KEGG   Theileria annulata: TA20340
Entry
TA20340           CDS       T00253                                 
Name
(RefSeq) ATP-dependent helicase, putative
  KO
K12818  ATP-dependent RNA helicase DHX8/PRP22 [EC:5.6.2.6]
Organism
tan  Theileria annulata
Pathway
tan03040  Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:tan00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03040 Spliceosome
    TA20340
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03041 Spliceosome [BR:tan03041]
    TA20340
Enzymes [BR:tan01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.6  RNA 3'-5' helicase
     TA20340
Spliceosome [BR:tan03041]
 Complex C
  Other components
   Step II factors
    TA20340
SSDB
Motif
Pfam: OB_NTP_bind HA2_C Helicase_C HA2_N DEAD Eap1 AAA_22 ATPase AAA_19
Other DBs
NCBI-GeneID: 3863666
NCBI-ProteinID: XP_954227
UniProt: Q4UH89
Position
1:1502979..1509497
AA seq 1160 aa
MDGIEELQSLSVISKVNEMLKNYLEIDQSELAEFIIYLAKKSKDLDEFNKLLNENDANMS
FDFINQLYRIIITLDPPKQMDEWDNIIKSNNDETNFPALSLKNNPNRKELLLPSPTVELS
EWAKELINKENPNIKLQNYKSNKDKDNRDRDKHRRSLSRDRDRDRSRYRERDRDHDRYKE
RDRGRDRHKRSRSRDRDRDRDRDRRSRSREINRSRDSSRDFEPDTVMEELEEENDILNNK
KRYINDIERWENQQLLKSGILTNEEKFKLKSELELQEEIQPEVTINLNPPNFLKGQTIRS
GIVLSPIKLVAKPEGSLQRTITTSLQIQNELKSIHHTHNTTHNTHSTHTTTHSTNTTHTH
TTASTKRVYKNILEERKNLPIYKLREEIINEIIHNQILIVIGETGSGKTTQIPQYLYESK
FHYYNHFLSLISPVTVTGPPDSNGTNGSTVVPGSSTNEGTVGPSTVTEGKGANSTATECT
TTNTTNNTKDIEDIKGTNTKEVPFGVGGTGGCRVLDTVTEKKMIGITQPRRISCINIAKR
VSDEMYCIIGNEVGYCIRFSDVTSDKTIIKYMTDGMLLREILHDPLLNNYITIMLDEAHE
RTIATDVLFSLLKETCMKRKDFRLIVTSATLESEKFSKYFFNSKIFKIPGRSFPVEIFHS
KEQEFDYLETSLITILNIHLNEKPGDILLFLTGEEDIETGIKILEERLNKLKNMNIPKLL
LFPVYSALPQDQQQQIFQPAPPGTRKCILATNIAEASITIDGILYVIDPGLCKIKSYNPK
TGMESLIITPISQANARQRAGRAGRTAPGKCFRLYTEKTFHEEMLPTPIPEIQRVNLTNV
VIILKSMGINDFLHFDFMDKYALRPCNEMLIDALDILYHLGALDDEGLLTHLGRKMAQFP
IDPTLSKILLYSIEMDCYNEIITIISMLSVQNIFYRPSDKREKADQSRRKFFQSEGDHLT
YLYIYNQWSNNQFSNYYCYNNFLQYRALIKVQDIKKQLISIIDKYKFMKKKMKIDNLNKT
ERIQKCICSGFFHHSAKRDEDSYRTLLDEQKVYIHPSSSLFQRYCLPTEENLFPLTRSIF
DIYFFLPYFSNYFYYLINNCIRNPEYVLYHELILTSKEYMRDLTIIKSKWLLELAPTMFI
SSNNTFKHSSNKIIKLKLKY
NT seq 3483 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggatggaatagaagaattacaatcacttagtgtaatatctaaagttaatgaaatgctt
aaaaattatcttgaaattgatcaatccgagttagcagaatttataatatatttggcaaaa
aaatcgaaagatttggatgaatttaataaattattaaatgaaaatgatgctaatatgagt
tttgattttattaatcaactctatcgtattattattacacttgatcctccaaaacaaatg
gatgaatgggataatataattaaaagtaataatgatgaaacaaattttccggcactttca
ttaaaaaataatccaaatcgtaaagaacttttattaccatcaccaactgtagaattatca
gaatgggctaaagaattaattaataaagaaaatcctaatattaaattacaaaattataaa
tctaataaagataaagataatagagatcgagataaacatagacgtagtctttctagagac
cgtgaccgtgaccgttctagatatagagaaagagatagagaccatgatagatataaggaa
agagacagaggtagagatagacataaacgtagtcgttctagagaccgtgatcgtgataga
gatagagatagacgtagtcgttctagagaaataaatcgttctagagatagttctagagac
tttgaaccagacaccgttatggaagaattagaagaagaaaatgatatattgaataataaa
aaacgttatataaatgatatagaacgttgggagaatcaacaattattaaaaagtggaatt
ttaactaatgaagagaaatttaaattgaaatctgaattagaattacaagaagaaattcaa
cctgaagttactattaatttaaatccaccaaattttttaaaaggacaaactataagatca
ggtatagtattatcacctataaaattagttgcaaaacctgaaggttcattacaaagaact
attactacttcattacaaatacaaaatgaacttaaatctatacatcatacacataatact
acacataatacacacagtacacacactactacacatagtactaatactacacatacacat
actacagcaagtacaaaaagagtatataaaaatatattagaagaaaggaaaaatttacct
atatataaattaagagaagaaataataaatgaaataatacataatcaaatattaattgtt
attggtgaaactggtagtggtaaaactacacaaataccacaatatctttatgaatctaaa
tttcattattataatcattttttatcattaatttctcccgttacggtgactggtccacca
gacagtaatggtactaacggtagtacagttgtacctggtagtagtaccaacgagggtacc
gttggaccaagcaccgttacggagggaaagggagctaattctacagccacggagtgtact
actactaatactactaataatactaaggatattgaggatattaagggtactaatactaag
gaagtcccttttggggttggtggtactggtggttgtcgtgtactagacaccgtaacggag
aaaaaaatgattggtataacacaacctagaagaatatcatgtataaatatagcaaaaaga
gtaagtgatgaaatgtattgtataattggtaatgaagttggttattgtataagatttagt
gatgttactagtgataaaactattattaaatatatgactgatggaatgttattaagagaa
attctacatgatcctttattaaataattatattactattatgttggatgaagcacatgaa
agaacaatagcaactgatgtattattttcacttcttaaagagacatgtatgaaaagaaaa
gattttagattaatagtaacatcagcaacattagaaagtgagaaatttagtaaatatttt
tttaattcgaaaatttttaaaattcctggtcgttcttttcctgttgaaattttccattct
aaagaacaagaatttgattatcttgaaacttcacttattactatattaaatatacatctt
aatgaaaaacctggtgatattctattatttcttactggtgaagaagatatagaaacgggt
ataaaaatattagaagaaagattaaataaattaaagaatatgaatataccgaaattatta
ttatttccagtatattcagcattaccacaagatcaacaacaacaaatctttcaacctgca
ccaccaggaactagaaaatgtattttagctactaatattgctgaagcttctattactatt
gatggaatattatatgttattgatcctggattatgtaaaattaaatcatataatcctaaa
actggaatggaaagtttaataataacaccaatatcacaagctaatgctagacaaagagct
ggtagagctggtcgtacagcaccaggtaaatgttttcgtttatatactgagaaaactttt
catgaagaaatgcttcctacacctattcctgaaattcaacgtgttaatcttaccaatgtt
gttattatacttaaatctatgggtattaatgattttttacattttgattttatggataag
tacgcattacgaccttgtaatgaaatgttaattgatgcattggatatattatatcatttg
ggtgcattagatgatgaaggtttattaacacatttaggacgtaaaatggcacaatttcca
attgatccaacattatccaaaatattattatattcgattgaaatggattgttataatgaa
ataataacaataatatcaatgttatcagtacagaatatattttatcgtccaagtgataaa
agagaaaaagctgatcaatccagacgtaaattctttcaatctgaaggagatcatttaact
tatctttatatatataatcaatggtctaataatcaattctccaattattattgttataat
aattttctacaatatagagcattaataaaagtacaagatataaagaaacaattaatatca
ataattgataaatataaatttatgaagaagaaaatgaaaattgataatttaaataaaact
gaacgtatacaaaaatgtatttgtagtggattttttcatcattctgctaaaagagatgaa
gattcttatcgtacattattagatgaacaaaaagtttatatacatccttcttcatcatta
tttcaaaggtattgcttacctacagaggaaaatttatttcctctaacccgatcaattttt
gacatttatttttttttaccttatttttctaattatttttattatttgattaataattgt
attagaaatccagaatatgtattatatcatgaattaatattaacaagtaaagaatatatg
agagatttaacaataattaaatcaaaatggttattagaattagcaccaacaatgttcata
tcatctaataatacatttaaacattcaagtaacaaaattattaaactaaaattaaaatat
taa

  All links  
Ontology (2)   
   KEGG BRITE (2)   
Pathway (1)   
   KEGG PATHWAY (1)   
Chemical reaction (1)   
   KEGG ENZYME (1)   
Genome (1)   
   KEGG GENOME (1)   
Gene (87)   
   KEGG ORTHOLOGY (1)   
   RefGene (83)   
   NCBI-PROTEINID (1)   
   NCBI-Gene (1)   
   OC (1)   
Protein sequence (2)   
   UniProt (1)   
   RefSeq(pep) (1)   
DNA sequence (1)   
   RefSeq(nuc) (1)   
Protein domain (9)   
   Pfam (9)   
All databases (104)   

Download RDF
DBGET integrated database retrieval system