KEGG   Shewanella baltica OS117: Sbal117_1165
Entry
Sbal117_1165      CDS       T02013                                 
Name
(GenBank) type IV pilin biogenesis protein, putative
  KO
K02674  type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
sbs  Shewanella baltica OS117
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sbs00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:sbs02044]
    Sbal117_1165
   02035 Bacterial motility proteins [BR:sbs02035]
    Sbal117_1165
Secretion system [BR:sbs02044]
 Type II secretion system
  Pilin secretion/fimbrial assembly protein
   Sbal117_1165
Bacterial motility proteins [BR:sbs02035]
 Pilus system
  Pilus assembly proteins
   Sbal117_1165
SSDB
Motif
Pfam: Neisseria_PilC C7_FIM2_N
Other DBs
NCBI-ProteinID: AEH12940
UniProt: A0A7U4E0D9
Position
1326177..1329683
AA seq 1168 aa
MIIKKLACSTLLVLTFVSAYSFGDDTELYVKESTTRTGARPKVLVIFDNSGSMSTEEITQ
VVDYDPNYNYPAVSGSGYSDTLIYYAVGGGGLPTPDTSSDKRYFKASLNGCSQSKAALAE
LGRFTGYIREFTASGTTGIWKELPETNGTAISVVDCWQDISKTDPNNSSSYSNGFAANGL
TTGSGKKKKAYPYFTSSSPGTSWADALAAANNTDFGVGQPVTLYTDNYLRWYGLSKAGKL
PTVKVSRLEIAKKAISNIISSTPTVDFGLAVFNYNYPNEGNRDGGRIVSGITQMTDSTRA
SLLTTIDNLLAKTNTPLCETMYEAYRYFAGKGVKYGHGDTDYGSYVGNNPPYDSLVEKGG
SYESPFKVCTDIAYVIYVTDGTPTVDKNANNDVISLTASGSKEGNYSSFSKNLDTASYLP
ALASYMFNNDLINKLDSSNTEQVQNVRTYTIGFSKGAEDAAPLLAETAKRGGGLYFAAQN
SLELQNALNDALSNILNIDSSFTSPSIASNNFDRTQTFDAAYYAMFLPGKGPRWSGNLKK
LKVTADGTLVDSKGNAAIADNGNIKDGACTIWSNCDAQKDGNKVEVGGVAAQIRTQSVRK
IVSDLGAGSSLTPLTLANAQSAAGGDTALASYMRTSVDELTNTFDWLKGIDVDDDNKDGS
TTDKRNDVMGDPLHSKPLALNFGSSTATDIRIMLGTNQGVLHMFKDAGESVSETWGFIPY
ELLPNLTELRSNDPSGVHTVYGIDSSPVAYTETDATGKVIKAWVYVGMRRGGSSYYALNV
TNPDSPTLMWSINPSTEGFSDLGQTWSEPIVTKIVGYEKPVLIFGGGYDTSFDATPSSSP
AGRAVYIVDAEKGTLIHSFGGSTSGATVLSGIQDSIPNSVAVLDSNNDGYTDRIYATDVG
GNVWRMDLPSASQSSWTAFKFAALGGSNNDNRRFFAEPVVAQTMFTNIAEVKVTTGTGTT
TTKTYQNVPYDAVVIGSGARPHPSSTAVNDMFFTLQDRNVVTKSFTGSDIPSVITINDLY
DVSSSAPVSETDNISFGKKLGWFYDFSGLGEKSLTAALIVQGKVYFTSYSPPADSVAENV
CVVSGSGKLYVFDLHKGTRTFSQLYFELGERVPDTPQIVIPAPETGKDPYIYIIGVGKGE
KNKDGEYSGTINVASGLGVNKIYYHINE
NT seq 3507 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattattaaaaagctggcttgttctacactacttgtgctgacttttgtgtcggcttac
tcctttggtgatgatactgaattgtatgtaaaagagtcgacaactcgaacaggcgcaaga
ccgaaagtacttgtcatatttgataactcgggaagtatgtcgacagaagaaatcactcag
gttgtagattatgaccctaactataactacccagctgtaagtggttctgggtatagtgat
actcttatttattatgctgttggcggtggaggattaccaactcctgataccagttctgac
aagcgttattttaaagcaagtttaaatggatgtagtcaaagcaaagcagcattagcagag
cttggacgttttactggctatattcgagagtttacagcgagtggtactacaggtatttgg
aaagaactgcctgaaactaacggtactgcaataagtgtagttgattgttggcaggatatt
tcaaaaacagatcctaacaattcatcatcatactctaatggatttgctgccaatggccta
acaactgggtctggtaaaaaaaagaaagcctatccctattttacttcttcatctccaggg
acgagttgggctgatgctttagccgctgcaaataatactgattttggcgttggtcaacct
gttaccttgtacactgataattatctaagatggtacggattatctaaagcagggaaatta
ccaacagtaaaagtttcaagactagaaattgcgaagaaagcgatttctaatattattagt
tcaactccaacagtggattttggacttgctgtatttaactataattatccaaatgaaggt
aaccgagacggtgggcgaattgtctctggcattactcagatgacggatagtacgcgtgcg
agtttactaactactattgataatttgttggcaaaaacaaatacaccactatgtgagact
atgtatgaagcttaccgttactttgcaggaaagggagttaaatatggtcatggtgatact
gattatggctcgtatgtaggaaataaccccccttatgatagtttagtggagaaggggggt
agctacgaaagtccatttaaagtatgtacggatattgcttatgttatttatgtcactgat
ggcactcctactgttgataaaaatgcaaataatgatgttattagtttaacggcttcagga
agtaaagaaggtaattattcctcattttctaaaaatttagatacggcaagttatttaccc
gccttagctagttatatgtttaataatgatttaatcaataaactggacagctcgaatact
gagcaggtgcaaaatgttcgaacttatactattggctttagtaaaggtgctgaagatgcc
gcccctttacttgctgaaactgcaaaaagaggtggcggtttatattttgcggctcagaac
agtcttgaactacagaatgcactgaatgatgctttatcgaatattttgaacattgattca
agttttacctcccccagtatcgccagcaataattttgatagaactcaaacatttgacgca
gcttattacgcgatgtttttacctggcaaagggcctcgttggagtggtaatttaaagaaa
ttaaaagtgactgcagatggaacactggttgatagcaaaggtaatgccgctatcgccgat
aacgggaatattaaagacggcgcctgtactatatggtcaaactgtgatgcgcaaaaggac
ggcaataaagttgaggtaggaggcgttgcagcgcaaataaggacacaatcggttagaaaa
attgtaagtgatttaggggcgggatcaagtttaacgccattaacgcttgctaatgcacaa
agtgcagcaggtggtgatacagcgttagctagttacatgagaactagtgtagatgagctt
acaaatacattcgattggctcaaagggatagatgtcgatgacgataacaaagatggtagt
acgactgataaacgtaatgatgttatgggtgatccacttcactctaagccgctagctctt
aattttggttcatctacagcaactgatattcgtattatgttaggcactaatcaaggtgtt
ttgcatatgtttaaagatgcgggagagtctgtatcagaaacttggggatttattccctat
gaattattgcctaatttaacagaactaaggagtaatgatccttcaggtgtgcatacagta
tatggaatagactcatcaccagtcgcttacactgagactgatgctacaggtaaagtaatt
aaagcatgggtttatgtcggcatgcgtcgaggtggttcgtcttattatgcccttaatgtg
acaaatcctgacagtcctactttaatgtggtcgattaatccttcaaccgaaggtttttca
gatctcggacaaacatggtctgaaccaatagtgacaaaaatcgtcggttatgaaaagcct
gtactcatttttggtggtggctatgatacaagctttgatgccactccttcttcttcgccg
gctggtcgtgcagtgtatattgttgatgcagagaaggggactttgattcattcttttggc
ggttcgacctcgggtgcaacagtactttctggcattcaggatagcattccaaactcagtc
gcggtacttgatagtaataatgatggttacacagatcgaatttatgcaactgatgttggt
ggtaatgtttggcgtatggatttgcccagtgctagccagagtagttggaccgcatttaaa
tttgcagcgctaggaggaagcaataacgataatagacgcttttttgccgagcccgtggtt
gcacaaacgatgtttactaacattgctgaagttaaagtgacgactggtactggaacgaca
actaccaaaacctaccaaaatgttccctatgatgccgtcgtgataggcagtggtgccaga
cctcatccttctagtactgcagtgaatgacatgtttttcacgttgcaggataggaatgtg
gtgactaagagttttactggcagtgatattccaagcgtgattaccatcaatgatctctat
gacgtgtcttctagcgcaccagtttcggagactgataatattagctttggtaaaaaacta
ggctggttttatgatttttctggcttaggagagaagagcttaactgccgccttaattgtg
caagggaaggtatatttcacctcttactcaccacctgcagattctgttgccgaaaacgtc
tgtgtagtttctgggtctgggaagctctatgtatttgatcttcataagggaacaagaacc
ttctcccagttgtattttgagcttggtgagcgagtacccgatacgcctcagattgttatc
cctgcgcctgaaacagggaaggatccttatatttatattattggagtgggtaagggtgag
aaaaacaaagatggtgaatatagtggaaccataaatgtagcctctggtttaggtgtgaat
aaaatttattatcatataaatgaatga

  All links  
Ontology (3)   
   KEGG BRITE (3)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (3)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (1)   
   UniProt (1)   
Protein domain (2)   
   Pfam (2)   
All databases (10)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system