KEGG   Rickettsia conorii: RC0144
Entry
RC0144            CDS       T00061                                 
Name
(GenBank) unknown
  KO
K03201  type IV secretion system protein VirB6
Organism
rco  Rickettsia conorii
Pathway
rco03070  Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:rco00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09131 Membrane transport
   03070 Bacterial secretion system
    RC0144
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:rco02044]
    RC0144
Secretion system [BR:rco02044]
 Type IV secretion system
  Conjugal DNA-protein transfer (VirB/D) protein
   RC0144
SSDB
Motif
Pfam: TrbL
Other DBs
NCBI-ProteinID: AAL02682
UniProt: Q92JC3
Position
139663..142563
AA seq 966 aa
MQGNLLKVLGVLAIVATLVCFIFAALGMIGAVKVGDSCYMRYASDGQGGADSIIGTITLN
ANANYVNTAKMLSDGTTLLVPDPTRYGEWLNTQVLVENSQPVNLQVVGQVSLCLAYIPKD
NLQRTGAGSNLDDNGQMIPIPRINDANNPPVSLIMDAKNNEWRNIAELYANDRVLVSVSP
NFANTDATVKDAFKGAEVTQDCSENKTTYNPICGKYSVYSGEYVNACELKEKYWNCEVTW
RCPTWHEQIGCDWGALGCVASCKKIPECTTKCMAWVNITRPAPENYLDDGSFTFSWSDNT
GKLFIDYSALQCSYNANIPPVDKCPDRVRDRRIKDKDYIGGVHCTSGICSDGDFQKNRRF
WYTADGKGGKGPTGLIYQMNDAGSVSQALPSKLEFAKFVADTDQPPDYKGKDGKYLYKVI
YNIPFNSNIAKSYLQYRLWSPTSQDSSKNTGGYVLNIKQTKCYRENGNSFNDTFDDRGRV
QYIIVKPSENPNTSGKTYSPQGISVDSEGKYSFNANEAGYIWMKILNDPGNNLRDYKDSE
GSYKVHFSTSLKVGSFTIKVMNPLLQLFKTKVQGAATSIFKNMVCYKANDSSSCTNFFTY
IKAILILYVMTYGAMFLLGFAKINQKELVIRIAKIGVVSGLMNGNTFEFFNNYLFDAITN
FSDSIIANMSGYSLFTSTNTISNPFMFLDAVMSKIFFSQTFIAQLLALLSLGLSGIIYFI
ITFIAVCIVIITALRAVAVYIMAFMATCILIGIAPLFISFLLFDFTRYLFDNWVRFTIRY
MMEPVVMMAGIIVLTQLFTIYLDFVLGYSVCWKCALPIKIPFIGTILPIALLNVPIFCIN
WFAPWGMDYMSGMMGVNMQNIVALVIIAYGMYGYVEFSGRIVVKLTSAVGPSATEIGGKM
SHDAGQKVLSSIGMDDKTRQGITGRAEARLKQRNKTLDQAEKNRKNTQKEGGEKTNEEPP
KPETPK
NT seq 2901 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcagggtaacttattaaaagttttaggagtacttgctatagtagcaacgttagtttgc
tttatttttgcagcacttggtatgataggagcagtaaaagtcggtgacagctgctacatg
agatatgcgtcggacggtcaaggaggagcggattcaataatcggtactataacccttaat
gctaatgctaattatgtaaacactgctaagatgttgtccgacggcacgactctacttgtt
cctgatcctactcgttacggtgaatggctaaatactcaggtgctagtagaaaacagccaa
ccggtgaatttacaagtggtcggtcaggttagtttgtgtttagcttatataccgaaagat
aatttacaacgtacaggggctggatctaatttagacgataacggtcaaatgatcccgatt
cctcgtattaacgatgcaaataatccacctgtctctctaataatggatgcaaaaaataat
gaatggcgtaatattgccgaattatacgccaatgatagagttttagtttccgtatctcct
aattttgccaatacggatgcgacagttaaagatgcttttaaaggtgctgaagttacgcaa
gattgttcagagaataaaactacttataatccaatttgtggaaaatattctgtttattca
ggtgagtatgtcaatgcttgcgagttaaaagagaagtattggaattgtgaagtcacatgg
aggtgccctacctggcatgagcaaataggttgcgactggggagcattgggctgtgttgcg
tcttgtaaaaagataccagaatgtacaacgaaatgtatggcttgggttaatataacgaga
ccagcaccagaaaactacctagatgatgggagttttacattttcgtggtctgacaacaca
ggtaaattatttatcgactattcagcccttcaatgttcttataatgctaatattcctcca
gttgataaatgtcctgatcgtgttcgcgatcgtcgtataaaagataaagattatattgga
ggtgtacattgtacttcgggcatatgtagcgatggagattttcaaaagaatcggagattt
tggtatacggcggacggtaaaggaggcaaaggaccaactggattaatatatcaaatgaat
gatgcgggttctgtaagtcaagctctgccttctaagctagaatttgctaaatttgttgca
gatacagatcaaccgcctgactataaaggtaaagacggtaaatatttatataaagttata
tataatataccttttaacagtaatattgcaaaaagttatttacaatataggctgtggtcg
cctacctcacaagatagtagtaagaatacgggaggatacgttttaaatattaaacagact
aaatgctatagagaaaacggtaatagttttaacgatacttttgatgatcgaggacgagtg
caatacatcatagtaaagccttcggaaaacccgaatactagcggtaaaacctattcacct
caaggaattagtgttgatagtgaaggtaaatatagctttaacgcaaatgaggcgggttat
atatggatgaaaattctaaatgatcctggtaataatttaagggactataaagatagtgaa
ggtagctataaagtacatttctcaacatccttaaaagtaggaagttttactattaaagta
atgaatccgttacttcagttatttaaaactaaagtgcaaggggctgctacttctattttt
aaaaatatggtatgttataaagctaatgatagttcgtcctgtactaacttttttacctat
attaaagcaattttaattctgtatgtgatgacttacggagcaatgtttttacttggtttt
gctaagataaaccaaaaagagctagtaattagaatagcaaaaatcggggtagttagcgga
cttatgaacggtaatacctttgaatttttcaataactatctttttgatgcaattaccaat
ttttcagactcaattattgctaatatgagtggatatagtttgtttacttctactaatact
atttctaatcctttcatgtttttagatgcagtaatgagtaaaatattttttagtcaaacc
tttatcgctcaattacttgcacttctttctcttgggcttagcggtattatatattttata
attacttttattgcggtttgtatagtaattattacggcgcttagagctgttgccgtttat
attatggcatttatggcaacttgtatattaatcggtatagcccctttatttattagtttc
ttattatttgattttactaggtatttatttgataattgggtgaggtttacgatccgctat
atgatggaaccggtagttatgatggcaggtattatagtgctaacacaactatttaccatt
tatctagattttgttttaggttatagcgtgtgttggaaatgtgctttaccgataaaaatt
ccgtttatcggtactattttacctattgccttgctgaatgtacctatcttctgtattaat
tggtttgccccttggggaatggattatatgtcgggtatgatgggagtaaatatgcaaaat
atcgtagctctagttattattgcttacggtatgtacggttatgtcgaattttcaggacgt
atagtagtaaaattaactagtgctgttgggccttcggctactgaaattggtggtaaaatg
tctcatgatgcaggacaaaaagtattaagttcaataggaatggatgataaaacaagacaa
ggtattaccggcagagcggaagcacgattaaaacaacgcaataagacattagatcaggct
gagaaaaataggaaaaatacgcaaaaagaagggggcgagaagacaaatgaagaaccacct
aaacctgaaacaccgaaatag

  All links  
Gene (2)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   SWISS-PROT (1)   
Protein domain (1)   
   Pfam (1)   
All databases (5)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system