ID HTH_LUXR_1; PATTERN.
AC PS00622;
DT 01-JUN-1992 CREATED; 01-APR-2006 DATA UPDATE; 25-MAY-2022 INFO UPDATE.
DE LuxR-type HTH domain signature.
PA [GDC]-x(2)-[NSTAVY]-x(2)-[IV]-[GSTA]-x(2)-[LIVMFYWCT]-x-[LIVMFYWCR]-x(3)-
PA [NST]-[LIVM]-x(2)-{T}-x(2)-[NRHSA]-[LIVMSTA]-x(2)-[KR].
NR /RELEASE=2022_02,567483;
NR /TOTAL=188(188); /POSITIVE=173(173); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=15(15);
NR /FALSE_NEG=77; /PARTIAL=0;
CC /TAXO-RANGE=??EP?; /MAX-REPEAT=1;
CC /VERSION=2;
DR P29369 , AGMR_PSEAE , T; A8R3T0 , AGMR_PSEPU , T;
DR A0A0N8YGA2, ANOR_ACINO , T; P0A4H3 , BVGA_BORBR , T;
DR P0A4H4 , BVGA_BORPA , T; P0A4H2 , BVGA_BORPE , T;
DR Q46751 , CARR_PECCC , T; P14204 , CMPA_BACSU , T;
DR P52106 , CSGD_ECOLI , T; O54294 , CSGD_SALTY , T;
DR P37740 , DCTR_RHOCA , T; P13800 , DEGU_BACSU , T;
DR P54662 , DEGU_BREBE , T; P9WMF8 , DEVR_MYCTO , T;
DR P9WMF9 , DEVR_MYCTU , T; Q46967 , ECHR_DICCH , T;
DR O69280 , ECNR_CITFR , T; P54293 , ESAR_PANSE , T;
DR P0ACZ6 , EVGA_ECO57 , T; P0ACZ5 , EVGA_ECOL6 , T;
DR P0ACZ4 , EVGA_ECOLI , T; P0ACZ7 , EVGA_SHIFL , T;
DR Q47188 , EXPR_DICD3 , T; Q47189 , EXPR_PECPM , T;
DR P0AEL9 , FIMZ_ECO57 , T; P0AEL8 , FIMZ_ECOLI , T;
DR P26319 , FIMZ_SALTY , T; P26487 , FIXJ_AZOC5 , T;
DR P23221 , FIXJ_BRADU , T; P10958 , FIXJ_RHIME , T;
DR Q51373 , GACA_PSEAE , T; P32967 , GACA_PSEPH , T;
DR Q52376 , GACA_PSEU2 , T; P95582 , GACA_PSEVI , T;
DR P11470 , GERE_BACSU , T; P25084 , LASR_PSEAE , T;
DR O32197 , LIAR_BACSU , T; P94439 , LNRK_BACSU , T;
DR P12746 , LUXR_ALIFS , T; P35327 , LUXS_ALIF1 , T;
DR A8AQX2 , MALT_CITK8 , T; A7ME76 , MALT_CROS8 , T;
DR A7ZSU8 , MALT_ECO24 , T; B7UKC3 , MALT_ECO27 , T;
DR B7MDP4 , MALT_ECO45 , T; B7L4U8 , MALT_ECO55 , T;
DR Q8X701 , MALT_ECO57 , T; B5YTW9 , MALT_ECO5E , T;
DR B7NMI3 , MALT_ECO7I , T; B7N1J6 , MALT_ECO81 , T;
DR B7M2H9 , MALT_ECO8A , T; C4ZVX0 , MALT_ECOBW , T;
DR B1X764 , MALT_ECODH , T; A8A5M7 , MALT_ECOHS , T;
DR A1AGU2 , MALT_ECOK1 , T; Q0TC49 , MALT_ECOL5 , T;
DR Q8CXX5 , MALT_ECOL6 , T; B1IP47 , MALT_ECOLC , T;
DR P06993 , MALT_ECOLI , T; B7NE23 , MALT_ECOLU , T;
DR B6I2Y2 , MALT_ECOSE , T; B1LI79 , MALT_ECOSM , T;
DR Q1R5L6 , MALT_ECOUT , T; A4WFK6 , MALT_ENT38 , T;
DR B7LSC1 , MALT_ESCF3 , T; B5XTR7 , MALT_KLEP3 , T;
DR A6TF41 , MALT_KLEP7 , T; Q7N976 , MALT_PHOLL , T;
DR B5F8N2 , MALT_SALA4 , T; A9MMA9 , MALT_SALAR , T;
DR Q57IV9 , MALT_SALCH , T; B5FKD6 , MALT_SALDC , T;
DR B5R375 , MALT_SALEP , T; B5R7J9 , MALT_SALG2 , T;
DR B4TKU2 , MALT_SALHS , T; B4SVL9 , MALT_SALNS , T;
DR Q5PM00 , MALT_SALPA , T; A9MTT7 , MALT_SALPB , T;
DR B5BHH3 , MALT_SALPK , T; B4TY75 , MALT_SALSV , T;
DR Q8Z227 , MALT_SALTI , T; Q8ZLI3 , MALT_SALTY , T;
DR A8GKU0 , MALT_SERP5 , T; Q31VL4 , MALT_SHIBS , T;
DR Q0SZP7 , MALT_SHIF8 , T; Q3YWK7 , MALT_SHISS , T;
DR A7N5N6 , MALT_VIBCB , T; Q9KNF3 , MALT_VIBCH , T;
DR Q87FQ5 , MALT_VIBPA , T; Q8D4P3 , MALT_VIBVU , T;
DR Q7MG94 , MALT_VIBVY , T; A1JSF2 , MALT_YERE8 , T;
DR A7FNW4 , MALT_YERP3 , T; Q1C2L4 , MALT_YERPA , T;
DR B2K5W2 , MALT_YERPB , T; Q8ZJI2 , MALT_YERPE , T;
DR A4TGR4 , MALT_YERPP , T; Q664J3 , MALT_YERPS , T;
DR B1JHZ0 , MALT_YERPY , T; P54794 , MOAR_KLEAE , T;
DR P0AF30 , NARL_ECO57 , T; P0AF29 , NARL_ECOL6 , T;
DR P0AF28 , NARL_ECOLI , T; P0AF31 , NARL_SHIFL , T;
DR P31802 , NARP_ECOLI , T; P44845 , NARP_HAEIN , T;
DR P15940 , NODW_BRADU , T; A7X623 , NREC_STAA1 , T;
DR A6U4C0 , NREC_STAA2 , T; Q2FEA6 , NREC_STAA3 , T;
DR Q2FVM7 , NREC_STAA8 , T; A5IVH2 , NREC_STAA9 , T;
DR Q2YZ42 , NREC_STAAB , T; Q5HDG5 , NREC_STAAC , T;
DR A6QJN1 , NREC_STAAE , T; Q99RN8 , NREC_STAAM , T;
DR Q7A3U5 , NREC_STAAN , T; Q6GE42 , NREC_STAAR , T;
DR Q6G6T0 , NREC_STAAS , T; A8Z580 , NREC_STAAT , T;
DR Q7A029 , NREC_STAAW , T; Q7WZY4 , NREC_STACT , T;
DR Q5HLK6 , NREC_STAEQ , T; Q8CN75 , NREC_STAES , T;
DR Q4L8Q6 , NREC_STAHJ , T; P54303 , PHZR_PSECL , T;
DR Q51786 , PHZR_PSEFL , T; P69406 , RCSA_ECO57 , T;
DR P0DMC9 , RCSA_ECOLI , T; P0DMD0 , RCSA_ECOLX , T;
DR P20098 , RCSA_ERWAM , T; P05338 , RCSA_KLEAE , T;
DR P27488 , RCSA_PANSE , T; Q56083 , RCSA_SALTI , T;
DR P54698 , RCSA_SALTY , T; P69409 , RCSB_ECO57 , T;
DR P69408 , RCSB_ECOL6 , T; P0DMC7 , RCSB_ECOLI , T;
DR P0DMC8 , RCSB_ECOLX , T; Q56127 , RCSB_SALTI , T;
DR P58663 , RCSB_SALTY , T; P69410 , RCSB_SHIFL , T;
DR Q03316 , RHIR_RHILV , T; P54292 , RHLR_PSEAE , T;
DR P07026 , SDIA_ECOLI , T; P56644 , SGAR_HYPME , T;
DR O30919 , SOLR_RALSL , T; P58590 , SOLR_RALSO , T;
DR O87940 , TDIR_THAAR , T; Q2T4M4 , THAA_BURTA , T;
DR P24908 , TRPO_PSEAE , T; Q7CQM8 , TTRR_SALTY , T;
DR P0AGA8 , UHPA_ECO57 , T; P0AGA7 , UHPA_ECOL6 , T;
DR P0AGA6 , UHPA_ECOLI , T; P27667 , UHPA_SALTY , T;
DR P0AGA9 , UHPA_SHIFL , T; P66798 , UVRY_ECO57 , T;
DR P66797 , UVRY_ECOL6 , T; P0AED5 , UVRY_ECOLI , T;
DR P0AED6 , UVRY_SHIFL , T; P55629 , Y4QH_SINFN , T;
DR P9WMG0 , Y890_MYCTO , T; P9WMG1 , Y890_MYCTU , T;
DR P59969 , Y914_MYCBO , T; P96686 , YDFI_BACSU , T;
DR P54295 , YENR_YEREN , T; P45785 , YEXN_AERSA , T;
DR P58664 , YGEK_ECO57 , T; Q46791 , YGEK_ECOLI , T;
DR O07528 , YHCZ_BACSU , T; P37640 , YHJB_ECOLI , T;
DR P55184 , YXJL_BACSU , T;
DR P0A3J5 , AHYR_AERHY , N; Q0VKZ4 , ALKS_ALCBS , N;
DR P17051 , ALKS_PSEOL , N; Q9L4M7 , ALKS_PSEPU , N;
DR P0A3J6 , ASAR_AERSA , N; P39404 , BGLJ_ECOLI , N;
DR Q89VI3 , BJAR1_BRADU, N; Q01108 , BRPA_STRHY , N;
DR Q8X5P3 , DCTR_ECO57 , N; Q8FCK2 , DCTR_ECOL6 , N;
DR P37195 , DCTR_ECOLI , N; Q83J60 , DCTR_SHIFL , N;
DR O34723 , DESR_BACSU , N; A7ZI28 , ECPR_ECO24 , N;
DR B7UJE2 , ECPR_ECO27 , N; B7L425 , ECPR_ECO55 , N;
DR Q8X6I1 , ECPR_ECO57 , N; B5Z1N3 , ECPR_ECO5E , N;
DR B7MP71 , ECPR_ECO81 , N; B1XE36 , ECPR_ECODH , N;
DR A7ZWT2 , ECPR_ECOHS , N; A1A7X7 , ECPR_ECOK1 , N;
DR Q9AME2 , ECPR_ECOKI , N; Q0TKZ0 , ECPR_ECOL5 , N;
DR Q8FKL2 , ECPR_ECOL6 , N; B1J0X8 , ECPR_ECOLC , N;
DR P71301 , ECPR_ECOLI , N; B7N8J2 , ECPR_ECOLU , N;
DR B6I082 , ECPR_ECOSE , N; B1LHW0 , ECPR_ECOSM , N;
DR Q1RFQ3 , ECPR_ECOUT , N; B5Y159 , ECPR_KLEP3 , N;
DR A6T571 , ECPR_KLEP7 , N; Q325R5 , ECPR_SHIBS , N;
DR A8R3S7 , EXAE_PSEPU , N; P63206 , GADE_ECO57 , N;
DR P63205 , GADE_ECOL6 , N; P63204 , GADE_ECOLI , N;
DR P63207 , GADE_SHIFL , N; Q1M7A0 , MCTR_RHIL3 , N;
DR P29904 , MOXX_PARDE , N; P9WGM4 , NARL_MYCTO , N;
DR P9WGM5 , NARL_MYCTU , N; O54452 , RAIR_RHIET , N;
DR Q6NCZ5 , RPAR_RHOPA , N; Q8KR08 , TMOT_PSEME , N;
DR A5W4E2 , TODT_PSEP1 , N; I7CA98 , TODT_PSEPT , N;
DR Q3LWR6 , TODT_PSEPU , N; P54294 , TRAR_AGRFC , N;
DR P33909 , TRAR_AGRVI , N; P33905 , TRAR_RHIRD , N;
DR P55407 , TRAR_SINFN , N; P74946 , VANR_VIBAN , N;
DR Q2YJ50 , VJBR_BRUA2 , N; Q579W9 , VJBR_BRUAB , N;
DR Q8YAY5 , VJBR_BRUME , N; A5VTN1 , VJBR_BRUO2 , N;
DR Q8FXF9 , VJBR_BRUSU , N; P0C0Z1 , VRAR_STAA1 , N;
DR Q5HEP0 , VRAR_STAAC , N; Q7A2Q1 , VRAR_STAAM , N;
DR Q7A4R9 , VRAR_STAAN , N; Q6GFH3 , VRAR_STAAR , N;
DR Q6G850 , VRAR_STAAS , N; Q7A0I0 , VRAR_STAAW , N;
DR Q5HN50 , VRAR_STAEQ , N; Q8CNP9 , VRAR_STAES , N;
DR Q4L7J5 , VRAR_STAHJ , N; Q49YS9 , VRAR_STAS1 , N;
DR P48359 , YCF29_CYAPA, N; O78417 , YCF29_GUITH, N;
DR Q1XDE4 , YCF29_NEOYE, N; P51343 , YCF29_PORPU, N;
DR P0ADD7 , YJJQ_ECOLI , N; Q9JMT8 , YUAB_ECOLI , N;
DR O87971 , YUKR_YERRU , N;
DR A5PMU4 , ANS1B_DANRE, F; Q2FJE2 , GLMU_STAA3 , F;
DR Q2G0S3 , GLMU_STAA8 , F; Q2YVU6 , GLMU_STAAB , F;
DR Q5HIH6 , GLMU_STAAC , F; Q99WA4 , GLMU_STAAM , F;
DR Q7A7B4 , GLMU_STAAN , F; Q6GJH2 , GLMU_STAAR , F;
DR Q6GBY9 , GLMU_STAAS , F; Q8NXZ7 , GLMU_STAAW , F;
DR Q9HCM3 , K1549_HUMAN, F; Q68FD9 , K1549_MOUSE, F;
DR P02964 , RPSH_BACLI , F; P17869 , RPSH_BACSU , F;
DR P60951 , Y170_LACJO , F;
3D 1A04; 1FSE; 1JE8; 1RNL; 1X3U; 1ZG1; 1ZG5; 1ZLJ; 1ZLK; 2KRF; 3C3W; 3C57;
3D 3ULQ; 4LFU; 4LGW; 5F64; 5O8Y; 5O8Z; 5VXN; 5W43; 6EO2; 6EO3; 6MWH; 6MWL;
3D 6MWW; 6MWZ; 6V7W; 6V7X; 6ZIX; 6ZJ2;
DO PDOC00542;
//
