GenomeNet

Database: PROSITE
Entry: PS51162
LinkDB: PS51162
Original site: PS51162 
ID   THYROGLOBULIN_1_2; MATRIX.
AC   PS51162;
DT   01-NOV-2005 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 10-APR-2019 INFO UPDATE.
DE   Thyroglobulin type-1 domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=63;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=63;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7733458; R2=0.0065978; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=732; N_SCORE=6.6; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=550; N_SCORE=5.4; MODE=1; TEXT='R?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-17,-26,-16,-7,-14,-19,-14,-7,-2,-2,-1,-15,2,-6,-3,-12,-8,-7,-22,-10,-8;
MA   /M: SY='T'; M=3,-3,-17,-7,-4,-19,-2,-14,-18,-8,-18,-13,1,-9,-3,-8,16,18,-11,-29,-16,-4;
MA   /M: SY='P'; M=-10,0,-28,4,1,-21,-18,-13,-19,1,-19,-14,-3,15,-5,-5,-4,-2,-18,-28,-16,-4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-11,2,-28,5,26,-27,-20,1,-21,9,-13,-8,0,-10,25,9,-4,-10,-24,-25,-13,25;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-25,-6,2,-20,-21,-5,-11,10,-11,-2,-5,-16,7,12,-7,-7,-8,-24,-10,4;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='E'; M=-8,0,-25,1,18,-20,-17,9,-16,-1,-11,-3,-1,-11,14,-3,-3,-8,-18,-21,-8,16; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-10,-25,-10,1,-16,-21,-3,-14,12,-5,0,-7,-18,7,25,-10,-8,-11,-21,-7,2; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='E'; M=3,1,-21,2,12,-19,-13,-1,-19,-1,-15,-11,0,-11,7,-3,3,-2,-16,-23,-9,9; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='Q'; M=-6,-1,-17,-2,2,-23,-6,2,-22,-1,-21,-12,4,-14,7,7,7,0,-18,-28,-13,3; D=-2;
MA   /I: I=-2; MD=-11;
MA   /M: SY='V'; M=9,-18,-16,-24,-19,-7,-15,-20,12,-17,5,8,-16,-18,-15,-18,-5,1,15,-22,-9,-18; D=-2;
MA   /I: I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
MA   /M: M=-3,-5,-20,-8,-6,-14,-6,-4,-9,-3,-9,-5,0,-12,-2,-2,-4,-6,-9,-19,-7,-5; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-3,-23,-3,5,-16,-16,-8,-17,4,-17,-11,-1,5,2,2,0,2,-16,-22,-11,3; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='S'; M=-2,-3,-21,-3,-1,-19,-2,-8,-16,-4,-16,-11,0,-9,-5,-5,4,-2,-11,-27,-15,-4; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-11,-23,-13,-10,-8,-13,-11,-8,-8,-6,-4,-6,1,-10,-7,-7,-2,-9,-22,-10,-11; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='D'; M=-7,-2,-25,1,0,-19,-13,-8,-11,-4,-14,-8,-3,-5,1,-7,-1,-6,-12,-22,-8,-1; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-3,-24,-4,-8,-20,8,-9,-20,-7,-18,-8,-1,-11,-6,-7,-1,-4,-16,-18,-14,-7; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-16,-15,-17,-13,-3,-19,-13,2,-14,8,4,-15,-18,-12,-13,-11,-6,2,-22,-6,-13; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='Y'; M=-16,-21,-24,-24,-20,33,-24,6,-2,-18,3,0,-17,-22,-19,-13,-17,-10,-6,7,38,-20; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-23,-20,-25,-23,-3,-30,-24,27,-20,12,10,-21,-19,-20,-19,-14,-6,27,-24,-6,-24; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='P'; M=-9,-19,-38,-9,0,-28,-19,-19,-19,-9,-28,-19,-19,85,-9,-19,-9,-9,-28,-28,-28,-9; D=-2;
MA   /I: I=-2; DM=-11;
MA   /M: SY='Q'; M=0,9,-23,6,12,-29,-11,-1,-22,7,-23,-12,12,-11,18,3,7,-3,-22,-28,-16,15;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='D'; M=-10,22,-25,26,7,-27,-13,-5,-26,5,-19,-17,12,-13,1,1,-1,-3,-20,-31,-15,4;
MA   /M: SY='E'; M=-5,8,-26,13,28,-28,-16,3,-27,10,-21,-15,2,-7,13,5,1,-6,-23,-28,-15,20;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='B'; M=-10,21,-23,19,9,-25,-8,5,-25,2,-24,-17,21,-14,3,0,6,0,-23,-34,-15,6;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-29,-9,-19,-29,65,-19,-39,-19,-30,-20,1,-19,-19,-19,3,-17,-29,-21,-29,-19;
MA   /M: SY='H'; M=-11,5,-23,4,1,-8,-13,6,-17,-9,-12,-10,6,-17,-2,-8,0,-4,-17,-25,-2,-1;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-27,-23,47,-30,7,0,-17,3,0,-20,-30,-20,-13,-20,-10,-7,23,63,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-1,-24,-2,8,-22,-16,2,-18,6,-13,-8,1,-14,8,7,-2,-7,-16,-26,-10,7;
MA   /M: SY='P'; M=0,-8,-28,-4,8,-26,-16,-13,-20,1,-21,-15,-9,27,0,-5,-2,-5,-20,-27,-21,2;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-18,-18,-19,-13,-8,-25,-18,5,-3,5,5,-17,-22,-11,-1,-10,-2,13,-25,-8,-13;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='C'; M=-7,-18,104,-28,-27,-21,-28,-28,-29,-24,-20,-19,-18,-37,-27,-26,-9,-9,-10,-47,-28,-27;
MA   /M: SY='H'; M=-16,3,-24,4,0,-10,-18,22,-24,-4,-18,-11,3,-19,2,-1,-7,-11,-23,-13,8,0;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-25,-5,-3,-23,12,-11,-22,-7,-22,-12,1,-2,-4,-7,3,-5,-19,-26,-21,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-19;
MA   /M: SY='S'; M=7,3,-15,4,2,-21,0,-8,-20,-5,-23,-16,5,-10,0,-9,19,6,-13,-28,-14,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='T'; M=0,-2,-15,-6,-3,-16,-9,-9,-14,-2,-16,-10,3,-11,1,3,13,15,-9,-25,-12,-2; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-7,-25,-6,-13,-25,42,-16,-31,-10,-25,-16,0,-17,-13,-10,1,-14,-22,-20,-23,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; DM=-19;
MA   /M: SY='Y'; M=-11,-9,-26,-8,1,1,-17,-2,-16,-4,-12,-8,-8,-10,-3,-6,-6,-5,-16,-12,9,-2;
MA   /M: SY='C'; M=-6,-18,105,-28,-28,-19,-28,-29,-28,-28,-19,-19,-18,-37,-28,-28,-7,-6,-9,-47,-28,-28;
MA   /M: SY='W'; M=-19,-37,-44,-38,-29,15,-22,-25,-14,-20,-14,-15,-36,-30,-21,-19,-35,-25,-21,119,31,-21;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-29,-11,-29,-29,2,-30,-26,28,-19,9,9,-29,-30,-29,-19,-11,-1,46,-26,-3,-29;
MA   /M: SY='D'; M=-16,34,-27,42,8,-25,-8,0,-29,-4,-22,-20,19,-14,-4,-9,-1,-7,-24,-33,-13,2;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='K'; M=5,-2,-25,-3,2,-24,-8,-12,-23,8,-22,-14,-2,-3,0,1,0,-4,-17,-18,-16,0;
MA   /M: SY='B'; M=-5,7,-23,6,6,-19,-11,-4,-19,1,-18,-10,7,-13,2,-4,2,0,-17,-21,-9,4;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-5,-25,-5,6,-21,-20,3,-17,14,-16,-4,-2,-15,8,17,-5,-6,-12,-25,-8,6;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-1,-27,3,27,-25,-17,-6,-25,11,-19,-15,-4,2,9,8,-2,-8,-22,-26,-18,16;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-27,-20,-31,-23,1,-29,-23,25,-22,23,15,-24,-25,-20,-17,-18,-7,23,-23,-5,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-12,-29,-8,2,-22,-18,-9,-17,-7,-19,-13,-10,32,-1,-9,0,-1,-20,-27,-16,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-8,-32,-6,-15,-28,46,-18,-36,-17,-29,-21,-2,-6,-17,-19,-3,-18,-30,-13,-26,-16;
MA   /M: SY='T'; M=1,-6,-17,-12,-11,-12,-8,-18,-12,-10,-15,-11,-3,-13,-9,-11,12,21,-6,-17,-8,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-2,-26,0,4,-23,-15,-6,-24,10,-21,-14,1,-3,4,23,1,-3,-19,-27,-16,2;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-2,-16,-5,0,-18,-18,-13,-9,-6,-13,-8,-2,-12,2,-7,12,20,-2,-30,-13,1;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-8,-26,-9,2,-21,-15,-8,-15,6,-15,-8,-5,0,4,8,-4,-5,-14,-23,-13,1; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-11,-25,-12,-12,-16,14,-10,-18,-9,-17,-10,-4,-6,-12,-8,-4,-11,-14,-19,-14,-13; D=-4;
MA   /I: I=-4; MD=-23;
MA   /M: SY='G'; M=-4,-5,-23,-4,-3,-22,20,-11,-26,3,-21,-12,-1,-6,-5,2,-3,-11,-20,-16,-17,-4; D=-4;
MA   /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
MA   /M: SY='E'; M=-8,5,-27,11,14,-28,-15,-3,-25,1,-24,-17,1,8,8,-1,5,0,-23,-31,-18,9;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-17,-17,-14,-7,-21,-19,-16,-11,-9,-18,-11,-15,28,-11,-15,-5,-6,-11,-30,-20,-12;
MA   /M: SY='N'; M=-2,4,-23,3,3,-25,-6,-1,-24,3,-22,-13,7,-10,6,4,6,1,-19,-28,-15,4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2019_03,559634;
NR   /TOTAL=126(75); /POSITIVE=126(75); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=PS_Langendijk_Genevaux;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=11;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Thyroglobulin type-1;
CC   /VERSION=3;
DR   Q9VCR3    , COW_DROME  , T; Q3T0L5    , EPCAM_BOVIN, T;
DR   Q5F381    , EPCAM_CHICK, T; P16422    , EPCAM_HUMAN, T;
DR   Q1WER1    , EPCAM_MACMU, T; Q99JW5    , EPCAM_MOUSE, T;
DR   Q75QW1    , EPCAM_PIG  , T; O55159    , EPCAM_RAT  , T;
DR   P81439    , EQST_ACTEQ , T; P04233    , HG2A_HUMAN , T;
DR   P04441    , HG2A_MOUSE , T; P10247    , HG2A_RAT   , T;
DR   P24591    , IBP1_BOVIN , T; P08833    , IBP1_HUMAN , T;
DR   Q6Q484    , IBP1_ICTTR , T; P47876    , IBP1_MOUSE , T;
DR   Q75ZP3    , IBP1_PIG   , T; P21743    , IBP1_RAT   , T;
DR   Q9PTH3    , IBP2A_DANRE, T; B3F211    , IBP2B_DANRE, T;
DR   P13384    , IBP2_BOVIN , T; P49705    , IBP2_CHICK , T;
DR   P18065    , IBP2_HUMAN , T; P47877    , IBP2_MOUSE , T;
DR   P24853    , IBP2_PIG   , T; P12843    , IBP2_RAT   , T;
DR   Q29400    , IBP2_SHEEP , T; Q5XHC5    , IBP2_XENLA , T;
DR   A4IIA2    , IBP2_XENTR , T; P20959    , IBP3_BOVIN , T;
DR   P17936    , IBP3_HUMAN , T; P47878    , IBP3_MOUSE , T;
DR   P16611    , IBP3_PIG   , T; P15473    , IBP3_RAT   , T;
DR   Q05716    , IBP4_BOVIN , T; P22692    , IBP4_HUMAN , T;
DR   P47879    , IBP4_MOUSE , T; P24854    , IBP4_PIG   , T;
DR   P21744    , IBP4_RAT   , T; Q28893    , IBP4_SHEEP , T;
DR   Q05717    , IBP5_BOVIN , T; P24593    , IBP5_HUMAN , T;
DR   Q07079    , IBP5_MOUSE , T; Q28985    , IBP5_PIG   , T;
DR   P24594    , IBP5_RAT   , T; Q90WV8    , IBP5_XENLA , T;
DR   Q05718    , IBP6_BOVIN , T; P24592    , IBP6_HUMAN , T;
DR   P47880    , IBP6_MOUSE , T; P35572    , IBP6_RAT   , T;
DR   P14543    , NID1_HUMAN , T; P10493    , NID1_MOUSE , T;
DR   Q14112    , NID2_HUMAN , T; O88322    , NID2_MOUSE , T;
DR   B5DFC9    , NID2_RAT   , T; P84032    , PN16_PHONI , T;
DR   P31226    , SAX_LITCT  , T; Q9H4F8    , SMOC1_HUMAN, T;
DR   Q8BLY1    , SMOC1_MOUSE, T; Q9H3U7    , SMOC2_HUMAN, T;
DR   Q8CD91    , SMOC2_MOUSE, T; P09758    , TACD2_HUMAN, T;
DR   Q8BGV3    , TACD2_MOUSE, T; Q6P9Z6    , TACD2_RAT  , T;
DR   P01267    , THYG_BOVIN , T; P01266    , THYG_HUMAN , T;
DR   O08710    , THYG_MOUSE , T; P06882    , THYG_RAT   , T;
DR   Q08629    , TICN1_HUMAN, T; Q62288    , TICN1_MOUSE, T;
DR   Q92563    , TICN2_HUMAN, T; Q9ER58    , TICN2_MOUSE, T;
DR   Q9BQ16    , TICN3_HUMAN, T; Q8BKV0    , TICN3_MOUSE, T;
DR   Q5RD69    , TICN3_PONAB, T;
3D   1ICF; 1L3H; 1RMJ; 1ZT3; 1ZT5; 2DSQ; 2DSR; 2H7T; 4MZV;
PR   PRU00500;
DO   PDOC00377;
//
DBGET integrated database retrieval system