KEGG   Rickettsia prowazekii Madrid E: RP107
Entry
RP107             CDS       T00018                                 
Symbol
RP107
Name
(GenBank) unknown
  KO
K03201  type IV secretion system protein VirB6
Organism
rpr  Rickettsia prowazekii Madrid E
Pathway
rpr03070  Bacterial secretion system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:rpr00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09131 Membrane transport
   03070 Bacterial secretion system
    RP107 (RP107)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:rpr02044]
    RP107 (RP107)
Secretion system [BR:rpr02044]
 Type IV secretion system
  Conjugal DNA-protein transfer (VirB/D) protein
   RP107 (RP107)
SSDB
Motif
Pfam: TrbL
Other DBs
NCBI-ProteinID: CAA14576
UniProt: Q9ZE41
Position
125021..127687
AA seq 888 aa
MKILKSLVLLVLFIVMPAKAHDAFSWMSTSFSGLKGLFGCLEVPEFTSFQESNIGINLSK
AGAWQSTGHTVEKGKLLKINWSIAGVTTEPRKYLVLYRIDPRFSTPQVFIKTYNYSKLQF
EALGFPRFVTNSNSSIPGAIPPDKDLDALSFTKMSDSIKYFNYSKNNVKIEVKAGDVVNI
SLVGKDNFFTSNTLDNILTEELDSSIFAPSALYTQSNLGNFDNRIIYASAKEVCDIIDAA
RDPDKPSGCSGTGAATKYKSINSNEALVGKPMMIGAIHNFMGLINSCPEHSGINTRPACY
YDQGRGMIIKVGGQVIKERDQSFVKSGRNSFIYYQATRDGIMNFTSDWQVSNMFNNSVLM
SDWIRRFLNYPSFIDYINQNDWSANFLYFGRYSMIVEIGNGANSISADVQQNISLEYLIT
YDGTLPDPSIRGTPVDYNFAADAPKDGYLWLRVVNPNSNIQGVVSVNYANYTGTTWFSDI
VYNGAIKPITDQFRTFSKNFYIKLIKNSAVQNIVKAALTLYVIIFGLMFVAGALKLTAIE
VITRICKIAIVAFLIREESWNFFNTYFFSVFTDGINFFITNVVGATSSRSNIFGFIDPIF
DKYTNGRIWGLLFIELLQIHNGLAFIAIITIYSLITYFRAILEVIIGYVIAFIGITVMIS
LAPFFIILMLFEKTKSLFDNWISTLLSYVVQPTILLIFFLLIDQVLSEQLLKVVVRACWD
TLIPIKIGLDLTNLGIPINFSFTLPFLPGIPFYVPDVPEISRSNIFTNNANTFLVLFTTS
LLFYSYCLMSYGLVTFVNIVVGMLTNVTPARISGNYQARSDPVGAVMQDIGSVTTPMKNA
SMVPARVFKDKIIDQNYKARKSEGGVEFTNKFFSERNDITKKEEGARE
NT seq 2667 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaattctcaagagtttagttttattagttttgtttattgtaatgccagctaaagct
catgatgctttttcatggatgtcaactagttttagtggattaaaaggtttattcggttgt
ttagaagtccctgaatttacaagttttcaagaaagtaatataggaattaatttatctaaa
gcaggggcttggcaatcaacaggtcatactgttgaaaaaggtaaattgttaaaaataaat
tggtctattgcaggtgttactactgaacctagaaaatatctagtattatatagaattgat
ccaagatttagtacgcctcaagtttttattaaaacttataattattcgaaattacaattt
gaagctttaggatttcctcgttttgttactaacagtaatagttcaatacctggggctata
ccgcctgataaagatcttgatgcactttcatttactaagatgtctgattctataaaatat
tttaactattctaaaaataatgtaaaaattgaagttaaggctggtgatgtagtaaatatt
agtttagttggtaaagataatttttttacctctaatactctagataatattttaacagaa
gaacttgatagttcaatatttgctccttctgcactttatactcaaagtaaccttggaaat
tttgataataggataatttacgcatctgcaaaagaggtatgtgatattatagatgctgca
agagatcctgataaaccaagtgggtgtagcggtactggtgcagctacaaaatataaaagt
ataaatagtaatgaagcattagtaggcaaacccatgatgataggtgcgatacataatttc
atgggattaattaattcttgccctgagcactccggtataaatactaggcctgcttgctat
tatgatcaaggtagagggatgataattaaagtaggtgggcaggttattaaggaacgagat
cagagttttgtaaagtcaggtagaaatagctttatatattatcaagcgactagggatggt
attatgaattttactagtgattggcaagtgagtaacatgtttaataattcagttttaatg
agtgattggattagacgttttttaaattaccctagttttatagattatataaatcagaat
gattggtcagctaattttttatattttggtcgttattcgatgattgttgaaataggtaat
ggggctaattcaattagtgctgatgtccaacaaaatataagtttagaatatttaataaca
tatgatggtacattacctgatccatctattcgtggtacgccggtagattataattttgca
gctgatgcaccgaaagatggctatttatggttaagggtagtaaatcctaatagtaatata
caaggtgtagttagtgtaaattatgctaattacaccggtacaacttggttttctgatata
gtatataatggggctattaaacctattacggatcagtttaggacttttagtaaaaatttt
tatattaagttaattaaaaattctgcagtacagaatatagtgaaagctgcattaactctt
tatgttattatatttggtctcatgttcgttgcaggagcattaaaattaactgctatagaa
gtcataacacgtatatgcaaaatagctatagtcgcttttttaattcgagaagaaagttgg
aatttctttaatacgtacttctttagtgtatttactgatggtattaatttctttataact
aatgtagtaggtgctacaagttctagatctaatatttttggtttcattgatcctatattt
gataaatatactaatggtagaatttggggattactctttattgaattattacaaatacat
aatggtttagcatttatcgctattataacaatttattcacttattacttattttcgagct
attttagaagtgataataggttatgttattgcattcataggtataacggttatgatttca
ttagcaccgttttttataatattaatgttatttgaaaaaactaaaagtttatttgataat
tggatatcaacattgttgagttatgttgtgcagccaacaatattattgattttcttttta
ttgatagatcaggttttatcggagcagcttttaaaagtggtagttagagcttgttgggat
actcttatacctataaaaataggacttgatttaacaaatcttggtattcctatcaatttc
tcttttacattaccgtttttaccaggcatacctttttatgtacctgatgttccagaaatt
agtagatcgaatatttttactaataatgctaatactttcttagtattatttactacgtct
ttattattttattcatattgcttgatgtcatatggtttagtaacttttgttaatatagta
gttggcatgcttacaaatgttacaccagcacgaatatcaggaaattatcaagcgcgttct
gatcctgtaggagccgtgatgcaagatataggttcggtaacaacgccgatgaaaaatgct
tcaatggttccagctagagtattcaaagacaagataattgatcaaaattataaagctaga
aaatcggaaggaggtgttgaatttacaaataaattcttttccgagcgtaatgatataacg
aagaaagaggaaggagcgagggaataa

  All links  
Gene (32)   
   RefGene (30)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   SWISS-PROT (1)   
Protein domain (1)   
   Pfam (1)   
All databases (35)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system