KEGG   Rickettsia rickettsii Colombia: RPL_06495
Entry
RPL_06495         CDS       T01722                                 
Name
(GenBank) NAD-specific glutamate dehydrogenase
  KO
K15371  glutamate dehydrogenase [EC:1.4.1.2]
Organism
rrc  Rickettsia rickettsii Colombia
Pathway
rrc00220  Arginine biosynthesis
rrc00250  Alanine, aspartate and glutamate metabolism
rrc00910  Nitrogen metabolism
rrc01100  Metabolic pathways
rrc01120  Microbial metabolism in diverse environments
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:rrc00001]
 09100 Metabolism
  09102 Energy metabolism
   00910 Nitrogen metabolism
    RPL_06495
  09105 Amino acid metabolism
   00250 Alanine, aspartate and glutamate metabolism
    RPL_06495
   00220 Arginine biosynthesis
    RPL_06495
  09106 Metabolism of other amino acids
   00430 Taurine and hypotaurine metabolism
    RPL_06495
Enzymes [BR:rrc01000]
 1. Oxidoreductases
  1.4  Acting on the CH-NH2 group of donors
   1.4.1  With NAD+ or NADP+ as acceptor
    1.4.1.2  glutamate dehydrogenase
     RPL_06495
SSDB
Motif
Pfam: Bac_GDH_CD GDH_C GDH_HM3 GDH_ACT3 GDH_ACT1 GDH_HM1 GDH_ACT2 GDH_HM2 ELFV_dehydrog
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFB24085
Position
complement(1074635..1079389)
AA seq 1584 aa
MTPKTTSLNFSRLNCQIPNYKTKILELSKERESSSIYIDFVQKFLNYIPIDYDFENRAKL
FQNFADEAFKFFKQRIARARKIAITKAVIENDPAINVLILLDNKPHIVDFIICLLKNMNL
QTKFLLHPVINCVRNSKGELEKILENSVSDEKSESILHLTILGNFDDKTTTFLTEAINER
LEKLEQSYSHLPQLRTKLQDLSKNIIDNYKLNFKEAKEFLNWLQNDNLVLLGTLDFEVKS
LKLSNEIGAAKIWQEVKDEIDDIIKCSANPLYQNQLIILGKINSASLIHSDNLIDYILVK
NFDSSGEYISGSIIFGIYNSNMYYHSISNIPILRQKFNFVIEKAGFALSGYNADKLRILM
ESLPREALIQIDQGDLYCMCLHMLSSMMSKKLKLFIQYDWSSSFLNIIIFLPRERLTAEI
HNMIDCYLAEKFGSKILSNYITEVAGNFSYLFVTLEAQGEHKINFEAEIIQQDLDRISTC
WSEDFYFKFSKKFGEYQAGINLKLFDNVFSADYRQKFSPEIALVDIEYLTEASKSQKCMF
NLVSVNETEFYLKIYSPKVKLALSNILPPIENLGFKAIDEQTFAIKEALEIKESWIYNFI
LTSIVPVKDNITELKINVEEALDKMALGMLANDSLSKLIVLAGFNWKQVKLVKALTRYLH
QTGFSYGKGYVQLTLLKHPEYTKMLVNLFDIKFNPKHSDNNCDVIKDKLNNYLVTVEMSS
EDKVLRNMLGIVNAITRTNYYQPHKHIFSFKFDSSKVPDLPKPVPFAEAFVYSRNFEAVH
LRGGPVSRGGLRWSDRAEDYRLEVLGLMKAQMTKNSVIVPVGSKGGFYVHFTEEGLTRDE
YMEKVVECYKNFLRGLLDITDNIIDGKVVHPKDVIIYDKEDPYLVVAADKGTASFSDYAN
SVAREYNYWLDDAFASGGSAGYDHKKMAITSKGAWISVTNHFKTLGLDVQKDPITVVGIG
DMSGDVFGNGMLRSETIKLVAAFNHKHIFIDPTPDPLSSFNERLRLFNLKGSNWSDYDSK
LISKGGKVFERSSKLIKLSPEIKKLLDINDNELSPEELIKAILKADVDLLWNGGIGTYIK
AKTENNLEIGDKANDNLRCNGEEIRAKVIAEGGNVGVSQRGRVEYAKKGGRINADFIDNS
AGVDCSDHEVNIKIALSSAITSGKITLEERNKLLNDMTKQVEELVLLDNYKQTEAITIMQ
LSPTLTVNILSQFIDILEEEKVLERENEFLPSAEELNSRAISGEVLTRPELCILLSYSKR
SAYHELINSTFSHDKYFDAYLIDYFPEMMQKKFRNEILSHPLKHEIIKTVTINKIMNQLG
GPLISIVKREIGAPLCDIIRSYTIICEIFDLDDIWETISKLPTNIDYNVKIDMFTEITKL
MRRGISWFIKNLKHPINISETIEEFRVPAQNLRKTVDTLLVGETKIRFEEKLNYYTTSGV
EESLAATIATFDNLISVFDIIYVTQQTSGNNKEIAKAYFVISDMFSLDWLRKACDRQLND
SFWRRLGIQSLKDDLYDKQRRLLIKIINKSKTTIDLDLWIDNYNNNLVRNLLDFIKEIKA
QETIDLNIIILANKKFEIFLQKLE
NT seq 4755 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaccccaaaaacaacctctttaaactttagccgtttaaattgtcaaatcccaaattat
aaaactaaaattctagaacttagcaaggaacgtgagtcaagttccatatatatagatttt
gttcaaaagtttttaaattatattccgatagattatgattttgagaatagagcaaaatta
ttccaaaattttgcagatgaagcctttaagttttttaagcaaaggatagcaagagcaaga
aaaatagcaataacaaaggcagttatcgaaaatgatccggcaataaatgtcttgatatta
cttgataataagccgcatattgttgattttatcatatgtctgcttaaaaacatgaattta
caaactaagtttttactccatccggtaataaactgtgtccgaaatagtaaaggagaatta
gaaaaaatattagaaaattctgtgtcggatgaaaaatcagaatcaatactacatttaacc
attttaggaaattttgacgataaaactactacatttttaaccgaggctataaatgaaaga
ttagaaaagttagagcaaagctatagccatttaccgcaattacgcacaaaattacaagat
ttatctaaaaatataattgataattataaattaaattttaaagaggctaaagaattctta
aattggttacaaaacgataatttggttttattagggactcttgattttgaagtaaaatct
ttaaaattaagcaatgaaataggagcagcaaaaatatggcaagaagtaaaagacgagatt
gatgatattataaaatgttctgctaatcctttatatcaaaatcaattaataatactcggt
aaaataaatagtgcgtcgcttatccattcagataatttaatcgactatatcttagtgaaa
aattttgactcttcgggtgaatatatttcgggaagtataattttcggtatatataattca
aatatgtattaccattcaataagtaatattccaatcctacgacaaaaatttaattttgta
attgagaaagccggttttgcattatctggttataatgccgataagttaagaattttaatg
gagtcgttaccgagagaagctttaatacaaattgatcaaggcgatttatattgtatgtgt
ttacatatgctctcaagtatgatgagtaagaagcttaaattatttattcaatatgattgg
tctagttcttttcttaatatcataatttttctgccacgagaacgtttaacggctgaaatc
cataatatgatagattgttatttagcagaaaaatttggtagtaaaattttatccaactat
atcaccgaagtagccggtaatttttcttatctttttgtaacgcttgaagcacaaggggaa
cataaaataaattttgaagcagaaataatacagcaagatttagatcgtatctctacatgt
tggagtgaagatttttattttaagttttctaaaaaattcggcgagtatcaagcaggtatt
aatttaaagctttttgataatgttttttcggcagattatcggcaaaaattttctccggaa
atagctttagtagatattgaatatctaacggaagcaagtaagtcacaaaaatgtatgttt
aatctagtgtctgtaaatgaaacggaattttacttaaaaatatatagtccaaaagtaaaa
cttgcactttctaacatattgccgccaatagaaaatttaggttttaaagcaattgatgaa
caaacttttgcaattaaggaggctctcgaaatcaaagaaagctggatatataattttatc
ttaacttctattgtacctgtaaaggataatattaccgaattaaaaataaatgttgaagaa
gctttagacaaaatggcacttgggatgcttgctaatgattctttaagtaaattaatagtg
cttgccggttttaattggaagcaagttaaactcgtcaaagctttaacaagatatttacat
caaacgggatttagttacggtaaaggctatgtacagttaacgttacttaaacatcccgaa
tatacaaaaatgttggtaaatctatttgatataaaatttaatcctaaacattcggataat
aattgtgacgtaattaaagataaactaaataattacttagtaaccgttgagatgagtagt
gaagataaagtactacgtaatatgcttggtatagttaatgctattactagaacaaattac
tatcaaccacataaacatattttttcatttaagtttgattcttcaaaagtaccggattta
cctaaacctgttccgtttgccgaagcatttgtttattctagaaattttgaagctgtgcat
ttaagaggcgggcccgtatcacgcggagggcttagatggtcggatagagcagaagattat
aggcttgaggtccttgggcttatgaaagcacaaatgactaagaattctgttattgtccct
gtcggttctaaaggcggattttatgttcattttactgaggaagggcttactcgtgatgaa
tatatggaaaaagtggtagaatgctataagaatttccttagaggtttattagacataact
gataatatcattgacggtaaagtagtacatccaaaagacgttattatttatgataaagaa
gatccttatttagtggttgctgccgataaaggtacagcctcattttcggattatgctaat
agtgtggcaagagaatataattactggcttgatgatgcttttgcttccggtggttctgca
ggttacgatcataaaaaaatggctattacttccaaaggagcttggatttccgtaactaac
cactttaaaactttagggttagatgtccaaaaagaccctattaccgtcgtaggtatagga
gatatgtcgggagatgtgttcggtaacggtatgctcagatcagagactattaagttagtt
gctgcctttaatcataaacatatatttattgatcctactcctgatcctttatcaagtttt
aatgagcgtttgcgtttatttaatttaaaggggtctaattggtctgattatgattctaag
cttatttctaaaggaggcaaagtatttgaacgcagtagtaaattaataaaattatcgccg
gaaattaaaaaattacttgatataaatgataatgaattatcaccggaagaattaattaaa
gctattttaaaagcagatgttgatttattgtggaatggtggaataggcacttatatcaaa
gctaaaacggaaaataatttagaaatcggtgataaagcaaatgataaccttagatgtaac
ggtgaagaaattagagcaaaagttatagcagaaggcggtaatgttggggtatcacagaga
ggtagagttgaatatgctaaaaaaggcgggcgcataaatgctgactttattgataattca
gcaggtgttgattgctccgatcatgaggtaaatatcaagattgctttaagtagtgcgata
acctcaggaaaaattactttagaagaacgtaataaacttctaaacgatatgacaaagcaa
gttgaggagttagtattacttgataattataagcaaaccgaagcaataacaattatgcaa
ctatctcctactttaactgttaatatacttagtcaatttatagatattttagaagaagaa
aaagtattagagcgggaaaatgaattcttgcctagtgcagaagaattgaatagcagagct
attagcggtgaagtattaactcgtcctgagctttgcatattgctatcatatagtaagaga
tctgcttatcatgagttaattaattctactttttcccatgataaatattttgatgcatat
cttatagattattttcctgaaatgatgcaaaaaaagtttcgtaatgaaattttatctcat
ccacttaaacatgagattattaaaactgttactataaataaaataatgaatcagcttgga
ggaccgcttattagtattgtaaagcgtgagattggggctcctctttgtgatataataagg
tcatataccattatttgtgaaatttttgatcttgatgatatatgggaaacgataagtaag
ctacctactaatattgattacaatgtaaaaatcgacatgtttaccgaaataacgaaatta
atgcgtcgaggtatttcgtggtttattaaaaatttaaaacatcctattaatattagtgaa
actatagaagagtttagagttcctgcacaaaacttaagaaaaacggtagatactttatta
gtcggagaaactaaaataagatttgaagaaaaattaaattattataccactagcggggta
gaggaatcattggctgctactatcgctacatttgacaatttaatttcagtatttgacatt
atatatgtaacacaacagacttcagggaataataaagagatagcaaaagcttattttgtt
ataagtgatatgtttagtcttgattggttacgtaaagcttgtgataggcaattgaacgat
tcattttggcgtcgcttaggtattcaatcgctaaaagatgatttatatgacaaacaacgt
agattattaataaaaataattaataaatctaaaacaactattgatttagatttatggatt
gataattataataataacttagttagaaatttgcttgattttattaaagaaattaaagct
caagaaactatagacttaaatataattattttagcaaacaagaaatttgaaatattctta
caaaaacttgagtaa

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Pathway (5)   
   KEGG PATHWAY (5)   
Chemical substance (7)   
   KEGG COMPOUND (7)   
Chemical reaction (2)   
   KEGG ENZYME (1)   
   KEGG REACTION (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (3)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein domain (9)   
   Pfam (9)   
All databases (29)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system