KEGG   Rickettsia peacockii: RPR_02845
Entry
RPR_02845         CDS       T00907                                 
Name
(GenBank) virB6d protein
  KO
K03201  type IV secretion system protein VirB6
Organism
rpk  Rickettsia peacockii
Pathway
rpk03070  Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:rpk00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09131 Membrane transport
   03070 Bacterial secretion system
    RPR_02845
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:rpk02044]
    RPR_02845
Secretion system [BR:rpk02044]
 Type IV secretion system
  Conjugal DNA-protein transfer (VirB/D) protein
   RPR_02845
SSDB
Motif
Pfam: TrbL
Other DBs
NCBI-ProteinID: ACR47377
UniProt: C4K1C6
Position
485537..488212
AA seq 891 aa
MKILKSLVLLVLFMAMPAKADDVFSWMSTSFGGLKSLFGCLEVPEFTSFQEGNIGISLST
AGIWQSTGNTVQKGKLLKINWSTSGITPEPRKYLVLYRIDPRFGMPQVFIKTYNYSKLQF
EALGFPRFVTDNNSETPGTIPPDKDLDALSFTKMSDFVKYFNYSNGNSRIEVKAGDVVNI
SLVGKDNFFSPNTLKLPNTVDNILTQELDSSIFAASALYTQSNLGDLDNRIIYSSAEQVC
NMIDEERKSVCSGTGTATKYKNTDNGVIVGKPMITGAVQYFMGLIKACPANAGINTSPAC
YYDQGRGMIIKVGGQVIKGRDQSFVNSGSTQSSFIYYQATSGGTMDFTSDWQVSNMFSNS
VLMSDWSRNFSNYASFVDYINKNDWSANFLYFGCYSMIVEIGNGANSINPDDQQNIKLEY
LITSDGTLPDPSVRGTPVDYNFATDAPQDGYLWLRVVNPNSNIQGVVSVNYANYTGTTWF
SDIIYNGAIKPITDQFRTFSQNFYIKLVKNSAVQNLAKTALTLYVTIFGLMFVTGALKLT
AVEVITRICKIAIVAFLIREESWSFFNTYFFSVFTDGIDFFVTNVLGATSSRSNIFGFID
PIFDKYTNGRIWGLLFIELLQIHNGLAFIAIITIYSLITYFRAILEVIIGYVIAFIGVTV
MISLAPFFIILMLFEKTKSLFDNWISTLLSYVVQPTILLIFFLLIDQVLSEQLLKVVVRA
CWDTLIPIKIGLDLTNLGIPIHFSFTLPFLPGIPFYVPDVPEISSSNILTNNANTFLVLF
TTALLFYSYCLMSYSLVTFVNIVVGMLTNVTPARISGNYQERSDPVGAVMQDIDSVTKPI
KKAAMAPARVFKDKIIDQNYKARKLEVGGEFTNKFLAERNDVKKEEGEKKE
NT seq 2676 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaattcttaagagtttagttttattagttttgtttatggcgatgccagctaaagcc
gatgatgttttttcatggatgtcaaccagttttggtgggttaaaaagcttattcggttgt
ttagaagtgcctgaatttacaagttttcaagagggtaatataggaattagtttatctaca
gccggaatttggcaatcaacaggtaatactgttcagaaaggtaaattgttaaaaataaat
tggtctacttcaggtattactcctgaacctagaaaatatctagtattatatagaattgat
ccaaggtttggtatgccgcaagttttcattaaaacttataattattctaaattacaattt
gaagctttaggatttcctcgttttgttacggacaataacagtgaaacaccggggactata
ccgcctgacaaagaccttgatgcactttcatttactaaaatgtctgattttgttaaatat
tttaactattctaacggtaattcgagaattgaagttaaggccggcgatgtagtaaatatt
agtttagttggtaaagataatttttttagccctaatactctaaaacttcctaataccgta
gataatattttaacacaggaacttgatagctcgatattcgctgcttctgcactttatact
caaagtaaccttggagatttggataatagaataatttactcttctgcagagcaggtgtgt
aatatgatagatgaggaaagaaaaagtgtatgtagcggcacgggtactgctacaaagtat
aaaaataccgataatggagtaatagtcggtaagcctatgataacgggagcggtacagtat
ttcatgggcttaattaaggcttgtcctgctaatgccggtataaatactagccctgcttgc
tattacgatcaaggtagagggatgataattaaagtaggcgggcaggttattaagggacga
gatcagagttttgtaaattcaggcagtactcaaagtagctttatatattatcaagccact
agcggtggtactatggattttactagcgattggcaagttagtaacatgtttagtaattca
gttttaatgagtgattggagccgaaatttttcaaattatgctagttttgtagattatata
aataagaatgattggtcagctaattttttatattttggttgttattcgatgattgttgaa
ataggtaatggggcaaattcaattaatcctgatgatcaacaaaatataaagttagaatat
ttaataacgtctgatggtacattacctgatccatctgttcgtggtacgccggtagattat
aactttgcgactgatgccccgcaagatggatatttatggttaagggtggtaaatcctaat
agtaatatacaaggggtagttagtgtaaattatgctaattataccggtacaacttggttt
tctgatataatatataacggtgctattaaacctattaccgatcagtttagaacttttagt
caaaacttttatattaagttagttaaaaattctgcagtgcagaatttagctaaaactgca
ttaaccctttatgttactatatttgggctaatgttcgttacaggagcattaaaattaact
gccgtagaagtaataacacgtatatgcaaaatagctatagtagcttttttaattagagaa
gaaagttggagcttctttaatacatacttctttagtgtatttactgacggtattgatttc
tttgtaactaacgtattaggtgctacaagctctagatctaatatttttggttttattgat
cctatatttgataaatatactaacggtaggatttggggattactatttattgaattatta
caaatacataatggtttagcatttatcgctattataaccatttattcacttattacttat
tttagagctattttagaagttataataggttatgttattgcattcataggggtaactgtt
atgatttcattggcaccgttttttataatattaatgttatttgaaaaaactaaaagttta
tttgataattggatatcgacattgcttagctatgtagtgcagccgacaatattattgatt
ttctttttattgatagatcaggttttatctgagcagcttttaaaagtggtagttagagcc
tgttgggatactcttataccaataaaaatagggcttgatttaacaaatcttggtattccg
attcatttctcttttacattaccgttcttacccggaatacctttctatgtaccggatgtt
ccagaaattagtagctcgaatattctaacgaacaatgctaatactttcttagtattattt
actacggctttattattttattcatattgcttgatgtcatatagtttagtaacttttgta
aatatagtagttggaatgcttacaaatgttacaccggcacgaatatcaggaaattatcaa
gaacgttctgatcctgtgggagccgttatgcaggatatagattcagtaacaaaaccgatt
aaaaaggctgcaatggctccggctagagttttcaaagacaagataattgatcaaaattat
aaagctagaaaactggaagtaggtggtgaatttacaaataaatttcttgctgagcgtaat
gatgtgaagaaagaggaaggagagaagaaagaataa

  All links  
Gene (2)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   UniProt (1)   
Protein domain (1)   
   Pfam (1)   
All databases (4)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system