KEGG   Rickettsia typhi Wilmington: RT0699
Entry
RT0699            CDS       T00193                                 
Symbol
ompB
Name
(GenBank) rickettsial outer membrane protein B
Organism
rty  Rickettsia typhi Wilmington
SSDB
Motif
Pfam: rOmpB Autotransporter RNase_P-MRP_p29
Other DBs
NCBI-ProteinID: AAU04158
UniProt: P96989
Position
complement(888831..893768)
AA seq 1645 aa
MAQKPNFLKKIISAGLVTASTATIVAGFSGVAMGAVMQYNRTTNAAATTVDGAGFDQTGA
GVNLPVATNSVITANSNNAITFNTPNGNLNSLFLDTANTLAVTINENTTLGFVTNVTKQG
NFFNFTIGAGKSLTITGHGITAQQAATTKSAQNVVSKVNAGAAINDNDLSGVGSIDFTAA
PSVLEFNLINPTTQEAPLTLGDNAKIVNGANGILNITNGFVKVSDKTFAGIKTINIGDNQ
GLMFNTTPDAANALNLQGGGNTINFNGRDGTGKLVLVSKNGNATEFNVTGSLGGNLKGVI
EFDTTAAAGKLIANGGAANAVIGTDNGAGRAAGFIVSVDNGNAATISGQVYAKDIVIQSA
NAGGQVTFEHLVDVGLGGKTNFKTADSKVIITENASFGSTDFGNLAVQIVVPNNKILTGN
FIGDAKNNGNTAGVITFNANGTLVSGNTDPNIVVTNIKAIEVEGAGIVQLSGIHGAELRL
GNAGSIFKLADGTVINGPVNQNPLVNNNALAAGSIQLDGSAIITGDIGNGAVNAALQDIT
LANDASKILTLSGANIIGANAGGAIHFQANGGTIQLTSTQNNILVDFDLDVTTDQTGVVD
ASSLTNNQTLTINGSIGTIGANTKTLGRFNVGSSKTILNAGDVAINELVMENDGSVHLTH
NTYLITKTINAANQGKIIVAADPINTDTALADGTNLGSAESPLSNIHFATKAANGDSILH
IGKGVNLYANNITTTDANVGSLHFRSGGTSIVSGTVGGQQGLKLNNLILDNGTTVKFLGD
ITFNGGTKIEGKSILQISSNYITDHIESADNTGTLEFVNTDPITVTLNKQGAYFGVLKQV
MVSGPGNIAFNEIGNGVAHAIAVDSISFENASLGASLFLLSGTPLDVLTIKSTVGNGTVD
NFNAPILVVSGIDSMINNGQVIGDQKNIIALSLGSDNSITVNSNTLYAGIRTTKTNQGTV
TLSGGIPNNPGTIYGLGLENGDPKLKQVTFTTDYNNLGSIIATNVTINDDVTLTTGGIAG
TDFDGKITLGSINGNANVKFVDRTFSHPTSMIVSTKANQGTVTYLGNALVGNIGSSDIPV
ASVRFTGNDSGVGLQGNIHSQNIDFGTYNLTILNSDVILGGGTTAINGEIDLLTNNLIFA
NGTSTWGNNTSLSTTLNVSNGNVGQIVIAEGAQVNATTTGTTTIKIQDNANANFSGTQTY
TLIQGGARFNGTLGAPNFDVTGNNIFVKYELIRDANQDYVLTRTNDVLNVVTTAVGNSAI
ANAPGVHQNIAICLESTDTAAYNNMLLAKDSSDVATFIGAIATDTGAAVATVNLNDTQKT
QDLLGNRLGALRYLSNSETADVGGSETGAVSSGDEAIDQVSYGVWAKPFYNIAEQDKKGG
LAGYKAKTAGVVVGLDTLANDNLMIGAAIGITKTDIKHQDYKKGDKTDIKGLSFSLYGAQ
QLVKNFFAQGSAIFTLNKVKSKSQRYFFDANGKMNKQIAAGNYDNITFGGNLMFGYDYNA
LQGVLVTPMAGLSYLKSSNENYKETGTTVANKRIHSKFSDRIDLIVGAKVTGSAMNINDI
VIYPEIHSFVVHKVNGKLSKAQSMLDGQTAPFISQPDRTAKTSYNIGLSANIRSDAKMEY
GIGYDFNAASKYTAHQGTLKVRINF
NT seq 4938 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggctcaaaaaccaaattttctaaaaaaaataatttccgcaggattggtaactgcttcc
acggctactatagttgctggtttttctggtgtagcaatgggtgctgttatgcaatataat
agaacaacaaatgcagcagctacaactgttgatggtgcaggatttgatcaaactggcgct
ggtgttaatcttcctgtcgctacaaattcggttattactgctaattctaataatgctatt
acttttaatactccaaacggtaatttaaatagtttgtttttggatactgcaaatacttta
gcagtaacaattaatgaaaatactaccttagggtttgtaactaatgttactaaacagggt
aacttctttaattttactattggtgctggtaaaagtcttaccataacaggtcatggtatt
actgctcaacaagctgctactacaaaaagtgctcaaaatgttgtttcaaaagttaatgct
ggtgctgctattaacgataatgatcttagcggtgtaggatcaatagactttactgctgcg
ccttctgtattagaatttaatttaataaatcctacaactcaagaagctcctcttacactt
ggtgataatgctaaaatagttaatggtgctaatgggatattaaatattactaatgggttt
gttaaggtttcagataaaacttttgctggtattaagacaattaatatcggtgataatcaa
ggtttaatgtttaatactactcctgatgccgctaatgctttaaatttgcaaggaggtggt
aatactattaattttaatggaagagacggtactggtaaattagtattggtcagtaagaat
ggcaatgctactgaatttaatgttacaggaagtttaggcggtaatctaaaaggtgttatt
gaatttgatactacagcagcagctggtaagcttatcgctaatggaggtgctgctaatgca
gtaataggtacagataatggagcaggtagagctgcaggatttattgttagtgttgataat
ggtaatgcagcaacaatttccggacaggtttatgctaaagacatagttatacaaagtgct
aatgcaggtggacaagtcacttttgaacatttagttgatgttggtttaggcggtaagacc
aattttaaaaccgcagattctaaagttataataacagaaaacgcaagctttggttctact
gattttggtaatcttgcagtacagattgtagtgcctaataataagatacttacaggtaat
ttcataggtgatgcaaaaaataacggtaatactgcaggtgtgatcacttttaatgctaat
ggtactttagtaagtggtaatactgatccaaatattgtagtaacaaatattaaggcaatc
gaagtagaaggtgccgggattgtacaattatcaggaatacatggtgcagaattacgttta
ggaaatgctggctctatctttaaacttgctgatggcacagtgattaacggtccagttaac
caaaatcctcttgtgaataataatgcgcttgcagctggttctattcagttagatggaagt
gctataattaccggtgatataggtaacggtgctgttaatgctgcgttacaagacattact
ttagctaatgatgcttcaaaaatattaacacttagtggggcaaatattatcggcgctaat
gctggtggtgcaattcattttcaagctaacggtggtactattcaattaacaagcactcaa
aataatattttagttgattttgatttagatgtaactactgatcaaacaggtgttgttgat
gcaagtagtttaacaaataatcaaactttaactattaatggtagcatcggtactattggc
gctaatactaaaacacttggaagatttaatgttgggtcaagtaaaacaatattaaatgct
ggagatgttgctattaacgagttagttatggaaaatgatggttcagtacaccttactcac
aatacttacttaataacaaaaactatcaatgctgcaaatcaaggtaaaatcatagttgcc
gctgatcctattaatactgatacagctcttgctgatggtacgaatttaggtagtgcagaa
agtccactttctaatattcattttgctactaaagctgctaatggtgactctatattacat
ataggtaaaggagtaaatttatatgctaataatattactactaccgatgctaatgtaggt
tctttacactttaggtctggtggaaccagtatagtaagtggtacagttggtggacagcaa
ggtcttaagcttaataatttaatattagataatggtactactgttaagtttttaggtgat
atcacatttaatggtggtactaaaattgaaggtaaatctatcttgcaaattagcagcaat
tatattactgatcatattgaatctgctgataatactggtacattagaatttgttaatact
gatcctatcaccgtaacgttaaataaacaaggtgcttattttggtgttttaaaacaagta
atggtttctggtccaggtaacatagcatttaatgagataggtaatggagttgcacatgct
atagcagttgattccatttcttttgaaaatgcaagtttaggtgcatctttattcttactt
agtggcactccattagatgtgctaacaattaaaagtaccgtaggtaatggtacagtagat
aattttaatgctcctattttagttgtatcaggtattgatagtatgatcaataacggtcaa
gttatcggtgatcaaaagaatattatagctctatcgcttggaagtgataacagtattact
gttaattctaatacattatatgcaggtatcagaactactaaaactaatcaaggtactgtt
acacttagcggtggtatacctaataaccctggtacaatttatggtttaggtttagagaat
ggtgatccaaagttaaagcaagtaacgtttactacagattataacaacttaggtagtatt
attgcaactaacgtaacaattaatgacgatgtaacacttactacaggaggtatagccggg
acagattttgacggtaaaattactcttggaagtattaacggtaatgctaatgtaaagttt
gttgacagaacattttctcatcctacaagtatgattgtttctactaaagctaatcagggt
actgtaacttatttaggtaatgcattagtcggtaatattggtagttcagatattcctgta
gcttctgttagatttactggtaatgatagtggtgtaggattacaaggcaatattcactca
caaaatatagactttggtacttataacttaactattttaaattctgatgtaattttaggc
ggtggtactactgctattaatggtgagattgatcttttgacaaataatttaatatttgca
aatggtacttcaacatggggcaataatacctctcttagtacaacattaaacgtatcaaac
ggtaatgtaggtcaaatagttattgctgaaggtgctcaagttaatgcaacaactacagga
actacaaccattaaaatacaagataatgctaatgcaaatttcagtggtacacaaacttat
actttaatccaaggtggtgccagatttaacggtactttaggagctcctaactttgatgta
acaggaaataatattttcgtaaaatatgaattaatacgtgatgcgaatcaggattatgtg
ttaacacgtactaacgatgtattaaatgtagttacaacagctgtaggaaatagtgcaatt
gcaaatgcacctggtgtacatcaaaatattgctatatgcttagaatcaactgatacagca
gcttataataatatgcttttagctaaagattcttctgatgtcgcaacatttataggagct
attgctacagatacaggtgctgctgtagctacagtaaacttaaatgatacacaaaaaact
caagatctacttggtaataggctaggtgcacttagatatctaagtaattctgaaactgct
gatgttggtggatctgaaacaggtgcagtatcttcaggtgatgaagcgattgatcaagta
tcttatggtgtatgggctaaacctttctataacatcgcagaacaagataaaaaaggtggt
ctagctggttataaagcaaaaactgctggtgttgtagttggtttagatactctcgctaat
gataacctaatgattggtgcagctattggtatcactaaaactgacataaaacaccaagat
tataaaaaaggtgataaaactgatattaagggtttatccttctctctatatggtgcccag
cagcttgttaagaatttctttgctcaaggtagtgcaatatttaccttaaacaaagtcaaa
agtaaaagtcagcgttacttcttcgatgctaatggtaagatgaacaagcaaattgctgcc
ggtaattatgataacataacattcggtggtaatttaatgtttggttatgattataatgca
ctgcaaggtgtattagtgactccaatggcagggcttagctacttaaaatcttctaatgaa
aactataaagaaactggtactacagttgcaaataagcgcattcacagcaaatttagtgat
agaatcgatttaatagtaggtgctaaagtaactggtagtgctatgaatataaatgatatt
gtgatatatccagaaattcattcttttgtagtgcacaaagtaaatggtaagctatctaag
gctcagtctatgttagatggacaaactgctccatttatcagtcagcctgatagaactgct
aaaacatcttataatataggcttaagtgcaaatataagatctgatgctaagatggagtat
ggtatcggttatgattttaatgctgcaagtaaatatactgcacatcaaggtactttaaaa
gtacgtataaatttctaa

  All links  
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (2)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   SWISS-PROT (1)   
Protein domain (3)   
   Pfam (3)   
All databases (8)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system