KEGG   Paramecium tetraurelia: GSPATT00017698001
Entry
GSPATT00017698001 CDS       T01055                                 
Name
(RefSeq) hypothetical protein
  KO
K18442  brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein
Organism
ptm  Paramecium tetraurelia
Pathway
ptm04144  Endocytosis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ptm00001]
 09140 Cellular Processes
  09141 Transport and catabolism
   04144 Endocytosis
    GSPATT00017698001
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04131 Membrane trafficking [BR:ptm04131]
    GSPATT00017698001
Membrane trafficking [BR:ptm04131]
 Endosome - Golgi transport
  Arf GTPases and associated proteins
   Arf GTPase associated proteins
    GSPATT00017698001
SSDB
Motif
Pfam: Sec7 Sec7-like_HDS BIG2_C Sec7-like_HUS Phage_lambda_P
Other DBs
NCBI-GeneID: 5036536
NCBI-ProteinID: XP_001450751
Genoscope: GSPATT00017698001
UniProt: A0DJY7
Position
undetermined
AA seq 1473 aa
MNETYQSLVQQYIEKLKKVLPQKGNYYKETLSKFYGQDKSYFGDHIIAFKQGMQIKQSKI
KELTLTTLINIVSKGYIDGQLIDNTQNFQYFETIEITDATGKKKEQSINVIESLILLVQQ
CLVEKDEIISLALKLLISLVTNPFCNMQQHELTKIIKTVVYIYAQSKSQNIDRLCKSIFL
QIILITFQGTNCESIVKITMDNIINKVSDKKLCQYCGKQGKFECRQQKVTVCSYGCKKNI
QETLELQQKNYENAQNVFDLLIRLLSPKQNQIILLEGIYFICDNYDFSVESKSLNNLSSD
LLKFCLQNEYQLYSLSFKIFQRLAFSKHKEMINQINIFINQIYLSVLENKNTTDQHKQTT
LESLLNIFQRKHASLEFYLNYDCSIKHEFLMENIINALHTIFQQNEQFRPLITQIYQAII
VGIEQTFNEKAISNSQQEQQQPQDIDETVFINQLEMQRQQKQEIQKGVELFKKNPEKGVS
FFLKANIIQDDPTSIAKFLLENKSLPKESVGQYLGGHHPINIQVLRDYTNFLTFHNLSVE
QALRQYLDLFTLPPESQQIDRVVQKFADKFYEDNQNNQNFHFKSSSSIYTFTYLLVMLQT
DLHNPKVVEKMKLTDFTKLARQINDGEDLPLEYLTITYNSIQKNPLAVRESNTSMNPLTP
NQYQNQMEELLKKIKDLIKRQSDSNYIQIDQETILLSKGLLESFSGKFLEILLVTFETTP
NGDALIKSILQLIRLSSKLQMKIENLVQDVVKVGLNSLKKGNGMLMIGLLSIIPIIGNSL
HEQGWKCVLEAVSLMDELRQLDSDHTDKVFMSSKDLDNLSIEEFIIQLCQLSKQEIFNKH
RIYSLQKLVEVSDYNMDRVKVIWNRLWSIVGQHIQEAVAFRVKSITIFAVDSLKQLNIKF
LQKEELYNIQFQREVLKPFEIIYLNSDADEKEFVLLCVKQILQNSKTYIKSGYKVIFNLI
NLGLKEENDTISKLAFDLLKFIEIQEMILIDLIQTYQILGKKDNEYMAINSIEFVKQCQR
FMVTQEQQTLQVPLLGILSNLAGDKRIQIQTQAVETLFYILEEKGSLFNEEYWIMIFSSV
LRPIFDEIQFTLSTSPELNQYWFKDSCQKKHYTKLKGQLADFLKLFQNCIQNQNEKLAQL
SIWAFKTMIIDKGLQFDQKDWEQILLFIQQMLRYTIPTKLKDIDQTTIKQEQQFNGILKK
QKSFQSITNDIINECYSQCASQLLLIQTSKDICELYHQNWNLNQLDNLEKTFYESYQFAK
DFNQQIELRYNIWRSGFMQEMSVLPGLLRQEREAFSCMIMIIQFKMKMLKQEQQQQQKQE
QNEQQSQEQQIKEQQLREQYQIDLNKYLQILLDSIKQFNSKHIQFVNQQQEVVDDNPLIK
IKQQETEREMTNLRTLLDVSILPKILLLCDEEIKIKLSEFYEQLLNACSYVSEYCILQMS
CQECKKCGRCLSQQKNNLFFQIKKCLLKLFELK
NT seq 4422 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatgaaacatattaaagtctggtttaataatatattgaaaaattgaaaaaggtgctt
ccctaaaaaggaaattattacaaagagaccctttcaaaattctatggataagacaaatcg
tatttcggagatcacattattgcttttaaatagggaatgcaaatcaagtaaagtaaaatt
aaagaattaactttaacaacactaattaacatagtatcaaaagggtatattgatggataa
ttaattgataatacataaaacttttaatattttgagacaatagaaataacagatgctaca
gggaaaaaaaaagaataatcgattaatgtgatagaatcactaatacttctagtataataa
tgcttggtcgagaaggatgaaataatttcattagcattaaaattattgatatcacttgta
acaaatccattttgtaatatgtaataacatgagctaacaaaaataattaaaaccgttgtg
tatatttatgcacagtcaaagtcttaaaatattgatagattatgcaaaagcattttctta
tagataattttaataacattttaaggaactaattgtgaaagcattgtgaaaattacaatg
gataatattataaataaagtttctgataaaaaattatgctagtattgtggaaaacaaggt
aagtttgaatgtagacagtagaaagtaacagtttgttcttatggatgcaagaagaatatt
taagagaccctagaattataataaaaaaattatgaaaatgcataaaatgtctttgatttg
ttaattagacttttatctccaaagcaaaattaaataattttactagagggaatttatttc
atatgcgataattatgatttctctgtggagagtaaaagcttaaataatttaagttcagac
ttgttaaaattttgtttataaaacgaatactaattatactcattaagttttaaaatcttt
taaagattagcatttagtaaacataaagaaatgattaattaaataaatatctttattaat
caaatttatctcagtgttctcgaaaacaaaaacactactgattaacataagtaaacaact
ttagaatcgttgttgaatatatttcaaagaaagcacgcctctcttgagttctatttgaat
tatgattgcagcataaagcatgaattcttaatggaaaatattattaatgcattacacact
atcttctaacaaaatgaataattccgtccattgattacacaaatatattaagcaataatt
gtaggcatagaataaacctttaatgaaaaagctattagtaattcatagtaggagtaataa
tagccttaggacattgatgaaactgtatttataaactaattagaaatgcaaagacaataa
aagtaagaaatataaaaaggagtagaactttttaaaaagaatcctgagaagggagtttca
ttttttttaaaggcaaatataatataagatgatccaacttcaattgcaaaatttttattg
gagaataaaagtttaccaaaggaatctgtaggttaatatcttggtggccatcatccaatc
aatatctaagtgttgagagattacactaattttttaacatttcataatttgtcagttgaa
taagccttaagacaatacttggatttgtttactttaccacctgaatcatagtagattgat
agagttgtctagaaatttgcagataaattctacgaggacaaccaaaacaattagaatttt
cactttaagtctagcagtagcatttatactttcacatatctcttagtcatgttataaaca
gatttacacaatcctaaggtcgttgaaaaaatgaaattaactgatttcacaaagttggca
agacaaataaatgatggtgaagatttgcctttggaatatctaacgattacttataattca
atttaaaagaatccacttgctgttagggaatcaaatacatcaatgaatccactaactccc
aactaatattaaaattaaatggaagaactcttaaagaagattaaagatttaatcaagaga
taatcagattctaactatatataaatagatcaagaaactatattattatcaaagggtttg
ctagaatccttttcaggcaaattcttagaaattcttttagtaacttttgaaactacccct
aatggcgatgcattaatcaaaagtatcctataattaattaggttgtcctcaaagttataa
atgaaaatagaaaatctagtttaagatgttgtaaaggttggcttgaatagtttaaaaaaa
ggaaatggtatgttaatgattggcttattgtctataattccaataattggtaattccttg
catgaataaggatggaaatgtgtattagaagcagtaagtttaatggatgaattaagataa
ttagattctgatcacacagataaagtctttatgagttcaaaagatttagataacttatct
attgaggaatttattattcaactatgctaattatcaaaataagaaatctttaataagcat
cgtatatattctttacaaaagcttgttgaagttagtgattacaatatggatagagtcaaa
gtcatatggaatagattatggtctattgtaggttaacatatttaagaagcagttgcattt
agagttaaatcaatcactattttcgctgtcgattctttaaaataacttaacattaaattc
ttatagaaagaagaattgtacaatattcaattttaaagagaggtcttgaagccatttgaa
ataatatatttaaatagtgatgcagatgaaaaagaatttgtactgctatgtgttaagtaa
atcctttaaaatagtaagacctacattaaaagtggatataaggtaatatttaatcttatt
aatcttggattgaaagaggaaaatgacacaatatctaagttagcatttgatctcttaaaa
tttatagaaatataagaaatgatactgatcgatttgattcaaacctattagatcttaggt
aaaaaggataatgaatatatggcaataaattcaatagaatttgtaaagcaatgctaacgt
tttatggtaacataagagtaataaacgttataagttcctctattaggaatcttatcaaat
ttggcaggtgataaacgaattcaaatttaaacttaagctgttgaaacattattttacatc
ttagaagagaaaggcagtttattcaatgaagagtactggataatgattttttcttctgta
ttaagacctatatttgatgaaatttaatttactttaagtacaagtccagagctcaattaa
tattggtttaaggatagttgccaaaagaaacattacactaaattgaaaggataattggca
gatttcttaaaattattttaaaattgcattcaaaattaaaatgaaaaattagcacaatta
agtatttgggcttttaaaactatgattattgataaaggactataatttgatcaaaaagat
tgggaatagatattgttatttatttaataaatgctaagatatacaataccaactaaactt
aaagatattgattaaacaacgattaaataagaatagtagttcaatggcatattgaagaaa
cagaaatcattttagagtatcacgaatgatatcattaatgaatgctatagttagtgtgct
tcctaattactattaatttaaaccagtaaggatatatgtgaactttatcattagaattgg
aatttaaattaattggacaatttagagaagaccttttacgaatcatatcaatttgccaaa
gactttaatcaataaatagaattaaggtataatatttggagatctggatttatgtaggaa
atgagtgttttacctggtttgctcagataagaaagagaggcattttcttgtatgattatg
ataatacaatttaaaatgaagatgttaaaataagaatagtaataataataaaaacaagag
taaaatgaacaataatcataagaataatagataaaggaataataactgagagaacaatat
tagatagatttaaataaatatttatagattttgttagactctattaagtaatttaattct
aagcacatttaatttgtgaatcaataataggaagttgttgatgataatccacttattaaa
ataaaataataagagacagaaagggaaatgacgaatctcagaactctgttggatgtttct
attttgccgaaaattctattgctgtgtgatgaggagattaaaataaaattaagtgaattt
tatgaataattactgaatgcatgtagttatgtcagtgaatactgtattttataaatgagc
tgttaagagtgtaagaaatgtggtagatgcttgagttaatagaaaaataatttatttttt
caaattaagaaatgcttactaaaattgtttgagttaaaatga

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (49)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (44)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   GENOSCOPE (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (5)   
   Pfam (5)   
All databases (61)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system