ID LYS_RICH; MATRIX.
AC PS50318;
DT 01-APR-2002 CREATED; 01-APR-2002 DATA UPDATE; 01-APR-2002 INFO UPDATE.
DE Lysine-rich region profile.
MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=2;
MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=2;
MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1803; R2=0.14343843; TEXT='NScore';
MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=52; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=38; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA /DEFAULT: SY_I='K'; I0=-1; M0=-1;
MA /M: SY='K'; M=-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,5,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1;
MA /I: MI=0; IM=0; I=-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,5,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1;
MA /M: SY='K'; M=-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,5,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1,-1;
CC /MATRIX_TYPE=composition;
CC /SCALING_DB=db_global;
CC /AUTHOR=P_Bucher;
CC /SKIP-FLAG=TRUE;
CC /FT_KEY=COMPBIAS; /FT_DESC=Lys-rich;
CC /VERSION=3;
PR PRU00012;
DO PDOC50099;
//