GenomeNet

Database: PROSITE
Entry: PS50271
LinkDB: PS50271
Original site: PS50271 
ID   ZF_UBP; MATRIX.
AC   PS50271;
DT   01-OCT-2005 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 10-APR-2019 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger UBP-type profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=62;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7795434; R2=0.0055944; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8770.0097656; R2=3.0890775; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1452; H_SCORE=13255; N_SCORE=9.9; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=844; H_SCORE=11377; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-16; D=-80; I=-80; B1=-200; E1=-200; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
MA   /I: B1=0; BI=-255; BD=-255;
MA   /M: SY='W'; M=-9,19,-44,-23,-29,-15,-23,-17,37,-9,2,-23,2,10,1,8,5,-14,90,-34;
MA   /M: SY='K'; M=-30,-21,-28,-26,-17,5,15,1,36,-7,-14,-20,-2,8,31,-26,-3,17,-52,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-29,143,-57,-58,-33,-37,-58,-54,-54,-46,-46,-32,-68,-61,-60,-29,-38,-31,-76,-57;
MA   /I: I=-22; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
MA   /M: SY='S'; M=-6,4,-10,22,-5,-13,14,-42,-10,-30,-3,-1,-20,0,-38,54,1,-3,-54,3;
MA   /M: SY='V'; M=-24,-50,27,28,-45,-16,-40,3,15,-23,6,2,-45,6,-13,4,11,29,-59,-27;
MA   /M: SY='C'; M=-35,133,-32,-41,-50,-24,-53,-53,-48,-48,-46,-38,-59,-52,-55,17,23,-42,-74,-55;
MA   /M: SY='D'; M=-29,-37,46,5,-18,30,9,-43,-12,20,-8,11,-48,33,-28,-8,-32,-44,-57,-40;
MA   /I: I=-18; MI=0; MD=-57; IM=0; DM=-57;
MA   /M: SY='S'; M=-22,-7,-20,13,-31,-9,11,-25,-5,-2,-10,18,-35,-32,-15,45,20,-15,22,-4; D=-18;
MA   /I: I=-18; DM=-57;
MA   /M: SY='W'; M=-27,14,-16,9,-22,-5,-7,-22,0,-17,-25,33,-13,-1,17,-4,35,-16,57,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-25,-38,3,35,-33,5,17,-5,-2,-12,-37,22,-5,-3,-11,9,16,3,-59,-42;
MA   /M: SY='N'; M=-16,-50,24,13,-54,-14,48,-54,-20,-39,-23,72,-2,2,5,21,-23,-52,-66,-43;
MA   /M: SY='L'; M=-39,-47,-51,-51,-28,-56,-47,37,-49,50,5,21,-21,-46,-51,-15,0,32,-56,-36;
MA   /M: SY='W'; M=-49,-65,-36,-51,18,-53,-3,-32,-43,-14,20,-56,-57,-43,-1,-32,-51,-47,140,68;
MA   /M: SY='C'; M=21,41,-56,-50,-31,-52,-50,33,-48,37,36,-49,-54,-45,-19,-15,-18,27,-55,-38;
MA   /M: SY='C'; M=-39,143,-52,-56,-50,-51,-54,-56,-51,-48,-47,19,-68,-58,-58,-40,-38,-45,-79,-59;
MA   /M: SY='L'; M=-28,-21,-60,-53,-15,-61,-46,4,-52,74,23,-57,-59,-47,-26,-41,-22,-4,-50,-32;
MA   /M: SY='T'; M=-26,-27,5,6,-43,-18,14,24,-15,-31,-32,-32,-45,36,-39,11,44,25,-58,-14;
MA   /I: I=-22; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
MA   /M: SY='C'; M=-39,142,13,-51,-50,-53,-55,-57,-52,-48,-48,-41,-66,-58,-59,-30,-38,-45,-79,-59;
MA   /M: SY='G'; M=-27,-54,-19,-20,-23,77,-23,-39,-27,-48,-38,-7,17,-26,-30,6,-40,-32,-50,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-15,-21,-37,-27,16,-31,69,-31,33,-17,-3,20,-48,13,0,18,-27,-35,-9,26;
MA   /M: SY='Y'; M=-35,3,-53,-51,18,-57,12,34,-47,-11,-17,-32,-6,-32,-38,-11,-11,51,-40,56;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-50,-50,-53,53,58,-44,-35,-49,13,-10,-23,-53,-48,-51,-21,-32,-14,-38,22;
MA   /M: SY='C'; M=-38,136,-51,-34,-52,-38,-50,-55,-45,-47,-45,-41,-62,44,-50,-37,-14,-45,-72,-55;
MA   /M: SY='G'; M=-24,39,-23,-32,-21,75,-49,-16,-37,-45,-46,-31,-25,-44,-41,7,-5,-36,32,-47;
MA   /I: I=-13; MD=-40;
MA   /M: SY='R'; M=-48,-64,9,-5,-42,-16,-37,-52,3,-58,-49,-5,-55,-27,84,-33,-16,-57,-14,-29; D=-13;
MA   /I: I=-13; MD=-40;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-62,6,-11,-8,9,1,-54,-15,-53,-30,-8,-24,-27,-11,1,-13,-32,10,56; D=-13;
MA   /I: I=-13; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40;
MA   /M: SY='P'; M=-29,-34,-13,-15,-52,29,-16,-24,8,-49,-34,-27,47,12,-17,-43,-37,-7,-64,-44; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-40;
MA   /M: SY='N'; M=-22,-56,-20,5,-56,7,43,-59,6,-41,-48,62,-52,19,-9,11,-37,-53,-65,-14; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-40;
MA   /M: SY='S'; M=-8,-50,10,13,-56,37,-37,-54,11,-46,-28,13,-43,14,2,46,-5,-39,-58,-47;
MA   /M: SY='H'; M=-47,-59,-8,-20,-44,-49,132,-59,-36,-46,-16,-23,8,-27,-32,-37,-44,-46,-25,1;
MA   /I: I=-24; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77;
MA   /M: SY='A'; M=72,-21,-47,-40,-11,-11,-46,1,-40,-29,12,-40,-46,-21,-17,9,-31,-11,-52,-43;
MA   /M: SY='Y'; M=-35,-51,-33,-14,7,-46,16,4,1,35,-2,-28,-52,8,11,-20,16,-10,-42,44;
MA   /M: SY='W'; M=-6,-24,-3,33,-16,-27,-2,-16,34,-12,-5,-26,-29,21,9,0,1,-12,34,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-47,-59,-31,-31,-46,-49,139,-64,-36,-46,-32,-20,-48,-25,-30,-37,-46,-63,-81,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=29,-11,-45,-45,43,-4,27,-41,-43,-34,-36,-23,-51,-39,-44,35,-25,-31,31,64;
MA   /M: SY='Q'; M=-35,-31,-10,32,-21,-44,23,-5,24,5,-13,15,-46,37,26,-15,-25,-3,-55,-38;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-51,9,50,-38,-32,-13,-45,18,-9,0,10,-42,37,-23,17,1,-24,-57,-43;
MA   /I: I=-19; MI=0; MD=-61; IM=0; DM=-61;
MA   /M: SY='T'; M=-16,-46,6,20,-21,-43,-11,-34,17,-32,-14,5,-40,0,-26,22,67,-23,-60,-42;
MA   /M: SY='G'; M=-25,-18,14,-5,-55,40,13,-56,23,-33,-29,37,-46,27,13,18,-23,-52,-58,-45;
MA   /I: I=-24; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77;
MA   /M: SY='H'; M=-47,-59,-32,-32,-22,-49,135,-61,-36,-45,-31,-22,-49,-26,-19,-37,-46,-61,-68,23;
MA   /M: SY='P'; M=-24,49,-31,-38,-24,-31,55,-24,-36,-20,-6,6,72,-23,15,-22,-21,-42,56,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-36,-1,-61,-56,43,-61,-49,25,-53,38,11,-40,-59,-53,-53,-49,-36,50,-43,20;
MA   /M: SY='A'; M=49,7,-50,-46,40,6,-45,-11,-45,-34,-34,-42,-50,-44,-48,13,-18,21,-12,25;
MA   /M: SY='M'; M=-18,-48,-58,-29,-2,-60,-50,40,-49,34,58,-53,-54,-18,-33,-47,-36,47,-2,-32;
MA   /M: SY='N'; M=-37,-52,32,19,-51,-18,-1,-39,30,-29,-25,55,-45,15,-20,23,-18,-26,35,-42;
MA   /M: SY='L'; M=-29,14,-55,-51,21,-55,-8,8,-50,51,21,-35,-57,-37,-49,8,-24,6,-2,39;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-27,2,25,-52,25,0,-34,17,-29,-30,4,-31,8,15,23,11,-40,-56,-25;
MA   /M: SY='T'; M=-33,-5,27,-10,-49,-36,-11,-47,-14,-50,-44,33,10,-32,-4,29,68,-41,-63,-11;
MA   /M: SY='P'; M=-20,-12,-40,-9,-4,22,-6,19,-3,15,-7,-21,43,33,-41,-11,-38,-31,-12,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-16,-51,-2,13,-25,-30,-1,-45,23,-14,-6,-7,-21,24,29,18,25,-37,-49,24;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-29,-36,19,-31,-51,23,-13,15,2,-46,12,-46,-48,-16,14,46,-53,-34;
MA   /I: I=-15; MI=0; MD=-47; IM=0; DM=-47;
MA   /M: SY='W'; M=-50,2,-57,-54,31,-54,-14,-30,-45,-35,-35,-30,-60,-44,-31,-49,-49,-45,124,97;
MA   /M: SY='C'; M=-37,125,34,-31,-35,-49,-49,-19,-47,-45,-24,-1,-59,-49,-53,9,-34,-12,-73,-52;
MA   /M: SY='Y'; M=-49,-25,-53,-33,64,-58,-27,-17,-47,20,-24,-51,-60,1,-44,-47,-43,-33,-17,94;
MA   /M: SY='P'; M=19,-29,-4,1,-47,-27,-29,-1,-7,-10,24,-9,61,0,-9,2,-22,-3,-56,-35;
MA   /M: SY='C'; M=-31,119,16,30,-53,4,-20,-57,-41,-45,-48,-23,-26,-14,-48,-15,-11,-48,-69,-54;
MA   /M: SY='D'; M=-39,-56,72,40,-61,5,-31,-47,-2,-57,-31,34,-43,27,-6,-5,-35,-55,-65,-48;
MA   /M: SY='D'; M=-7,-27,66,25,-21,-25,-31,-48,-1,-36,-5,14,-46,-29,2,2,-22,-23,-51,37;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,12,-9,38,31,-52,-31,-2,-24,-17,35,-32,2,-6,-40,-21,-28,-28,-16,70;
MA   /M: SY='V'; M=-24,-47,-58,-44,1,-61,-55,36,-35,14,-8,-53,-56,-50,-18,-45,-17,70,-11,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-32,-26,10,4,6,-27,66,-4,-2,0,-33,2,-8,-18,-8,-3,0,-13,26,28;
MA   /M: SY='D'; M=-35,-54,62,4,-14,-39,28,-9,-31,5,-21,26,-18,-9,20,2,-28,-21,-61,-26;
MA   /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;
NR   /RELEASE=2019_03,559634;
NR   /TOTAL=77(76); /POSITIVE=77(76); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=2;
CC   /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=UBP-type;
CC   /VERSION=5;
DR   Q95QN6    , BRAP2_CAEEL, T; Q7Z569    , BRAP_HUMAN , T;
DR   Q99MP8    , BRAP_MOUSE , T; O13747    , EPT1_SCHPO , T;
DR   P38748    , ETP1_YEAST , T; Q20296    , HDA6_CAEEL , T;
DR   Q9UBN7    , HDAC6_HUMAN, T; Q9Z2V5    , HDAC6_MOUSE, T;
DR   Q9VVR1    , NOT_DROME  , T; P43589    , SAD1_YEAST , T;
DR   Q54QE6    , SIR2A_DICDI, T; Q53GS9    , SNUT2_HUMAN, T;
DR   Q3TIX9    , SNUT2_MOUSE, T; Q5R761    , SNUT2_PONAB, T;
DR   Q6GNI6    , UB22A_XENLA, T; Q6DCJ1    , UB22B_XENLA, T;
DR   Q9USR2    , UBP10_SCHPO, T; E1BMF7    , UBP13_BOVIN, T;
DR   E1BY77    , UBP13_CHICK, T; F1QFS9    , UBP13_DANRE, T;
DR   Q92995    , UBP13_HUMAN, T; Q5BKP2    , UBP13_MOUSE, T;
DR   F6V6I0    , UBP13_XENTR, T; Q8L6Y1    , UBP14_ARATH, T;
DR   Q11119    , UBP14_SCHPO, T; P38237    , UBP14_YEAST, T;
DR   Q08DA3    , UBP16_BOVIN, T; A8HAL1    , UBP16_DANRE, T;
DR   Q9Y5T5    , UBP16_HUMAN, T; Q4R6X7    , UBP16_MACFA, T;
DR   Q99LG0    , UBP16_MOUSE, T; Q2KJ09    , UBP16_RAT  , T;
DR   Q6PAW2    , UBP16_XENLA, T; Q0VA64    , UBP16_XENTR, T;
DR   Q9FPT5    , UBP1_ARATH , T; A7Z056    , UBP20_BOVIN, T;
DR   A5PN09    , UBP20_DANRE, T; Q9Y2K6    , UBP20_HUMAN, T;
DR   Q8C6M1    , UBP20_MOUSE, T; Q5R5Z6    , UBP20_PONAB, T;
DR   B1WBD7    , UBP20_XENLA, T; A0JM59    , UBP20_XENTR, T;
DR   Q9LEW0    , UBP22_ARATH, T; P0C8Z3    , UBP22_BOVIN, T;
DR   A6H8I0    , UBP22_DANRE, T; Q9UPT9    , UBP22_HUMAN, T;
DR   Q5DU02    , UBP22_MOUSE, T; Q8W4N3    , UBP2_ARATH , T;
DR   A6QNM7    , UBP33_BOVIN, T; A5PMR2    , UBP33_DANRE, T;
DR   Q8TEY7    , UBP33_HUMAN, T; Q8R5K2    , UBP33_MOUSE, T;
DR   Q5REG5    , UBP33_PONAB, T; Q28CN3    , UBP33_XENTR, T;
DR   Q9Y6I4    , UBP3_HUMAN , T; Q91W36    , UBP3_MOUSE , T;
DR   D2HBJ8    , UBP44_AILME, T; Q7ZUM8    , UBP44_DANRE, T;
DR   Q9H0E7    , UBP44_HUMAN, T; Q8C2S0    , UBP44_MOUSE, T;
DR   Q0V9G5    , UBP44_XENTR, T; Q70EL2    , UBP45_HUMAN, T;
DR   Q8K387    , UBP45_MOUSE, T; Q70CQ1    , UBP49_HUMAN, T;
DR   Q6P9L4    , UBP49_MOUSE, T; Q70EK9    , UBP51_HUMAN, T;
DR   B1AY15    , UBP51_MOUSE, T; P45974    , UBP5_HUMAN , T;
DR   P56399    , UBP5_MOUSE , T; Q5R407    , UBP5_PONAB , T;
DR   Q9P7S5    , UBP7_SCHPO , T; Q09738    , UBP8_SCHPO , T;
DR   P50102    , UBP8_YEAST , T; P54201    , UBPA_DICDI , T;
DR   Q6NTR6    , UP44A_XENLA, T; Q5XGZ2    , UP44B_XENLA, T;
3D   2G43; 2G45; 2I50; 2L80; 2UZG; 3C5K; 3GV4; 3IHP; 3JCR; 3M99; 3MHH; 3MHS;
3D   3PHD; 4FIP; 4FJC; 4FK5; 4MSX; 4WA6; 4ZUX; 5B8D; 5KH3; 5KH7; 5KH9; 5WBN;
3D   5WPB; 5Z4I; 6AH0; 6AQR; 6CE6; 6CE8; 6CEA; 6CEC; 6CED; 6CEE; 6CEF; 6DXH;
3D   6DXT; 6NFT;
PR   PRU00502;
DO   PDOC50271;
//
DBGET integrated database retrieval system