GenomeNet

Database: PROSITE
Entry: PS51826
LinkDB: PS51826
Original site: PS51826 
ID   PSBD; MATRIX.
AC   PS51826;
DT   15-FEB-2017 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 13-FEB-2019 INFO UPDATE.
DE   Peripheral subunit-binding (PSBD) domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=38;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=35;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.8716874; R2=0.0078783; TEXT='-LogE';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3992.8278809; R2=0.7047478; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=969; H_SCORE=4676; N_SCORE=10.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=461; H_SCORE=4318; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-64; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255;
MA   /I: B1=0; BI=-255; BD=-255;
MA   /M: SY='H'; M=-51,-121,-32,-109,38,-119,51,17,14,7,-99,35,-16,-105,34,-15,6,-17,-115,30;
MA   /M: SY='A'; M=80,-113,-119,-112,-21,-107,-114,-22,-113,27,28,-114,-16,-21,-116,-8,-102,-22,-118,2;
MA   /M: SY='S'; M=3,-112,-108,-107,-37,-50,-110,-109,-21,-18,36,-97,-112,-102,-110,83,69,-104,-128,-111;
MA   /M: SY='P'; M=-114,-139,-114,-103,-134,-116,-117,-121,-110,-132,-118,-121,134,-114,-123,-111,-106,-127,-127,-131;
MA   /M: SY='S'; M=50,-114,-114,-110,-42,-107,-112,-101,-110,26,-101,-107,16,-106,-20,66,-14,9,-122,-8;
MA   /M: SY='A'; M=77,-112,-123,-116,-110,-111,-123,16,-116,-97,9,-117,-119,-114,-119,-100,-100,71,-127,-113;
MA   /M: SY='R'; M=-21,-127,-109,-97,-124,-119,-102,-127,48,-75,-111,-102,-119,5,107,-11,-109,-121,-123,-111;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-124,-105,-96,-48,-116,-102,-121,80,-33,-36,32,-117,-18,75,-104,-59,-118,-120,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-115,-120,-126,-56,-51,-132,-1,30,-117,79,-82,-124,-129,-114,3,-121,-110,-44,-110,56;
MA   /M: SY='A'; M=88,-112,-120,-113,-110,-106,-117,7,-114,22,46,-115,-118,-110,-117,-97,-102,-20,-123,-112;
MA   /M: SY='R'; M=27,-121,-17,38,-121,-66,3,-67,45,-29,-21,-102,-114,-93,66,2,-11,-41,-125,-112;
MA   /M: SY='E'; M=-108,-127,37,95,-127,-39,-19,-32,34,-120,15,-34,-107,6,-96,-54,-107,-120,-128,-116;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-120,-103,-106,0,-56,92,-110,34,31,-100,74,-121,-40,-46,-104,-106,-112,-124,11;
MA   /M: SY='G'; M=-21,-121,18,-108,-128,80,-33,-131,22,-130,-120,63,-116,-105,-109,3,-105,-126,-127,-120;
MA   /M: SY='I'; M=-108,-119,-132,-127,-95,-134,-126,74,-124,43,11,-126,-126,-121,-125,-119,-104,64,-123,-34;
MA   /M: SY='D'; M=-24,-125,99,26,-131,-111,-100,-130,-18,-128,-123,39,-40,-19,26,-9,-103,-125,-139,-117;
MA   /I: I=-24; MI=0; MD=-61; IM=0; DM=-61;
MA   /M: SY='L'; M=36,-117,-125,-118,-59,-122,-118,30,-30,72,-86,-122,22,-115,-119,-47,-106,-25,-121,-106;
MA   /M: SY='S'; M=26,-117,20,6,-120,-51,-106,-118,24,-61,-114,28,-114,-37,-4,70,-40,-37,29,-29;
MA   /M: SY='Q'; M=-2,-121,21,43,-2,-22,-103,-37,-29,-12,-108,31,-114,69,-60,24,-4,-63,-123,-35;
MA   /M: SY='V'; M=-105,-119,-129,-126,-101,2,-131,78,-123,-41,-88,-122,-123,-34,-125,-115,-103,80,-127,-108;
MA   /M: SY='T'; M=19,-117,-105,-23,-121,-111,-2,-82,43,-66,-109,0,20,36,-15,32,61,-22,-128,-113;
MA   /M: SY='G'; M=44,-9,-113,-117,-128,91,-118,-129,-115,-128,-118,-102,30,-113,-122,-62,-49,-121,-123,-124;
MA   /M: SY='T'; M=-36,-111,-35,-28,-119,-59,-111,-114,-1,-117,-112,-94,-109,-101,-107,74,93,-106,-132,-114;
MA   /M: SY='G'; M=-97,-123,-47,-121,-128,105,-118,-133,-116,-50,-120,-98,-116,-114,-123,-28,-17,-127,-122,-124;
MA   /I: I=-26; MD=-65;
MA   /M: SY='P'; M=-23,-132,-115,-51,-131,-39,-117,-70,36,-127,-117,-52,102,-109,4,-7,-30,-12,-130,-126; D=-26;
MA   /I: I=-26; MI=-65; MD=-65; IM=-65; DM=-65;
MA   /M: SY='N'; M=-41,-124,33,-31,-48,41,53,-53,22,-71,-23,63,-118,-4,36,-102,-108,-123,-128,-18; D=-26;
MA   /I: I=-26; DM=-65;
MA   /M: SY='G'; M=-103,-127,23,-116,-133,95,-115,-139,-113,-135,-125,30,-119,-28,-27,-100,-115,-133,-128,-126; D=-26;
MA   /I: I=-26; DM=-65;
MA   /M: SY='R'; M=-113,-129,-115,-46,-120,-127,-107,-23,-46,-114,-108,-109,-124,-8,108,-110,-34,30,-127,-112;
MA   /M: SY='I'; M=-111,-122,-135,-130,-10,-137,-131,87,-127,25,-86,-128,-127,-125,-129,-122,-107,54,-124,-105;
MA   /M: SY='T'; M=-108,-117,-119,-116,-105,-127,-117,-14,-108,48,-21,-111,-120,-112,34,-103,82,15,-129,-109;
MA   /M: SY='K'; M=-24,-127,-107,-50,-126,-120,3,-28,100,-122,-112,-100,-115,-46,48,-107,-108,-52,-123,-113;
MA   /M: SY='E'; M=20,-42,21,81,-130,13,-107,-128,10,-125,-119,-102,-111,32,-102,-7,-107,-75,-128,-51;
MA   /M: SY='D'; M=-117,-131,123,-81,-137,-114,5,-136,-104,-133,-132,-85,-117,-103,-113,-105,-107,-133,-153,-119;
MA   /M: SY='V'; M=-6,-118,-132,-127,-102,-132,-132,60,-125,0,-89,-126,-126,-124,-127,-116,-103,85,-131,-109;
MA   /M: SY='D'; M=-113,-124,58,56,-111,-125,-109,-58,-26,55,-99,-108,-119,21,-110,-52,-54,-19,-129,-112;
MA   /M: SY='A'; M=60,-118,-70,16,-125,-44,-109,-119,30,-44,-112,41,-116,7,7,19,-30,-69,-128,-118;
MA   /M: SY='Y'; M=32,-121,-116,-18,56,-118,46,-107,-22,-26,-103,-113,-124,-110,-112,3,-12,-33,-100,87;
MA   /M: SY='Q'; M=8,-121,-59,-53,-107,-59,-117,36,-11,39,-3,-117,-41,49,-26,-45,-50,35,-125,-109;
MA   /I: E1=0; IE=-255; DE=-255;
NR   /RELEASE=2019_02,559228;
NR   /TOTAL=91(91); /POSITIVE=91(91); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??EP?; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Peripheral subunit-binding (PSBD);
CC   /VERSION=3;
DR   O31550    , ACOC_BACSU , T; O06159    , BKDC_MYCTU , T;
DR   Q9M7Z1    , ODB2_ARATH , T; P37942    , ODB2_BACSU , T;
DR   P11181    , ODB2_BOVIN , T; Q23571    , ODB2_CAEEL , T;
DR   P11182    , ODB2_HUMAN , T; P53395    , ODB2_MOUSE , T;
DR   Q9I1M0    , ODB2_PSEAE , T; P09062    , ODB2_PSEPU , T;
DR   P20708    , ODO2_AZOVI , T; P16263    , ODO2_BACSU , T;
DR   Q6FYD4    , ODO2_BARQU , T; Q8GCY1    , ODO2_BARVB , T;
DR   Q89AJ6    , ODO2_BUCBP , T; P52993    , ODO2_CUPNH , T;
DR   P0AFG7    , ODO2_ECO57 , T; P0AFG6    , ODO2_ECOLI , T;
DR   P45302    , ODO2_HAEIN , T; Q9I3D2    , ODO2_PSEAE , T;
DR   Q1RHI5    , ODO2_RICBR , T; Q92J43    , ODO2_RICCN , T;
DR   Q4UKI7    , ODO2_RICFE , T; Q9ZDY4    , ODO2_RICPR , T;
DR   Q68XI8    , ODO2_RICTY , T; Q2FH26    , ODO2_STAA3 , T;
DR   Q2FYM2    , ODO2_STAA8 , T; Q2YY06    , ODO2_STAAB , T;
DR   Q5HG07    , ODO2_STAAC , T; Q99U75    , ODO2_STAAM , T;
DR   Q7A5N4    , ODO2_STAAN , T; Q6GGZ6    , ODO2_STAAR , T;
DR   Q6G9E9    , ODO2_STAAS , T; Q8NWR7    , ODO2_STAAW , T;
DR   Q5HPC7    , ODO2_STAEQ , T; Q8CSL9    , ODO2_STAES , T;
DR   Q4L6C3    , ODO2_STAHJ , T; Q49XM4    , ODO2_STAS1 , T;
DR   Q0WQF7    , ODP21_ARATH, T; Q8RWN9    , ODP22_ARATH, T;
DR   Q5M729    , ODP23_ARATH, T; Q9SQI8    , ODP24_ARATH, T;
DR   Q9C8P0    , ODP25_ARATH, T; P35489    , ODP2_ACHLA , T;
DR   P10802    , ODP2_AZOVI , T; P21883    , ODP2_BACSU , T;
DR   P57302    , ODP2_BUCAI , T; Q8K9T8    , ODP2_BUCAP , T;
DR   Q89AQ9    , ODP2_BUCBP , T; Q19749    , ODP2_CAEEL , T;
DR   Q8NNJ2    , ODP2_CORGL , T; Q59098    , ODP2_CUPNH , T;
DR   P36413    , ODP2_DICDI , T; P06959    , ODP2_ECOLI , T;
DR   P11961    , ODP2_GEOSE , T; P45118    , ODP2_HAEIN , T;
DR   P10515    , ODP2_HUMAN , T; Q6ABX9    , ODP2_LEIXX , T;
DR   Q8BMF4    , ODP2_MOUSE , T; P65634    , ODP2_MYCBO , T;
DR   Q49110    , ODP2_MYCCT , T; P9WIS6    , ODP2_MYCTO , T;
DR   P9WIS7    , ODP2_MYCTU , T; P20285    , ODP2_NEUCR , T;
DR   Q59638    , ODP2_PSEAE , T; P08461    , ODP2_RAT   , T;
DR   Q9R9N3    , ODP2_RHIME , T; Q1RJT3    , ODP2_RICBR , T;
DR   Q92HK7    , ODP2_RICCN , T; Q4ULG1    , ODP2_RICFE , T;
DR   Q9ZD20    , ODP2_RICPR , T; Q68WK6    , ODP2_RICTY , T;
DR   O59816    , ODP2_SCHPO , T; Q5HGY9    , ODP2_STAAC , T;
DR   P65635    , ODP2_STAAM , T; P65636    , ODP2_STAAN , T;
DR   Q6GHZ0    , ODP2_STAAR , T; Q6GAB9    , ODP2_STAAS , T;
DR   Q59821    , ODP2_STAAU , T; Q8NX76    , ODP2_STAAW , T;
DR   Q5HQ74    , ODP2_STAEQ , T; Q8CT13    , ODP2_STAES , T;
DR   P12695    , ODP2_YEAST , T; O66119    , ODP2_ZYMMO , T;
DR   P22439    , ODPX_BOVIN , T; O00330    , ODPX_HUMAN , T;
DR   P86238    , ODPX_MESAU , T; Q8BKZ9    , ODPX_MOUSE , T;
DR   O94709    , ODPX_SCHPO , T; P16451    , ODPX_YEAST , T;
DR   Q86AD5    , Y1564_DICDI, T;
3D   1BAL; 1BBL; 1EBD; 1W3D; 1W4E; 1W4F; 1W4G; 1W4H; 1W85; 1W88; 1ZWV; 1ZY8;
3D   2BTG; 2BTH; 2COO; 2CYU; 2F5Z; 2F60; 2PDD; 2PDE; 2WXC; 3DUF; 3DV0; 3DVA;
3D   3RNM;
PR   PRU01170;
DO   PDOC51826;
//
DBGET integrated database retrieval system