ID RUBREDOXIN_LIKE; MATRIX.
AC PS50903;
DT 01-MAR-2003 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 25-MAY-2022 INFO UPDATE.
DE Rubredoxin-like domain profile.
MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=51;
MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=46;
MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8945000; R2=0.0087416; TEXT='NScore';
MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2623.0000000; R2=3.5000000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=699; H_SCORE=5070; N_SCORE=8.0; MODE=1; TEXT='!';
MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=527; H_SCORE=4468; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-60; B1=-60; E0=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA /M: SY='M'; M=-7,-6,-23,-7,-5,-12,-13,-6,-4,-7,-1,15,-10,-12,-3,-10,-8,-5,-5,-23,-6,-5;
MA /M: SY='P'; M=-1,-4,-27,-4,2,-28,-5,-11,-22,5,-23,-13,-3,7,3,-1,-2,-7,-20,-25,-19,2;
MA /M: SY='K'; M=-7,-9,-27,-11,-5,-9,-21,-11,-10,5,-9,-5,-7,-18,-5,5,-11,-7,-9,-8,0,-6;
MA /M: SY='Y'; M=-19,-24,-32,-27,-22,23,-25,7,-4,-15,-2,4,-22,-28,-13,-13,-24,-16,-12,43,45,-18;
MA /M: SY='E'; M=-9,-10,-25,-9,8,-18,-24,-10,-4,4,-6,0,-10,-15,5,4,-9,-8,-1,-25,-11,6;
MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA /M: SY='R'; M=-7,-1,-24,-1,4,-21,-15,-8,-22,8,-20,-14,2,0,1,14,3,3,-18,-28,-16,1;
MA /M: SY='I'; M=-2,-15,-21,-19,-17,-8,-24,-20,14,-15,4,4,-11,-21,-13,-16,-9,-5,14,-20,-8,-16;
MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA /M: SY='G'; M=-4,-6,-31,-6,-15,-27,49,-17,-36,-16,-29,-19,0,-20,-13,-17,-3,-19,-30,-7,-22,-14;
MA /M: SY='Y'; M=-17,-17,-29,-19,-17,23,-26,10,-6,-12,-5,-5,-15,-27,-11,-11,-16,-8,-13,28,53,-16;
MA /M: SY='I'; M=-5,-21,-24,-25,-17,-8,-27,-25,22,-18,5,6,-17,-14,-16,-20,-10,-3,18,-24,-8,-19;
MA /M: SY='Y'; M=-19,-18,-28,-20,-18,27,-28,25,-3,-13,-1,2,-15,-28,-11,-10,-18,-11,-9,14,58,-18;
MA /M: SY='D'; M=-14,22,-28,30,21,-28,-16,2,-26,2,-20,-18,11,-10,4,-3,-2,-6,-23,-33,-15,12;
MA /M: SY='P'; M=-4,-7,-32,-1,8,-29,5,-15,-28,-8,-27,-20,-7,29,-5,-15,-2,-11,-28,-28,-27,-1;
MA /M: SY='E'; M=9,1,-21,3,20,-25,-11,-9,-22,4,-20,-16,-2,-4,5,-3,7,-1,-17,-28,-19,12;
MA /I: I=-2; MD=-11;
MA /M: SY='K'; M=5,-6,-19,-8,2,-19,-12,-13,-12,7,-12,-7,-7,-12,-1,-1,-1,-2,-5,-22,-13,1; D=-2;
MA /I: I=-2; MD=-11;
MA /M: SY='G'; M=1,-9,-21,-8,-12,-25,26,-14,-26,-15,-22,-15,-5,1,-14,-17,-2,-13,-19,-23,-23,-14; D=-2;
MA /I: I=-2; MD=-11;
MA /M: SY='D'; M=-8,9,-29,18,10,-28,-4,-10,-27,-5,-25,-21,0,14,-4,-12,-2,-10,-25,-21,-19,2; D=-2;
MA /I: I=-2; MD=-11;
MA /M: SY='P'; M=0,-3,-24,1,18,-24,-13,-9,-19,3,-19,-14,-6,20,5,-5,0,-6,-20,-23,-18,10; D=-2;
MA /I: I=-2; MD=-11;
MA /M: SY='R'; M=-8,1,-15,2,1,-5,-11,-5,-11,4,-9,-4,-1,-10,-2,5,-4,-4,-7,-13,-4,0; D=-2;
MA /I: I=-2; MD=-11;
MA /M: SY='B'; M=-2,2,-12,1,1,-11,-1,-4,-12,-1,-10,-7,2,-7,1,-1,2,2,-9,-12,-5,1; D=-2;
MA /I: I=-2; MD=-11;
MA /M: SY='G'; M=-3,1,-16,4,1,-17,11,-6,-17,-5,-15,-10,0,2,-2,-7,1,-6,-15,-14,-13,-1; D=-2;
MA /I: I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
MA /M: SY='P'; M=-1,-4,-15,0,2,-13,-8,-8,-10,-5,-10,-9,-5,19,-3,-8,0,-3,-11,-16,-12,-2; D=-2;
MA /I: I=-2; DM=-11;
MA /M: SY='P'; M=-3,-9,-19,-5,1,-16,-10,-9,-10,-4,-14,-9,-9,38,-1,-9,-4,-5,-15,-15,-14,-3; D=-2;
MA /I: I=-2; DM=-11;
MA /M: SY='G'; M=-1,-1,-17,0,-8,-17,33,-9,-22,-9,-17,-12,3,-11,-9,-10,0,-10,-17,-13,-16,-9; D=-2;
MA /I: I=-2; DM=-11;
MA /M: SY='T'; M=-1,-3,-8,-8,-8,-3,-8,-12,-6,-8,-6,-5,-2,-8,-8,-7,8,22,0,-16,-6,-8; D=-2;
MA /I: I=-2; DM=-11;
MA /M: SY='P'; M=2,-9,-19,-7,0,-17,-9,-10,-11,-2,-15,-9,-8,29,-2,-5,-3,-5,-13,-16,-14,-3; D=-2;
MA /I: I=-2; DM=-11;
MA /M: SY='F'; M=-13,-21,-18,-26,-20,41,-18,-15,-3,-18,2,-3,-16,-20,-23,-13,-16,-10,-5,29,20,-18; D=-2;
MA /I: I=-2; DM=-11;
MA /M: SY='D'; M=-6,13,-15,20,15,-19,-9,-3,-17,0,-15,-14,5,-5,2,-5,5,0,-12,-23,-12,9; D=-2;
MA /I: I=-2; DM=-11;
MA /M: SY='D'; M=-1,11,-15,14,7,-20,-3,-4,-18,2,-17,-13,7,-7,2,-3,5,-3,-14,-21,-12,5; D=-2;
MA /I: I=-2; DM=-11;
MA /M: SY='L'; M=-5,-20,-13,-21,-15,4,-21,-15,17,-18,25,12,-19,-19,-14,-14,-16,-5,13,-14,-1,-15; D=-2;
MA /I: I=-2; DM=-11;
MA /M: SY='P'; M=-5,-11,-23,-6,0,-19,-11,-12,-13,-7,-20,-13,-10,49,-6,-12,-2,-4,-18,-21,-19,-6; D=-2;
MA /I: I=-2; DM=-11;
MA /M: SY='D'; M=-8,20,-20,29,19,-23,-10,-2,-22,0,-14,-16,6,-6,3,-6,-1,-6,-18,-24,-13,11; D=-2;
MA /I: I=-2; DM=-11;
MA /M: SY='D'; M=-7,21,-16,22,4,-15,-6,3,-19,-3,-17,-14,17,-10,-2,-5,3,-2,-17,-24,-10,1; D=-2;
MA /I: I=-2; DM=-11;
MA /M: SY='W'; M=-13,-24,-30,-24,-16,13,-15,-17,-12,-13,-10,-11,-23,-20,-14,-13,-23,-17,-17,77,21,-12; D=-2;
MA /I: I=-2; DM=-11;
MA /M: SY='R'; M=-8,-13,-7,-14,-7,-9,-20,-6,-11,1,-6,-2,-9,-20,-5,11,-8,-6,-4,-22,-8,-8; D=-2;
MA /I: I=-2; DM=-11;
MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA /M: SY='V'; M=-3,-6,-19,-8,-9,-10,-20,-15,4,-13,2,-1,-6,-20,-12,-12,-5,-2,6,-29,-11,-11;
MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA /M: SY='G'; M=0,0,-25,-1,-11,-23,33,-14,-31,-11,-26,-18,6,-17,-12,-11,4,-11,-24,-24,-22,-11;
MA /M: SY='A'; M=23,-11,-14,-15,-7,-16,-10,-9,-8,-9,-7,-6,-9,-14,-8,-12,5,0,1,-25,-14,-8;
MA /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA /M: SY='P'; M=-3,-7,-32,-1,1,-30,-1,-16,-26,-4,-28,-19,-8,37,-7,-13,-3,-10,-26,-28,-26,-5;
MA /M: SY='K'; M=-9,-3,-20,-4,6,-28,-20,-9,-29,39,-27,-10,-1,-13,9,29,-9,-10,-19,-22,-11,7;
MA /M: SY='D'; M=-2,12,-20,14,10,-24,-12,-8,-22,2,-21,-17,8,-11,0,-3,9,6,-14,-32,-17,5;
MA /M: SY='Y'; M=-10,-1,-25,1,1,-8,-20,2,-15,-1,-13,-6,-4,-17,4,-2,-5,-5,-13,-15,7,2;
MA /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-39,-29,77,-30,-18,0,-29,9,0,-20,-30,-38,-19,-20,-10,-1,11,33,-29;
MA /M: SY='E'; M=-8,-6,-23,-5,7,-13,-24,-14,-6,0,-8,-6,-8,-14,-4,-3,-5,-1,-2,-26,-10,1;
MA /M: M=-1,-12,-21,-11,0,-16,-19,-14,-7,-2,-8,-4,-12,-5,-5,-1,-3,-3,-1,-27,-14,-4;
MA /M: SY='V'; M=-5,-19,-20,-20,-14,-1,-26,-14,9,-11,4,4,-17,-22,-10,-12,-9,-3,11,-17,5,-13;
MA /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR /RELEASE=2022_02,567483;
NR /TOTAL=97(94); /POSITIVE=97(94); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC /SCALING_DB=reversed;
CC /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC /TAXO-RANGE=A??P?; /MAX-REPEAT=2;
CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Rubredoxin-like;
CC /VERSION=5;
DR Q9FDN6 , HRB_MOOTA , T; Q03009 , HUPJ_RHOCA , T;
DR P30820 , NIGY_DESVH , T; A0KEJ1 , NORV_AERHH , T;
DR A4STH4 , NORV_AERS4 , T; Q5E3W9 , NORV_ALIF1 , T;
DR B6EIL4 , NORV_ALISL , T; A8ANR7 , NORV_CITK8 , T;
DR A7ZQD9 , NORV_ECO24 , T; Q8X852 , NORV_ECO57 , T;
DR B1XCN7 , NORV_ECODH , T; A8A3I7 , NORV_ECOHS , T;
DR A1AEQ0 , NORV_ECOK1 , T; Q0TEH0 , NORV_ECOL5 , T;
DR P59404 , NORV_ECOL6 , T; B1IUW9 , NORV_ECOLC , T;
DR Q46877 , NORV_ECOLI , T; B1LQ28 , NORV_ECOSM , T;
DR Q1R7Z0 , NORV_ECOUT , T; A4WDR6 , NORV_ENT38 , T;
DR A6TCX5 , NORV_KLEP7 , T; Q6D8S0 , NORV_PECAS , T;
DR C6D9Q2 , NORV_PECCP , T; A9MFX6 , NORV_SALAR , T;
DR Q57KT3 , NORV_SALCH , T; Q5PF19 , NORV_SALPA , T;
DR A9N0D9 , NORV_SALPB , T; Q8Z4C5 , NORV_SALTI , T;
DR Q8ZMJ7 , NORV_SALTY , T; A8GG94 , NORV_SERP5 , T;
DR Q31X74 , NORV_SHIBS , T; Q32CL8 , NORV_SHIDS , T;
DR Q0T1D5 , NORV_SHIF8 , T; P59405 , NORV_SHIFL , T;
DR Q3YYF4 , NORV_SHISS , T; Q8D4F8 , NORV_VIBVU , T;
DR Q7MFY8 , NORV_VIBVY , T; Q97D82 , RRBR1_CLOAB, T;
DR Q97D83 , RRBR2_CLOAB, T; Q50533 , RUBH_METTH , T;
DR P48344 , RUBL_BRADU , T; P28151 , RUBL_RHILV , T;
DR Q0VTA9 , RUBR1_ALCBS, T; P58992 , RUBR1_CHLTE, T;
DR Q8XMB2 , RUBR1_CLOPE, T; P04170 , RUBR1_DESDA, T;
DR Q58145 , RUBR1_METJA, T; Q9HTK7 , RUBR1_PSEAE, T;
DR P12692 , RUBR1_PSEOL, T; Q9WWW4 , RUBR1_PSEPU, T;
DR Q0VKZ2 , RUBR2_ALCBS, T; P58993 , RUBR2_CHLTE, T;
DR P14072 , RUBR2_CLOPE, T; Q93PP8 , RUBR2_DESDA, T;
DR Q58150 , RUBR2_METJA, T; Q9HTK8 , RUBR2_PSEAE, T;
DR P00272 , RUBR2_PSEOL, T; Q9WWW5 , RUBR2_PSEPU, T;
DR Q9AE63 , RUBR2_RHOER, T; P58025 , RUBR3_CHLTE, T;
DR P0A4E8 , RUBR3_RHOER, T; P0A4E9 , RUBR3_RHOSQ, T;
DR P0A4F0 , RUBR4_RHOER, T; P0A4F1 , RUBR4_RHOSQ, T;
DR P23474 , RUBR_ACESD , T; P42453 , RUBR_ACIAD , T;
DR P48343 , RUBR_AZOCH , T; P30778 , RUBR_AZOVI , T;
DR P14071 , RUBR_BUTME , T; P09947 , RUBR_CHLTI , T;
DR Q9AL94 , RUBR_CLOAB , T; P00268 , RUBR_CLOPA , T;
DR P31912 , RUBR_CUPNH , T; P00269 , RUBR_DESVH , T;
DR P15412 , RUBR_DESVM , T; P56263 , RUBR_HELMO , T;
DR P00271 , RUBR_MEGEL , T; P00270 , RUBR_MEGGA , T;
DR O26258 , RUBR_METTH , T; Q9WWN1 , RUBR_NOSS1 , T;
DR P00267 , RUBR_PEPAS , T; Q9V099 , RUBR_PYRAB , T;
DR P24297 , RUBR_PYRFU , T; P73068 , RUBR_SYNY3 , T;
DR P19500 , RUBR_THETC , T; O83956 , RUBR_TREPA , T;
DR Q9XBL8 , RUBR_TRIV2 , T; Q97FZ9 , RUBY1_CLOAB, T;
DR Q97ET8 , RUBY2_CLOAB, T; P51591 , RUBY_CLOPE , T;
DR P24931 , RUBY_DESVH , T; Q58144 , RUBY_METJA , T;
DR Q9AGG3 , RUBY_PORGI , T; Q58147 , Y737_METJA , T;
3D 1B13; 1B2J; 1B2O; 1B71; 1BE7; 1BFY; 1BQ8; 1BQ9; 1BRF; 1C09; 1CAA; 1CAD;
3D 1DVB; 1E8J; 1FHH; 1FHM; 1IRN; 1IRO; 1IU5; 1IU6; 1JYB; 1LKM; 1LKO; 1LKP;
3D 1QCV; 1QYB; 1R0F; 1R0G; 1R0H; 1R0I; 1R0J; 1RB9; 1RDG; 1RDV; 1RWD; 1RYT;
3D 1S24; 1S2Z; 1S30; 1SMM; 1SMU; 1SMW; 1SPW; 1T9O; 1T9P; 1T9Q; 1VCX; 1YK4;
3D 1YK5; 1YUX; 1YUZ; 1YV1; 1ZRP; 2DSX; 2KKD; 2MS3; 2PVE; 2PVX; 2PYA; 2QL0;
3D 2RDV; 2V3B; 3KYU; 3KYV; 3KYW; 3KYX; 3KYY; 3RYG; 3RZ6; 3RZT; 3SS2; 4AR3;
3D 4AR4; 4AR5; 4AR6; 4D02; 4K9F; 4MBS; 4RXN; 4XNV; 4XNW; 5AI2; 5AI3; 5LLD;
3D 5LMC; 5NW3; 5OME; 5RXN; 5UIW; 5VBL; 6AKX; 6AKY; 6BD4; 6GPS; 6GPX; 6IIU;
3D 6IIV; 6KNM; 6LI2; 6LN2; 6ME6; 6ME7; 6ME8; 6ME9; 6NW0; 6NW1; 6RXN; 7F1T;
3D 7RXN; 8RXN;
PR PRU00241; PRU00299;
DO PDOC50903;
//
