KEGG   Spiroplasma clarkii: SCLARK_001048
Entry
SCLARK_001048     CDS       T05330                                 
Name
(GenBank) ABC transporter ATP-binding protein
  KO
K06147  ATP-binding cassette, subfamily B, bacterial
Organism
scla  Spiroplasma clarkii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:scla00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:scla02000]
    SCLARK_001048
Transporters [BR:scla02000]
 ABC transporters, eukaryotic type
  ABCB (MDR/TAP) subfamily
   ABCB-BAC subgroup
    SCLARK_001048
SSDB
Motif
Pfam: ABC_tran ABC_membrane SMC_N AAA_15 AAA_22 AAA_29 AAA_23 AAA_5 AAA_7 AAA DUF6709 LAX
Other DBs
NCBI-ProteinID: ARU91628
Position
865092..866891
AA seq 599 aa
MSLLLITNIKIIEYITALLVSKSVIDAANNVEKANGFFSRWVTDPNLQKIILENLNNTIK
DREAFLQDVIETFFYSNVNYTNHTVYLVLWGLNLNLYNLVEIMIVDIALVILVVYIVYII
SGYIAGSYEAKIRKALIDKLIDQDLDYFSQNKTGELIGTLVKESSILAKHIKEAPANYTL
SSVTILISSIMMFKINWKLASSVFGLLAIFLILVFIFILITNSSTKKIHQASQKLDNNLT
EKVYSIRLIKSSGTFNKEKTEFQESINFVDKKNKGKLFLAEIPNALIVGGIGSFSMASII
FGVFLYYEQTQALVSVMTAFTAGVIVMTLPILQLRQVIADEPAAHVAAASVVRILDSTIC
IDKHKTQIISEPLTEICFENVEFKYPSSDEIILKNLDIELKKNYKYAFVGPTGSGKSTIA
KLILRFYDPSSGLIKINQKYNLQDLNLKSWLDKIGYVDQEPQILSGTIYANIAYGLDNVS
NEDIVIAAKKAKLHDLIMSWSDGYDTILFECGSQLSGGQKQRLVIARLILKDPEILILDE
ATSALDNIVEAEIQAELEKLMVGRTTIAIAHRLSTIKSFDKILYLNQEWELFRLEPLMT
NT seq 1800 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcattattattaattacaaatataaaaattattgaatacattactgctctattagta
tcaaaaagtgttattgatgctgcaaataatgtggaaaaagccaatggtttttttagtcgt
tgagtaactgatccaaatttgcaaaaaataattttagaaaatctcaataacactattaaa
gaccgtgaagcttttttacaagatgtaatcgaaacatttttttatagcaatgttaattat
acaaatcacacagtttacttagttctttggggtttaaacttaaatctttataaccttgtt
gaaattatgattgtggatattgctttggttattttagtggtttacatagtttacatcatt
agtggctacattgctggaagctatgaggcaaaaattagaaaagctttaattgacaagtta
attgatcaagatttagattattttagtcaaaataaaactggtgaactaattggtaccttg
gttaaagaaagtagtattctagcaaaacacattaaagaagcaccagccaactacacccta
tctagtgtcacaattttgatttcatcaattatgatgtttaaaattaattgaaaactagct
tcgagtgtttttggattattagcaatctttttaatcttagtttttatctttattttgata
accaatagtagcactaaaaaaattcaccaagcaagtcagaaattagataataatttaact
gaaaaagtttatagcattcgtttgattaaatcaagtggaacctttaataaagagaaaaca
gaatttcaagagtcaataaattttgttgataaaaaaaataaaggtaaattatttttagct
gagattcccaatgctttaattgttggaggcattggaagtttctcaatggctagtattatc
tttggtgtctttttatattatgaacaaactcaagcacttgttagtgtaatgactgctttt
actgctggagttattgtaatgactcttccaattttgcaattgcgacaagtaattgctgat
gaaccagcagcacatgttgctgcagcatctgttgtaagaattttagattcaactatttgc
attgataaacacaaaacccaaattatttctgagccattaacagaaatctgttttgaaaat
gttgaatttaaatatccaagtagtgatgaaatcattttaaaaaatttagacattgaactc
aaaaaaaattataaatatgcttttgtaggaccaactggaagtggaaaatcaacaattgct
aaattgattttaagattttatgatccatcaagtggacttataaaaattaatcaaaaatat
aatttacaagacctaaatctaaagtcatgattggacaagattggttatgttgatcaagaa
ccacaaatattaagtggaacaatttatgcaaacattgcttatggacttgacaatgtttca
aatgaagacatagtaattgctgcaaaaaaggcaaaattgcatgacttaattatgagttga
tctgatggttatgacacaattttatttgagtgtggaagtcaattgtcaggtggacaaaaa
caaagattagttattgctcgtttgattttaaaagaccctgagattttaattttagatgaa
gctactagtgctcttgacaatattgtggaagcggaaattcaagcagaacttgaaaaactt
atggttggtagaaccacaattgcaattgctcatcgtttaagtacaataaaaagttttgat
aaaattttgtacttgaaccaagaatgggaattgttcagattggaacctttgatgacttaa

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (3)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   OC (1)   
Protein domain (12)   
   Pfam (12)   
All databases (18)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system