GenomeNet

Database: PROSITE
Entry: PS50865
LinkDB: PS50865
Original site: PS50865 
ID   ZF_MYND_2; MATRIX.
AC   PS50865;
DT   01-JAN-2003 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 10-APR-2019 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger MYND-type profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.2840000; R2=0.0086421; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1470.3616943; R2=3.8778980; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=835; H_SCORE=4708; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=604; H_SCORE=3813; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-11,99,-22,-25,-20,-25,-24,-28,-25,-22,-20,-8,-37,-25,-25,-7,-8,-13,-48,-28,-25;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-9,-24,-12,-11,-4,-17,0,-13,-8,-10,-8,-7,-20,-9,-4,-7,-3,-11,4,7,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-8,0,-23,-6,-7,-10,-11,-5,-9,-7,-13,-9,7,-20,-5,-8,-1,-2,-10,-15,-2,-6;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-5,-5,-26,-7,-12,-12,30,-15,-26,-17,-17,-14,2,-20,-16,-16,-2,-13,-22,-21,-18,-14;
MA   /M: SY='R'; M=-7,1,-8,-4,1,-22,-16,-8,-25,15,-23,-14,6,-16,1,18,0,0,-17,-29,-15,0;
MA   /M: SY='W'; M=-8,-10,-28,-8,5,-11,-12,-13,-21,-2,-18,-15,-9,-15,-2,-3,-2,-5,-19,9,-5,2;
MA   /M: SY='A'; M=17,-4,-11,-8,4,-23,-10,-12,-17,-1,-16,-10,-3,-7,1,-9,4,-4,-12,-26,-19,2;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='T'; M=1,-3,-18,-5,-2,-14,-9,-11,-8,-9,-7,-3,-2,-7,-5,-11,2,4,-7,-25,-13,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-6,-3,-18,-2,2,-4,-13,1,-14,2,-13,-8,-3,-6,-2,-2,-2,-4,-12,-12,3,0; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=3,-4,-14,-6,0,-13,-9,0,-9,7,-7,1,-4,-8,4,2,-4,-5,-7,-12,-5,2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-21;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-3,-24,-4,5,-21,-20,0,-22,18,-17,-8,-1,-13,4,18,-3,2,-15,-24,-8,3;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: I=-6; MD=-29;
MA   /M: SY='S'; M=3,-4,-16,-5,-1,-17,1,-10,-19,-4,-18,-13,2,-12,-2,1,16,6,-11,-28,-16,-2; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; MD=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-9,-24,-10,-4,-15,4,-9,-23,4,-15,-9,-4,-16,-1,14,-5,-10,-17,-17,-12,-4; D=-6;
MA   /I: I=-6; DM=-29;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-2,-31,-5,1,-21,-12,1,-25,16,-24,-10,4,-17,11,19,-8,-12,-25,-4,-3,5;
MA   /M: SY='R'; M=-10,1,-21,-4,-6,-8,-17,-6,-13,3,-15,-7,7,-19,-3,10,-1,1,-9,-25,-8,-4;
MA   /M: SY='A'; M=17,-11,-12,-16,-10,-12,-15,-21,-2,-12,-5,-5,-11,-15,-13,-16,8,15,9,-27,-14,-11;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-12,-27,-13,-5,-17,-16,0,-19,9,-18,-7,-8,-13,0,14,-8,-10,-14,-4,-5,-4;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='S'; M=6,1,-6,1,-3,-22,5,-12,-24,-12,-29,-21,8,-13,-4,-12,31,12,-13,-38,-22,-3;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-6,-25,-7,3,-24,-18,-10,-18,17,-20,-9,-3,-7,7,15,-1,-3,-12,-24,-13,4;
MA   /M: SY='E'; M=-6,2,-25,6,25,-13,-18,-7,-23,6,-18,-15,-1,-8,4,-1,1,-3,-19,-24,-11,15;
MA   /M: SY='C'; M=-12,-16,86,-23,-23,-20,-28,-1,-30,-26,-20,-16,-13,-36,-21,-23,-10,-12,-14,-46,-19,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='R'; M=-5,-10,-23,-11,-3,-18,-20,2,-12,7,-11,-2,-7,-18,6,11,-6,-5,-7,-21,-4,0;
MA   /M: SY='K'; M=0,-6,-22,-7,0,-19,-13,-13,-13,3,-8,-6,-5,-14,0,0,-2,-3,-9,-24,-12,-1;
MA   /M: SY='D'; M=-1,22,-24,27,10,-29,-10,16,-29,-4,-22,-18,11,-12,1,-9,1,-9,-22,-32,-12,4;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-5,-27,-3,4,-19,-15,-4,-17,2,-10,-7,-4,-5,2,4,-7,-8,-17,-26,-12,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='G'; M=-1,-5,-22,-7,-8,-15,4,-12,-17,-7,-12,-10,-3,-18,-10,-10,-1,-3,-12,-20,-8,-9;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-3,-29,-3,6,-27,-14,4,-29,28,-25,-9,1,-14,14,30,-5,-10,-22,-22,-9,8;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-3,-26,-3,1,-17,-20,9,-15,4,-12,-2,-2,-12,5,8,-7,-7,-13,-24,-3,1;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-8,-28,-9,11,-10,-22,-14,-9,-7,-10,-10,-9,-13,-3,-12,-7,-5,-11,1,-5,4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2019_03,559634;
NR   /TOTAL=98(98); /POSITIVE=97(97); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=1(1);
NR   /FALSE_NEG=10; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=window20;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /TAXO-RANGE=??E?V; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=MYND-type;
CC   /VERSION=6;
DR   A0A1C3NSL9, AJM1_CAEEL , T; Q9P2S6    , ANKY1_HUMAN, T;
DR   Q0VCS9    , ANKY2_BOVIN, T; Q5ZMD2    , ANKY2_CHICK, T;
DR   Q8IV38    , ANKY2_HUMAN, T; Q3TPE9    , ANKY2_MOUSE, T;
DR   Q8C0W1    , ANMY1_MOUSE, T; Q7XJS0    , ASHR1_ARATH, T;
DR   Q9N3Q8    , DAF25_CAEEL, T; Q24180    , DEAF1_DROME, T;
DR   O75398    , DEAF1_HUMAN, T; Q9Z1T5    , DEAF1_MOUSE, T;
DR   O77562    , DEAF1_PANTR, T; O88450    , DEAF1_RAT  , T;
DR   G5EBV0    , EGL9_CAEEL , T; Q9GZT9    , EGLN1_HUMAN, T;
DR   Q91YE3    , EGLN1_MOUSE, T; Q9FK27    , FB342_ARATH, T;
DR   Q55DW9    , GACZ_DICDI , T; Q4VC12    , MSS51_HUMAN, T;
DR   Q9D5Z5    , MSS51_MOUSE, T; D3ZKV9    , MSS51_RAT  , T;
DR   Q5F3B1    , MTG16_CHICK, T; O75081    , MTG16_HUMAN, T;
DR   O54972    , MTG16_MOUSE, T; O43439    , MTG8R_HUMAN, T;
DR   O70374    , MTG8R_MOUSE, T; Q9IAB2    , MTG8R_XENLA, T;
DR   Q06455    , MTG8_HUMAN , T; Q61909    , MTG8_MOUSE , T;
DR   A1CBG9    , MUB1_ASPCL , T; B0Y1D1    , MUB1_ASPFC , T;
DR   B8NKS1    , MUB1_ASPFN , T; Q4WVI6    , MUB1_ASPFU , T;
DR   A2RA63    , MUB1_ASPNC , T; Q2U685    , MUB1_ASPOR , T;
DR   Q0CW83    , MUB1_ASPTN , T; O42631    , MUB1_EMENI , T;
DR   A1DDX0    , MUB1_NEOFI , T; P87311    , MUB1_SCHPO , T;
DR   Q03162    , MUB1_YEAST , T; Q2YDC9    , PDCD2_BOVIN, T;
DR   Q16342    , PDCD2_HUMAN, T; P46718    , PDCD2_MOUSE, T;
DR   P47816    , PDCD2_RAT  , T; Q9ULU4    , PKCB1_HUMAN, T;
DR   Q09415    , SET14_CAEEL, T; O94256    , SET6_SCHPO , T;
DR   Q5BJI7    , SMY2A_DANRE, T; Q7ZXV5    , SMY2A_XENLA, T;
DR   Q5RGL7    , SMY2B_DANRE, T; Q6GN68    , SMY2B_XENLA, T;
DR   Q8NB12    , SMYD1_HUMAN, T; P97443    , SMYD1_MOUSE, T;
DR   Q0P585    , SMYD2_BOVIN, T; E1C5V0    , SMYD2_CHICK, T;
DR   Q9NRG4    , SMYD2_HUMAN, T; Q8R5A0    , SMYD2_MOUSE, T;
DR   C3RZA1    , SMYD2_PIG  , T; Q7M6Z3    , SMYD2_RAT  , T;
DR   Q9H7B4    , SMYD3_HUMAN, T; Q9CWR2    , SMYD3_MOUSE, T;
DR   Q5F3V0    , SMYD4_CHICK, T; Q8IYR2    , SMYD4_HUMAN, T;
DR   Q8BTK5    , SMYD4_MOUSE, T; Q5R5X9    , SMYD4_PONAB, T;
DR   Q58EK5    , TDRD1_DANRE, T; Q9BXT4    , TDRD1_HUMAN, T;
DR   Q99MV1    , TDRD1_MOUSE, T; A9CPT4    , TDRD1_ORYLA, T;
DR   Q9FPS9    , UBP15_ARATH, T; Q9SB51    , UBP16_ARATH, T;
DR   Q9FKP5    , UBP17_ARATH, T; Q67XW5    , UBP18_ARATH, T;
DR   Q9SJA1    , UBP19_ARATH, T; O94966    , UBP19_HUMAN, T;
DR   Q3UJD6    , UBP19_MOUSE, T; Q6J1Y9    , UBP19_RAT  , T;
DR   Q54DL6    , Y2140_DICDI, T; Q54D67    , Y2454_DICDI, T;
DR   Q54Q80    , Y4059_DICDI, T; Q54ZX8    , Y7331_DICDI, T;
DR   Q5UQS2    , YR331_MIMIV, T; F1QN74    , ZMY10_DANRE, T;
DR   Q9VU41    , ZMY10_DROME, T; O75800    , ZMY10_HUMAN, T;
DR   Q99ML0    , ZMY10_MOUSE, T; Q6AXZ5    , ZMY10_RAT  , T;
DR   Q5FWU8    , ZMY10_XENLA, T; Q15326    , ZMY11_HUMAN, T;
DR   Q8R5C8    , ZMY11_MOUSE, T; Q9H0C1    , ZMY12_HUMAN, T;
DR   Q9H091    , ZMY15_HUMAN, T; Q8C0R7    , ZMY15_MOUSE, T;
DR   Q96E35    , ZMY19_HUMAN, T; Q9CQG3    , ZMY19_MOUSE, T;
DR   Q7TSV3    , ZMY19_RAT  , T;
DR   Q5PP37    , ATXR2_ARATH, N; Q9SRU2    , BIG_ARATH  , N;
DR   B9G2A8    , BIG_ORYSJ  , N; Q5ZIZ2    , SMYD5_CHICK, N;
DR   Q6GMV2    , SMYD5_HUMAN, N; Q3TYX3    , SMYD5_MOUSE, N;
DR   Q6GPQ4    , SMYD5_XENLA, N; Q557F7    , Y3589_DICDI, N;
DR   Q557F6    , Y3591_DICDI, N; Q54IV4    , Y8495_DICDI, N;
DR   Q9FYF9    , FB76_ARATH , F;
3D   2D8Q; 2DAN; 2DJ8; 2JW6; 2OD1; 2ODD; 3MEK; 3N71; 3OXF; 3OXG; 3OXL; 3PDN;
3D   3QWP; 3QWV; 3QWW; 3RIB; 3RU0; 3S7B; 3S7D; 3S7F; 3S7J; 3TG4; 3TG5; 4A24;
3D   4O6F; 4WUY; 4YND; 5ARF; 5ARG; 5CCL; 5CCM; 5EX0; 5EX3; 5HDA; 5HI7; 5HQ8;
3D   5KJK; 5KJL; 5KJM; 5KJN; 5MQ4; 5V37; 5V3H; 5WCG; 5XXD; 5XXG; 5XXJ; 5YJO;
3D   6CBX; 6CBY; 6MON;
PR   PRU00134;
DO   PDOC50865;
//
DBGET integrated database retrieval system