GenomeNet

Database: PROSITE
Entry: PS51803
LinkDB: PS51803
Original site: PS51803 
ID   ZF_C2HC_RNF; MATRIX.
AC   PS51803;
DT   01-JUN-2016 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 13-NOV-2019 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger C2HC RNF-type profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=20;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=18;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.2985992; R2=0.0061719; TEXT='-LogE';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1499.4128418; R2=0.2231357; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1167; H_SCORE=1760; N_SCORE=10.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=519; H_SCORE=1615; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-66; D=-60; I=-60; B1=-600; E1=-600; MI=-180; MD=-180; IM=-180; DM=-180;
MA   /I: B1=0; BI=-180; BD=-180;
MA   /M: SY='C'; M=-113,153,-133,-133,-121,-129,-132,-126,-129,-119,-119,-119,-143,-136,-135,-116,-113,-34,-150,-42;
MA   /M: SY='R'; M=-30,-125,-92,-47,-124,-49,50,-64,45,-121,23,-8,-119,-98,68,23,30,-119,-131,-112;
MA   /M: SY='G'; M=-28,72,-112,36,-122,80,-118,-132,-116,-46,-120,-108,-121,-113,-123,-105,-117,-126,19,16;
MA   /M: SY='C'; M=-113,154,-133,-132,-121,-128,-132,-127,-128,-45,-118,-119,-143,-136,-135,-116,-113,-116,-151,-132;
MA   /M: SY='G'; M=-25,-68,17,25,-131,49,-3,-133,-3,-131,-122,31,-118,-39,38,29,-76,-127,-132,-121;
MA   /M: SY='K'; M=-27,-124,-107,-13,-126,-120,-111,-119,91,-121,3,-25,-115,8,-87,-73,46,-23,-128,-117;
MA   /M: SY='Q'; M=-94,-126,-72,6,-125,-117,-53,-115,58,-24,12,25,-41,97,-30,-39,-53,-16,-124,-112;
MA   /I: I=-18; MI=0; MD=-55; IM=0; DM=-55;
MA   /M: SY='V'; M=-106,-116,-131,-125,36,-131,-122,31,-61,-12,78,-124,-125,-121,-121,-117,-103,83,-121,-40;
MA   /M: SY='C'; M=-72,85,-115,-43,33,-25,-111,-19,31,-33,-106,-107,-46,-108,20,15,33,-18,-115,41;
MA   /M: SY='L'; M=-115,-117,-132,-125,39,-133,-116,-33,-125,90,-4,-130,-131,-120,-122,-124,-111,-34,-113,-38;
MA   /M: SY='S'; M=15,-114,-107,-107,-111,-76,25,-38,-39,-57,-45,-72,-114,-99,-109,99,-90,-44,-121,36;
MA   /M: SY='K'; M=-111,-53,21,34,-120,-119,-41,-125,88,-77,-113,-98,-113,42,28,-105,-107,-122,24,12;
MA   /M: SY='M'; M=-110,-117,-130,-122,-22,-125,-105,12,-116,13,142,-119,-120,-108,-114,-118,-25,-88,-119,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-114,-131,-110,-98,-123,-124,6,-130,-5,-122,-111,-103,-122,-88,121,-108,-113,-124,-124,-109;
MA   /M: SY='S'; M=60,-115,-40,-12,-120,-33,54,-79,-106,-24,-108,-36,-79,29,-109,66,-54,-31,-128,-111;
MA   /M: SY='H'; M=-117,-129,-101,-101,-115,-119,157,-134,-106,-116,-101,-90,-117,-95,-100,-106,-115,-133,-151,-84;
MA   /M: SY='Y'; M=15,-118,-117,-117,-63,-121,13,45,-114,-11,-15,-3,-121,-23,-116,-104,43,37,-111,73;
MA   /M: SY='A'; M=54,-117,-108,-102,-119,-34,-108,-118,51,-118,-31,-35,-114,-97,49,43,2,-56,-122,-8;
MA   /M: SY='S'; M=7,-111,-103,-106,-119,-103,-109,-113,-105,-117,-19,23,-111,-102,-111,84,79,-66,-132,-114;
MA   /M: SY='C'; M=-109,159,-129,-129,-119,-124,-129,-126,-124,-116,-117,-115,-139,-132,-131,-111,-109,-113,-149,-130;
MA   /I: E1=0; IE=-180; DE=-180;
NR   /RELEASE=2019_10,561356;
NR   /TOTAL=19(19); /POSITIVE=19(19); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=C2HC RNF-type;
CC   /VERSION=3;
DR   Q4U5R4    , RN114_BOVIN, T; Q9Y508    , RN114_HUMAN, T;
DR   Q9ET26    , RN114_MOUSE, T; Q6J212    , RN114_PANTR, T;
DR   Q6J1I8    , RN114_PIG  , T; Q6J2U6    , RN114_RAT  , T;
DR   Q96EQ8    , RN125_HUMAN, T; Q95KF1    , RN125_MACFA, T;
DR   Q9D9R0    , RN125_MOUSE, T; Q32LN5    , RN138_BOVIN, T;
DR   Q8WVD3    , RN138_HUMAN, T; Q9CQE0    , RN138_MOUSE, T;
DR   Q99PD2    , RN138_RAT  , T; Q1L721    , RN138_XENLA, T;
DR   Q5F3B2    , RN166_CHICK, T; Q96A37    , RN166_HUMAN, T;
DR   Q3U9F6    , RN166_MOUSE, T; Q6J1I7    , RN166_RAT  , T;
DR   Q3KPU8    , RN166_XENLA, T;
3D   5DKA;
PR   PRU01144;
DO   PDOC51803;
//
DBGET integrated database retrieval system