GenomeNet

Database: PROSITE
Entry: PS51234
LinkDB: PS51234
Original site: PS51234 
ID   TSP3; MATRIX.
AC   PS51234;
DT   01-MAR-2007 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 10-APR-2019 INFO UPDATE.
DE   Thrombospondin type-3 (TSP3) repeat profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=36;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=36;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8454413; R2=0.0060809; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=2164; N_SCORE=15.0; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=766; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='R?';
MA   /DEFAULT: M0=-33; D=-120; I=-120; B1=-200; E1=-200; MI=-305; MD=-305; IM=-305; DM=-305;
MA   /I: B1=0; BI=-305; BD=-305;
MA   /M: SY='E'; M=-20,12,13,50,-41,-50,-41,-19,36,-5,-18,-20,-49,11,30,-25,8,-38,-61,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-51,-64,108,-17,-70,-47,-37,-66,-39,-67,-65,22,-6,-38,-47,-39,-40,-43,-85,-54;
MA   /M: SY='T'; M=12,-49,4,-42,4,-32,-1,-41,-14,-47,-21,-19,-49,-42,-17,42,62,10,-62,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-50,-63,106,-8,-70,-30,-36,-68,-38,-68,-65,33,-6,-38,-47,-38,-40,-66,-84,-55;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-58,-43,-1,-56,58,-46,-33,13,-2,-38,11,-53,-15,28,9,-32,-34,-60,-52;
MA   /M: SY='D'; M=-50,-61,103,-19,-69,-45,-34,-68,-37,-68,-64,58,-52,-37,-45,-37,-38,-66,-85,-54;
MA   /M: SY='G'; M=-35,-60,-12,-43,-65,90,-52,-39,-12,-61,-56,-24,-52,-33,-12,-19,-39,-63,-58,-59;
MA   /M: SY='W'; M=-37,-59,-54,3,-2,-62,10,19,3,-4,-5,-51,-57,2,23,-40,-15,44,81,-3;
MA   /M: SY='G'; M=-38,-123,-97,-113,-133,185,-108,-143,-103,-138,-116,-72,55,-100,-76,-68,-101,-132,-116,-123;
MA   /M: SY='D'; M=-51,-63,109,-17,-71,-46,-36,-69,-38,-68,-66,31,-51,-37,-46,-38,-40,-66,-86,-54;
MA   /I: I=-31; MI=0; MD=-78; IM=0; DM=-78;
MA   /M: SY='A'; M=66,-49,-41,-24,-51,-19,-43,5,-21,-19,-22,-47,-52,-27,-30,-2,-9,28,-62,-50;
MA   /M: SY='C'; M=-90,298,-129,-130,-110,-121,-129,-124,-121,-105,-106,-102,-151,-137,-134,-95,-90,-99,-170,-132;
MA   /I: I=-17; MD=-44;
MA   /M: SY='D'; M=-37,-81,67,37,-85,-70,-58,-44,-17,-79,-76,-46,-66,-15,-59,-39,-35,-76,-92,-72; D=-17;
MA   /I: I=-17; MI=-44; MD=-44; IM=-44; DM=-44;
MA   /M: SY='D'; M=-41,-76,41,-9,-57,-7,-62,-71,-21,-48,-69,-11,-6,-58,-49,-11,18,-37,-85,-28; D=-17;
MA   /I: I=-17; DM=-44;
MA   /M: SY='D'; M=-69,-83,92,-34,-88,-66,-55,-87,-54,-85,-83,-38,-22,-55,-15,-57,-59,-83,-101,-71; D=-17;
MA   /I: I=-17; DM=-44;
MA   /M: SY='F'; M=4,-69,5,-28,60,-37,-62,9,-65,-40,-8,-62,-72,-48,-49,-32,-57,-16,-55,5; D=-17;
MA   /I: I=-17; DM=-44;
MA   /M: SY='D'; M=-63,13,94,-32,-83,-62,-52,-81,-53,-80,-78,-34,-65,-53,-62,-27,-17,-77,-99,-68; D=-17;
MA   /I: I=-17; DM=-44;
MA   /M: SY='N'; M=-44,-69,-17,-57,-71,37,-32,-67,-19,-24,-29,68,-69,-4,-58,-47,-53,-36,-80,-67; D=-17;
MA   /I: I=-17; DM=-44;
MA   /M: SY='D'; M=-14,-73,92,-31,-79,-59,-52,-71,-31,-74,-72,-35,-28,-51,-58,-49,-23,-27,-93,-65; D=-17;
MA   /I: I=-17; DM=-44;
MA   /M: SY='G'; M=-34,-66,-13,-33,-71,45,-58,-70,6,-42,-62,4,-61,-30,-37,19,25,-65,-75,-65; D=-17;
MA   /I: I=-17; DM=-44;
MA   /M: SY='I'; M=-57,-69,-73,-73,-32,-78,-69,61,-68,-13,-36,-11,-30,-67,-46,-51,-51,38,-66,15; D=-17;
MA   /I: I=-17; DM=-44;
MA   /M: SY='P'; M=-50,-73,-17,-36,-33,-67,26,4,-25,-8,4,-28,58,-23,-22,-25,-6,-11,-74,-38; D=-17;
MA   /I: I=-17; DM=-44;
MA   /M: SY='D'; M=-60,46,70,-9,-76,-56,-47,-77,-47,-77,-71,61,-66,-48,-17,-39,-49,-74,-93,-67; D=-17;
MA   /I: I=-17; DM=-44;
MA   /M: SY='I'; M=-16,-70,-2,8,-42,-18,2,17,-23,-9,-39,-35,-18,-22,3,-14,-2,-28,-71,-15; D=-17;
MA   /I: I=-17; DM=-44;
MA   /M: SY='K'; M=-32,-71,13,1,-34,-61,-57,3,16,5,-1,-54,-4,5,7,-35,-35,-17,-70,-32; D=-17;
MA   /I: I=-17; DM=-44;
MA   /M: SY='D'; M=-52,-65,113,-15,-72,-48,-37,-70,-39,-68,-67,-19,-51,-38,-47,-39,-41,-67,-87,-54;
MA   /M: SY='N'; M=-13,-51,2,-41,-57,-38,14,-36,-36,-57,-48,103,-56,-37,-43,-2,-26,12,-77,-52;
MA   /M: SY='C'; M=-90,298,-129,-130,-110,-121,-129,-124,-121,-105,-106,-102,-151,-137,-134,-95,-90,-99,-170,-132;
MA   /M: SY='P'; M=-48,-69,-53,-42,-57,-47,-53,0,-43,-15,-23,-55,105,-4,8,-38,-43,-6,15,-56;
MA   /M: SY='E'; M=-19,-57,8,44,-17,-54,-21,-38,21,25,-17,21,-52,-20,3,-1,-16,-38,-54,25;
MA   /M: SY='N'; M=-24,-53,-33,-27,-39,-52,-28,12,-23,15,-17,61,-4,-26,-49,-3,-7,47,-67,-47;
MA   /M: SY='P'; M=30,-58,-33,-27,-12,-47,4,-42,11,-36,-45,-2,73,-41,-21,15,-31,-14,-54,28;
MA   /M: SY='N'; M=-32,-53,-1,30,-61,-26,-30,-59,-6,-63,-3,103,-53,-31,-38,-6,-33,-59,-74,-55;
MA   /M: SY='P'; M=-21,-59,-22,-47,-22,-26,-54,33,-42,-37,-39,-19,72,-38,-31,31,-8,30,-63,-50;
MA   /M: SY='D'; M=-27,-56,58,-21,3,28,32,-55,-35,-32,-8,18,-51,-28,-21,12,36,-52,-66,-30;
MA   /M: SY='Q'; M=-22,-62,-30,-2,-58,-53,6,-46,-23,10,-5,-38,-52,105,-31,-20,-1,-26,-58,-43;
MA   /I: E1=0; IE=-305; DE=-305;
PP   /COMPETES_HIT_WITH: PS51236;
NR   /RELEASE=2019_03,559634;
NR   /TOTAL=176(22); /POSITIVE=176(22); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=1; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=N_Hulo;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=8;
CC   /FT_KEY=REPEAT; /FT_DESC=TSP type-3;
CC   /VERSION=3;
DR   P35445    , COMP_BOVIN , T; P49747    , COMP_HUMAN , T;
DR   Q9R0G6    , COMP_MOUSE , T; P35444    , COMP_RAT   , T;
DR   Q28178    , TSP1_BOVIN , T; P07996    , TSP1_HUMAN , T;
DR   P35441    , TSP1_MOUSE , T; P35448    , TSP1_XENLA , T;
DR   Q95116    , TSP2_BOVIN , T; P35440    , TSP2_CHICK , T;
DR   P35442    , TSP2_HUMAN , T; Q03350    , TSP2_MOUSE , T;
DR   Q8JHW2    , TSP3A_DANRE, T; Q1L8P7    , TSP3B_DANRE, T;
DR   P49746    , TSP3_HUMAN , T; Q05895    , TSP3_MOUSE , T;
DR   Q8JGW0    , TSP4B_DANRE, T; Q3SWW8    , TSP4_BOVIN , T;
DR   P35443    , TSP4_HUMAN , T; Q9Z1T2    , TSP4_MOUSE , T;
DR   P49744    , TSP4_RAT   , T; Q06441    , TSP4_XENLA , T;
DR   Q04732    , ARP_EUGGR  , N;
3D   1UX6; 1YO8; 2RHP; 3FBY;
PR   PRU00634;
DO   PDOC51234;
//
DBGET integrated database retrieval system