KEGG   Rickettsia africae: RAF_ORF0130
Entry
RAF_ORF0130       CDS       T00979                                 
Symbol
virB6-1
Name
(GenBank) VirB6
  KO
K03201  type IV secretion system protein VirB6
Organism
raf  Rickettsia africae
Pathway
raf03070  Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:raf00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09131 Membrane transport
   03070 Bacterial secretion system
    RAF_ORF0130 (virB6-1)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:raf02044]
    RAF_ORF0130 (virB6-1)
Secretion system [BR:raf02044]
 Type IV secretion system
  Conjugal DNA-protein transfer (VirB/D) protein
   RAF_ORF0130 (virB6-1)
SSDB
Motif
Pfam: TrbL
Other DBs
NCBI-ProteinID: ACP53103
UniProt: C3PME3
Position
135320..138439
AA seq 1039 aa
MKLFPRSILITLVLSFALNLGIVTKTHAKDTLDSIVDILSGLTCETQGVGDLLRTEFSHT
CIVAPFFTFAVMNLVSPVLYMNTFLKLKINDSDLFNDSNFGNFPGGQCTRENRIDPKNPE
LRFALCNNAKLIVSRAKSVAESALAIAKAVLTGSDPWDDIKTAWANKKKEYHVPYSGKPG
DDGFAFDLGFPVIYWKVIQDKDRICVSTKGFTGDVPVGCKYMKEPFPKSMYNSFMDVADK
DFIEDPNKTPTDPLALVSCSAAGDGCYQKAYNASKTAVVMTSPLIECMRQMIARLLISKD
VCSLDNVSQVVNLVSRQDSVFFQFQVGMYKIVTAFLTLYVMFFGFKLLLAGEVPPKSEYI
NFILKMIFVTYFSIGINITPGNGSPYDRLDGMIQWAFPFLLDGINGLASWVMNAAPSGLC
KFNNLSYDGTVSYIALWDALDCRVAHYLGLDILSTLLVENAYRSHDFLNFDFFSFSAPPY
IYLLIPAIISGNMMLVSLALSYPLLVISVAAFMVNATIMCMISIVILGILAPLFVPMFLF
AYTRNYFESWVKLMISFLLQPMVVVTFMITMFSVYDYGFYGKCQYKSKLIHNSIEDKIQG
GITSKRDVLIFYINNDWDDTSQYPDKDAVESCQNSLGYMLNNPITTVFNFTKDSVSEIVD
SKPGSTPTDKFLAKFQFLSGVVLGPGMFFMSPKVLFEKIKNILLALVMACFTLYLMYNFS
SQLAEFAADMTEGVALNNVAIKPQAIFKAAMAVLATAGAATKGGDQIASRGGVGDLKAGQ
GGGASDLEVGKGGLPNDNIAASGGTSAPAVTTPTASSSVATSSPKTVSSEARSDVVTPPA
PTEAVSPPSASIRTSISTPTASSSVATSSPKTVSSEARSDVVIPPAPTEAVSPPSASIRT
SISTPAPRVGKIIRDNNQESKKEIDNTPPSQEKVDNAAPQEKVDSTSKGTGVIDYSFNLK
EHDNPTGVKQIRENAEIRDKRVKVEKVWNELVASGGGRVREQEGGEISERRANAEKAWDE
LVKSGVVTEKKDNSSNENS
NT seq 3120 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaattatttcctcgtagtatacttataacattagtattaagctttgccctaaattta
gggatagttactaaaactcatgctaaagatactcttgatagcattgtagatattttgagt
ggcttaacttgcgaaacccaaggcgtaggcgatttgctgcgtactgaattttctcataca
tgtattgttgctccgttctttacttttgcggtaatgaatcttgtctctcccgttttatac
atgaatacgtttttaaagcttaaaataaacgacagtgatttatttaacgatagtaacttt
gggaattttcccggaggtcaatgtactcgtgaaaacagaattgatcctaaaaatccagaa
ttacgctttgctttatgtaataatgctaaattaattgtatctcgggcaaaatctgttgca
gaatcggcacttgctattgctaaagccgtcttaacagggagcgacccttgggatgatata
aagacagcgtgggcaaataaaaaaaaggaatatcatgttccatatagtggtaagcccggt
gatgacggttttgcatttgatttaggttttcctgtaatatattggaaagttattcaagat
aaagatagaatatgcgtatcgacaaaaggatttacaggagacgttcccgttggctgtaaa
tatatgaaagagccgtttccaaaatccatgtataatagctttatggatgtagcagataag
gattttattgaggatccaaataaaactcctaccgatcctttagctttagtttcctgtagt
gcagcgggtgatggatgttatcaaaaagcttataatgcttcaaaaactgcagtagtcatg
acttctcctcttatagaatgtatgaggcaaatgattgctagattactaattagtaaagat
gtttgtagtttggataatgtaagccaagtggttaatttggtttcaaggcaagatagtgta
ttctttcagtttcaagtaggaatgtataaaatagttacggcttttctaactttatatgtt
atgttttttggctttaaactattacttgcaggtgaagtgccgccaaaaagtgagtatata
aattttatattgaaaatgatattcgtaacttatttttcaataggaattaatataacccct
ggtaatggttctccgtatgaccggttagacggcatgattcagtgggcgtttcctttctta
cttgacggtataaacggtttagcaagttgggttatgaatgctgctccgtccggtttatgt
aaatttaacaatctttcttatgacggtaccgtttcttatattgcattatgggatgcatta
gattgtagggtagctcattatttagggcttgatatattatctacgttacttgtcgaaaat
gcttatcgcagtcatgattttttaaattttgatttctttagttttagtgctccaccatat
atttatttgctaattccggcgataatctccggtaatatgatgttggtgtcactcgctctt
tcttatccgttacttgtgatttcggttgctgcctttatggttaatgcaacgattatgtgt
atgatatctatagtaatactcggtattttggctcctctttttgtacctatgtttttattc
gcatatacaagaaattattttgagagctgggttaaactaatgatctcgttcttgctacaa
cctatggtggtagttacttttatgatcacgatgttttcggtatatgattatggtttctac
ggtaaatgtcaatataagagcaagttaattcacaatagtatagaagacaaaattcaaggt
ggcattacttctaagagggatgttttaatattttacattaataatgattgggatgatacg
tcacagtatcctgataaagatgctgtagaaagttgtcaaaatagtttaggttatatgtta
aataaccctattaccacagtatttaactttacaaaagatagtgtaagtgaaattgtcgat
agtaaaccgggtagtacccctaccgataaatttcttgctaaattccagtttttatcggga
gtagttttagggcccggaatgtttttcatgtctccaaaagtgctttttgagaaaattaaa
aatattttgcttgcgttagttatggcatgttttacattgtatttgatgtataattttagt
agtcagctagctgaatttgctgcagatatgacggaaggagtagctcttaataatgttgct
ataaaaccgcaagcaatatttaaggcagctatggcagtacttgctactgcgggtgctgca
actaaggggggcgatcagatagcaagtagaggaggagttggtgatttaaaagctggtcaa
ggtggaggagcaagtgatttagaggtagggaaaggcggactaccaaatgataatattgct
gcaagcggaggtacgtcggcacctgcggtaacaacgccgacagcttcgtcttctgtagca
acttctagcccaaaaactgtaagtagtgaagcaagatcagatgttgttactcctcctgct
cctacagaagctgtttcaccaccgtctgctagtattagaacttctatttctacgccgaca
gcttcgtcttctgtagcaacttctagcccaaaaactgtaagtagtgaagcaagatcagat
gttgttattcctcctgctcctacagaagctgtttcaccaccgtctgctagtattagaact
tctatttctacacctgcaccacgtgttggaaaaatcataagagataataatcaagaaagt
aaaaaagagattgataatactccgccttcacaggaaaaagttgataatgcagctccacaa
gaaaaagttgacagcacaagtaaaggtacaggagtaattgattatagttttaacttaaag
gaacatgataatccgacaggcgtaaaacagatacgggaaaatgcagagattcgagataaa
cgtgtaaaagtagaaaaagtatggaatgaactagtagcaagtggaggaggaagagtaaga
gaacaagaaggaggagaaatatcagaacgacgtgcaaatgctgaaaaggcatgggatgag
ttagtaaaaagcggcgtagtaacagaaaaaaaagataatagttctaatgaaaactcttaa

DBGET integrated database retrieval system