KEGG   Rickettsia conorii: RC0142
Entry
RC0142            CDS       T00061                                 
Name
(GenBank) unknown
  KO
K03201  type IV secretion system protein VirB6
Organism
rco  Rickettsia conorii
Pathway
rco03070  Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:rco00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09131 Membrane transport
   03070 Bacterial secretion system
    RC0142
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:rco02044]
    RC0142
Secretion system [BR:rco02044]
 Type IV secretion system
  Conjugal DNA-protein transfer (VirB/D) protein
   RC0142
SSDB
Motif
Pfam: TrbL
Other DBs
NCBI-ProteinID: AAL02680
UniProt: Q92JC5
Position
134703..137684
AA seq 993 aa
MKLFPRSILITLVLSFALNLGIVTKIHAKDTLDSIVDILSGLTCETQGVGDLLRTEFSHT
CIVAPFFTFAVMNLVSPVLYMNTFLKLKINDSDLFNDSNFGNFPGGQCTRENRIDPKNPE
LRFALCNNAKLIVSRAKSVAESALAIAKAVLTGSDPWDDIKTAWANKKKEYHVPYSGKPG
DDGFAFDLGFPVIYWKVIQDKDRICVSTKGFTGDVPVGCKYMKEPFPKSMYNSFMDVADK
DFIEDPNKTPTDPLALVSCSAAGDGCYQKAYNASKTAVVMTSPLIECMRQMIARLLISKD
VCSFDNVSQVVNLVSRQDSVFFQFQVGMYKIVTAFLTLYVMFFGFKLLLAGEVPPKSEYI
NFILKMIFVTYFSIGINITPGNGSPYDRLDGMIQWAFPFLLDGINGLASWVMNAAPSGLC
KFNNLSYDGTVSYIALWDALDCRVAHYLGLDILSTLLVENAYRSHDFLNFDFFSFSAPPY
IYLLIPAIISGNMMLVSLALSYPLLVISVAAFMVNATIMCMISIVILGILAPLFVPMFLF
AYTRNYFESWVKLMISFLLQPMVVVTFMITMFSVYDYGFYGKCQYKSKLIHNSIEDKIQG
GITSKRDVLIFYINNDWDDTSQYPDKDAVESCQNSLGYMLNNPITTVFNFTKDSVSEIVG
SKPGSTPTDKFLAKFQFLSGVVLGPGMFFMSPKVLFEKIKNILLALVMACFTLYLMYNFS
SQLAEFAADMTEGVALNNVAIKPQAIFKAAMAVLATAGAATKGGDQIASRGGVGDLKAGQ
GGGASDLEVGKGGLPNDNIAASGGTSAPAVTTPTASSSVASSSPKTVSSEARSDVVTPPA
PTEAVSPPPASIRTSISTLAPRVGKIIRDNNQESKKEIDNTPPSQEKVDNAAPQEKVDST
SKGTGVIDYSFNLKEHDNPTGVKQIRENAEIRDKRVKVEKAWNELVARGGGRVREQEGGE
ISERRANAEKAWDELVKSGVVTEKKDNSSNENS
NT seq 2982 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaattatttcctcgtagtatacttataacattagtattaagctttgccctaaattta
gggatagttactaaaattcatgctaaagatactcttgatagcattgtagatattttgagt
ggcttaacttgcgaaacccaaggcgtaggcgatttgctgcgtactgaattttctcataca
tgtattgttgctccgttctttacttttgcggtaatgaatcttgtctctcccgttttatac
atgaatacgtttttaaagcttaaaataaacgacagtgatttatttaacgatagtaacttt
gggaattttcccggaggtcaatgtactcgtgaaaacagaattgatcctaaaaatccagaa
ttacgctttgctttatgtaataatgctaaattaattgtatctcgggcaaaatctgttgca
gaatcggcacttgctattgctaaagccgtcttaacagggagcgacccttgggatgatata
aagacagcatgggcaaataaaaaaaaggaatatcatgttccatatagtggtaagcccggt
gatgacggttttgcatttgatttaggctttcctgtaatatattggaaagttattcaagat
aaagatagaatatgcgtatcgacaaaaggatttacaggagacgttcccgttggctgtaaa
tatatgaaagagccgtttccaaaatccatgtataatagctttatggatgtagcagataag
gattttattgaggatccaaataaaactcctaccgatcctttagctttagtttcctgtagt
gcagcgggtgatggatgttatcaaaaagcttataatgcttcaaaaactgcagtagtcatg
acttctcctcttatagaatgtatgaggcaaatgattgctagattactaattagtaaagat
gtttgtagttttgataatgtaagccaagtggttaatttggtttcaaggcaagatagtgta
ttctttcagtttcaagtaggaatgtataaaatagttacggcttttctaactttatatgtt
atgttttttggctttaaactattacttgcaggtgaagtgccgccaaaaagtgagtatata
aattttatattgaaaatgatattcgtaacttatttttcaataggaattaatataacccct
ggtaatggttctccgtatgaccggttagacggcatgattcagtgggcgtttcctttctta
cttgacggtataaacggtttagcaagctgggttatgaatgctgctccgtccggtttatgt
aaatttaacaatctttcttatgacggtaccgtttcttatattgcattatgggatgcatta
gattgtagggtagctcattatttagggcttgatatattatctacgttacttgtcgaaaat
gcttatcgcagtcatgattttttaaattttgatttctttagttttagtgctccaccatat
atttatttgctaattccggcgataatctccggtaatatgatgttggtgtcactcgctctt
tcttatccgttacttgtgatttcggttgctgcctttatggttaatgcaacgattatgtgt
atgatatctatagtaatactcggtattttggctcctctttttgtacctatgtttttattc
gcatatacaagaaattattttgagagctgggttaaactaatgatctcgttcttgctacaa
cctatggtggtagttacttttatgatcacaatgttttcggtatatgattatggtttctac
ggtaaatgtcaatataagagcaagttaattcacaatagtatagaagacaaaattcaaggt
ggcattacttctaagagggatgttttaatattttacattaataatgattgggatgatacg
tcacagtatcctgataaagatgccgtagaaagctgtcaaaatagtttaggttatatgtta
aataaccctattaccacggtatttaactttacaaaagatagtgtaagtgaaattgtcggt
agtaaaccgggtagtacccctaccgataaatttcttgctaaattccagtttttatcagga
gtagttttagggcccggaatgtttttcatgtctccaaaagtgctttttgagaaaattaaa
aatattttgcttgcgttagttatggcatgttttacattgtatttgatgtataattttagt
agtcagctagctgaatttgctgcagatatgacggaaggagtagctcttaataatgttgct
ataaaaccgcaagcaatatttaaggcagctatggcagtacttgctactgcgggtgctgca
actaaggggggcgatcagatagcaagtagaggaggagttggtgatttaaaagctggtcaa
ggtggaggagcaagtgatttagaggtagggaaaggcggactaccaaatgataatattgct
gcaagtggaggtacgtcggcacctgcggtaacaacgccgacagcttcgtcttctgtagca
agttctagcccaaaaactgtaagtagtgaagcaagatcagatgttgttactcctcctgct
cctacagaagctgtttcaccaccgcctgctagtattagaacttctatttctacacttgca
ccacgtgttggaaaaatcataagagataataatcaagaaagtaaaaaagagattgataat
actccgccttcacaggaaaaagttgataatgcagctccacaagaaaaagttgacagcaca
agtaaaggtacaggagtaattgattatagttttaacttaaaggaacatgataatccgaca
ggcgtaaaacagatacgggaaaatgcagagattcgagataaacgtgtaaaagtagaaaaa
gcatggaatgaactagtagcaagaggaggaggaagagtcagagaacaagaaggaggagaa
atatcagaacgacgtgcaaatgctgaaaaggcatgggatgagttagtaaaaagcggcgta
gtaacagaaaaaaaagataatagttctaatgaaaactcttaa

  All links  
Gene (2)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   SWISS-PROT (1)   
Protein domain (1)   
   Pfam (1)   
All databases (5)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system