KEGG   Spiroplasma sp. NBRC 100390: S100390_v1c04400
Entry
S100390_v1c04400  CDS       T05859                                 
Symbol
recD
Name
(GenBank) exodeoxyribonuclease V alpha subunit
  KO
K03581  exodeoxyribonuclease V alpha subunit [EC:3.1.11.5]
Organism
sprn  Spiroplasma sp. NBRC 100390
Pathway
sprn03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:sprn00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03440 Homologous recombination
    S100390_v1c04400 (recD)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:sprn03400]
    S100390_v1c04400 (recD)
Enzymes [BR:sprn01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.11  Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.11.5  exodeoxyribonuclease V
     S100390_v1c04400 (recD)
DNA repair and recombination proteins [BR:sprn03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    RecBC pathway proteins
     S100390_v1c04400 (recD)
SSDB
Motif
Pfam: AAA_19 AAA_30 SH3_13 HHH_4 UvrD_C_2 Viral_helicase1 AAA_11 UvrD-helicase SLFN-g3_helicase AAA_22 nSTAND3 Helicase_RecD PIF1 RuvB_N AAA_12 AAA_29 HHH_5 AAA PhoH DEAD AAA_28 AAA_5 T2SSE Mg_chelatase RsgA_GTPase AAA_24 AAA_16 SMC_N
Other DBs
NCBI-ProteinID: APE13253
UniProt: A0A1J0U0D8
Position
490552..492699
AA seq 715 aa
MSEKLRGYLKLIVFESKNGYRICKFQLEKDKTHFIFIKGFLSALQPDQLYELTGEFVYNN
RYGESFEVNELKQIAPQSNDEVLKYLTSSLFPTIGPKTAQSIIDYYENDVVSKIKANVLA
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NT seq 2148 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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