GenomeNet

Database: PROSITE
Entry: PS51344
LinkDB: PS51344
Original site: PS51344 
ID   HTH_TFE_IIE; MATRIX.
AC   PS51344;
DT   01-DEC-2007 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 20-JUN-2018 INFO UPDATE.
DE   TFE/IIEalpha-type HTH domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=89;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=84;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.7896526; R2=0.0077522; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=13692.6064453; R2=1.8483009; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=737; H_SCORE=15055; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=479; H_SCORE=14578; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-92; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
MA   /I: B1=0; BI=-255; BD=-255;
MA   /M: SY='M'; M=27,-14,14,-24,27,-91,-215,-8,-52,18,44,30,-64,-215,-94,-212,-62,4,-223,12;
MA   /M: SY='N'; M=-93,-228,35,1,-227,-218,-48,-6,62,-62,-216,63,-30,1,-12,-17,-207,-25,-235,-219;
MA   /M: SY='P'; M=-94,-229,35,26,-42,-219,-209,-227,23,-226,-3,-1,42,19,42,14,19,-224,-232,-219;
MA   /M: SY='L'; M=16,-220,-227,-14,-43,-229,-221,-10,-29,74,-46,-227,-53,-217,-221,-63,-211,13,-225,-208;
MA   /M: SY='V'; M=4,-221,-231,-225,-31,-231,-57,48,-32,32,-30,-225,-228,-222,-223,-217,-39,64,-225,2;
MA   /M: SY='R'; M=-96,-230,-212,-25,-34,-225,-27,-44,57,2,-207,-37,-222,48,76,-83,-212,-54,-222,-12;
MA   /M: SY='C'; M=-10,45,-7,14,22,-30,-210,-23,2,-10,38,-44,-222,28,-32,-2,-11,-74,-217,43;
MA   /M: SY='V'; M=-25,10,-229,-53,-29,-231,-219,27,-223,5,-8,-226,-30,-222,-224,-217,-207,74,-216,64;
MA   /M: SY='V'; M=40,-218,-228,-222,-42,-108,-225,23,-70,15,33,-221,-225,-219,-223,-82,7,66,-229,-211;
MA   /M: SY='R'; M=-216,-230,-213,-7,-28,-60,22,-100,0,-20,-208,-209,-224,-3,95,-55,-65,-17,-219,37;
MA   /M: SY='K'; M=19,-223,16,7,-224,36,-212,-28,37,-25,28,-8,-218,-29,-6,11,-22,-214,-229,-218;
MA   /M: SY='F'; M=-86,-221,-234,-228,102,-231,-219,19,-44,24,33,-225,-231,-226,-62,-23,-213,-25,-203,-183;
MA   /I: I=-28; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71;
MA   /M: SY='Y'; M=-59,-227,-224,-225,29,-24,-17,7,-219,-27,-16,-47,-230,-216,-218,-216,-73,17,-192,115;
MA   /M: SY='D'; M=-206,-10,74,36,-233,70,-212,-235,-209,-91,-226,-197,-28,-206,-217,9,-72,-229,-234,-224;
MA   /M: SY='D'; M=-75,-224,66,42,-224,-48,-209,7,9,-38,-215,11,-13,-202,-66,24,29,-60,-235,-218;
MA   /M: SY='E'; M=-66,-230,35,81,-225,-221,-21,-36,15,-222,-217,-70,37,-23,-12,-17,-82,-21,-228,0;
MA   /I: I=-17; MI=0; MD=-44; IM=0; DM=-44;
MA   /M: SY='H'; M=50,-222,-34,1,-72,34,79,-214,-48,-215,-17,-56,-220,-32,-213,-72,-209,12,-221,47;
MA   /M: SY='I'; M=11,-221,-226,-43,2,-228,-224,60,-12,-13,23,-221,-224,-216,4,-49,-74,58,-225,-207;
MA   /M: SY='L'; M=-36,-223,-16,12,-208,-84,-24,15,22,40,31,-40,-6,-75,17,-214,-208,36,-227,-210;
MA   /M: SY='V'; M=-26,-219,-232,-227,-49,-232,-231,67,-224,-15,5,-225,-226,-224,-226,-216,-27,82,-17,-208;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-219,-233,-226,24,-64,-222,40,-225,57,54,-227,-228,-221,-224,-219,-209,44,-221,-202;
MA   /M: SY='D'; M=-67,-229,98,48,-228,-78,-24,-230,6,-82,-49,-11,-215,-49,1,-35,-207,-227,-236,-8;
MA   /M: SY='A'; M=68,4,-217,-21,-45,-35,9,1,-32,-2,37,-43,-220,-74,-34,-31,-33,0,-225,-50;
MA   /M: SY='L'; M=-216,-220,-234,-227,24,-85,-219,26,-82,83,24,-230,-42,-221,-224,-225,-212,-30,-218,-200;
MA   /I: I=-15; MD=-38;
MA   /M: SY='T'; M=-56,-15,-229,-39,-27,-234,-223,39,-225,35,34,-224,-26,-222,-227,-217,45,11,-225,27; D=-15;
MA   /I: I=-15; MI=0; MD=-38; IM=0; DM=-38;
MA   /M: SY='R'; M=-74,-227,-77,-4,9,-65,-208,2,28,-65,-42,-6,39,-11,79,-44,-1,-58,-222,-32;
MA   /M: SY='H'; M=-23,-226,23,27,-49,-12,84,-226,32,-104,-55,42,-217,-5,24,-85,-39,-223,-225,29;
MA   /M: SY='Q'; M=-57,-7,-204,27,-227,40,-209,-82,1,-74,-215,-9,24,57,-23,43,14,-56,-228,-218;
MA   /M: SY='W'; M=-12,72,1,67,-214,-71,-218,-17,-78,-42,-211,-81,-7,-204,-26,-55,-210,27,99,-210;
MA   /M: SY='V'; M=-21,-218,-229,-70,-23,-230,-18,32,-221,39,60,-224,-226,-219,-76,-216,-50,68,-224,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-40,-218,-46,-204,-218,-215,0,-69,29,-66,-211,-40,-13,-201,48,42,79,-52,-229,-34;
MA   /M: SY='D'; M=-60,-229,100,82,-233,-218,-203,-231,-198,-67,-225,-193,-88,-194,-208,-205,-48,-226,-240,-220;
MA   /M: SY='E'; M=-74,-228,70,96,-230,-221,-204,-56,-1,-74,-221,-199,-209,-190,-48,-205,-5,-222,-234,-220;
MA   /M: SY='D'; M=-82,-229,97,63,-232,-217,19,-228,-67,-226,-222,-39,-213,26,-17,-55,-57,-37,-240,-217;
MA   /M: SY='L'; M=-214,-220,-233,-227,-193,-235,-221,65,-226,77,39,-229,-228,-220,-225,-224,-54,-31,-222,-204;
MA   /M: SY='A'; M=83,18,-215,-25,-220,4,-35,-55,-16,-30,-9,-209,-217,-208,-214,1,-37,-18,-226,-218;
MA   /M: SY='E'; M=-25,-225,-20,66,-53,-219,23,-24,41,-13,-209,4,-214,23,5,-8,-23,-214,-223,13;
MA   /M: SY='L'; M=-32,-222,17,34,-62,-222,-210,-19,27,54,-51,-32,-220,-1,18,5,-72,-95,-225,-210;
MA   /M: SY='L'; M=-66,-217,-226,-221,-197,-228,-218,7,-220,75,44,-220,-224,-216,-221,-22,51,-11,-225,-205;
MA   /M: SY='G'; M=-205,-225,-15,-17,-229,69,-10,-231,57,-229,-21,44,-216,4,-2,-12,-208,-227,-227,-219;
MA   /M: SY='M'; M=-212,-220,-231,-225,43,-232,-217,62,-55,35,76,-223,-226,-219,-62,-219,-27,25,-214,11;
MA   /M: SY='N'; M=-209,-224,42,7,-226,-82,29,-224,53,-44,-40,59,15,39,-16,27,-202,-223,-231,-214;
MA   /M: SY='L'; M=-20,-222,-46,-18,-27,-221,-211,12,26,32,-199,-58,19,28,32,-4,18,-14,-223,-44;
MA   /M: SY='N'; M=-34,-221,-196,-198,-226,-209,-201,-69,83,-226,-215,94,-23,-25,-10,-62,-9,-221,-230,-217;
MA   /M: SY='Q'; M=-64,-225,39,62,-59,-219,-17,-9,-6,-97,19,-38,-213,71,-18,-39,19,-16,-227,-39;
MA   /M: SY='V'; M=-74,-20,-230,-225,-197,-232,-225,32,-224,61,-185,-226,-227,-222,-224,-217,-4,73,-227,-206;
MA   /M: SY='R'; M=-215,13,-40,-202,-225,-26,20,-232,-177,-225,-214,-43,-224,-192,118,-209,-215,-226,-227,-212;
MA   /M: SY='K'; M=-29,-226,-40,-21,-49,-218,0,-224,77,-46,-212,-74,-24,27,64,12,-49,-221,-224,-212;
MA   /M: SY='I'; M=13,-8,-224,-220,-201,-226,-13,69,-36,33,-191,-217,-223,-59,-36,-94,34,4,-223,5;
MA   /M: SY='L'; M=-71,63,-233,-227,-194,-233,-221,30,-226,84,-16,-228,-232,-221,-226,-222,-52,-60,-224,-206;
MA   /M: SY='Y'; M=11,-223,-210,-26,25,9,3,-60,-204,-211,-26,33,-222,23,24,-20,-1,-74,-205,85;
MA   /M: SY='K'; M=-22,-222,-16,-205,20,-82,-30,7,55,-17,-55,-17,-219,-7,29,-18,39,-57,-217,28;
MA   /M: SY='L'; M=-217,-219,-234,-226,19,-235,-217,-182,-227,95,-3,-232,-233,-221,-224,-226,-213,-190,-217,-199;
MA   /M: SY='Y'; M=-35,-227,-204,50,-35,-71,36,-215,40,-51,15,-26,-218,-32,40,-49,-210,-30,-210,76;
MA   /M: SY='E'; M=-42,-32,50,85,-230,-12,-205,-230,20,-73,-220,-9,-211,-36,17,-39,-60,-224,-231,-220;
MA   /M: SY='D'; M=10,-226,79,25,-226,-214,48,-77,-9,-72,20,37,-216,46,-41,-203,-207,-76,-235,-54;
MA   /M: SY='R'; M=-74,-227,-48,-202,-225,43,-42,-227,64,-74,20,3,-218,-26,75,-37,-210,-223,-225,-215;
MA   /M: SY='L'; M=-217,-220,-235,-228,68,-234,-219,36,-227,71,46,-229,-231,-223,-225,-225,-212,-49,-212,-192;
MA   /M: SY='V'; M=41,-15,-229,-223,-204,-224,-228,58,-222,18,-191,-223,-225,-220,-225,-65,-204,68,-228,-210;
MA   /M: SY='K'; M=0,-220,9,-13,-220,-7,-211,-14,41,-98,23,-24,-216,-20,22,26,37,7,-229,-215;
MA   /M: SY='Y'; M=-211,44,-64,-20,-11,-77,-203,-23,-54,-207,-204,-37,-226,-46,54,9,-51,31,-205,92;
MA   /M: SY='H'; M=-55,13,6,-57,-39,-221,79,-22,26,-216,-209,-22,-221,-38,78,-35,-63,-15,-225,20;
MA   /M: SY='R'; M=-210,-224,-55,-12,-69,-220,52,-48,32,-44,23,-39,-218,19,69,8,40,-43,-227,-34;
MA   /M: SY='R'; M=-96,-226,-205,36,-221,-42,-30,1,29,-80,-208,-7,-217,52,65,-46,3,15,-28,-213;
MA   /M: SY='R'; M=-75,-226,-211,-52,-57,-222,-207,-215,64,-48,-5,-205,8,-3,78,-40,17,-8,-223,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-39,-226,73,81,-230,-216,5,-225,-47,-225,-220,37,-212,-32,-62,-51,-17,-20,-237,-219;
MA   /M: SY='E'; M=-69,-224,11,47,-43,-72,-209,-31,45,-33,9,3,38,-50,-202,1,32,-28,-226,-14;
MA   /M: SY='D'; M=20,-223,51,48,-228,-20,-206,-60,-33,-224,-217,37,-24,24,23,-22,21,-218,-232,-219;
MA   /I: I=-13; MD=-32;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-251,-11,31,-249,-10,-21,-56,-3,-74,-239,-35,22,-59,-63,-84,-79,-90,-252,-60; D=-13;
MA   /I: I=-13; MD=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-64,-253,35,-230,-248,24,-236,-52,-47,-51,-243,31,-247,-33,-8,-230,-237,-248,44,-241; D=-13;
MA   /I: I=-13; MD=-32;
MA   /M: SY='Q'; M=-4,-246,-40,-229,-40,11,-232,-245,-46,-244,6,18,-15,34,-23,-9,-22,-242,-251,-239; D=-13;
MA   /I: I=-13; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-70,-247,-46,-234,-70,-248,46,-7,-80,-65,-226,-10,-247,16,-23,-231,13,21,-253,-12; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-32;
MA   /M: SY='T'; M=-231,-245,-224,-1,-247,-238,-22,-245,19,-78,-47,34,-239,-51,-1,3,37,-240,-257,-240; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-32;
MA   /M: SY='H'; M=-210,-224,-213,-209,-33,-221,63,-24,13,-218,-212,-204,-43,-204,54,43,56,-20,-229,8; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-32;
MA   /M: SY='N'; M=-204,-50,-204,-2,-218,53,-208,-23,-27,-220,-53,56,-217,13,-62,31,35,-29,-225,19; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-32;
MA   /M: SY='W'; M=-73,-231,-223,-217,-43,-222,44,-210,-34,-41,-205,-218,-226,-208,20,-10,-44,-20,134,98;
MA   /M: SY='Y'; M=-215,59,-46,-220,35,-226,-202,2,-217,20,-38,-21,1,-216,-217,-212,18,-64,-197,104;
MA   /M: SY='Y'; M=-208,48,-212,11,31,-222,11,-20,-18,-81,-202,-209,-220,-209,-56,5,55,23,-207,82;
MA   /M: SY='Y'; M=-215,-226,-223,-222,-51,-229,27,67,-218,13,-191,-219,-226,-46,-217,-55,-17,-58,38,105;
MA   /M: SY='Y'; M=-91,-222,61,-202,-51,-215,47,-211,-16,16,-205,57,-23,-204,-61,-23,11,-213,-214,77;
MA   /M: SY='W'; M=-69,13,-232,-225,8,-223,-212,-83,-218,-57,-208,-228,-229,-216,-218,-37,-79,-57,153,99;
MA   /M: SY='R'; M=10,37,-46,-37,-213,-54,48,-43,39,-76,-209,-203,-1,-28,69,-46,19,-214,-220,37;
MA   /M: SY='Q'; M=-25,-222,-217,-25,15,-224,13,46,-36,29,-44,-213,14,56,-14,-35,1,14,-221,-203;
MA   /M: SY='N'; M=16,-17,53,-10,13,-213,-74,-8,-27,-33,-207,58,-218,-48,-14,-36,23,16,-228,-40;
MA   /M: SY='Y'; M=-211,-22,5,-70,-24,-225,-209,50,-213,13,-44,-35,15,-25,-7,-16,-34,24,-15,76;
MA   /M: SY='D'; M=-39,-225,93,48,-77,-88,-12,-227,-2,-99,-10,47,-213,-49,-10,-33,-34,-223,-237,-216;
MA   /M: SY='V'; M=24,-218,0,10,-216,-72,-4,-11,31,-70,-204,33,-71,14,-33,-13,-11,53,-230,-213;
MA   /M: SY='I'; M=-54,-15,-228,-226,-1,-230,-226,85,-223,7,-19,-6,-224,-221,-225,-55,-38,55,-224,-204;
MA   /M: SY='K'; M=-25,33,-15,10,-220,-217,-51,-16,70,-37,-210,35,34,-63,41,-60,-73,-85,-225,-32;
MA   /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;
NR   /RELEASE=2018_06,557713;
NR   /TOTAL=59(59); /POSITIVE=59(59); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=A?E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=HTH TFE/IIEalpha-type;
CC   /VERSION=5;
DR   A6QLI8    , T2EA_BOVIN , T; Q557M8    , T2EA_DICDI , T;
DR   P29083    , T2EA_HUMAN , T; Q9D0D5    , T2EA_MOUSE , T;
DR   Q5R8H5    , T2EA_PONAB , T; Q9P3W1    , T2EA_SCHPO , T;
DR   P36100    , T2EA_YEAST , T; Q9YAD5    , TFE_AERPE  , T;
DR   O29501    , TFE_ARCFU  , T; A8M8Z5    , TFE_CALMQ  , T;
DR   A0RYF4    , TFE_CENSY  , T; Q5V3R0    , TFE_HALMA  , T;
DR   Q9HRC7    , TFE_HALSA  , T; Q18HD8    , TFE_HALWD  , T;
DR   A2BLW2    , TFE_HYPBU  , T; A8ABJ9    , TFE_IGNH4  , T;
DR   A6UW55    , TFE_META3  , T; Q8TJB7    , TFE_METAC  , T;
DR   Q0W8N8    , TFE_METAR  , T; A7I7T6    , TFE_METB6  , T;
DR   Q46G12    , TFE_METBF  , T; Q12YV9    , TFE_METBU  , T;
DR   Q2FT22    , TFE_METHJ  , T; Q58187    , TFE_METJA  , T;
DR   Q8TY11    , TFE_METKA  , T; A2SQM6    , TFE_METLZ  , T;
DR   A4G0F7    , TFE_METM5  , T; A6VI24    , TFE_METM7  , T;
DR   Q8PZ06    , TFE_METMA  , T; A3CVQ3    , TFE_METMJ  , T;
DR   Q6M181    , TFE_METMP  , T; A5UKV8    , TFE_METS3  , T;
DR   A4YJ15    , TFE_METS5  , T; Q2NEV4    , TFE_METST  , T;
DR   O27705    , TFE_METTH  , T; A0B9P3    , TFE_METTP  , T;
DR   A6UR14    , TFE_METVS  , T; Q74MZ3    , TFE_NANEQ  , T;
DR   Q3IP08    , TFE_NATPD  , T; Q9UYS6    , TFE_PYRAB  , T;
DR   Q8ZYH0    , TFE_PYRAE  , T; A4WGY5    , TFE_PYRAR  , T;
DR   A3MY45    , TFE_PYRCJ  , T; Q8U3H5    , TFE_PYRFU  , T;
DR   O58353    , TFE_PYRHO  , T; A1RTG5    , TFE_PYRIL  , T;
DR   B1YA16    , TFE_PYRNV  , T; A3DN07    , TFE_STAMF  , T;
DR   Q4JAZ3    , TFE_SULAC  , T; C3MZJ0    , TFE_SULIA  , T;
DR   C4KIS0    , TFE_SULIK  , T; C3MRF5    , TFE_SULIL  , T;
DR   C3MY51    , TFE_SULIM  , T; C3NFW2    , TFE_SULIN  , T;
DR   C3N7L2    , TFE_SULIY  , T; Q980M5    , TFE_SULSO  , T;
DR   Q975T8    , TFE_SULTO  , T; Q5JDD5    , TFE_THEKO  , T;
DR   A1RY32    , TFE_THEPD  , T;
3D   1Q1H; 5FMF; 5FYW; 5FZ5; 5GPY; 5IY6; 5IY7; 5IY8; 5IY9; 5IYA; 5IYB; 5IYC;
3D   5IYD; 5OQJ; 5OQM; 5SVA;
PR   PRU00676;
DO   PDOC51344;
//
DBGET integrated database retrieval system