KEGG   Spiroplasma phoeniceum: SDAV_001668
Entry
SDAV_001668       CDS       T06376                                 
Name
(GenBank) phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta
  KO
K01890  phenylalanyl-tRNA synthetase beta chain [EC:6.1.1.20]
Organism
sphh  Spiroplasma phoeniceum
Pathway
sphh00970  Aminoacyl-tRNA biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sphh00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09122 Translation
   00970 Aminoacyl-tRNA biosynthesis
    SDAV_001668
 09180 Brite Hierarchies
  09181 Protein families: metabolism
   01007 Amino acid related enzymes [BR:sphh01007]
    SDAV_001668
  09182 Protein families: genetic information processing
   03016 Transfer RNA biogenesis [BR:sphh03016]
    SDAV_001668
Enzymes [BR:sphh01000]
 6. Ligases
  6.1  Forming carbon-oxygen bonds
   6.1.1  Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds
    6.1.1.20  phenylalanine---tRNA ligase
     SDAV_001668
Amino acid related enzymes [BR:sphh01007]
 Aminoacyl-tRNA synthetase
  Class II (U)
   SDAV_001668
Transfer RNA biogenesis [BR:sphh03016]
 Eukaryotic type
  Aminoacyl-tRNA synthetases (AARSs)
   Other AARSs
    SDAV_001668
 Prokaryotic type
    SDAV_001668
SSDB
Motif
Pfam: tRNA_synthFbeta B5 FDX-ACB B3_4 tRNA_bind
Other DBs
NCBI-ProteinID: AXF96625
UniProt: A0A345DQY4
Position
complement(1313735..1316128)
AA seq 797 aa
MIITRRWLNKYIDFTDISNADIVAALNSLGFEVERTHNFDRNSNIVCGRIQVVNEIPDTH
LKFCLVDIGQELVDPIVCGASNPAENGYVVVARPGAVLADGAKIAKREIKGYASEGMMCS
LSELGIAEKYLTPAEQDEIILTFNEKEGSYDMIGAEDVLTKIGLTDYLFEIDLTLNRSDC
LSAYELARELAHYFKRELFPLELESTENLKEYQNPLKVEIATSAVESAISVNIKLTPEKT
PLKLSDRIWLKINEYQSNVADPFGDLAIKATLETGQPLLLYDFNKIKNPLKITDDYENKT
FNIKKGDLVVLDGNEFLELIGVRVNPTYAISATTTEITVLALHLNHIIMRQQQRKVGISN
INLQRYIKPLSYATVGLGLSRYLYLLKINGFLAELSVLNFIKEYKKTVESINITLLEINQ
FIGYSFTLLEIKALLEPLAFQFKTEGEQLFVTPPATRTDIFQKADLIEEITRLFGYNNIV
AQPPVLPNLVKAKRPSEKTIKNFETFFLNNGFYQAKTYALVKQEEITHFNFFNYQKPYQL
LSPLSEEHAVMRLSLTNSLLNSVKYNNARNQKNVKLFTVEKIYVNEKSYYHGAFVSQAEI
IQNKITGDSLSNSYYYIKSLLEAYLQSEQIDIDELSYQSAPKNKIYHPYQTSHVFLGKQL
LAIIGVINHSYQKEVDLKSATYFGEINFEVMFNYPHKKQTFFTPPSKFSTSSRDISIWVP
VTVTYEQIKKKILTGVKNVVAIEVIDQYFDHKEMPNHVALTISFTFNDMAKQLTETDINQ
QFEQIKMNLKKLQLQIR
NT seq 2394 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgattattacaagaagatgattaaataaatatattgattttactgatattagtaatgct
gatattgttgctgctttaaatagtttagggtttgaagtagaacgtacgcataattttgat
cgtaatagtaatattgtttgtggtcgaattcaagttgttaatgaaattcctgatacgcat
ttaaagttttgtctagttgatataggacaagaattagttgatccaattgtttgcggagct
agtaacccagcggaaaatggatatgttgtcgttgctcgtccaggggcagtgttagccgat
ggtgcaaaaattgcaaaacgtgaaattaaaggatatgcttcggaaggaatgatgtgttca
ctaagtgaattaggaattgctgaaaaatatttaacgccagccgaacaagatgaaattatt
ttaacttttaatgaaaaagaaggttcatatgatatgattggtgctgaagatgttttaact
aaaattggtttaactgattatttgtttgagattgatttaacattaaaccgcagtgattgc
ttaagtgcttatgaattagcccgtgaattagcccactattttaaacgtgaattatttccg
ttagaattagaatcaacagaaaatttaaaagaatatcaaaatccattaaaagtagaaatt
gcaacatcagcagttgaatcagcaattagtgttaatattaaattaacgccggaaaaaact
ccgctaaaattatcagatcgaatttggttaaaaattaatgaatatcaatcaaatgtagca
gatccatttggcgatttagcaattaaagcaacccttgaaacagggcaaccattattactt
tatgattttaataaaattaaaaaccctttaaaaattactgatgattatgaaaataaaact
tttaatattaaaaaaggtgatttagtagttcttgatgggaatgaatttttagaattaatt
ggtgtccgcgttaatccgacttatgctattagtgctacaacaacggagataacagtgtta
gcactccatttaaatcatattataatgcgtcaacaacaacgaaaagttggtattagtaac
attaatttacaacgttatatcaaaccccttagttatgctactgttggattaggattatca
cgttatttgtatttattaaaaattaatggttttttagccgagttatcagttttaaacttt
attaaagaatataagaaaacagttgagtcaattaacattactttacttgagattaatcaa
tttatcggttattcttttaccttattagaaattaaagctttattagaaccattagctttc
caatttaaaacagaaggtgaacaattatttgtgacaccaccagcaactcgtaccgatatt
tttcagaaagctgatttgattgaagaaattacccggttatttggttataataacattgtt
gctcaaccaccagtcttaccaaatttagttaaggctaaacgtccttctgaaaaaacaatt
aaaaattttgaaactttctttttaaataatggtttttatcaggcaaaaacatatgcgcta
gttaaacaagaagaaattactcattttaacttttttaattatcaaaaaccatatcaatta
ctatcgccattatcggaagaacatgctgtaatgcggttaagtttaacaaatagtttatta
aacagtgttaaatacaataatgctcgaaatcaaaaaaatgttaagttatttactgttgaa
aaaatttatgtaaatgagaaaagttattatcatggggcatttgtaagtcaagcagaaatt
attcaaaataaaataacaggcgatagtctttctaattcgtattattatattaaaagttta
ttggaagcttatttgcaaagtgaacaaattgatattgatgaattatcatatcaatcagca
ccaaaaaataaaatttaccatccttatcaaactagtcatgtttttttaggaaaacaatta
ttagcaattattggtgtgattaatcatagttatcaaaaagaagttgatttaaaaagtgca
acttattttggcgaaattaattttgaagtaatgtttaattatccgcataagaaacaaaca
tttttcacaccgccttctaaatttagtacaagtagtcgtgacatttcaatttgagtacca
gtaacagtaacctacgaacaaattaagaaaaagattttaacaggagttaaaaatgttgtt
gcaatagaagtgattgaccagtattttgatcataaagaaatgcctaatcatgttgcttta
acaattagttttacatttaatgatatggcaaaacagctaactgaaacagatattaaccaa
caatttgaacaaattaaaatgaatttgaagaaattacaattacaaattcgctag

  All links  
Ontology (4)   
   KEGG BRITE (4)   
Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Chemical substance (6)   
   KEGG COMPOUND (6)   
Chemical reaction (2)   
   KEGG ENZYME (1)   
   KEGG REACTION (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (2)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
Protein sequence (1)   
   UniProt (1)   
Protein domain (5)   
   Pfam (5)   
All databases (22)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system