GenomeNet

Database: PROSITE
Entry: SLH
LinkDB: SLH
Original site: SLH 
ID   SLH; MATRIX.
AC   PS51272;
DT   01-NOV-2006 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 17-JUN-2020 INFO UPDATE.
DE   S-layer homology (SLH) domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=64;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=64;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-1.0779995; R2=0.0092227; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1095; N_SCORE=9.02; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=714; N_SCORE=5.5; MODE=1; TEXT='R?';
MA   /DEFAULT: M0=-14; D=-100; I=-100; B1=-500; E1=-500; MI=-250; MD=-250; IM=-250; DM=-250;
MA   /I: B1=0; BI=-250; BD=-250;
MA   /M: SY='P'; M=7,-53,-2,10,9,-10,-34,-10,2,6,-18,8,12,5,-19,7,3,-4,-16,0;
MA   /I: I=-22; MD=-56;
MA   /M: SY='A'; M=21,-43,0,-10,-8,-15,-14,-22,4,-12,-23,18,-5,-15,-25,17,12,-11,-57,5; D=-22;
MA   /I: I=-22; MD=-56;
MA   /M: SY='P'; M=2,-35,-13,-8,-16,-22,-15,-11,3,-24,-31,8,29,0,-26,13,12,-5,-26,-3; D=-22;
MA   /I: I=-22; MD=-56;
MA   /M: SY='F'; M=-6,-39,-26,-25,42,-27,-34,-22,-9,-20,-20,-5,18,-9,-20,-9,12,-13,-49,25; D=-22;
MA   /I: I=-22; MD=-56;
MA   /M: SY='F'; M=-21,-59,-16,-28,57,-28,-37,-25,-5,-24,-44,-14,8,-12,-13,7,10,-28,-49,7; D=-22;
MA   /I: I=-22; MD=-56;
MA   /M: SY='D'; M=-19,-55,61,-18,44,-33,-31,-26,13,-19,-37,-10,-7,-23,-24,8,9,-23,-53,-13; D=-22;
MA   /I: I=-22; MI=-56; IM=-56; DM=-56;
MA   /M: SY='D'; M=11,-55,72,-6,-9,-23,-33,-31,7,-34,-48,4,-24,-15,-20,7,3,-26,4,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-6,-45,61,-11,-40,-17,-37,2,-13,-18,-24,-2,-20,-25,-38,-8,-11,43,-66,-26;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-55,19,-1,-47,-30,-43,17,11,-20,-12,8,46,13,-34,18,9,-5,-61,-47;
MA   /M: SY='I'; M=4,-44,-5,5,-24,-27,-35,35,18,-25,-25,-6,21,9,-20,4,6,12,-58,-30;
MA   /M: SY='N'; M=-4,-54,18,-18,-43,36,-36,-48,-10,-43,-49,42,38,-9,-33,31,0,-38,-25,-29;
MA   /M: SY='H'; M=7,-47,33,-10,-25,-19,82,-31,-14,-43,-34,2,9,-6,-20,23,3,-46,-35,2;
MA   /M: SY='W'; M=-28,-69,-36,-18,-2,-40,-50,-36,-23,-32,-18,-30,14,-11,-26,-15,-32,-42,148,24;
MA   /M: SY='A'; M=62,-44,-16,-38,14,-5,-26,-35,-39,-16,-26,-21,-43,-37,-47,4,-28,-23,-4,49;
MA   /M: SY='Y'; M=14,-44,-25,13,-6,-37,-24,-25,37,-24,-20,-25,-39,18,28,-9,-19,-15,-33,51;
MA   /M: SY='P'; M=0,-57,30,32,-56,17,-30,-45,16,-48,-41,19,35,17,-5,-1,-10,-42,-48,-40;
MA   /M: SY='Y'; M=40,-29,14,16,5,-25,-8,-37,-26,-37,-36,-19,-5,-1,-40,19,-20,-26,-13,54;
MA   /M: SY='I'; M=-17,-53,-56,-51,-22,-53,-54,73,-56,1,17,-56,-45,-54,-54,-42,-36,55,-57,-21;
MA   /I: I=-45; MI=-3; MD=-42; IM=0; DM=-42;
MA   /M: SY='Q'; M=27,-38,5,27,-52,-14,-28,-28,11,-18,13,22,-47,39,-10,6,-9,-27,-45,-14;
MA   /M: SY='A'; M=35,-51,-17,-5,-6,-31,-16,3,6,-15,-19,-13,-31,5,6,-1,13,-6,33,14;
MA   /M: SY='L'; M=45,9,-57,-51,-20,-22,-50,-3,-51,46,40,-45,-56,-47,-52,-31,-27,11,-25,-35;
MA   /M: SY='Y'; M=33,-29,-43,-20,-22,-33,-11,3,-5,-14,-23,-23,-52,3,-30,5,9,31,-5,42;
MA   /M: SY='E'; M=23,-54,19,34,-49,-10,-2,-44,25,-47,-30,5,-41,23,6,21,-12,-42,-22,-12;
MA   /M: SY='N'; M=22,-39,-30,2,-24,-36,-3,-20,26,15,0,27,-51,5,18,-12,-8,-29,-36,10;
MA   /I: I=-22; MI=0; MD=-56; IM=0; DM=-56;
MA   /M: SY='G'; M=-21,-57,-6,-5,-52,80,-22,-60,-6,-49,-48,18,-43,-3,-29,-16,-44,-60,-56,-36;
MA   /M: SY='I'; M=-36,-14,-64,-60,8,-66,-56,70,-54,32,-10,-49,-58,-54,-58,-46,-25,33,-39,12;
MA   /M: SY='M'; M=-16,-51,-55,-51,10,-55,-53,55,-52,12,58,-35,-43,-50,-50,-22,10,40,-55,-24;
MA   /I: I=-20; MI=0; MD=-49; IM=0; DM=-49;
MA   /M: SY='S'; M=3,-39,-4,2,-42,-17,-12,-16,34,-33,-29,21,-36,11,2,37,15,-4,-60,-42;
MA   /M: SY='G'; M=-20,-57,-16,-41,-61,88,-49,-44,-38,-46,-52,0,-10,-41,-42,-23,-27,-53,-56,-49;
MA   /M: SY='Y'; M=-40,-56,14,-21,25,-42,-19,-10,6,-26,9,-8,-44,-40,-6,-25,8,-2,1,85;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-58,3,20,-56,31,-33,-50,-22,-42,-44,-12,74,-17,-41,10,13,-40,-36,-41;
MA   /I: I=-9; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='D'; M=-15,-59,82,-4,-49,-1,-37,-57,-13,-54,-51,45,-28,-5,-39,-20,-19,-57,-74,-46; D=-9;
MA   /I: I=-9; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='G'; M=-30,-56,-3,-27,-52,73,-43,-64,0,-53,-46,39,-19,-9,-17,-6,-8,-59,-59,-48; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-21;
MA   /M: SY='T'; M=-30,-36,-30,-12,-37,-28,-23,-27,20,-12,8,14,-41,0,-1,16,62,-20,-47,4; D=-9;
MA   /I: I=-9; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='F'; M=-52,-48,-66,-62,103,-63,-46,-6,-58,14,-18,-58,-50,-64,-55,-54,-43,-28,3,33;
MA   /M: SY='R'; M=1,-43,5,0,-39,11,-2,-55,32,-40,-5,25,-50,16,55,-11,-34,-38,-56,-8;
MA   /M: SY='P'; M=-11,-67,-48,-38,-46,-17,-51,-50,-44,-34,-48,-51,113,-47,-52,-28,-27,-38,-34,-59;
MA   /M: SY='N'; M=-22,-47,52,20,-43,4,-15,-48,15,-29,-41,54,-48,22,-18,-1,-8,-51,-20,-21;
MA   /M: SY='Q'; M=4,-55,31,27,-52,7,-18,-45,25,-39,-9,26,-47,31,23,-5,-14,-40,-61,-43;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-55,-10,-6,-24,-31,-12,-22,0,-21,-31,40,58,1,-22,16,11,-20,-56,10;
MA   /M: SY='I'; M=9,-43,-61,-57,-29,-52,-58,61,-54,25,25,-54,-56,-52,-56,-37,-8,46,-58,-39;
MA   /M: SY='T'; M=-33,-44,-16,-38,-49,-45,-45,-37,-2,-34,-42,6,-31,-27,-35,30,91,-32,-67,-42;
MA   /M: SY='R'; M=-44,-47,-44,-33,-45,-47,-29,-55,7,-49,-44,-34,-56,-8,104,-38,-43,-46,-25,-9;
MA   /M: SY='A'; M=61,-49,-22,30,-44,19,-44,-35,-34,-17,-22,-30,-47,6,-41,-3,-33,-29,-35,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-25,-61,24,83,-63,-52,-11,-60,-24,-55,-28,-29,-40,64,-28,-21,-34,-49,-24,-42;
MA   /M: SY='M'; M=45,-43,-57,-51,51,-40,-47,0,-48,6,58,-50,-55,-44,-51,-21,-18,13,-45,3;
MA   /M: SY='A'; M=70,-13,-52,-42,-22,-36,-51,7,-46,-4,6,-46,-50,-44,-50,-8,-4,17,-56,-33;
MA   /M: SY='A'; M=40,-30,-38,-24,-42,-41,-34,-1,5,-29,-16,-29,-49,17,-7,0,32,36,-59,-27;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-43,-57,-56,35,-57,-40,39,-53,29,72,-55,-57,-45,-53,-29,-29,20,24,0;
MA   /M: SY='I'; M=-25,-28,-64,-58,1,-65,-54,53,-45,53,35,-58,-59,-52,-56,-52,-18,20,-53,-31;
MA   /M: SY='Y'; M=21,-17,-20,-30,-10,-28,-4,-7,-18,-13,6,11,-53,-14,-26,4,-2,37,-38,47;
MA   /M: SY='R'; M=-24,-58,-22,-25,-56,-39,-26,-46,46,-39,-34,35,-41,16,78,-23,-25,-45,-58,-45;
MA   /M: SY='A'; M=51,-3,-52,-40,-2,-11,-43,6,-47,14,27,-40,-52,-33,-50,-3,7,7,-30,2;
MA   /M: SY='L'; M=-5,-51,-21,-27,23,-52,-26,12,-29,54,31,-29,-58,-34,-31,-27,-25,-3,-24,12;
MA   /M: SY='G'; M=-12,-37,25,14,-50,41,-28,-38,21,-38,-23,36,-29,19,-6,-7,-24,-25,-40,-36;
MA   /M: SY='L'; M=0,-35,-23,-12,-8,-39,-19,9,10,33,-17,-1,-21,-1,3,-17,-20,2,-9,26;
MA   /I: I=-20; MD=-49;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-43,6,23,-16,-17,-29,-1,20,-4,-7,3,19,11,-11,-1,-6,-5,-43,-8; D=-20;
MA   /I: I=-20; MD=-49;
MA   /M: SY='P'; M=7,-39,5,19,-32,22,-8,-18,7,-20,-15,-1,23,13,-19,-5,-11,-16,-5,-15; D=-20;
MA   /I: I=-20; MD=-49;
MA   /M: SY='E'; M=-2,-58,10,21,-36,-14,-38,-25,10,-18,-31,14,1,10,-6,5,4,-21,-29,-16; D=-20;
MA   /I: I=-20; MD=-49;
MA   /M: SY='N'; M=9,-58,14,15,-26,-8,-15,-15,-4,-19,-15,22,0,-11,-18,2,-9,-15,-39,-26; D=-20;
MA   /I: I=-20; MI=-49; MD=-49; IM=-49; DM=-49;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-56,5,5,-36,-4,-30,-13,13,-11,-28,17,25,12,-21,-6,14,-3,-26,-14; D=-20;
MA   /I: I=-20; DM=-49;
MA   /M: SY='P'; M=7,-44,19,-7,-22,3,-45,-12,3,-10,-14,1,29,-3,-24,6,6,0,-20,-15; D=-20;
MA   /I: I=-20; DM=-49;
MA   /M: SY='D'; M=8,-37,20,8,-25,-12,-42,-6,11,-9,-2,10,5,1,-21,3,12,0,-29,-7; D=-20;
MA   /I: I=-20; DM=-49;
MA   /M: SY='P'; M=3,-54,1,12,-11,4,-11,-24,9,-25,1,7,23,12,-8,17,-2,-4,-11,-10;
MA   /I: I=-20; E1=0; IE=-250; DE=-49;
NR   /RELEASE=2020_03,562755;
NR   /TOTAL=54(24); /POSITIVE=54(24); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=2;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=S_Ohji;
CC   /TAXO-RANGE=???P?; /MAX-REPEAT=3;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=SLH;
CC   /VERSION=4;
DR   Q06848    , ANCA_HUNT2 , T; P38536    , APU_THETU  , T;
DR   P19424    , GUN_BACS6  , T; Q01969    , OMPA_THEMA , T;
DR   P49051    , SLAP1_BACAN, T; Q06852    , SLAP1_HUNT2, T;
DR   Q5SH37    , SLAP1_THET8, T; P94217    , SLAP2_BACAN, T;
DR   Q06853    , SLAP2_HUNT2, T; P35830    , SLAP2_THET8, T;
DR   P38538    , SLAPH_BRECH, T; P06546    , SLAPM_BREBN, T;
DR   P35824    , SLAP_BACCI , T; P49052    , SLAP_BACLI , T;
DR   Q9ZES5    , SLAP_BACTF , T; P38537    , SLAP_LYSSH , T;
DR   P22258    , SLAP_THEKI , T; Q9RRB6    , SLPA_DEIRA , T;
DR   C6CRV0    , XYNA1_PAESJ, T; P36917    , XYNA_THESA , T;
DR   P38535    , XYNX_HUNTH , T; Q8YNL5    , Y4550_NOSS1, T;
DR   Q9RMZ0    , Y6545_BACAN, T; P15730    , Y772_SYNY3 , T;
DR   P85122    , SLAP1_BACHU, P; P85110    , SLAP2_BACHU, P;
PR   PRU00777;
DO   PDOC00823;
//
DBGET integrated database retrieval system