ID Q658I1_ORYSJ Unreviewed; 145 AA.
AC Q658I1;
DT 25-OCT-2004, integrated into UniProtKB/TrEMBL.
DT 25-OCT-2004, sequence version 1.
DT 27-MAR-2024, entry version 118.
DE RecName: Full=Large ribosomal subunit protein uL29m {ECO:0000256|ARBA:ARBA00035289};
GN OrderedLocusNames=Os06g0128500 {ECO:0000313|EMBL:BAS95952.1};
GN ORFNames=OSNPB_060128500 {ECO:0000313|EMBL:BAS95952.1};
OS Oryza sativa subsp. japonica (Rice).
OC Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
OC Spermatophyta; Magnoliopsida; Liliopsida; Poales; Poaceae; BOP clade;
OC Oryzoideae; Oryzeae; Oryzinae; Oryza; Oryza sativa.
OX NCBI_TaxID=39947 {ECO:0000313|EMBL:BAS95952.1, ECO:0000313|Proteomes:UP000059680};
RN [1] {ECO:0000313|EMBL:BAG86732.1}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA Kikuchi S., Satoh K., Nagata T., Kawagashira N., Doi K., Kishimoto N.,
RA Yazaki J., Ishikawa M., Yamada H., Ooka H., Hotta I., Kojima K., Namiki T.,
RA Ohneda E., Yahagi W., Suzuki K., Li C., Ohtsuki K., Shishiki T., Otomo Y.,
RA Murakami K., Iida Y., Sugano S., Fujimura T., Suzuki Y., Tsunoda Y.,
RA Kurosaki T., Kodama T., Masuda H., Kobayashi M., Xie Q., Lu M.,
RA Narikawa R., Sugiyama A., Mizuno K., Yokomizo S., Niikura J., Ikeda R.,
RA Ishibiki J., Kawamata M., Yoshimura A., Miura J., Kusumegi T., Oka M.,
RA Ryu R., Ueda M., Matsubara K., Kawai J., Carninci P., Adachi J., Aizawa K.,
RA Arakawa T., Fukuda S., Hara A., Hashidume W., Hayatsu N., Imotani K.,
RA Ishii Y., Itoh M., Kagawa I., Kondo S., Konno H., Miyazaki A., Osato N.,
RA Ota Y., Saito R., Sasaki D., Sato K., Shibata K., Shinagawa A., Shiraki T.,
RA Yoshino M., Hayashizaki Y.;
RT "Collection, Mapping, and Annotation of Over 28,000 cDNA Clones from
RT japonica Rice.";
RL Science 301:376-379(2003).
RN [2] {ECO:0000313|EMBL:BAH00811.1}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA Adachi J., Aizawa K., Akimura T., Arakawa T., Carninci P., Doi K.,
RA Fujimura T., Fukuda S., Hanagaki T., Hara A., Hashizume W., Hayashida K.,
RA Hayashizaki Y., Hayatsu N., Hiramoto K., Hiraoka T., Hori F., Hotta I.,
RA Iida J., Iida Y., Ikeda R., Imamura K., Imotani K., Ishibiki J., Ishii Y.,
RA Ishikawa M., Itoh M., Kagawa I., Kanagawa S., Katoh H., Kawagashira N.,
RA Kawai J., Kawamata M., Kikuchi S., Kishikawa-Hirozane T., Kishimoto N.,
RA Kobayashi M., Kodama T., Kojima K., Kojima Y., Kondo S., Konno H.,
RA Kouda M., Koya S., Kurihara C., Kurosaki T., Kusumegi T., Li C., Lu M.,
RA Masuda H., Matsubara K., Matsuyama T., Miura J., Miyazaki A., Mizuno K.,
RA Murakami K., Murata M., Nagata T., Nakahama Y., Nakamura M., Namiki T.,
RA Narikawa R., Niikura J., Nishi K., Nomura K., Numasaki R., Ohneda E.,
RA Ohno M., Ohtsuki K., Oka M., Ooka H., Osato N., Ota Y., Otomo Y., Ryu R.,
RA Saitoh H., Sakai C., Sakai K., Sakazume N., Sano H., Sasaki D., Sato K.,
RA Satoh K., Shibata K., Shinagawa A., Shiraki T., Shishiki T., Sogabe Y.,
RA Sugano S., Sugiyama A., Suzuki K., Suzuki Y., Tagami M., Tagami-Takeda Y.,
RA Tagawa A., Takahashi F., Takaku-Akahira S., Tanaka T., Tomaru A., Toya T.,
RA Tsunoda Y., Ueda M., Waki K., Xie Q., Yahagi W., Yamada H., Yamamoto M.,
RA Yasunishi A., Yazaki J., Yokomizo S., Yoshimura A.;
RT "Collection, mapping, and annotation of 28K full-length cDNA clones from
RT japonica rice.";
RL Submitted (JAN-2003) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RN [3] {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RC STRAIN=cv. Nipponbare {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680};
RX PubMed=16100779; DOI=10.1038/nature03895;
RG International rice genome sequencing project (IRGSP);
RA Matsumoto T., Wu J., Kanamori H., Katayose Y., Fujisawa M., Namiki N.,
RA Mizuno H., Yamamoto K., Antonio B.A., Baba T., Sakata K., Nagamura Y.,
RA Aoki H., Arikawa K., Arita K., Bito T., Chiden Y., Fujitsuka N.,
RA Fukunaka R., Hamada M., Harada C., Hayashi A., Hijishita S., Honda M.,
RA Hosokawa S., Ichikawa Y., Idonuma A., Iijima M., Ikeda M., Ikeno M.,
RA Ito K., Ito S., Ito T., Ito Y., Ito Y., Iwabuchi A., Kamiya K.,
RA Karasawa W., Kurita K., Katagiri S., Kikuta A., Kobayashi H., Kobayashi N.,
RA Machita K., Maehara T., Masukawa M., Mizubayashi T., Mukai Y., Nagasaki H.,
RA Nagata Y., Naito S., Nakashima M., Nakama Y., Nakamichi Y., Nakamura M.,
RA Meguro A., Negishi M., Ohta I., Ohta T., Okamoto M., Ono N., Saji S.,
RA Sakaguchi M., Sakai K., Shibata M., Shimokawa T., Song J., Takazaki Y.,
RA Terasawa K., Tsugane M., Tsuji K., Ueda S., Waki K., Yamagata H.,
RA Yamamoto M., Yamamoto S., Yamane H., Yoshiki S., Yoshihara R., Yukawa K.,
RA Zhong H., Yano M., Yuan Q., Ouyang S., Liu J., Jones K.M., Gansberger K.,
RA Moffat K., Hill J., Bera J., Fadrosh D., Jin S., Johri S., Kim M.,
RA Overton L., Reardon M., Tsitrin T., Vuong H., Weaver B., Ciecko A.,
RA Tallon L., Jackson J., Pai G., Aken S.V., Utterback T., Reidmuller S.,
RA Feldblyum T., Hsiao J., Zismann V., Iobst S., de Vazeille A.R., Buell C.R.,
RA Ying K., Li Y., Lu T., Huang Y., Zhao Q., Feng Q., Zhang L., Zhu J.,
RA Weng Q., Mu J., Lu Y., Fan D., Liu Y., Guan J., Zhang Y., Yu S., Liu X.,
RA Zhang Y., Hong G., Han B., Choisne N., Demange N., Orjeda G., Samain S.,
RA Cattolico L., Pelletier E., Couloux A., Segurens B., Wincker P., D'Hont A.,
RA Scarpelli C., Weissenbach J., Salanoubat M., Quetier F., Yu Y., Kim H.R.,
RA Rambo T., Currie J., Collura K., Luo M., Yang T., Ammiraju J.S.S.,
RA Engler F., Soderlund C., Wing R.A., Palmer L.E., de la Bastide M.,
RA Spiegel L., Nascimento L., Zutavern T., O'Shaughnessy A., Dike S.,
RA Dedhia N., Preston R., Balija V., McCombie W.R., Chow T., Chen H.,
RA Chung M., Chen C., Shaw J., Wu H., Hsiao K., Chao Y., Chu M., Cheng C.,
RA Hour A., Lee P., Lin S., Lin Y., Liou J., Liu S., Hsing Y., Raghuvanshi S.,
RA Mohanty A., Bharti A.K., Gaur A., Gupta V., Kumar D., Ravi V., Vij S.,
RA Kapur A., Khurana P., Khurana P., Khurana J.P., Tyagi A.K., Gaikwad K.,
RA Singh A., Dalal V., Srivastava S., Dixit A., Pal A.K., Ghazi I.A.,
RA Yadav M., Pandit A., Bhargava A., Sureshbabu K., Batra K., Sharma T.R.,
RA Mohapatra T., Singh N.K., Messing J., Nelson A.B., Fuks G., Kavchok S.,
RA Keizer G., Linton E., Llaca V., Song R., Tanyolac B., Young S., Ho-Il K.,
RA Hahn J.H., Sangsakoo G., Vanavichit A., de Mattos Luiz.A.T., Zimmer P.D.,
RA Malone G., Dellagostin O., de Oliveira A.C., Bevan M., Bancroft I.,
RA Minx P., Cordum H., Wilson R., Cheng Z., Jin W., Jiang J., Leong S.A.,
RA Iwama H., Gojobori T., Itoh T., Niimura Y., Fujii Y., Habara T., Sakai H.,
RA Sato Y., Wilson G., Kumar K., McCouch S., Juretic N., Hoen D., Wright S.,
RA Bruskiewich R., Bureau T., Miyao A., Hirochika H., Nishikawa T.,
RA Kadowaki K., Sugiura M., Burr B., Sasaki T.;
RT "The map-based sequence of the rice genome.";
RL Nature 436:793-800(2005).
RN [4] {ECO:0000313|EMBL:BAS95952.1}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RX PubMed=23299411; DOI=10.1093/pcp/pcs183;
RA Sakai H., Lee S.S., Tanaka T., Numa H., Kim J., Kawahara Y., Wakimoto H.,
RA Yang C.C., Iwamoto M., Abe T., Yamada Y., Muto A., Inokuchi H., Ikemura T.,
RA Matsumoto T., Sasaki T., Itoh T.;
RT "Rice Annotation Project Database (RAP-DB): an integrative and interactive
RT database for rice genomics.";
RL Plant Cell Physiol. 54:E6-E6(2013).
RN [5] {ECO:0000313|EMBL:BAS95952.1, ECO:0000313|Proteomes:UP000059680}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE [LARGE SCALE GENOMIC DNA].
RC STRAIN=cv. Nipponbare {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680};
RX PubMed=24280374; DOI=10.1186/1939-8433-6-4;
RA Kawahara Y., de la Bastide M., Hamilton J.P., Kanamori H., McCombie W.R.,
RA Ouyang S., Schwartz D.C., Tanaka T., Wu J., Zhou S., Childs K.L.,
RA Davidson R.M., Lin H., Quesada-Ocampo L., Vaillancourt B., Sakai H.,
RA Lee S.S., Kim J., Numa H., Itoh T., Buell C.R., Matsumoto T.;
RT "Improvement of the Oryza sativa Nipponbare reference genome using next
RT generation sequence and optical map data.";
RL Rice 6:4-4(2013).
RN [6] {ECO:0000313|EMBL:BAS95952.1}
RP NUCLEOTIDE SEQUENCE.
RA Sakai H., Kawahara Y., Matsumoto T., Buell C.R., Itoh T.;
RL Submitted (OCT-2015) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
CC -!- SUBCELLULAR LOCATION: Mitochondrion {ECO:0000256|ARBA:ARBA00004173}.
CC -!- SIMILARITY: Belongs to the universal ribosomal protein uL29 family.
CC {ECO:0000256|ARBA:ARBA00009254}.
CC ---------------------------------------------------------------------------
CC Copyrighted by the UniProt Consortium, see https://www.uniprot.org/terms
CC Distributed under the Creative Commons Attribution (CC BY 4.0) License
CC ---------------------------------------------------------------------------
DR EMBL; AK058563; BAG86732.1; -; mRNA.
DR EMBL; AK122132; BAH00811.1; -; mRNA.
DR EMBL; AP014962; BAS95952.1; -; Genomic_DNA.
DR RefSeq; XP_015641552.1; XM_015786066.1.
DR AlphaFoldDB; Q658I1; -.
DR SMR; Q658I1; -.
DR STRING; 39947.Q658I1; -.
DR PaxDb; 39947-Q658I1; -.
DR EnsemblPlants; Os06t0128500-01; Os06t0128500-01; Os06g0128500.
DR GeneID; 4339986; -.
DR Gramene; Os06t0128500-01; Os06t0128500-01; Os06g0128500.
DR KEGG; osa:4339986; -.
DR eggNOG; KOG3331; Eukaryota.
DR HOGENOM; CLU_127352_0_0_1; -.
DR OMA; HNPLKEF; -.
DR OrthoDB; 148238at2759; -.
DR Proteomes; UP000059680; Chromosome 6.
DR GO; GO:0005762; C:mitochondrial large ribosomal subunit; IBA:GO_Central.
DR GO; GO:0003735; F:structural constituent of ribosome; IBA:GO_Central.
DR GO; GO:0032543; P:mitochondrial translation; IBA:GO_Central.
DR Gene3D; 6.10.330.20; -; 1.
DR InterPro; IPR038340; MRP-L47_sf.
DR InterPro; IPR010729; Ribosomal_uL29_mit.
DR InterPro; IPR036049; Ribosomal_uL29_sf.
DR PANTHER; PTHR21183:SF18; 39S RIBOSOMAL PROTEIN L47, MITOCHONDRIAL; 1.
DR PANTHER; PTHR21183; RIBOSOMAL PROTEIN L47, MITOCHONDRIAL-RELATED; 1.
DR Pfam; PF06984; MRP-L47; 1.
DR SUPFAM; SSF46561; Ribosomal protein L29 (L29p); 1.
PE 1: Evidence at protein level;
KW Mitochondrion {ECO:0000256|ARBA:ARBA00023128};
KW Proteomics identification {ECO:0007829|ProteomicsDB:Q658I1};
KW Reference proteome {ECO:0000313|Proteomes:UP000059680};
KW Ribonucleoprotein {ECO:0000256|ARBA:ARBA00023274};
KW Ribosomal protein {ECO:0000256|ARBA:ARBA00022980}.
SQ SEQUENCE 145 AA; 16729 MW; B456D0B0F681F994 CRC64;
MLSLSRALGR RLFSSSSAAA SDATAAAAAV VRKAQNPLEE FFEVERSTEE DKPPPHYGRS
WKASELRLKS WDDLQKLWYV LLKEKNMLMS QRQMLHSENM RFPNPERVSK VKKSMCRIKH
VLTERAIAEP DPRRSAEMKR MINAL
//
