-5,-26,-5,1,-22,-19,9,-23,19,-21,-7,0,-16,8,25,-3,-4,-15,-24,-6,3;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-16,96,-24,-24,-20,-24,-26,-28,-26,-22,-20,-14,-34,-24,-26,-1,-4,-10,-48,-28,-24;
MA   /I: I=-6; MI=-10; IM=-10; DM=-15; MD=-15;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-7,-20,-10,-1,-14,-18,-10,-5,-6,0,-1,-5,-17,3,-6,-2,0,-6,-26,-11,1;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-15,-23,-16,-6,-14,-25,-13,3,-2,0,3,-12,-19,1,1,-8,-6,4,-24,-8,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-11,-16,92,-24,-24,-21,-28,-14,-30,-22,-21,-17,-15,-36,-23,-22,-10,-11,-13,-46,-23,-24;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-5,-27,0,10,-14,-18,-3,-19,-8,-19,-14,-6,14,-4,-12,-1,-6,-18,-27,-13,2;
MA   /M: SY='D'; M=-13,40,-24,41,13,-30,-6,4,-30,0,-29,-24,35,-14,1,-5,7,-4,-29,-39,-20,7;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-19,-29,-21,-19,32,-29,22,-3,-12,-1,0,-17,-29,-12,-10,-19,-11,-11,23,69,-19;
MA   /M: SY='D'; M=-17,36,-29,46,13,-35,-5,9,-35,-1,-28,-23,21,-13,5,-7,0,-10,-30,-36,-16,9;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-30,-22,-33,-23,7,-33,-23,28,-29,39,19,-27,-27,-21,-23,-26,-9,18,-21,-1,-23;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=1,1,-22,1,6,-19,-17,-9,-11,-5,-12,-8,-3,-12,6,-9,2,-1,-9,-25,-12,6;
MA   /M: SY='S'; M=-3,-3,-21,-5,-6,-19,-9,-15,-10,-5,-18,-11,0,-6,-7,-9,8,5,-6,-30,-16,-8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-14,-27,-14,1,25,-26,-1,-11,-6,-5,-6,-13,-20,-10,-7,-14,-10,-13,3,29,-5;
MA   /M: SY='N'; M=-3,0,-21,-5,-8,-7,-8,-11,-13,-11,-16,-13,7,-8,-10,-9,6,1,-12,-27,-12,-9;
MA   /M: SY='T'; M=2,-4,-19,-8,-4,-20,-9,-6,-17,2,-18,-9,-1,-13,0,-2,8,9,-8,-27,-12,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-6,-6,-27,-7,-5,-25,8,-2,-25,2,-22,-7,-2,-7,0,-2,-2,-7,-20,-24,-14,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-25,-8,-4,-15,-11,-6,-13,4,-12,-6,1,-18,2,7,-3,-6,-13,-21,-5,-2;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-3,-12,-5,-8,-3,3,-3,-7,-7,-8,-5,1,-12,-7,-7,-1,0,-6,-6,4,-8; D=-6;
MA   /I: DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=0,0,-18,-2,5,-17,-8,22,-19,-6,-14,-7,2,-10,2,-6,2,0,-15,-22,-4,2; D=-6;
MA   /I: DM=-29;
MA   /M: SY='H'; M=-12,2,-29,6,4,-24,-4,12,-29,2,-24,-14,2,-5,0,1,-4,-9,-25,-24,-7,0;
MA   /M: SY='E'; M=-8,6,-28,12,20,-29,-3,-8,-29,3,-24,-18,1,1,5,-5,1,-4,-25,-28,-20,12;
MA   /M: SY='H'; M=-17,0,-29,-2,1,-16,-21,63,-20,-8,-16,-1,8,-19,9,-3,-9,-15,-23,-24,16,1;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-2,-24,-3,9,-20,-19,6,-20,9,-14,-8,-1,-12,4,8,-2,1,-16,-26,-7,5;
MA   /M: SY='M'; M=-11,-20,-24,-24,-14,-7,-23,-9,8,-4,9,26,-18,-12,-5,1,-17,-9,4,-22,-6,-11;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-16,-22,-18,-7,2,-23,4,1,-15,9,7,-15,-20,-8,-13,-14,-10,-2,-17,6,-9;
MA   /M: SY='R'; M=-13,3,-28,5,4,-16,-19,7,-19,9,-14,-9,2,-17,2,10,-9,-10,-18,-19,3,1;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2019_10,561356;
NR   /TOTAL=101(92); /POSITIVE=101(92); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=3; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=3;
CC   /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=ZZ-type;
CC   /VERSION=5;
DR   Q59WH0    , ADA2_CANAL , T; Q9P7J7    , ADA2_SCHPO , T;
DR   Q02336    , ADA2_YEAST , T; Q9SRU2    , BIG_ARATH  , T;
DR   B9G2A8    , BIG_ORYSJ  , T; P34545    , CBP1_CAEEL , T;
DR   Q92793    , CBP_HUMAN  , T; P45481    , CBP_MOUSE  , T;
DR   Q6JHU9    , CBP_RAT    , T; Q9VDW6    , DMDA_DROME , T;
DR   Q9VDW3    , DMDB_DROME , T; Q0KI50    , DMDD_DROME , T;
DR   Q7YU29    , DMDE_DROME , T; Q9TW65    , DMD_CAEEL  , T;
DR   O97592    , DMD_CANLF  , T; P11533    , DMD_CHICK  , T;
DR   P11532    , DMD_HUMAN  , T; P11531    , DMD_MOUSE  , T;
DR   Q5GN48    , DMD_PIG    , T; P11530    , DMD_RAT    , T;
DR   Q13474    , DRP2_HUMAN , T; Q05AA6    , DRP2_MOUSE , T;
DR   Q9EPA0    , DRP2_RAT   , T; Q9Y048    , DTN1_CAEEL , T;
DR   Q9Y4J8    , DTNA_HUMAN , T; Q9D2N4    , DTNA_MOUSE , T;
DR   O60941    , DTNB_HUMAN , T; O70585    , DTNB_MOUSE , T;
DR   P84060    , DTNB_RAT   , T; A2CI97    , DYTN_DANRE , T;
DR   A2CJ06    , DYTN_HUMAN , T; A2CI98    , DYTN_MOUSE , T;
DR   Q09472    , EP300_HUMAN, T; B2RWS6    , EP300_MOUSE, T;
DR   Q9FWQ5    , HAC12_ARATH, T; Q9C5X9    , HAC1_ARATH , T;
DR   Q9FYH1    , HAC2_ARATH , T; Q9LG11    , HAC4_ARATH , T;
DR   Q9LE42    , HAC5_ARATH , T; Q6YXY2    , HACL1_ORYSJ, T;
DR   Q5Z8V7    , HACL2_ORYSJ, T; Q9XHY7    , HACL3_ORYSJ, T;
DR   O95714    , HERC2_HUMAN, T; Q4U2R1    , HERC2_MOUSE, T;
DR   M1BJF6    , JOKA2_SOLTU, T; Q1LZE1    , KCMF1_BOVIN, T;
DR   Q7T321    , KCMF1_DANRE, T; Q95RX5    , KCMF1_DROME, T;
DR   Q9P0J7    , KCMF1_HUMAN, T; Q80UY2    , KCMF1_MOUSE, T;
DR   Q6GPB6    , KCMF1_XENLA, T; Q804S5    , MIB1_DANRE , T;
DR   Q86YT6    , MIB1_HUMAN , T; Q80SY4    , MIB1_MOUSE , T;
DR   Q6GNY1    , MIB1_XENLA , T; Q5ZIJ9    , MIB2_CHICK , T;
DR   Q96AX9    , MIB2_HUMAN , T; Q8R516    , MIB2_MOUSE , T;
DR   Q68LP1    , MIB2_RAT   , T; Q9VUX2    , MIB_DROME  , T;
DR   Q9SB64    , NBR1_ARATH , T; Q14596    , NBR1_HUMAN , T;
DR   P97432    , NBR1_MOUSE , T; Q5RC94    , NBR1_PONAB , T;
DR   Q501R9    , NBR1_RAT   , T; Q8LBL5    , PRT1_ARATH , T;
DR   P14199    , REF2P_DROME, T; Q24629    , REF2P_DROSI, T;
DR   Q13501    , SQSTM_HUMAN, T; Q64337    , SQSTM_MOUSE, T;
DR   Q5RBA5    , SQSTM_PONAB, T; O08623    , SQSTM_RAT  , T;
DR   Q8VY05    , SWI3D_ARATH, T; Q9SFD5    , TAD2A_ARATH, T;
DR   Q9ATB4    , TAD2B_ARATH, T; Q503N9    , TAD2B_DANRE, T;
DR   Q8I8V0    , TAD2B_DROME, T; Q86TJ2    , TAD2B_HUMAN, T;
DR   Q5RBN9    , TAD2B_PONAB, T; Q6NRB5    , TAD2B_XENLA, T;
DR   Q75LL6    , TADA2_ORYSJ, T; P46939    , UTRO_HUMAN , T;
DR   O76695    , VER2_CAEEL , T; Q54QG5    , Y3893_DICDI, T;
DR   Q9P792    , YN8B_SCHPO , T; P34664    , YOY6_CAEEL , T;
DR   Q8NEG5    , ZSWM2_HUMAN, T; Q9D9X6    , ZSWM2_MOUSE, T;
DR   O43149    , ZZEF1_HUMAN, T; Q5SSH7    , ZZEF1_MOUSE, T;
DR   Q8IYH5    , ZZZ3_HUMAN , T; Q6KAQ7    , ZZZ3_MOUSE , T;
DR   P43609    , RSC8_YEAST , N; O14470    , SSR2_SCHPO , N;
DR   Q7KSD8    , TAD2A_DROME, N;
3D   1TOT; 2DIP; 2E5R; 2FC7; 2N1A; 4XI6; 4XI7; 4XIB; 5U7G; 5YP7; 5YP8; 5YPA;
3D   5YPB; 5YPC; 5YPE; 5YPF; 5YPG; 5YPH; 6CW2; 6CW3; 6DS6; 6E83; 6E86; 6MJ7;
PR   PRU00228;
DO   PDOC50135;
//
DBGET integrated database retrieval system