ID HMA_2; MATRIX.
AC PS50846;
DT 01-JAN-2002 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 17-JUN-2020 INFO UPDATE.
DE Heavy-metal-associated domain profile.
MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=67;
MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=62;
MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1320; R2=0.01838795; TEXT='NScore';
MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=401; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=292; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA /M: SY='K'; M=-6,-5,-22,-7,0,-19,-19,-6,-13,10,-14,-1,-3,-12,4,7,0,5,-8,-25,-9,1;
MA /M: SY='I'; M=-3,-16,-15,-20,-14,-8,-22,-16,8,-16,2,3,-12,-20,-8,-16,-6,-2,6,-22,-4,-12;
MA /M: SY='T'; M=-7,-4,-21,-4,1,-13,-21,-8,-8,-2,-9,-5,-6,-15,-1,-3,-2,3,-3,-24,-5,-1;
MA /M: SY='L'; M=-12,-29,-22,-32,-24,22,-31,-17,19,-26,29,15,-26,-28,-22,-20,-24,-10,11,-8,13,-23;
MA /M: SY='R'; M=-6,4,-23,2,3,-22,-14,0,-20,5,-20,-11,6,-12,7,8,4,1,-17,-27,-11,3;
MA /M: SY='V'; M=-5,-30,-19,-34,-30,2,-34,-29,37,-25,16,14,-26,-26,-26,-24,-15,-5,39,-25,-5,-30;
MA /M: SY='E'; M=-6,3,-24,6,12,-23,-13,-5,-21,0,-17,-13,1,-3,4,-4,3,1,-18,-30,-15,7;
MA /M: SY='G'; M=-1,-6,-29,-7,-17,-29,62,-18,-38,-18,-30,-20,3,-19,-18,-18,1,-17,-29,-22,-29,-17;
MA /M: SY='M'; M=-9,-22,-21,-30,-20,3,-23,-7,21,-14,20,47,-20,-21,-6,-14,-20,-10,12,-19,0,-13;
MA /M: SY='T'; M=-4,1,-10,-4,-7,-14,-17,-4,-16,-10,-14,-11,2,-12,-7,-9,13,26,-8,-31,-8,-7;
MA /M: SY='C'; M=-10,-18,113,-28,-29,-20,-29,-29,-29,-28,-20,-20,-18,-39,-29,-28,-9,-9,-10,-49,-29,-29;
MA /M: SY='A'; M=9,1,-20,-2,0,-23,-2,-8,-19,-5,-20,-14,2,-6,-1,-10,9,3,-14,-28,-17,-1;
MA /M: SY='S'; M=8,1,-13,-2,-5,-22,8,-7,-22,-11,-23,-16,7,-15,-6,-13,17,3,-15,-32,-19,-6;
MA /M: SY='C'; M=-9,-17,107,-25,-25,-21,-28,-28,-30,-27,-21,-20,-17,-37,-26,-28,-7,-9,-11,-49,-29,-25;
MA /M: SY='V'; M=15,-17,-13,-20,-13,-11,-17,-21,6,-13,-3,-1,-16,-14,-15,-17,1,2,17,-27,-15,-14;
MA /M: SY='S'; M=3,0,-21,-3,1,-21,-5,-4,-19,-2,-20,-12,4,-9,2,-4,7,-1,-16,-27,-14,1;
MA /M: SY='R'; M=-4,1,-21,-3,-3,-19,-12,0,-18,6,-19,-10,6,-13,-1,7,4,3,-13,-28,-11,-3;
MA /M: SY='I'; M=-7,-29,-22,-35,-29,4,-33,-28,35,-26,18,15,-24,-25,-24,-25,-17,-7,32,-22,-2,-28;
MA /M: SY='E'; M=-7,7,-28,12,40,-27,-17,-4,-28,12,-21,-18,2,-4,14,3,1,-6,-26,-25,-17,27;
MA /M: SY='R'; M=-7,3,-26,3,4,-26,-4,-6,-27,14,-25,-14,6,-14,4,16,0,-6,-20,-26,-16,3;
MA /M: SY='A'; M=9,-5,-15,-11,-8,-15,-11,-13,-7,-5,-11,-6,-1,-16,-7,-7,3,-1,-2,-26,-14,-8;
MA /M: SY='L'; M=-9,-30,-20,-32,-23,8,-32,-23,26,-29,39,18,-28,-28,-22,-22,-25,-9,19,-21,-1,-23;
MA /M: SY='N'; M=-5,4,-24,2,7,-25,-1,-6,-25,5,-24,-15,9,-10,5,5,6,-1,-22,-28,-18,5;
MA /M: SY='K'; M=-2,2,-25,0,9,-27,-12,-5,-24,19,-24,-12,5,-11,12,15,1,-4,-20,-25,-14,10;
MA /M: SY='L'; M=-7,-22,-21,-24,-15,-3,-28,-16,14,-15,20,13,-21,-23,-12,-12,-18,-7,12,-22,-4,-14;
MA /I: I=-6; MD=-29;
MA /M: SY='P'; M=-6,1,-28,5,10,-27,-11,-9,-22,2,-24,-16,-1,21,2,-6,-1,-7,-23,-28,-20,5; D=-6;
MA /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA /M: SY='G'; M=-3,-8,-26,-8,-17,-21,50,-16,-35,-18,-26,-18,-2,-20,-18,-18,-2,-17,-27,-18,-19,-17;
MA /M: SY='V'; M=0,-28,-13,-29,-28,-2,-30,-29,29,-20,10,10,-27,-27,-27,-21,-10,-1,44,-28,-9,-28;
MA /M: SY='Q'; M=-6,-2,-24,-4,5,-20,-18,2,-17,7,-16,-6,1,-14,12,5,0,-2,-15,-24,-7,8;
MA /I: I=-6; MD=-32;
MA /M: SY='E'; M=-4,3,-21,5,9,-21,-9,-2,-22,5,-21,-13,4,-11,7,4,8,-1,-18,-25,-10,7; D=-6;
MA /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA /M: SY='V'; M=13,-20,-11,-28,-21,-2,-21,-23,12,-20,4,3,-17,-20,-19,-22,-6,-2,15,-20,-7,-21;
MA /M: SY='D'; M=-8,4,-24,7,6,-23,-13,-3,-20,6,-18,-12,4,-13,4,5,2,-4,-15,-29,-13,4;
MA /M: SY='V'; M=0,-29,-13,-31,-29,1,-30,-29,30,-21,11,10,-27,-27,-27,-21,-11,-1,42,-27,-8,-29;
MA /M: SY='N'; M=2,15,-17,11,0,-21,-5,-5,-18,-7,-23,-17,19,-14,-2,-9,17,7,-14,-36,-18,-1;
MA /M: SY='L'; M=-12,-28,-20,-31,-22,25,-29,-16,13,-26,29,11,-24,-29,-23,-18,-23,-9,8,-11,11,-22;
MA /I: I=-6; MD=-32;
MA /M: SY='A'; M=5,-5,-23,-6,3,-21,-7,-13,-14,-5,-14,-10,-5,-1,-4,-9,1,-3,-11,-26,-18,-1; D=-6;
MA /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
MA /M: SY='T'; M=0,6,-19,1,4,-20,-13,-8,-17,1,-17,-12,9,-12,2,-1,9,11,-14,-29,-14,3;
MA /M: SY='R'; M=-5,1,-26,1,6,-27,4,-6,-29,8,-25,-15,6,-13,6,11,4,-7,-23,-26,-18,5;
MA /M: SY='K'; M=-6,-3,-23,-4,8,-20,-19,-8,-18,12,-16,-9,-2,-12,5,10,2,4,-12,-26,-11,6;
MA /M: SY='A'; M=25,-17,-11,-24,-17,-12,-9,-21,3,-16,0,-1,-16,-18,-16,-20,-1,-3,11,-23,-15,-17;
MA /M: SY='T'; M=-3,-5,-14,-8,-3,-13,-20,-9,-6,-9,-9,-6,-4,-16,-3,-10,2,6,-2,-27,-9,-4;
MA /M: SY='V'; M=-5,-30,-15,-33,-29,5,-31,-28,30,-24,15,12,-26,-28,-27,-22,-14,-4,37,-24,-5,-29;
MA /M: SY='E'; M=-7,-3,-21,-3,3,-14,-21,-10,-9,0,-9,-6,-5,-16,-3,-3,-4,0,-5,-23,-7,0;
MA /M: SY='Y'; M=-11,-19,-24,-22,-18,20,-19,-1,-4,-17,1,-2,-15,-23,-16,-14,-11,-4,-7,5,30,-18;
MA /I: I=-3; MD=-17;
MA /M: SY='D'; M=-11,24,-24,30,13,-29,-11,-1,-25,1,-24,-19,14,-9,4,-5,4,-4,-21,-34,-16,8; D=-3;
MA /I: I=-3; MD=-17;
MA /M: SY='P'; M=-1,-4,-26,0,4,-23,-10,-9,-19,-7,-20,-15,-6,27,-5,-13,-2,-5,-20,-26,-19,-2; D=-3;
MA /I: I=-3; MD=-17;
MA /M: SY='E'; M=1,4,-18,4,7,-17,-4,-4,-17,-3,-16,-13,5,-7,-1,-6,6,-1,-14,-24,-13,3; D=-3;
MA /I: I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA /M: SY='L'; M=-4,-12,-12,-13,-8,-6,-15,-12,4,-6,5,3,-10,-15,-7,-5,-7,-3,5,-17,-6,-8; D=-3;
MA /I: I=-3; DM=-17;
MA /M: SY='V'; M=3,-15,-13,-19,-15,-6,-21,-20,12,-15,3,3,-14,-16,-14,-15,0,9,17,-24,-9,-15; D=-3;
MA /I: I=-3; DM=-17;
MA /M: SY='S'; M=1,5,-17,4,1,-23,-6,-9,-19,-6,-21,-15,7,-10,2,-8,15,11,-14,-32,-17,1;
MA /M: SY='P'; M=-4,-18,-26,-16,-9,-13,-20,-16,-3,-12,-7,-4,-16,17,-10,-15,-8,-4,-5,-25,-13,-11;
MA /M: SY='E'; M=-6,7,-24,11,17,-25,-14,-5,-24,3,-19,-14,2,-7,8,0,0,-5,-21,-28,-16,12;
MA /M: SY='E'; M=-4,2,-24,3,10,-22,-17,-7,-18,7,-16,-9,-1,-11,9,2,0,-1,-14,-26,-12,9;
MA /M: SY='L'; M=-4,-27,-21,-32,-24,6,-30,-24,26,-26,27,15,-23,-24,-21,-23,-19,-6,19,-20,-2,-23;
MA /M: SY='R'; M=-6,-14,-13,-17,-8,-12,-21,-16,-6,-1,-5,-2,-11,-19,-5,1,-8,-4,-2,-23,-10,-8;
MA /M: SY='E'; M=-4,6,-26,7,17,-27,-13,2,-26,12,-21,-13,4,-10,11,6,0,-6,-22,-26,-13,13;
MA /M: SY='A'; M=20,-11,-16,-17,-8,-13,-10,-13,-7,-9,-5,-4,-9,-15,-6,-12,1,0,-1,-21,-12,-8;
MA /M: SY='I'; M=-7,-28,-23,-35,-27,0,-35,-28,38,-27,19,16,-22,-23,-21,-25,-16,-5,30,-23,-3,-27;
MA /M: SY='E'; M=-4,5,-24,7,24,-25,-14,-3,-24,8,-19,-15,3,-9,9,3,2,-4,-21,-28,-16,16;
MA /M: SY='D'; M=-4,15,-25,19,12,-28,-9,-3,-27,6,-23,-17,8,-11,7,0,2,-6,-22,-27,-14,9;
MA /M: SY='A'; M=11,-17,-8,-23,-16,-7,-17,-18,3,-17,11,8,-17,-20,-13,-17,-8,-2,5,-23,-10,-15;
MA /M: SY='G'; M=0,-8,-29,-8,-14,-29,54,-17,-36,-15,-28,-18,0,-18,-14,-15,1,-17,-27,-21,-27,-14;
MA /M: SY='Y'; M=-18,-23,-26,-27,-20,40,-29,-3,-2,-16,4,0,-19,-20,-20,-13,-19,-10,-7,11,41,-21;
MA /M: SY='E'; M=-10,6,-26,12,19,-30,-9,1,-29,5,-24,-16,2,-4,10,0,-1,-9,-26,-29,-16,14;
MA /M: SY='A'; M=24,-13,-14,-18,-11,-16,-8,-18,-6,-11,-8,-6,-12,-5,-10,-17,4,0,0,-23,-15,-11;
MA /M: SY='S'; M=-3,-4,-20,-5,-1,-12,-11,-4,-15,-5,-15,-10,0,-15,-4,-3,5,2,-9,-25,-8,-3;
MA /M: SY='I'; M=-5,-19,-22,-20,-10,-8,-24,-20,10,-14,9,5,-19,-14,-12,-14,-13,-6,10,-25,-9,-13;
MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR /RELEASE=2020_03,562755;
NR /TOTAL=276(189); /POSITIVE=276(189); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR /FALSE_NEG=14; /PARTIAL=0;
CC /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC /SCALING_DB=reversed;
CC /AUTHOR=N_Hulo;
CC /TAXO-RANGE=A?EP?; /MAX-REPEAT=6;
CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=HMA;
CC /VERSION=3;
DR P37279 , ATCS_SYNE7 , T; P73241 , ATCS_SYNY3 , T;
DR P58341 , ATCU1_RHIME, T; P58342 , ATCU2_RHIME, T;
DR Q9X5X3 , ATCU_SINMW , T; Q94BT9 , ATOX1_ARATH, T;
DR Q3T0E0 , ATOX1_BOVIN, T; Q9TT99 , ATOX1_CANLF, T;
DR Q54PZ2 , ATOX1_DICDI, T; O00244 , ATOX1_HUMAN, T;
DR O08997 , ATOX1_MOUSE, T; Q9WUC4 , ATOX1_RAT , T;
DR Q9XT28 , ATOX1_SHEEP, T; P49015 , ATP7A_CRIGR, T;
DR Q04656 , ATP7A_HUMAN, T; Q64430 , ATP7A_MOUSE, T;
DR P70705 , ATP7A_RAT , T; P35670 , ATP7B_HUMAN, T;
DR Q64446 , ATP7B_MOUSE, T; Q64535 , ATP7B_RAT , T;
DR Q9XT50 , ATP7B_SHEEP, T; P37385 , ATSY_SYNE7 , T;
DR P07893 , ATSY_SYNP6 , T; P38360 , ATU1_YEAST , T;
DR O59666 , ATU2_SCHPO , T; P38995 , ATU2_YEAST , T;
DR O74735 , ATX1_SCHPO , T; P38636 , ATX1_YEAST , T;
DR Q59998 , ATZN_SYNY3 , T; P20021 , CADA1_STAAU, T;
DR P37386 , CADA2_STAAU, T; P30336 , CADA_BACPE , T;
DR O32219 , CADA_BACSU , T; Q60048 , CADA_LISMN , T;
DR P58414 , CADA_LISMO , T; Q6GIX1 , CADA_STAAR , T;
DR O82089 , CCH_ARATH , T; Q75DD6 , CCS1_ASHGO , T;
DR Q6FU61 , CCS1_CANGA , T; Q6BK66 , CCS1_DEBHA , T;
DR Q6CIG2 , CCS1_KLULA , T; Q6BZU2 , CCS1_YARLI , T;
DR P40202 , CCS1_YEAST , T; Q9LD47 , CCS_ARATH , T;
DR O14618 , CCS_HUMAN , T; Q9WU84 , CCS_MOUSE , T;
DR Q7XTY9 , CCS_ORYSJ , T; Q6PWT7 , CCS_PIG , T;
DR Q9JK72 , CCS_RAT , T; P77871 , COPA1_HELPX, T;
DR Q59467 , COPA2_HELPX, T; O08462 , COPA3_HELPX, T;
DR O29777 , COPA_ARCFU , T; O32220 , COPA_BACSU , T;
DR Q8XD24 , COPA_ECO57 , T; Q59385 , COPA_ECOLI , T;
DR P32113 , COPA_ENTHA , T; O32619 , COPA_HELFC , T;
DR Q9ZM69 , COPA_HELPJ , T; P55989 , COPA_HELPY , T;
DR Q8Z8S4 , COPA_SALTI , T; Q8ZR95 , COPA_SALTY , T;
DR A7X6S1 , COPA_STAA1 , T; A6U4T8 , COPA_STAA2 , T;
DR Q2FDV0 , COPA_STAA3 , T; Q2FV64 , COPA_STAA8 , T;
DR A5IVY3 , COPA_STAA9 , T; Q2YWA3 , COPA_STAAB , T;
DR Q5HCZ3 , COPA_STAAC , T; A6QK47 , COPA_STAAE , T;
DR Q99R80 , COPA_STAAM , T; Q7A3E6 , COPA_STAAN , T;
DR Q6GDP1 , COPA_STAAR , T; Q6G6B7 , COPA_STAAS , T;
DR A8Z3F8 , COPA_STAAT , T; Q8NUQ9 , COPA_STAAW , T;
DR Q5HL56 , COPA_STAEQ , T; Q8CN02 , COPA_STAES , T;
DR Q4L970 , COPA_STAHJ , T; Q4A0G1 , COPA_STAS1 , T;
DR Q9KPZ7 , COPA_VIBCH , T; Q8ZCA7 , COPA_YERPE , T;
DR O32620 , COPP_HELFC , T; Q9ZM70 , COPP_HELPJ , T;
DR Q48271 , COPP_HELPY , T; O29901 , COPZ_ARCFU , T;
DR O32221 , COPZ_BACSU , T; Q47840 , COPZ_ENTHA , T;
DR A7X6S3 , COPZ_STAA1 , T; A6U4T9 , COPZ_STAA2 , T;
DR Q2FDU9 , COPZ_STAA3 , T; Q2FV63 , COPZ_STAA8 , T;
DR A5IVY4 , COPZ_STAA9 , T; P0C885 , COPZ_STAAB , T;
DR Q5HCZ2 , COPZ_STAAC , T; A6QK48 , COPZ_STAAE , T;
DR Q99R79 , COPZ_STAAM , T; Q7A3E5 , COPZ_STAAN , T;
DR Q6GDP0 , COPZ_STAAR , T; Q6G6B6 , COPZ_STAAS , T;
DR A8Z3F9 , COPZ_STAAT , T; Q79ZY4 , COPZ_STAAW , T;
DR Q5HL55 , COPZ_STAEQ , T; Q8CN01 , COPZ_STAES , T;
DR Q4L971 , COPZ_STAHJ , T; Q4A0G2 , COPZ_STAS1 , T;
DR P46839 , CTPA_MYCLE , T; P9WPU0 , CTPA_MYCTO , T;
DR P9WPU1 , CTPA_MYCTU , T; P59947 , CTPB_MYCBO , T;
DR P46840 , CTPB_MYCLE , T; P9WPT8 , CTPB_MYCTO , T;
DR P9WPT9 , CTPB_MYCTU , T; Q59207 , FIXI_BRADU , T;
DR O33533 , FIXI_RHILV , T; P18398 , FIXI_RHIME , T;
DR A0JPW5 , HIP19_ARATH, T; Q9C9A3 , HIP20_ARATH, T;
DR Q9LF57 , HIP21_ARATH, T; Q93VP2 , HIP22_ARATH, T;
DR O65657 , HIP23_ARATH, T; O81464 , HIP24_ARATH, T;
DR O49613 , HIP25_ARATH, T; Q67ZW1 , HIP27_ARATH, T;
DR F4IC29 , HIP28_ARATH, T; Q9LP41 , HIP29_ARATH, T;
DR F4IQG4 , HIP30_ARATH, T; Q84K70 , HIP31_ARATH, T;
DR Q9M8K5 , HIP32_ARATH, T; F4JZL7 , HIP33_ARATH, T;
DR Q0WV37 , HIP34_ARATH, T; Q9C7J6 , HIP35_ARATH, T;
DR Q84J88 , HIP36_ARATH, T; A2RVM8 , HIP37_ARATH, T;
DR Q9FJH5 , HIP3_ARATH , T; F4JMB8 , HIP44_ARATH, T;
DR B3H6D0 , HIP45_ARATH, T; Q9SJL2 , HIP5_ARATH , T;
DR Q9LZF1 , HIP6_ARATH , T; Q9C5D3 , HIP7_ARATH , T;
DR Q9M8T7 , HIP8_ARATH , T; Q9FLU5 , HIP9_ARATH , T;
DR Q9SZW4 , HMA2_ARATH , T; A3BF39 , HMA2_ORYSJ , T;
DR P0CW77 , HMA3A_ARATH, T; P0CW78 , HMA3B_ARATH, T;
DR Q8H384 , HMA3_ORYSJ , T; O64474 , HMA4_ARATH , T;
DR Q6H7M3 , HMA4_ORYSJ , T; Q9SH30 , HMA5_ARATH , T;
DR A3AWA4 , HMA5_ORYSJ , T; Q9SZC9 , HMA6_ARATH , T;
DR Q9S7J8 , HMA7_ARATH , T; B9DFX7 , HMA8_ARATH , T;
DR A0A0P0X004, HMA9_ORYSJ , T; Q9RQB4 , HMCT_HELFE , T;
DR Q9ZL53 , HMCT_HELPJ , T; Q59465 , HMCT_HELPY , T;
DR Q52109 , MERA_ACICA , T; P17239 , MERA_ACIFR , T;
DR P94188 , MERA_ALCSP , T; P16171 , MERA_BACCE , T;
DR P94702 , MERA_ENTAG , T; P00392 , MERA_PSEAI , T;
DR Q51772 , MERA_PSEFL , T; P08662 , MERA_SERMA , T;
DR Q54465 , MERA_SHEPU , T; P08332 , MERA_SHIFL , T;
DR P0A0E5 , MERA_STAAU , T; P0A0E4 , MERA_STAES , T;
DR Q52107 , MERP_ACICA , T; P94186 , MERP_ALCSP , T;
DR P0A217 , MERP_ENTAG , T; P0A218 , MERP_ENTCL , T;
DR P04131 , MERP_PSEAI , T; Q51770 , MERP_PSEFL , T;
DR P0A216 , MERP_SALTI , T; P13113 , MERP_SERMA , T;
DR Q54463 , MERP_SHEPU , T; P04129 , MERP_SHIFL , T;
DR Q8LDS4 , NAKR1_ARATH, T; Q58FZ0 , NAKR2_ARATH, T;
DR Q8RXH8 , NAKR3_ARATH, T; P71365 , Y1050_HAEIN, T;
DR P77868 , Y290_HAEIN , T; P43979 , Y291_HAEIN , T;
DR O32622 , Y292_HAEIN , T; P37617 , ZNTA_ECOLI , T;
DR Q3YW59 , ZNTA_SHISS , T;
DR Q54F73 , CCS_DICDI , N; Q9CAK6 , HIP15_ARATH, N;
DR Q9FVS0 , HIP17_ARATH, N; Q9T0K9 , HIP18_ARATH, N;
DR Q9ZUV1 , HIP1_ARATH , N; Q9SZN7 , HIP26_ARATH, N;
DR Q8GWS3 , HIP2_ARATH , N; O03982 , HIP39_ARATH, N;
DR F4I1X0 , HIP41_ARATH, N; Q9CAV5 , HIP42_ARATH, N;
DR Q9SFF7 , HIP43_ARATH, N; Q9SHQ8 , HIP4_ARATH , N;
DR A2XT03 , PI21_ORYSI , N; Q7XL73 , PI21_ORYSJ , N;
PR PRU00280;
DO PDOC00804;
//
