GenomeNet

Database: PROSITE
Entry: PS50919
LinkDB: PS50919
Original site: PS50919 
ID   MIR; MATRIX.
AC   PS50919;
DT   01-AUG-2003 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 20-JUN-2018 INFO UPDATE.
DE   MIR domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4597137; R2=0.0244729; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=247; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=96; N_SCORE=4.8; MODE=1; TEXT='RR';
MA   /DEFAULT: B0=-30; E0=-30; M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-4,-26,-3,-5,-24,17,-9,-26,-11,-22,-15,0,-5,-8,-12,-1,-10,-22,-26,-21,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-4,1,-23,2,4,-24,-2,-8,-23,-1,-21,-14,2,-8,0,-1,3,-4,-18,-28,-17,1;
MA   /M: M=-6,-5,-23,-7,-3,-8,-19,-3,-8,-6,-8,-5,-4,-13,-6,-7,-5,-2,-7,-21,-1,-6;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-28,-21,-30,-26,2,-26,-26,24,-24,15,10,-25,-25,-23,-22,-17,-8,24,-14,-3,-26;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-8,-25,-9,-2,-17,-18,-4,-16,10,-13,-6,-5,-10,1,11,-7,-4,-12,-21,-7,-2;
MA   /M: SY='W'; M=-12,-16,-22,-18,-16,0,-15,-6,-12,-12,-11,-9,-13,-22,-12,-9,-13,-10,-12,15,14,-15;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-5,-26,-6,-14,-23,38,-14,-28,-14,-22,-15,4,-20,-14,-14,0,-13,-22,-23,-21,-14;
MA   /M: SY='D'; M=-5,13,-22,17,9,-27,-9,2,-25,-2,-25,-17,10,-10,7,-5,12,3,-20,-34,-15,8;
MA   /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-12,-21,-13,-9,-10,-20,-12,0,-8,-3,-1,-12,-13,-9,-9,-5,-2,4,-23,-6,-10;
MA   /M: SY='V'; M=-8,-28,-10,-33,-27,16,-31,-24,21,-25,14,9,-24,-28,-26,-22,-16,-6,24,-18,3,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-11,-26,-13,-4,-13,-22,-7,-16,14,-12,-5,-5,-19,5,34,-8,-4,-11,-19,-6,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-33,-23,17,-31,-22,22,-29,37,16,-27,-28,-23,-21,-26,-9,13,-16,3,-23;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-12,-25,-14,-5,-7,-23,-7,-9,8,-7,0,-8,-19,1,16,-11,-8,-6,-18,-3,-3;
MA   /M: SY='H'; M=-16,4,-28,2,1,-21,-16,77,-28,-9,-22,-4,14,-15,8,-1,-4,-15,-29,-32,11,0;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-20,-17,-23,-18,-7,-17,-18,9,-16,7,6,-17,-21,-15,-15,-10,-4,12,-24,-9,-17;
MA   /M: SY='N'; M=1,0,-15,-3,-2,-18,-9,-5,-16,-4,-15,-10,2,-15,-5,-7,2,-1,-11,-28,-13,-4;
MA   /M: SY='T'; M=1,-2,-14,-7,-6,-13,-14,-12,-11,-10,-11,-8,0,-11,-4,-10,15,26,-5,-29,-11,-5;
MA   /M: SY='G'; M=-4,6,-26,6,3,-28,21,-7,-31,-4,-26,-18,9,-14,-2,-6,4,-9,-26,-27,-22,0;
MA   /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-7,-10,-9,-13,-7,-16,-15,-7,-15,1,-10,-2,-6,-20,-3,5,-6,-5,-9,-26,-11,-6;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-18,-26,-21,-18,14,-23,-1,-7,-12,-5,-6,-16,-24,-13,-10,-17,-10,-12,26,36,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-21,9,-30,-20,22,-29,45,21,-29,-29,-20,-20,-28,-9,13,-20,0,-21;
MA   /M: SY='H'; M=-2,-5,-19,-8,-6,-16,-11,22,-20,-9,-16,-7,1,-13,-2,-7,2,1,-15,-23,-2,-6;
MA   /M: SY='S'; M=5,-13,-7,-16,-12,-8,-14,-13,-5,-15,-6,-5,-9,-18,-11,-15,7,5,1,-26,-7,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-6,3,-22,2,4,-19,-14,22,-20,-6,-17,-8,6,-12,3,-5,5,2,-18,-31,-5,2;
MA   /M: SY='D'; M=-4,5,-24,7,5,-22,-6,-7,-20,-4,-19,-15,4,-8,-3,-8,2,-2,-16,-27,-15,0;
MA   /M: M=-5,-2,-22,-4,-2,-15,-16,-1,-10,-5,-12,-7,-1,-14,-2,-5,-1,-2,-7,-25,-7,-4;
MA   /M: SY='E'; M=-6,1,-25,2,7,-24,-14,-3,-20,3,-20,-12,2,1,6,1,1,-3,-19,-28,-15,5;
MA   /I: I=-4; MD=-8;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-11,-22,-11,-8,-4,-14,-6,-6,-9,-3,-4,-10,-11,-8,-10,-7,-5,-7,-12,5,-10; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-8;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-11,-26,-7,-3,-19,-11,-13,-14,-4,-15,-10,-10,21,-5,-10,-6,-7,-15,-22,-15,-6; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-8;
MA   /M: M=-4,-5,-18,-5,0,-13,-17,-9,-6,-3,-5,-2,-6,-12,-1,-3,-3,-2,-4,-23,-9,-1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-8;
MA   /M: SY='W'; M=-6,-9,-19,-9,-7,-6,-11,-8,-7,-6,-5,-5,-9,-7,-7,-6,-8,-4,-8,5,0,-7; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8;
MA   /M: SY='G'; M=-2,3,-20,4,0,-23,16,-10,-24,-8,-21,-16,5,-13,-5,-9,5,-6,-18,-25,-19,-3; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-8;
MA   /M: SY='K'; M=-6,-2,-24,-1,2,-14,-13,-8,-21,5,-20,-13,-1,-6,-2,2,2,-2,-15,-23,-10,-1;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-6,-26,-7,-2,-18,2,-9,-17,-8,-12,-8,-3,-14,-4,-7,-4,-9,-15,-20,-13,-4;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,1,-20,0,10,-26,-16,2,-20,3,-19,-8,0,-12,20,1,-1,-8,-21,-22,-11,14;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-9,-25,-11,-2,-11,-20,-1,-10,2,-8,1,-6,-17,10,6,-8,-6,-11,-17,-1,3;
MA   /M: SY='E'; M=-9,5,-27,9,22,-29,-16,-3,-26,13,-22,-14,2,-5,15,9,0,-6,-23,-27,-16,18;
MA   /M: SY='V'; M=4,-24,-13,-28,-24,-3,-25,-25,22,-19,9,9,-23,-23,-22,-20,-7,0,31,-26,-9,-24;
MA   /M: SY='T'; M=0,-7,-14,-13,-13,-9,-14,-14,-3,-12,-9,-5,-3,-17,-12,-12,9,16,4,-28,-9,-13;
MA   /M: SY='C'; M=1,-15,9,-20,-17,-10,-7,-17,-11,-19,-5,-6,-11,-22,-17,-19,-4,-5,-5,-27,-14,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-10,-10,-21,-11,-8,2,-23,1,-5,-8,-2,1,-10,-21,-7,-7,-10,-5,-4,-12,13,-8;
MA   /I: I=-7; MD=-14;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-5,-20,-4,4,-21,-8,-6,-18,0,-18,-11,-4,-1,1,-3,0,-3,-15,-24,-14,1; D=-7;
MA   /I: I=-7; MD=-14;
MA   /M: SY='E'; M=-7,1,-22,1,3,-9,-6,3,-19,-6,-15,-10,2,-13,-2,-6,0,-5,-17,-20,-5,0; D=-7;
MA   /I: I=-7; MD=-14;
MA   /M: SY='G'; M=0,-5,-17,-6,-6,-18,3,-12,-17,-5,-16,-10,-2,-10,-7,-6,0,-5,-12,-22,-15,-7; D=-7;
MA   /I: I=-7; MD=-14;
MA   /M: SY='S'; M=1,-1,-10,-4,-3,-11,-5,-8,-9,-4,-9,-6,0,-10,-4,-5,2,1,-5,-18,-10,-4; D=-7;
MA   /I: I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
MA   /M: SY='D'; M=-10,18,-24,22,9,-25,-6,9,-26,-1,-23,-16,13,-9,3,-4,2,-6,-23,-29,-12,5; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-14;
MA   /M: SY='E'; M=0,-1,-18,-1,4,-19,-12,-9,-13,-3,-13,-6,-2,-10,-1,-8,2,-2,-10,-25,-12,1; D=-7;
MA   /I: I=-7; DM=-14;
MA   /M: SY='N'; M=-4,12,-24,10,4,-25,-6,-2,-24,6,-23,-15,14,-13,3,4,3,-4,-21,-29,-15,3;
MA   /M: SY='S'; M=-2,11,-13,9,4,-20,-11,-9,-18,-7,-20,-16,11,-10,-3,-10,12,9,-14,-34,-17,0;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-14,-20,-16,-11,-5,-18,-10,-5,-13,1,-2,-14,-22,-10,-12,-13,-7,-6,-4,0,-11;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-34,-40,-36,-27,22,-23,-24,-13,-20,-8,-12,-32,-29,-22,-17,-33,-23,-20,96,27,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-5,0,-22,-3,1,-15,-17,-8,-12,2,-12,-8,2,-15,-1,2,0,2,-10,-25,-9,-1;
MA   /M: SY='I'; M=-5,-27,-19,-31,-25,5,-31,-25,27,-24,18,13,-23,-25,-22,-22,-16,-5,26,-22,-3,-25;
MA   /M: SY='E'; M=-6,0,-25,3,15,-20,-16,-1,-16,0,-12,-9,-2,-12,6,-2,-2,-6,-14,-27,-12,10;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-10,-24,-7,0,-19,-19,-13,-12,-6,-14,-9,-10,14,-6,-7,-6,-6,-12,-28,-17,-5;
MA   /M: M=-3,-9,-16,-12,-11,-8,-15,-7,-4,-12,-6,-3,-6,-17,-11,-12,-3,-2,0,-25,-7,-12;
MA   /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2018_06,557713;
NR   /TOTAL=241(62); /POSITIVE=241(62); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=5;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=MIR;
CC   /VERSION=4;
DR   Q9TU34    , ITPR1_BOVIN, T; Q14643    , ITPR1_HUMAN, T;
DR   P11881    , ITPR1_MOUSE, T; P29994    , ITPR1_RAT  , T;
DR   Q8WN96    , ITPR2_BOVIN, T; Q14571    , ITPR2_HUMAN, T;
DR   Q9Z329    , ITPR2_MOUSE, T; P29995    , ITPR2_RAT  , T;
DR   Q8WN95    , ITPR3_BOVIN, T; Q14573    , ITPR3_HUMAN, T;
DR   P70227    , ITPR3_MOUSE, T; Q63269    , ITPR3_RAT  , T;
DR   Q9Y0A1    , ITPR_CAEEL , T; P29993    , ITPR_DROME , T;
DR   Q8WSR4    , ITPR_PATPE , T; O74189    , PMT1_CANAL , T;
DR   O13898    , PMT1_SCHPO , T; P33775    , PMT1_YEAST , T;
DR   Q5ADM9    , PMT2_CANAL , T; Q9C100    , PMT2_SCHPO , T;
DR   P31382    , PMT2_YEAST , T; P47190    , PMT3_YEAST , T;
DR   Q59X23    , PMT4_CANAL , T; O42933    , PMT4_SCHPO , T;
DR   P46971    , PMT4_YEAST , T; Q5ACU3    , PMT5_CANAL , T;
DR   P52867    , PMT5_YEAST , T; Q5A688    , PMT6_CANAL , T;
DR   P42934    , PMT6_YEAST , T; Q06644    , PMT7_YEAST , T;
DR   F1QF89    , POMT1_DANRE, T; Q9VTK2    , POMT1_DROME, T;
DR   Q2LZ62    , POMT1_DROPS, T; Q9Y6A1    , POMT1_HUMAN, T;
DR   Q8R2R1    , POMT1_MOUSE, T; Q99PR0    , POMT1_RAT  , T;
DR   F1Q8R9    , POMT2_DANRE, T; Q9W5D4    , POMT2_DROME, T;
DR   Q29IL2    , POMT2_DROPS, T; Q9UKY4    , POMT2_HUMAN, T;
DR   Q8BGQ4    , POMT2_MOUSE, T; P21817    , RYR1_HUMAN , T;
DR   E9PZQ0    , RYR1_MOUSE , T; P16960    , RYR1_PIG   , T;
DR   P11716    , RYR1_RABIT , T; F1LMY4    , RYR1_RAT   , T;
DR   Q92736    , RYR2_HUMAN , T; E9Q401    , RYR2_MOUSE , T;
DR   P30957    , RYR2_RABIT , T; B0LPN4    , RYR2_RAT   , T;
DR   Q15413    , RYR3_HUMAN , T; A2AGL3    , RYR3_MOUSE , T;
DR   Q9TS33    , RYR3_RABIT , T; Q24498    , RYR_DROME  , T;
DR   Q3T083    , SDF2L_BOVIN, T; Q9HCN8    , SDF2L_HUMAN, T;
DR   Q9ESP1    , SDF2L_MOUSE, T; Q93ZE8    , SDF2_ARATH , T;
DR   Q3SZ45    , SDF2_BOVIN , T; Q54P23    , SDF2_DICDI , T;
DR   Q99470    , SDF2_HUMAN , T; Q9DCT5    , SDF2_MOUSE , T;
3D   1N4K; 1XZZ; 2MC2; 2XOA; 3HSM; 3ILA; 3IM5; 3IM6; 3IM7; 3JAV; 3JRR; 3MAL;
3D   3QR5; 3T8S; 3UJ0; 3UJ4; 4I0Y; 4I1E; 4I2S; 4I37; 4I3N; 4I6I; 4I7I; 4I8M;
3D   4I96; 4JKQ; 4KEI; 4KEJ; 4KEK; 4L4H; 4L4I; 4UWA; 4UWE; 5GUG; 5J8V; 5X9Z;
3D   5XA0; 5XA1;
PR   PRU00131;
DO   PDOC50919;
//
DBGET integrated database retrieval system